1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_109 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.35 0.3 0.48 0.41 0.46 0.46 0.38 0.47 0.3 0.42 0.38 0.29 0.56 0.34 0.87 0.51 0.3 0.31 0.54 0.85 0.15 1.0 0.28 0.37 0.08 0.14 0.15 0.15 0.34 0.44 0.29 0.42
0.83 0.68 0.71 0.61 0.8 0.84 0.9 0.86 0.9 0.7 0.62 0.66 0.34 0.32 0.67 0.34 0.39 0.25 0.44 0.65 0.41 1.0 0.4 0.4 0.57 0.43 0.48 0.39 0.42 0.46 0.34 0.35
0.49 0.7 0.68 0.67 0.51 0.57 0.55 0.48 0.57 0.57 0.61 0.6 0.2 0.34 1.0 0.29 0.3 0.34 0.11 0.45 0.6 0.29 0.24 0.29 0.05 0.47 0.44 0.5 0.21 0.28 0.48 0.35
0.65 0.75 0.54 0.67 0.74 0.8 0.84 0.82 0.8 0.88 0.8 0.72 0.67 0.51 0.83 0.66 0.52 0.59 0.86 0.44 0.14 0.31 0.59 0.67 0.58 1.0 0.69 0.74 0.74 0.7 0.65 0.66
0.74 0.66 0.7 0.71 0.61 0.77 0.8 0.93 0.93 0.97 0.82 0.72 0.41 0.43 1.0 0.45 0.43 0.34 0.56 0.34 0.28 0.45 0.39 0.41 0.85 0.78 0.64 0.69 0.58 0.65 0.52 0.52
0.63 0.76 0.77 0.93 0.83 0.92 1.0 0.92 0.9 0.85 0.82 0.75 0.39 0.43 0.78 0.36 0.61 0.44 0.51 0.92 0.31 0.26 0.48 0.41 0.37 0.58 0.71 0.83 0.57 0.6 0.34 0.34
0.69 0.7 0.68 0.78 0.59 0.79 0.79 0.79 0.87 1.0 0.85 0.72 0.51 0.4 0.84 0.63 0.38 0.29 0.61 0.38 0.0 0.02 0.43 0.41 0.06 0.4 0.58 0.55 0.54 0.58 0.57 0.62
0.98 0.9 0.82 0.89 1.0 0.93 0.89 0.89 0.97 0.97 0.89 0.9 0.66 0.61 0.83 0.73 0.46 0.47 0.67 0.44 0.06 0.07 0.49 0.5 0.29 0.76 0.76 0.78 0.55 0.54 0.59 0.5
0.39 0.47 0.65 0.68 0.88 0.83 0.97 0.62 0.7 0.59 0.58 0.39 0.27 0.32 1.0 0.28 0.37 0.5 0.2 0.32 0.04 0.24 0.38 0.53 0.04 0.19 0.25 0.32 0.38 0.54 0.32 0.37
0.23 0.33 0.44 0.44 0.52 0.54 0.6 0.37 0.44 0.35 0.32 0.22 0.18 0.27 1.0 0.21 0.26 0.36 0.08 0.13 0.02 0.2 0.16 0.2 0.03 0.17 0.22 0.27 0.2 0.27 0.13 0.11
0.5 0.66 0.64 0.61 0.54 0.49 0.86 0.71 0.83 0.98 0.79 0.72 0.37 0.73 0.59 0.44 0.65 0.77 1.0 0.07 0.15 0.16 0.29 0.55 0.09 0.63 0.17 0.17 0.36 0.62 0.31 0.24
0.31 0.53 0.67 0.64 0.78 0.68 0.65 0.5 0.47 0.46 0.45 0.35 0.32 0.23 1.0 0.17 0.28 0.16 0.3 0.11 0.22 0.34 0.52 0.59 0.31 0.37 0.62 0.6 0.14 0.15 0.3 0.47
0.62 0.56 0.72 0.67 0.59 0.61 0.73 0.63 0.73 0.77 0.83 0.66 0.45 0.35 0.52 0.34 0.77 0.47 0.45 1.0 0.12 0.46 0.33 0.38 0.11 0.4 0.31 0.35 0.58 0.68 0.67 0.57
0.77 0.86 0.86 0.77 0.67 0.78 0.84 0.64 0.7 0.91 0.92 0.8 0.32 0.63 0.79 0.45 0.45 0.24 0.47 1.0 0.09 0.5 0.45 0.35 0.25 0.61 0.28 0.52 0.44 0.45 0.35 0.43
0.48 0.95 0.91 0.74 0.82 0.79 0.92 0.63 0.86 1.0 1.0 0.77 0.34 0.3 0.53 0.46 0.61 0.75 0.76 0.74 0.27 0.34 0.68 0.74 0.01 0.61 0.33 0.4 0.29 0.42 0.29 0.22
0.2 0.26 0.33 0.41 0.42 0.39 0.5 0.38 0.42 0.35 0.33 0.27 0.18 0.55 1.0 0.34 0.36 0.29 0.31 0.22 0.08 0.17 0.2 0.21 0.09 0.32 0.36 0.42 0.29 0.39 0.29 0.36
0.86 0.85 0.78 0.81 0.93 0.89 0.84 0.89 0.97 1.0 0.8 0.76 0.74 0.83 0.8 0.66 0.47 0.49 0.82 0.73 0.4 0.59 0.5 0.54 0.86 0.61 0.82 0.84 0.56 0.6 0.72 0.47
0.78 0.94 0.63 0.67 0.87 0.7 1.0 0.51 0.75 0.44 0.51 0.62 0.47 0.82 0.85 0.45 0.15 0.21 0.41 0.0 0.0 0.0 0.36 0.34 0.04 0.48 0.43 0.38 0.21 0.19 0.11 0.07
0.66 0.75 0.79 0.89 0.68 0.84 0.72 1.0 0.76 0.76 0.91 0.83 0.3 0.59 0.61 0.33 0.25 0.11 0.44 0.97 0.19 0.24 0.34 0.42 0.48 0.51 0.49 0.46 0.25 0.23 0.28 0.22
0.68 0.73 0.73 0.79 0.71 0.87 0.92 0.79 0.89 1.0 0.89 0.84 0.54 0.43 0.71 0.58 0.45 0.34 0.54 0.67 0.47 0.39 0.42 0.4 0.41 0.49 0.58 0.5 0.5 0.57 0.64 0.58
0.65 0.67 0.75 0.69 0.41 0.59 0.59 0.75 0.71 0.63 0.91 0.85 0.07 0.2 0.04 0.1 0.54 0.72 0.12 1.0 0.18 0.0 0.32 0.09 0.14 0.19 0.39 0.2 0.39 0.25 0.48 0.32
0.38 0.51 0.7 0.72 0.85 0.82 0.87 0.71 1.0 0.76 0.79 0.51 0.04 0.19 0.86 0.1 0.41 0.45 0.28 0.51 0.04 0.2 0.24 0.2 0.06 0.23 0.18 0.26 0.3 0.37 0.29 0.43
0.34 0.39 0.55 0.51 0.39 0.47 0.6 0.31 0.66 0.6 0.6 0.56 0.23 0.23 0.41 0.28 0.25 0.35 0.13 0.4 0.01 0.26 0.76 1.0 0.03 0.09 0.05 0.12 0.29 0.27 0.23 0.19
0.67 0.63 0.62 0.63 0.62 0.67 0.64 0.63 0.74 0.78 0.75 0.64 0.57 0.55 0.76 0.6 0.38 0.37 0.51 1.0 0.45 0.75 0.47 0.47 0.23 0.44 0.46 0.35 0.43 0.42 0.55 0.65
0.71 0.69 0.68 0.75 0.89 0.83 0.86 0.75 0.93 0.77 0.8 0.79 0.33 0.49 0.96 0.57 0.31 0.1 0.48 0.97 0.25 1.0 0.37 0.41 0.4 0.38 0.6 0.51 0.28 0.35 0.32 0.36
0.36 0.54 0.71 0.69 0.6 0.63 0.48 0.41 0.45 0.43 0.41 0.36 0.44 0.33 1.0 0.52 0.46 0.25 0.34 0.73 0.16 0.31 0.59 0.5 0.13 0.43 0.53 0.64 0.31 0.39 0.16 0.17
0.43 0.72 0.71 0.75 0.94 0.73 0.7 0.52 0.6 0.6 0.69 0.46 0.33 0.18 1.0 0.35 0.42 0.15 0.49 0.34 0.25 0.75 0.4 0.36 0.03 0.56 0.28 0.36 0.2 0.28 0.22 0.13
0.39 0.59 0.9 0.7 0.73 0.72 0.56 0.49 0.55 0.44 0.44 0.4 0.47 0.22 1.0 0.44 0.44 0.29 0.58 0.35 0.18 0.46 0.39 0.3 0.03 0.5 0.45 0.44 0.21 0.26 0.21 0.14
0.24 0.24 0.42 0.39 0.33 0.32 0.47 0.43 0.29 0.58 0.54 0.41 0.06 0.25 1.0 0.06 0.14 0.24 0.14 0.28 0.2 0.09 0.07 0.09 0.08 0.37 0.54 0.85 0.04 0.11 0.03 0.06
0.54 0.59 0.77 0.85 0.73 0.78 0.94 0.59 0.83 0.67 0.68 0.61 0.38 0.99 1.0 0.65 0.72 0.49 0.24 0.71 0.41 0.64 0.49 0.47 0.37 0.2 0.49 0.66 0.47 0.55 0.48 0.48
0.56 0.55 0.55 0.55 1.0 0.64 0.74 0.67 0.89 0.73 0.8 0.63 0.21 0.3 0.9 0.16 0.29 0.06 0.18 0.35 0.31 0.43 0.11 0.14 0.1 0.36 0.21 0.29 0.23 0.28 0.25 0.2
0.21 0.39 0.54 0.57 0.6 0.61 0.63 0.39 0.35 0.34 0.31 0.24 0.14 0.25 1.0 0.24 0.4 0.25 0.15 0.12 0.07 0.23 0.21 0.18 0.01 0.53 0.34 0.44 0.18 0.19 0.17 0.13
0.26 0.26 0.47 0.48 0.64 0.75 0.58 0.53 0.46 0.45 0.28 0.2 0.22 0.43 1.0 0.42 0.18 0.3 0.24 0.78 0.07 0.39 0.17 0.21 0.19 0.43 0.47 0.38 0.26 0.3 0.08 0.1
0.53 0.75 0.77 0.88 1.0 1.0 0.7 0.64 0.57 0.75 0.43 0.53 0.52 0.65 0.97 0.32 0.24 0.22 0.21 0.01 0.06 0.14 0.53 0.66 0.15 0.28 0.62 0.59 0.16 0.16 0.4 0.59
0.49 0.62 0.9 0.81 0.9 0.82 0.97 0.79 0.88 0.88 0.81 0.6 0.16 0.23 0.73 0.27 0.86 1.0 0.23 0.56 0.16 0.95 0.56 0.35 0.07 0.32 0.22 0.35 0.55 0.68 0.54 0.5
0.43 0.56 0.69 0.74 0.8 0.7 0.54 0.44 0.57 0.44 0.45 0.43 0.21 0.29 1.0 0.29 0.76 0.69 0.34 0.84 0.58 0.08 0.38 0.2 0.19 0.29 0.5 0.6 0.23 0.23 0.31 0.32
0.66 0.44 0.62 0.78 0.28 0.35 0.84 0.57 1.0 0.5 0.74 0.88 0.08 0.24 0.46 0.07 0.22 0.91 0.21 0.67 0.0 0.0 0.16 0.13 0.21 0.77 0.53 0.27 0.16 0.25 0.11 0.12
0.66 0.8 0.8 1.0 0.86 0.83 0.56 0.5 0.91 0.82 0.95 0.84 0.08 0.32 0.97 0.32 0.21 0.08 0.21 0.32 0.0 0.18 0.07 0.07 0.2 0.27 0.27 0.39 0.22 0.36 0.26 0.26
0.67 0.76 0.62 0.71 0.71 0.71 0.81 0.77 0.75 0.84 0.71 0.78 0.05 0.55 0.48 0.13 0.41 0.51 0.68 0.65 0.17 0.17 0.46 0.28 0.65 0.7 0.95 1.0 0.37 0.36 0.25 0.28
0.56 0.73 0.51 0.62 1.0 0.66 0.62 0.55 0.89 0.53 0.55 0.54 0.37 0.43 0.6 0.43 0.23 0.06 0.37 0.06 0.23 0.47 0.33 0.41 0.16 0.34 0.32 0.37 0.22 0.27 0.23 0.26
0.49 0.44 0.46 0.45 0.49 0.53 0.46 0.47 0.48 0.54 0.5 0.46 0.56 0.49 0.82 0.6 0.34 0.4 0.51 1.0 0.4 0.8 0.44 0.5 0.18 0.35 0.21 0.21 0.37 0.42 0.38 0.42
0.73 0.68 0.62 0.66 0.86 0.89 0.95 0.93 0.84 0.97 0.8 0.76 0.56 0.45 1.0 0.55 0.54 0.48 0.59 0.48 0.3 0.2 0.61 0.6 0.43 0.69 0.85 0.84 0.55 0.67 0.49 0.61
0.53 0.5 0.53 0.61 0.69 0.69 0.82 0.79 0.8 0.8 0.7 0.66 0.44 0.48 1.0 0.37 0.35 0.41 0.51 0.75 0.44 0.41 0.36 0.39 0.7 0.76 0.79 0.74 0.35 0.4 0.55 0.58
0.65 0.61 0.63 0.59 0.68 0.69 0.66 0.63 0.55 0.57 0.56 0.51 0.47 0.46 0.72 0.55 0.37 0.39 0.54 1.0 0.41 0.72 0.41 0.44 0.58 0.49 0.58 0.61 0.37 0.39 0.44 0.42
0.22 0.31 0.36 0.37 0.41 0.4 0.38 0.32 0.33 0.28 0.27 0.22 0.18 0.25 0.58 0.25 0.33 0.24 0.12 0.38 0.11 1.0 0.25 0.23 0.03 0.18 0.2 0.3 0.19 0.2 0.09 0.09
0.11 0.12 0.16 0.15 0.29 0.26 0.23 0.26 0.22 0.14 0.12 0.13 0.1 0.06 0.5 0.14 0.11 0.16 0.09 0.06 0.17 1.0 0.08 0.1 0.11 0.16 0.29 0.25 0.09 0.11 0.04 0.05
0.52 0.52 0.58 0.57 0.62 0.63 0.61 0.66 0.62 0.69 0.58 0.58 0.66 0.44 1.0 0.64 0.35 0.19 0.45 0.49 0.28 0.56 0.48 0.6 0.3 0.42 0.45 0.5 0.42 0.51 0.38 0.38
0.19 0.2 0.27 0.37 0.38 0.46 0.43 0.19 0.26 0.24 0.24 0.19 0.21 0.25 1.0 0.22 0.29 0.22 0.16 0.11 0.1 0.16 0.04 0.03 0.02 0.16 0.22 0.27 0.12 0.17 0.13 0.14
0.59 0.79 0.71 0.67 0.92 0.81 0.67 0.55 0.71 0.76 0.74 0.67 0.2 0.27 1.0 0.27 0.35 0.2 0.1 0.76 0.2 0.45 0.25 0.28 0.04 0.36 0.29 0.37 0.23 0.28 0.42 0.33
0.88 0.89 0.87 0.82 0.76 0.84 0.73 0.69 0.88 0.99 0.93 0.82 0.41 0.47 0.92 0.49 0.41 0.35 0.42 1.0 0.43 0.55 0.52 0.61 0.39 0.45 0.37 0.41 0.41 0.46 0.34 0.35
0.84 0.83 0.83 0.84 0.94 0.91 0.85 0.87 0.86 1.0 0.84 0.86 0.56 0.71 0.86 0.57 0.44 0.28 0.57 0.64 0.73 0.7 0.48 0.43 0.99 0.53 0.56 0.55 0.47 0.53 0.3 0.3
0.23 0.5 0.63 0.69 0.77 0.8 0.73 0.4 0.58 0.33 0.36 0.31 0.22 0.22 0.6 0.25 0.44 0.21 0.29 0.1 0.05 1.0 0.33 0.31 0.38 0.15 0.25 0.29 0.25 0.4 0.25 0.13
0.55 0.52 0.5 0.52 0.78 0.78 0.84 0.89 0.84 0.87 0.73 0.63 0.47 0.36 0.62 0.59 0.5 0.37 0.68 0.36 0.03 0.0 0.6 0.52 0.19 1.0 0.87 0.99 0.62 0.67 0.53 0.56
0.47 0.49 0.54 0.61 0.58 0.62 0.61 0.55 0.56 0.54 0.47 0.42 0.27 0.3 0.73 0.36 0.45 0.24 0.3 0.7 0.23 1.0 0.34 0.37 0.21 0.3 0.46 0.44 0.3 0.35 0.22 0.24
0.51 0.49 0.57 0.51 0.5 0.56 0.52 0.53 0.6 0.59 0.59 0.47 0.7 0.45 0.48 0.65 0.38 0.32 0.41 1.0 0.53 0.71 0.42 0.43 0.32 0.31 0.32 0.32 0.36 0.35 0.36 0.4
0.35 0.41 0.42 0.47 0.56 0.56 0.47 0.33 0.35 0.31 0.32 0.24 0.45 0.16 0.64 0.44 0.49 0.27 0.31 0.28 0.48 1.0 0.22 0.21 0.26 0.24 0.45 0.47 0.31 0.37 0.16 0.19
0.52 0.74 0.72 0.89 0.86 1.0 0.75 0.66 0.78 0.66 0.59 0.49 0.12 0.23 0.87 0.3 0.89 0.54 0.25 0.82 0.15 0.67 0.29 0.1 0.12 0.4 0.55 0.7 0.53 0.66 0.47 0.3
0.79 0.69 0.77 0.76 0.68 0.85 0.87 0.85 1.0 0.89 0.89 0.72 0.34 0.4 0.69 0.34 0.43 0.22 0.45 0.51 0.21 0.27 0.34 0.42 0.55 0.47 0.64 0.62 0.41 0.46 0.59 0.6
0.3 0.37 0.43 0.58 0.58 0.69 0.72 0.55 0.59 0.49 0.43 0.36 0.29 0.34 1.0 0.32 0.35 0.53 0.52 0.28 0.05 0.48 0.35 0.37 0.26 0.33 0.48 0.51 0.36 0.4 0.23 0.23
0.64 0.57 0.56 0.62 0.83 0.62 0.76 0.74 0.9 0.79 0.83 0.74 0.35 0.11 0.79 0.36 0.4 0.34 0.48 0.52 0.19 0.03 0.26 0.34 0.63 0.44 0.64 0.44 0.39 0.52 0.76 1.0
0.83 0.86 0.77 0.7 1.0 0.78 0.7 0.86 0.92 0.85 0.74 0.76 0.58 0.56 0.74 0.69 0.38 0.35 0.84 0.37 0.12 0.13 0.49 0.46 0.4 0.59 0.5 0.46 0.46 0.52 0.41 0.44
0.61 0.68 0.8 0.86 1.0 0.96 0.95 0.74 0.78 0.62 0.6 0.6 0.48 0.61 0.76 0.44 0.58 0.34 0.42 0.72 0.41 0.88 0.45 0.38 0.39 0.41 0.66 0.66 0.44 0.46 0.45 0.46
0.74 0.77 0.77 0.75 0.89 0.96 0.99 0.9 0.91 1.0 0.84 0.7 0.39 0.43 0.58 0.69 0.5 0.46 0.56 0.65 0.04 0.27 0.47 0.41 0.08 0.47 0.66 0.64 0.54 0.64 0.57 0.61
0.25 0.24 0.42 0.6 0.71 0.87 0.95 0.86 0.85 0.55 0.51 0.37 0.08 0.08 0.78 0.08 0.57 0.21 0.15 0.72 0.21 0.62 0.1 0.07 0.2 0.13 0.8 1.0 0.46 0.43 0.19 0.11

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)