Heatmap: Cluster_188 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo105225	0.52	0.08	-0.21	-0.2	-0.24	-0.27	-0.35	-0.05	0.07	0.15	0.35	0.42	0.56	0.24	-0.17	0.5	-0.26	-0.42	0.53	-2.16	-1.93	-3.07	0.49	0.73	-0.74	0.58	-0.29	-0.35	-0.04	0.02	0.05	0.27
Smo105994	0.07	-0.24	-0.07	0.06	0.34	0.4	-0.11	0.14	0.41	0.12	-0.27	-0.08	1.02	-0.51	-1.09	1.08	-0.76	-0.32	0.58	-	-	-	0.96	1.09	-3.32	0.2	-0.48	-0.3	0.38	0.19	-0.37	0.04
Smo110385	0.15	0.09	0.04	0.2	0.16	-0.11	-0.18	-0.03	0.09	-0.01	-0.07	-0.13	0.87	0.5	0.22	0.73	-0.13	-0.55	0.64	-3.46	-	-8.94	0.18	0.1	-3.34	0.31	0.37	0.43	0.09	0.2	-0.05	0.2
Smo113760	-0.67	-0.48	-0.21	-0.07	0.07	-0.01	0.04	0.19	0.44	0.14	0.25	-0.31	0.61	0.49	0.39	0.66	0.09	-0.03	0.01	-4.83	-4.58	-2.3	0.51	0.74	-2.46	0.54	0.0	0.33	0.27	0.27	-0.24	-0.38
Smo113891	0.2	0.41	0.34	0.4	0.36	0.36	0.05	0.15	0.22	0.32	0.17	0.29	0.47	0.02	-0.51	0.6	-0.27	-0.84	0.3	-2.02	-1.82	-4.2	0.11	0.19	0.09	-0.17	-0.27	-0.09	-0.19	-0.12	-0.07	-0.06
Smo115394	-0.11	-0.03	0.06	0.17	-0.04	-0.15	-0.27	-0.2	0.09	0.29	0.11	-0.02	0.62	0.54	-0.89	1.06	-0.27	-0.8	0.24	-10.07	-9.62	-	0.3	0.18	-4.77	0.72	0.39	0.56	0.41	0.31	0.3	0.2
Smo116556	-0.06	-0.16	-0.08	-0.02	0.14	0.07	0.04	0.19	0.18	0.29	0.39	-0.01	0.59	0.29	-0.32	0.84	-0.67	-0.44	1.08	-6.42	-0.68	-0.98	-0.13	0.19	-0.79	0.88	-0.27	-0.13	-0.28	-0.25	-0.63	-0.38
Smo117111	0.15	0.49	0.26	0.12	-0.79	0.0	-0.33	0.03	-0.05	0.44	0.5	0.36	0.68	-0.87	0.04	1.2	0.22	0.28	0.58	-	-	-	0.39	0.49	-2.19	-0.03	-0.41	-0.69	0.51	0.36	-0.6	-0.36
Smo126194	0.16	0.12	0.05	0.23	0.4	0.36	0.08	0.06	0.08	0.32	0.1	0.01	0.68	-0.2	-0.07	0.86	-0.1	-0.3	0.63	-	-3.44	-3.38	0.29	0.4	-2.78	-0.19	0.12	-0.05	0.21	0.25	-0.2	-0.09
Smo126820	0.33	0.17	-0.22	0.0	-0.08	-0.24	-0.52	-0.36	0.13	0.16	0.25	0.3	0.97	0.13	-0.33	1.15	-0.46	-0.85	0.68	-7.75	-1.2	-5.44	0.35	0.67	-2.51	0.55	-1.0	-0.97	-0.03	0.05	0.45	0.62
Smo127483	-0.02	0.25	0.16	0.22	0.2	0.05	-0.0	0.19	0.23	0.31	0.15	0.34	0.39	0.44	-0.39	0.67	-0.27	-0.45	0.51	-2.83	-3.47	-2.87	0.24	0.24	-1.63	0.27	0.06	-0.07	0.02	-0.02	0.06	0.17
Smo131200	-0.34	-0.62	-0.59	-0.16	-0.05	-0.15	-0.38	0.12	0.36	0.37	0.15	-0.07	1.45	0.34	-0.06	0.64	-0.46	-0.5	-0.18	-2.71	-1.67	-2.84	0.84	1.01	-0.09	0.2	-0.39	-0.48	-0.02	-0.1	-0.26	0.08
Smo134275	-0.12	-0.06	-0.14	-0.11	-0.3	-0.34	0.14	-0.03	0.54	0.37	0.7	0.46	0.65	-0.44	-1.03	1.61	0.47	-0.39	0.78	-1.76	-2.12	-4.11	-0.35	-0.27	-2.47	0.19	-0.57	0.07	0.29	0.57	-0.59	-0.98
Smo142303	0.29	0.14	0.14	0.1	0.24	0.26	0.28	0.28	0.13	0.3	0.16	0.04	0.47	0.12	-0.3	0.72	-0.14	-0.34	0.49	-8.87	-9.16	-6.16	0.14	0.25	-4.93	0.27	0.13	0.19	0.2	0.3	0.0	0.04
Smo150151	-0.07	-0.16	-0.16	-0.23	-0.15	-0.34	-0.32	0.28	0.4	0.43	0.22	0.06	0.85	0.01	-2.54	0.82	-0.51	-0.69	1.07	-2.29	-0.44	-2.44	-0.08	0.18	-0.58	0.87	-0.2	-0.37	0.26	0.17	0.01	-0.04
Smo158887	0.56	-0.16	-0.21	-0.5	-0.47	-0.66	-0.14	-0.23	0.05	0.12	0.22	0.29	0.51	-0.02	-0.14	1.31	-0.17	0.2	0.89	-4.38	-2.62	-2.19	-0.1	0.05	-3.35	0.77	-0.92	-1.02	0.84	0.79	0.22	-0.21
Smo16064	0.41	0.47	0.5	0.34	0.51	0.34	0.18	0.18	-0.13	0.47	0.1	0.03	0.47	-0.08	-0.14	0.55	-0.04	-0.44	0.56	-	-	-	0.14	-0.02	-	-0.27	0.13	0.37	-0.03	-0.11	0.04	0.17
Smo171139	0.38	-0.32	-0.37	-0.13	0.05	-0.15	0.04	0.03	0.01	0.04	0.24	0.18	0.41	-0.35	0.15	0.97	-0.59	-0.9	0.55	-3.25	-3.75	-2.49	-0.15	0.28	-1.63	1.37	0.44	0.34	-0.14	-0.28	0.2	0.2
Smo174648	0.65	0.03	-0.27	-0.2	-0.06	-0.46	-0.63	-0.01	0.25	0.56	0.4	0.47	0.98	0.61	-1.54	0.82	-0.96	-0.79	0.97	-	-0.31	-6.3	-0.06	0.1	-1.36	1.08	-0.44	-0.75	-0.26	-0.58	0.18	0.07
Smo181239	0.29	-0.0	-0.06	0.11	0.19	0.25	-0.02	0.3	0.28	0.26	0.2	0.21	0.32	-0.31	-0.07	0.52	-0.47	-0.58	-0.29	-0.92	-1.34	-2.07	0.41	0.54	-1.11	0.08	0.03	0.04	-0.03	0.04	0.09	0.3
Smo183439	-0.07	-0.12	-0.09	0.04	0.07	0.04	-0.04	0.3	0.28	0.3	0.13	-0.0	0.33	0.4	0.18	0.63	-0.74	-0.66	0.39	-2.25	-0.42	-1.94	0.16	0.22	-0.62	0.78	0.07	-0.06	-0.31	-0.31	-0.01	0.07
Smo232261	0.25	0.35	0.38	0.04	0.22	0.18	0.17	0.18	0.15	0.16	0.12	-0.03	0.88	0.06	0.01	0.8	0.05	0.01	0.73	-4.38	-5.65	-	0.22	0.12	-4.33	-0.5	-0.31	-0.49	0.3	0.14	0.1	0.05
Smo232993	0.17	-0.15	-0.06	-0.31	0.07	-0.05	-0.32	-0.21	-0.01	-0.11	0.13	-0.15	0.68	0.02	-0.29	0.91	-0.24	-0.79	0.46	-9.87	-1.09	-3.88	0.19	0.37	-1.19	1.01	0.33	0.59	0.1	0.14	0.1	0.11
Smo234182	-0.02	-0.25	-0.1	-0.28	-0.27	-0.43	-0.29	0.13	0.09	0.26	0.21	-0.04	1.16	0.45	-1.59	1.17	-0.48	-1.03	0.63	-	-8.48	-3.18	0.5	0.63	-4.87	0.88	-0.19	-0.14	0.38	0.31	0.24	0.19
Smo24191	0.15	-0.04	-0.2	-0.08	0.05	-0.01	-0.22	0.34	0.11	0.37	0.03	0.18	0.89	0.21	0.09	0.83	-0.4	-0.55	0.28	-5.28	-4.03	-1.75	0.03	0.35	-1.76	0.71	0.07	0.25	-0.01	-0.05	0.02	0.12
Smo25489	0.41	0.33	0.17	-0.15	0.45	-0.18	-0.2	0.17	-0.19	0.27	-0.15	-0.05	0.84	0.17	-0.31	0.91	0.01	0.04	0.53	-3.48	-1.63	-2.91	-0.01	0.43	-3.13	0.18	-0.25	-0.32	0.05	0.08	0.2	0.12
Smo266879	-0.13	0.02	0.01	0.08	0.02	0.04	-0.2	0.16	0.21	0.19	0.27	0.04	0.51	-0.48	-0.82	0.74	-0.31	-0.48	0.47	-4.05	-1.57	-2.63	0.32	0.38	-0.76	0.57	0.21	0.23	0.0	-0.03	0.18	0.64
Smo270230	0.12	0.02	-0.06	-0.21	-0.12	-0.16	-0.18	-0.0	0.03	0.32	0.41	0.19	0.5	-0.66	-1.37	0.75	-0.69	-0.22	0.59	-1.1	-1.39	-4.23	0.19	0.31	-0.53	0.74	0.28	0.35	0.03	0.01	0.25	0.24
Smo35059	-0.02	-0.01	0.02	-0.14	-0.14	0.01	-0.08	0.04	-0.01	0.13	0.14	0.01	0.78	0.09	-0.43	0.75	-0.28	-0.47	0.46	-	-	-	0.32	0.63	-3.35	0.75	0.61	0.67	-0.14	-0.05	0.02	0.37
Smo35606	-0.15	-0.19	-0.1	-0.17	-0.14	-0.1	-0.2	0.09	0.11	0.16	0.17	0.12	0.86	-0.01	-0.2	0.98	-0.54	-0.4	0.38	-7.45	-5.43	-9.62	0.71	0.89	-3.56	0.89	-0.08	-0.13	0.02	0.02	0.2	0.39
Smo39145	-0.54	-0.4	-0.5	-0.36	-0.35	-0.51	-0.47	-0.32	-0.21	0.04	-0.23	-0.2	1.13	-0.3	-1.27	1.04	-0.4	-0.14	0.69	-4.51	-5.59	-	0.21	0.08	-5.25	0.98	0.92	0.94	0.46	0.4	0.55	0.52
Smo403735	0.29	0.63	-0.03	-0.2	-0.01	-0.61	-0.13	0.65	0.48	0.23	0.45	0.14	1.17	-0.47	0.03	1.31	-0.87	-2.14	-0.09	-	-	-	0.07	0.71	-1.06	0.81	-0.24	0.49	-0.44	-0.37	-0.49	-0.65
Smo408336	-0.39	-0.42	0.11	-0.08	-0.31	-0.39	0.0	0.31	0.29	0.07	-0.02	-0.26	1.06	0.26	-0.23	0.53	-0.08	-0.7	0.35	-	-6.34	-	0.46	0.75	-1.87	0.91	0.62	0.12	-0.12	0.12	0.19	0.2
Smo409751	-0.05	0.17	-0.08	0.02	0.08	-0.03	-0.19	0.09	0.32	0.39	0.32	0.07	0.52	-0.26	-0.5	1.09	0.33	0.58	0.74	-2.29	-3.61	-1.88	-0.4	-0.23	-3.29	0.76	-0.6	-0.34	0.16	0.15	-0.0	-0.05
Smo417958	0.41	0.73	0.53	-0.01	-0.77	0.15	0.11	0.29	0.57	0.14	-0.27	0.56	1.12	-0.58	-1.99	1.46	-1.5	-0.41	0.21	-2.74	-4.04	-	1.11	0.95	-	-0.08	-1.35	0.08	-0.38	0.44	-1.4	-1.37
Smo422394	0.07	-0.04	0.01	0.11	0.14	0.03	0.0	0.15	0.33	0.33	0.29	0.0	0.44	-0.15	-0.36	0.41	-0.23	-0.51	0.33	-2.88	-1.64	-4.67	0.15	0.18	-1.0	0.59	0.47	0.45	-0.17	-0.14	0.21	0.36
Smo430940	0.31	0.02	0.04	0.08	-0.1	0.06	0.05	0.14	0.27	0.39	0.35	0.21	0.38	-0.06	-0.12	0.5	0.04	0.02	0.56	-2.66	-1.44	-1.8	0.33	0.33	-2.17	0.36	-0.45	-0.18	0.01	0.13	-0.03	-0.05
Smo437329	0.16	-0.04	-0.07	-0.01	0.14	0.01	0.06	0.09	0.08	0.24	0.15	-0.01	0.2	0.21	-0.08	0.37	-0.47	-0.82	0.41	-3.13	-0.88	-1.49	0.15	0.33	-0.01	0.63	0.48	0.34	-0.41	-0.36	-0.03	0.19
Smo437629	0.2	0.43	0.31	0.22	0.18	0.32	0.28	-0.02	-0.11	-0.09	-0.19	-0.15	0.83	0.5	-0.83	1.51	-0.2	-0.22	0.87	-7.47	-6.05	-7.41	0.3	0.6	-4.05	0.22	-0.43	-0.23	0.0	0.1	-0.85	-1.06
Smo442028	0.32	0.6	0.47	0.48	0.39	0.37	0.08	0.08	0.28	0.34	0.2	0.31	0.54	0.3	-0.58	0.68	-0.35	-0.75	0.58	-4.26	-2.69	-5.91	0.02	0.05	-2.38	0.29	-0.07	0.12	-0.16	-0.1	-0.42	-0.43
Smo442173	0.14	0.29	0.05	0.17	0.21	0.28	0.06	0.22	0.37	0.4	0.18	0.23	0.13	-0.46	-0.54	0.24	-0.23	-0.31	0.33	-2.44	-0.95	-2.18	0.1	0.21	-0.29	0.32	0.18	0.15	-0.16	-0.11	-0.0	0.19
Smo444689	0.1	0.05	0.11	0.12	0.22	0.31	0.06	-0.2	0.0	0.11	0.12	-0.19	0.44	-0.12	0.62	0.21	0.0	0.13	0.78	-6.33	-1.27	-	0.45	0.58	-4.15	0.21	-0.1	-0.13	-0.25	-0.01	0.16	0.34
Smo55595	0.26	-0.12	-0.09	-0.11	0.07	-0.08	-0.15	-0.04	0.16	0.36	0.45	0.33	0.71	-0.46	-0.53	0.98	0.05	-0.23	0.53	-5.05	-1.95	-2.29	0.22	0.39	-1.51	0.37	-0.65	-0.52	0.48	0.6	-0.09	-0.04
Smo57044	-0.02	-0.2	-0.1	-0.23	-0.17	-0.13	-0.2	0.16	0.24	0.27	0.09	0.15	1.19	-0.08	-0.01	1.19	-0.6	-0.17	0.16	-6.27	-2.2	-4.46	0.47	0.7	-1.12	0.28	-0.4	-0.5	-0.03	0.12	0.16	0.3
Smo57713	0.08	-0.1	-0.23	0.18	-0.15	0.38	0.4	0.55	0.52	0.5	0.36	0.23	0.45	-0.58	-0.4	0.75	-0.03	-0.04	0.42	-3.61	-1.99	-4.59	0.16	0.18	-0.94	0.31	-0.83	-0.48	0.2	0.23	-0.07	0.03
Smo57817	0.14	0.1	0.05	-0.23	0.13	-0.0	0.1	-0.14	-0.12	0.09	-0.16	-0.12	0.59	-0.63	-0.75	1.09	-0.04	0.12	1.06	-	-7.3	-	0.59	0.42	-2.96	0.84	-0.1	-0.03	0.21	0.17	0.16	-0.06
Smo6338	-0.35	-0.02	-0.1	-0.15	0.01	-0.42	-0.02	-0.24	-0.16	-0.19	-0.2	-0.61	0.3	0.36	-0.11	0.76	-0.04	-0.05	0.35	-4.51	-	-5.63	0.77	0.76	-4.93	0.53	0.5	0.78	0.48	0.53	0.26	0.08
Smo64559	0.41	0.25	0.32	0.15	0.37	-0.06	-0.21	-0.18	0.14	0.18	0.16	-0.13	0.56	-0.0	-0.14	0.77	-0.44	-0.59	1.02	-	-3.72	-	0.32	0.53	-2.21	0.83	-0.07	-0.09	0.01	0.03	-0.39	-0.17
Smo6590	0.39	0.05	-0.06	-0.03	-0.25	-0.2	-0.05	-0.08	0.17	-0.16	0.07	0.24	0.73	-1.07	-1.08	0.98	0.4	0.69	0.51	-4.44	-3.11	-3.91	0.2	0.1	-3.17	0.63	-0.33	-0.25	0.42	0.28	0.4	0.35
Smo73721	0.08	-0.14	-0.19	-0.1	-0.02	-0.09	-0.17	0.1	0.17	-0.03	0.04	-0.13	0.45	0.14	-0.56	0.78	-0.41	-0.65	0.55	-1.37	0.13	-2.36	0.15	0.4	-0.93	0.79	0.33	0.29	0.11	0.01	-0.13	-0.41
Smo74346	0.32	0.33	0.28	0.21	0.2	0.14	0.15	0.25	0.08	0.39	0.32	0.17	0.44	0.11	-0.3	0.54	-0.23	-0.44	0.38	-1.85	-1.86	-6.25	-0.04	-0.08	-1.83	0.33	0.14	0.15	0.02	0.21	-0.14	-0.1
Smo80130	0.38	0.24	-0.03	-0.05	0.48	0.25	0.1	0.3	0.3	0.49	0.33	0.03	0.93	0.02	-0.74	0.85	-0.87	-0.8	0.3	-2.6	-1.2	-5.83	0.42	0.62	-1.48	0.34	-0.08	-0.13	-0.5	-0.66	-0.22	-0.08
Smo9008	0.22	0.18	0.07	-0.01	-0.1	-0.09	-0.01	0.06	0.32	0.15	0.55	0.07	0.16	-1.22	-1.23	0.57	-0.19	0.51	0.63	-	-	-	0.25	0.03	-	1.13	0.65	0.68	0.21	-0.02	-0.09	-0.12
Smo93690	-0.56	-0.59	-0.89	-0.76	-1.14	-0.32	-0.41	-0.27	-0.34	-1.07	0.04	-0.54	1.01	-0.27	-0.6	0.85	0.36	-0.19	0.38	-1.7	-	-	0.4	0.11	-	0.78	1.46	1.16	0.38	0.36	0.23	0.82
Smo96486	0.11	-0.08	-0.18	-0.17	-0.05	-0.03	-0.31	-0.3	-0.31	0.04	-0.11	-0.11	0.78	0.16	0.02	0.97	0.07	0.17	0.86	-	-	-6.42	0.46	0.64	-5.37	0.81	0.1	0.03	0.2	0.18	0.03	0.0
Smo97180	0.19	0.17	0.15	0.3	0.14	0.14	-0.0	0.35	-0.0	0.2	0.02	-0.09	0.43	0.53	-0.27	0.69	0.03	-0.18	0.61	-8.48	-1.39	-6.12	0.38	0.31	-1.27	-0.23	-0.01	0.09	0.12	0.15	-0.2	-0.27
Smo99313	0.19	-0.03	0.03	0.02	0.05	0.09	-0.01	0.21	0.24	0.3	0.11	0.15	0.45	-0.05	-0.81	0.48	-0.21	-0.46	0.48	-5.37	-0.6	-4.15	0.14	0.22	-0.46	0.61	0.11	0.29	-0.01	0.08	0.07	0.08
Smo99428	-0.17	-0.21	-0.26	-0.13	-0.18	-0.19	-0.12	0.06	0.28	0.35	0.3	0.19	0.84	0.32	-0.17	1.13	-0.17	-1.29	0.52	-4.32	-3.86	-2.23	0.23	0.34	-0.86	0.84	-0.38	-0.23	0.36	0.4	-0.31	-0.1
Smo99579	0.3	0.31	-0.23	-0.02	-0.13	-0.06	-0.32	-0.17	0.13	0.34	0.15	0.13	0.73	-0.23	-0.63	1.04	-0.09	0.36	0.6	-	-	-	0.21	0.42	-1.76	0.23	-0.05	-0.32	-0.02	0.25	0.38	0.51
Smo99677	0.34	0.37	0.23	0.2	0.12	0.27	-0.07	0.12	0.24	0.23	0.13	0.09	0.73	0.05	-0.5	0.85	-0.38	-0.53	0.35	-3.71	-0.44	-5.18	0.13	0.3	-0.42	-0.06	-0.26	-0.3	-0.26	-0.06	0.03	0.02

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.