Heatmap: Cluster_71 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.19 0.08 0.21 0.5 0.13 1.19 1.86 1.39 0.55 1.23 0.48 0.19 0.02 0.03 0.44 0.07 0.4 0.36 0.14 0.0 0.0 0.0 0.25 0.06 0.24 0.28 3.4 2.3 0.37 0.58 0.16 0.21
0.03 0.0 0.0 0.06 0.0 0.15 0.24 0.0 0.05 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.09 0.08 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.01 0.0 0.02 0.02 0.03 0.03 0.0 0.0 0.02 0.04 0.04 0.07 0.03 0.02 0.0 0.07 0.03 0.07 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.05 0.67 0.37 0.02 0.0 0.05 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.16 0.06 0.12 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.09 0.02 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.13 0.01 0.01 0.0 0.0
0.11 0.0 0.1 1.3 0.27 0.14 0.21 0.0 0.0 0.37 0.11 0.35 2.45 0.31 2.39 2.02 2.54 1.83 0.0 1.34 0.0 0.19 1.36 0.56 0.0 3.92 7.13 0.0 4.74 4.19 0.0 1.51
0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.03 0.13 0.02 0.07 0.03 0.14 0.03 0.06 0.07 0.03 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.13 0.24 0.44 0.0 0.0 0.03 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.06 0.12 0.02 0.02 0.02 0.02
3.37 5.47 6.93 4.62 5.58 6.96 9.87 4.46 5.46 5.92 3.33 3.69 0.1 0.0 0.0 0.05 29.28 19.1 4.93 0.0 0.0 0.0 2.32 0.79 0.0 7.61 51.34 44.58 9.48 12.02 11.14 11.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.2 0.19 0.25 0.0 0.13 0.0 0.0 0.04
0.98 1.11 0.9 1.36 2.52 2.06 2.97 2.63 2.62 2.73 0.99 1.48 0.86 0.82 0.12 0.82 1.42 1.6 4.93 1.91 0.46 0.54 2.32 3.93 2.18 4.14 12.78 9.37 2.52 2.71 1.96 1.73
0.53 0.32 0.71 0.88 0.92 1.24 1.57 1.9 1.13 1.02 0.41 0.46 1.0 0.63 1.53 1.41 1.67 1.47 1.67 0.21 0.25 0.1 1.09 0.65 0.85 2.06 5.97 4.56 1.25 0.95 0.36 0.32
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.11 0.19 0.08 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.02 0.04 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.08 0.04 0.21 0.0 0.09 0.12 0.12 0.04
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.35 1.55 0.65 0.66 0.86 1.13 0.81 0.64 1.04 0.75 0.17 0.58 0.57 1.5 2.02 10.13 0.74 1.43 4.65 0.0 0.65 0.0 0.35 0.28 0.25 7.86 10.55 18.47 1.67 2.15 0.57 0.81
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.12 0.06 0.17 0.1 0.11 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.13 0.59 0.41 0.03 0.03 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.39 0.07 0.26 0.13 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.46 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.72 0.66 0.41 0.16 0.16 0.08 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.39 0.12 0.0 0.26 1.56 0.34 0.71 0.46 0.39 0.0 0.27 0.0 0.0 0.07 0.06 0.12 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.15 0.31 0.77 0.45 2.99 3.29 0.22 0.3 0.14 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.05 0.01 0.01 0.08 0.01 0.02 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.24 0.07 0.05 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 0.24 0.1 0.88 0.66 1.24 1.28 0.2 0.2 0.0 0.43 0.48 0.0 0.12 0.16 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 1.09 0.0 0.0 2.41 0.64 2.93 1.86 0.12 0.0 0.0 0.0
0.03 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.08 0.0 0.0 0.09 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.08 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.1 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.2 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.05 0.21 0.1 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 0.0 0.08 0.03 0.0 0.03
0.31 0.21 0.18 0.21 0.19 0.61 0.48 0.03 0.1 0.03 0.23 0.11 0.0 0.0 0.22 0.16 0.08 0.24 0.44 0.0 0.08 0.0 0.03 0.09 0.0 0.4 0.96 0.38 0.11 0.0 0.06 0.04
0.12 0.04 0.04 0.17 0.44 0.31 0.1 0.11 0.04 1.0 0.1 0.1 0.18 0.33 0.91 0.4 0.29 0.37 0.78 0.12 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.22 2.38 1.1 0.0 0.05 0.13 0.09
0.11 0.5 0.12 0.54 0.2 0.46 0.21 0.33 0.38 0.19 0.26 0.15 0.36 0.11 0.31 0.09 0.1 0.06 0.16 0.0 0.0 0.0 0.1 0.02 0.07 0.15 0.29 0.63 0.14 0.13 0.05 0.02
3.5 4.25 3.54 2.15 3.17 3.58 4.26 2.36 3.63 2.94 2.54 2.73 0.0 0.08 0.08 0.05 12.1 2.72 0.16 0.68 0.86 2.08 0.16 0.0 0.34 2.52 16.76 17.29 6.11 6.01 1.23 0.71
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.27 0.16 0.03 0.0 0.03 0.03
0.08 0.1 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.11 0.0 0.0 0.0 0.12 0.11 0.25 0.12 0.16 0.0 0.11 0.0 0.0 0.05
0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.0 0.08 0.0 0.04 0.01 0.07 0.01 0.07 0.02 0.18 0.05 0.26 0.13 0.53 0.0 0.04 0.26 0.21 0.03 0.28 0.18 0.52 0.14 0.2 0.21 0.09 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.03 0.0 0.0 0.12 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.37 0.04 0.0 0.29 0.26 0.66 0.19 0.04 0.16 0.04 0.04
0.23 0.85 0.34 0.7 0.61 0.56 0.44 0.39 0.31 0.57 0.09 0.44 0.0 0.05 0.51 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.11 1.6 1.21 0.0 0.0 0.04 0.03
0.14 0.05 0.13 0.28 0.0 0.0 0.0 0.09 0.1 0.05 0.1 0.15 0.06 0.43 0.17 0.06 0.33 0.15 0.55 0.0 0.0 0.52 0.28 0.27 0.88 0.24 0.74 0.0 0.1 0.22 0.27 0.42
17.38 19.24 20.17 20.84 22.48 23.27 25.15 24.81 18.27 13.96 12.23 16.02 16.74 8.17 9.86 11.0 23.03 20.23 16.06 23.4 0.0 0.0 15.89 11.43 0.66 20.99 55.45 48.4 21.28 24.72 17.71 13.81
0.03 0.03 0.0 0.0 0.1 0.0 0.09 0.0 0.12 0.04 0.03 0.0 0.0 0.03 0.15 0.15 0.03 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.13 0.03 0.38 0.13 0.44 0.95 0.03 0.21 0.16 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.02 0.05 0.08 0.0 0.04 0.02 0.19 0.35 0.24 0.14 0.22 0.02 0.03 0.09 0.0 0.07 0.2 0.82 0.0 0.0 0.0 0.1 0.12 0.31 0.41 0.49 1.0 0.1 0.1 0.08 0.06
0.06 0.02 0.12 0.0 0.18 0.45 0.88 0.62 0.29 0.4 0.35 0.17 0.0 0.05 0.1 0.0 0.24 0.12 0.46 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.09 2.44 2.28 0.41 0.13 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.03 0.09 0.04 0.09 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.3 0.02 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
0.34 0.0 0.31 0.06 0.03 0.25 0.27 0.47 0.62 0.25 0.21 0.24 0.12 0.08 0.39 0.17 0.6 0.59 0.34 0.79 0.0 0.31 0.53 0.32 0.97 0.45 2.34 2.58 0.81 0.82 0.72 0.47
0.75 0.04 0.37 0.45 0.15 1.57 1.71 1.36 1.34 0.7 0.51 0.44 0.0 0.05 0.2 4.72 0.94 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.21 0.19 0.61 0.45 5.92 4.75 1.47 2.36 0.58 0.37
0.03 0.0 0.03 0.03 0.12 0.2 0.06 0.11 0.02 0.06 0.0 0.07 0.0 0.0 0.03 0.0 0.07 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.26 0.54 0.27 0.02 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.07 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 0.02 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.05 0.01 0.01 0.03 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.08 0.44 0.32 0.08 0.3 0.08 0.0 0.11 0.06 0.5 0.43 0.86 0.83 0.0 0.0 0.0 0.09 0.17 0.39 0.76 4.83 2.19 1.26 0.77 0.6 0.16
0.94 0.37 0.22 0.63 0.0 5.17 7.54 5.38 2.39 4.1 0.77 1.1 0.0 0.0 0.58 0.0 0.92 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.45 0.65 3.03 0.0 23.96 3.53 0.24 0.77 0.8 0.0
0.83 0.69 0.29 1.0 0.56 0.69 2.69 2.26 1.33 0.77 1.32 0.72 0.17 0.0 0.49 0.1 1.24 1.13 0.54 0.0 0.0 0.0 0.54 0.62 0.0 1.69 5.42 4.12 0.63 1.75 0.59 0.56
0.28 0.0 0.08 0.21 0.11 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.12 0.41 0.31 0.09 0.74 0.18 0.0 0.35 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 1.18 0.0 0.0 0.2 0.3 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.62 0.0 0.11 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)