Heatmap: Cluster_71 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.06 0.02 0.06 0.15 0.04 0.35 0.55 0.41 0.16 0.36 0.14 0.06 0.01 0.01 0.13 0.02 0.12 0.11 0.04 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.07 0.08 1.0 0.68 0.11 0.17 0.05 0.06
0.07 0.0 0.0 0.12 0.0 0.31 0.49 0.0 0.09 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.17 0.14 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0
0.01 0.0 0.02 0.02 0.03 0.03 0.0 0.0 0.02 0.05 0.05 0.08 0.03 0.02 0.0 0.07 0.03 0.08 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.06 0.74 0.41 0.03 0.0 0.06 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.32 0.12 0.23 0.14 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.1 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.1 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 1.0 0.21 0.0 0.0 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.08 0.26 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 1.0 0.11 0.11 0.0 0.0
0.02 0.0 0.01 0.18 0.04 0.02 0.03 0.0 0.0 0.05 0.02 0.05 0.34 0.04 0.34 0.28 0.36 0.26 0.0 0.19 0.0 0.03 0.19 0.08 0.0 0.55 1.0 0.0 0.66 0.59 0.0 0.21
0.09 0.06 0.0 0.0 0.0 0.15 0.06 0.06 0.29 0.05 0.15 0.06 0.31 0.06 0.13 0.16 0.07 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.3 0.54 1.0 0.0 0.0 0.07 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.4 0.45 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.41 0.54 1.0 0.21 0.21 0.2 0.19
0.07 0.11 0.14 0.09 0.11 0.14 0.19 0.09 0.11 0.12 0.06 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.37 0.1 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.15 1.0 0.87 0.18 0.23 0.22 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.57 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.36 0.0 0.01 0.0 0.31 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.15 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.78 0.75 1.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.17
0.08 0.09 0.07 0.11 0.2 0.16 0.23 0.21 0.2 0.21 0.08 0.12 0.07 0.06 0.01 0.06 0.11 0.13 0.39 0.15 0.04 0.04 0.18 0.31 0.17 0.32 1.0 0.73 0.2 0.21 0.15 0.14
0.09 0.05 0.12 0.15 0.15 0.21 0.26 0.32 0.19 0.17 0.07 0.08 0.17 0.1 0.26 0.24 0.28 0.25 0.28 0.04 0.04 0.02 0.18 0.11 0.14 0.35 1.0 0.77 0.21 0.16 0.06 0.05
0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.52 0.92 0.37 0.0 0.18 0.0 0.0 0.06 0.12 0.21 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.11 0.31 0.39 0.2 1.0 0.0 0.46 0.58 0.56 0.18
0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 1.0 0.0 0.22 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.08 0.04 0.04 0.05 0.06 0.04 0.03 0.06 0.04 0.01 0.03 0.03 0.08 0.11 0.55 0.04 0.08 0.25 0.0 0.04 0.0 0.02 0.02 0.01 0.43 0.57 1.0 0.09 0.12 0.03 0.04
0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.21 0.09 0.29 0.18 0.18 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.05 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.21 1.0 0.69 0.05 0.05 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.55 0.09 0.37 0.18 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.64 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 1.0 0.92 0.56 0.23 0.22 0.11 0.11
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.14 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.12 0.04 0.0 0.08 0.47 0.1 0.22 0.14 0.12 0.0 0.08 0.0 0.0 0.02 0.02 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.1 0.24 0.14 0.91 1.0 0.07 0.09 0.04 0.0
0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.2 0.05 0.05 0.32 0.06 0.07 0.0 0.08 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.14 1.0 0.3 0.19 0.0 0.0 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.08 0.03 0.3 0.23 0.43 0.44 0.07 0.07 0.0 0.15 0.17 0.0 0.04 0.06 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.82 0.22 1.0 0.63 0.04 0.0 0.0 0.0
0.13 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.37 0.0 0.0 0.38 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.34 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.21 0.72 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.17 0.74 0.36 0.0
0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.93 0.0 1.0 0.35 0.0 0.33
0.32 0.22 0.19 0.22 0.2 0.64 0.51 0.03 0.1 0.03 0.24 0.12 0.0 0.0 0.23 0.16 0.08 0.25 0.46 0.0 0.08 0.0 0.03 0.09 0.0 0.42 1.0 0.4 0.12 0.0 0.06 0.04
0.05 0.02 0.02 0.07 0.19 0.13 0.04 0.05 0.02 0.42 0.04 0.04 0.08 0.14 0.38 0.17 0.12 0.16 0.33 0.05 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.09 1.0 0.46 0.0 0.02 0.06 0.04
0.18 0.79 0.19 0.86 0.32 0.73 0.34 0.53 0.6 0.3 0.42 0.24 0.57 0.18 0.5 0.15 0.16 0.09 0.26 0.0 0.0 0.0 0.16 0.02 0.1 0.24 0.46 1.0 0.22 0.21 0.08 0.02
0.2 0.25 0.2 0.12 0.18 0.21 0.25 0.14 0.21 0.17 0.15 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.16 0.01 0.04 0.05 0.12 0.01 0.0 0.02 0.15 0.97 1.0 0.35 0.35 0.07 0.04
0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 1.0 0.59 0.12 0.0 0.12 0.12
0.33 0.41 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.45 0.0 0.0 0.0 0.47 0.46 1.0 0.48 0.64 0.0 0.44 0.0 0.0 0.22
0.01 0.02 0.06 0.0 0.03 0.0 0.15 0.0 0.07 0.02 0.12 0.03 0.12 0.03 0.35 0.1 0.5 0.25 1.0 0.0 0.07 0.5 0.39 0.05 0.52 0.34 0.99 0.26 0.38 0.39 0.16 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.05 0.0 0.0 0.19 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.56 0.06 0.0 0.44 0.4 1.0 0.3 0.06 0.25 0.06 0.06
0.14 0.53 0.21 0.44 0.38 0.35 0.27 0.24 0.19 0.36 0.05 0.28 0.0 0.03 0.32 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.07 1.0 0.75 0.0 0.0 0.02 0.02
0.16 0.06 0.15 0.32 0.0 0.0 0.0 0.1 0.11 0.05 0.12 0.17 0.07 0.49 0.2 0.07 0.38 0.18 0.62 0.0 0.0 0.59 0.32 0.31 1.0 0.27 0.84 0.0 0.12 0.25 0.31 0.48
0.31 0.35 0.36 0.38 0.41 0.42 0.45 0.45 0.33 0.25 0.22 0.29 0.3 0.15 0.18 0.2 0.42 0.36 0.29 0.42 0.0 0.0 0.29 0.21 0.01 0.38 1.0 0.87 0.38 0.45 0.32 0.25
0.03 0.03 0.0 0.0 0.11 0.0 0.09 0.0 0.12 0.05 0.03 0.0 0.0 0.03 0.15 0.16 0.03 0.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.13 0.04 0.39 0.14 0.46 1.0 0.03 0.22 0.17 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.02 0.05 0.08 0.0 0.04 0.02 0.19 0.35 0.24 0.14 0.22 0.02 0.03 0.09 0.0 0.07 0.2 0.82 0.0 0.0 0.0 0.1 0.12 0.31 0.41 0.49 1.0 0.1 0.1 0.08 0.06
0.03 0.01 0.05 0.0 0.08 0.19 0.36 0.26 0.12 0.17 0.14 0.07 0.0 0.02 0.04 0.0 0.1 0.05 0.19 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.04 1.0 0.94 0.17 0.05 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.06 0.09 0.3 0.13 0.32 0.0 0.07 0.0 0.0 0.08 0.12 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 1.0 0.08 0.08 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.37 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0
0.13 0.0 0.12 0.02 0.01 0.1 0.1 0.18 0.24 0.1 0.08 0.09 0.05 0.03 0.15 0.06 0.23 0.23 0.13 0.3 0.0 0.12 0.2 0.12 0.38 0.17 0.91 1.0 0.31 0.32 0.28 0.18
0.13 0.01 0.06 0.08 0.02 0.27 0.29 0.23 0.23 0.12 0.09 0.07 0.0 0.01 0.03 0.8 0.16 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.1 0.08 1.0 0.8 0.25 0.4 0.1 0.06
0.05 0.0 0.06 0.05 0.22 0.37 0.12 0.21 0.04 0.11 0.0 0.13 0.0 0.0 0.06 0.0 0.12 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.16 0.48 1.0 0.5 0.04 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.18 0.18 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.33 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0
0.07 0.06 0.1 0.0 0.2 0.0 0.06 0.0 0.1 0.2 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.3 0.06 0.07 0.17 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.09 0.07 0.02 0.06 0.02 0.0 0.02 0.01 0.1 0.09 0.18 0.17 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.08 0.16 1.0 0.45 0.26 0.16 0.12 0.03
0.04 0.02 0.01 0.03 0.0 0.22 0.31 0.22 0.1 0.17 0.03 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.13 0.0 1.0 0.15 0.01 0.03 0.03 0.0
0.15 0.13 0.05 0.19 0.1 0.13 0.5 0.42 0.25 0.14 0.24 0.13 0.03 0.0 0.09 0.02 0.23 0.21 0.1 0.0 0.0 0.0 0.1 0.11 0.0 0.31 1.0 0.76 0.12 0.32 0.11 0.1
0.23 0.0 0.07 0.18 0.1 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.1 0.34 0.27 0.08 0.63 0.16 0.0 0.29 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.17 0.25 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 1.0 0.0 0.18 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)