Heatmap: Cluster_219 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Aerial tissue - Light - ZT1	Aerial tissue - Light - ZT3	Aerial tissue - Light - ZT5	Aerial tissue - Light - ZT7	Aerial tissue - Light - ZT9	Aerial tissue - Light - ZT11	Aerial tissue - Dark - ZT1	Aerial tissue - Dark - ZT3	Aerial tissue - Dark - ZT5	Aerial tissue - Dark - ZT7	Aerial tissue - Dark - ZT9	Aerial tissue - Dark - ZT11	Roots	Root elongation and differentiation zone	Root meristematic zone	Aerial roots and rhizophores	Shoot tips	Microphyll	Strobili	Shoot apical meristem - AC	Shoot apical meristem - Core	Shoot apical meristem - P1	Stem - Top	Stem - Bottom	Whole plant	Aerial tissue - Stress - Dark	Aerial tissue - Stress - High light	Aerial tissue - Stress - Cont	Aerial tissue - Stress - 37C 1h	Aerial tissue - Stress - 37C 3h	Aerial tissue - Stress - 4C 1h	Aerial tissue - Stress - 4C 3h
Smo102633	0.42	0.37	0.37	0.44	0.52	0.55	0.54	0.66	0.59	0.57	0.54	0.49	0.37	0.23	0.5	0.39	0.33	0.22	0.44	0.04	0.02	0.01	0.41	0.4	0.26	1.0	0.82	0.84	0.45	0.44	0.42	0.51
Smo105976	0.46	0.48	0.53	0.61	0.59	0.57	0.57	0.72	0.62	0.64	0.59	0.56	0.39	0.52	0.32	0.39	0.28	0.26	0.41	0.08	0.14	0.03	0.37	0.39	0.34	1.0	0.87	0.89	0.34	0.32	0.5	0.41
Smo131582	0.45	0.52	0.48	0.53	0.58	0.58	0.56	0.7	0.61	0.63	0.58	0.53	0.34	0.28	0.48	0.35	0.27	0.18	0.4	0.0	0.07	0.11	0.32	0.34	0.39	0.87	1.0	0.96	0.28	0.31	0.44	0.43
Smo146641	0.5	0.57	0.72	0.79	0.78	0.68	0.77	0.72	0.73	0.7	0.69	0.54	0.58	0.8	0.62	0.64	0.48	0.29	0.64	0.11	0.08	0.07	0.59	0.6	0.28	0.8	1.0	0.96	0.54	0.54	0.53	0.6
Smo148107	0.63	0.61	0.64	0.69	0.7	0.64	0.66	0.79	0.73	0.76	0.72	0.65	0.49	0.44	0.57	0.45	0.36	0.29	0.54	0.06	0.19	0.11	0.41	0.45	0.48	0.97	0.95	1.0	0.37	0.41	0.62	0.57
Smo168311	0.59	0.62	0.61	0.72	0.72	0.76	0.77	0.85	0.85	0.8	0.8	0.65	0.65	0.48	0.73	0.53	0.49	0.31	0.46	0.16	0.02	0.12	0.42	0.44	0.2	0.85	1.0	0.98	0.46	0.5	0.36	0.41
Smo173329	0.41	0.41	0.41	0.49	0.59	0.48	0.43	0.53	0.45	0.47	0.43	0.36	0.33	0.31	0.2	0.45	0.23	0.06	0.39	0.06	0.1	0.02	0.37	0.37	0.33	1.0	0.74	0.81	0.25	0.24	0.5	0.33
Smo173775	0.63	0.74	0.81	0.82	0.99	0.92	0.88	0.97	0.78	0.82	0.81	0.69	0.69	0.58	0.88	0.72	0.51	0.27	0.6	0.34	0.05	0.06	0.64	0.7	0.15	0.92	0.97	1.0	0.53	0.59	0.44	0.52
Smo174109	0.56	0.64	0.74	0.76	0.74	0.75	0.72	0.77	0.67	0.59	0.56	0.53	0.33	0.5	0.37	0.4	0.6	0.45	0.58	0.03	0.11	0.02	0.46	0.42	0.37	0.55	0.89	1.0	0.56	0.59	0.45	0.42
Smo181271	0.6	0.58	0.59	0.77	0.75	0.75	0.7	0.74	0.71	0.66	0.6	0.57	0.41	0.59	0.46	0.48	0.5	0.3	0.57	0.04	0.2	0.03	0.52	0.48	0.51	0.87	0.96	1.0	0.44	0.48	0.43	0.48
Smo269627	0.6	0.61	0.78	0.8	0.97	0.88	0.88	0.86	0.83	0.8	0.7	0.64	0.6	0.61	0.92	0.71	0.5	0.39	0.79	0.2	0.05	0.15	0.62	0.65	0.17	1.0	0.72	0.77	0.48	0.51	0.48	0.45
Smo30736	0.5	0.58	0.57	0.65	0.67	0.62	0.63	0.65	0.65	0.65	0.58	0.55	0.49	0.46	0.5	0.57	0.39	0.26	0.5	0.22	0.03	0.13	0.51	0.54	0.22	1.0	0.77	0.84	0.36	0.41	0.34	0.29
Smo406890	0.67	0.72	0.82	0.8	0.87	0.83	0.84	0.85	0.82	0.75	0.8	0.65	0.66	0.67	1.0	0.71	0.5	0.38	0.59	0.18	0.2	0.08	0.72	0.78	0.14	0.91	0.87	0.93	0.48	0.51	0.4	0.44
Smo412312	0.49	0.58	0.57	0.71	0.79	0.61	0.84	0.8	0.73	0.72	0.67	0.56	0.45	0.44	0.92	0.52	0.36	0.17	0.55	0.01	0.0	0.0	0.37	0.45	0.03	1.0	0.85	0.95	0.4	0.41	0.26	0.33
Smo413713	0.47	0.48	0.5	0.58	0.65	0.61	0.64	0.68	0.6	0.61	0.54	0.47	0.5	0.26	0.32	0.58	0.35	0.17	0.7	0.13	0.13	0.17	0.44	0.43	0.44	0.81	0.88	1.0	0.46	0.49	0.27	0.28
Smo428253	0.47	0.46	0.45	0.55	0.64	0.5	0.67	0.72	0.65	0.69	0.56	0.59	0.39	0.35	0.43	0.44	0.37	0.55	0.54	0.1	0.1	0.06	0.41	0.45	0.32	1.0	0.75	0.76	0.5	0.55	0.34	0.38
Smo430101	0.47	0.47	0.55	0.6	0.7	0.68	0.77	0.87	0.77	0.77	0.73	0.62	0.54	0.34	0.44	0.58	0.5	0.42	0.6	0.09	0.17	0.04	0.53	0.54	0.65	1.0	0.9	0.99	0.6	0.58	0.53	0.47
Smo437220	0.75	0.7	0.85	0.82	0.92	0.89	0.75	0.8	0.81	0.79	0.7	0.65	0.76	0.59	0.89	0.83	0.45	0.33	0.73	0.42	0.16	0.32	0.61	0.68	0.47	0.89	0.91	1.0	0.47	0.49	0.58	0.64
Smo437242	0.39	0.41	0.44	0.48	0.53	0.5	0.54	0.62	0.56	0.53	0.51	0.48	0.36	0.37	0.49	0.41	0.34	0.31	0.49	0.12	0.23	0.14	0.37	0.37	0.52	1.0	0.97	0.89	0.36	0.37	0.45	0.47
Smo437336	0.49	0.49	0.53	0.62	0.66	0.65	0.71	0.84	0.75	0.75	0.66	0.59	0.38	0.37	0.54	0.42	0.35	0.22	0.56	0.17	0.18	0.1	0.36	0.4	0.37	0.87	0.98	1.0	0.43	0.46	0.48	0.53
Smo437404	0.47	0.47	0.48	0.54	0.51	0.54	0.59	0.65	0.62	0.59	0.54	0.53	0.35	0.42	0.35	0.34	0.31	0.23	0.36	0.07	0.25	0.05	0.33	0.31	0.51	0.9	1.0	0.94	0.34	0.34	0.42	0.41
Smo438037	0.58	0.63	0.65	0.63	0.64	0.66	0.68	0.7	0.66	0.73	0.66	0.63	0.48	0.43	0.45	0.49	0.3	0.26	0.58	0.18	0.22	0.17	0.34	0.36	0.37	1.0	0.93	0.96	0.37	0.39	0.36	0.41
Smo438644	0.47	0.47	0.59	0.61	0.67	0.73	0.76	0.84	0.78	0.71	0.67	0.59	0.62	0.43	0.74	0.61	0.46	0.34	0.59	0.09	0.21	0.21	0.54	0.6	0.52	1.0	0.81	0.88	0.52	0.56	0.33	0.26
Smo439355	0.39	0.36	0.38	0.52	0.59	0.55	0.63	0.72	0.6	0.58	0.52	0.45	0.38	0.31	0.21	0.49	0.29	0.09	0.59	0.01	0.07	0.01	0.38	0.35	0.15	1.0	0.86	0.85	0.39	0.39	0.48	0.49
Smo439455	0.33	0.27	0.3	0.38	0.53	0.53	0.58	0.61	0.55	0.46	0.43	0.4	0.23	0.16	0.34	0.32	0.23	0.1	0.36	0.02	0.07	0.17	0.23	0.27	0.12	1.0	0.88	0.93	0.3	0.37	0.22	0.25
Smo439642	0.4	0.4	0.46	0.5	0.56	0.56	0.59	0.63	0.55	0.5	0.51	0.42	0.2	0.21	0.21	0.25	0.28	0.18	0.29	0.12	0.1	0.19	0.26	0.24	0.24	0.71	0.97	1.0	0.27	0.28	0.25	0.25
Smo440019	0.36	0.43	0.59	0.68	0.75	0.76	0.79	0.79	0.73	0.66	0.59	0.45	0.17	0.17	0.49	0.19	0.55	0.29	0.24	0.06	0.04	0.1	0.29	0.23	0.16	0.69	1.0	0.92	0.35	0.38	0.52	0.53
Smo440240	0.47	0.42	0.43	0.59	0.66	0.66	0.73	0.81	0.71	0.72	0.62	0.61	0.39	0.59	0.46	0.47	0.36	0.15	0.61	0.04	0.07	0.03	0.39	0.36	0.26	0.97	0.96	1.0	0.42	0.44	0.43	0.41
Smo443175	0.56	0.49	0.45	0.52	0.48	0.49	0.47	0.58	0.61	0.63	0.64	0.6	0.38	0.67	0.46	0.48	0.35	0.26	0.46	0.18	0.1	0.11	0.41	0.46	0.39	1.0	0.97	0.93	0.39	0.4	0.53	0.47
Smo445664	0.56	0.54	0.59	0.62	0.68	0.63	0.6	0.59	0.52	0.53	0.48	0.46	0.41	0.36	0.5	0.52	0.43	0.25	0.68	0.03	0.02	0.03	0.47	0.48	0.3	1.0	0.77	0.79	0.42	0.42	0.47	0.43
Smo448426	0.37	0.41	0.43	0.46	0.55	0.49	0.5	0.63	0.53	0.5	0.48	0.4	0.45	0.25	0.21	0.53	0.32	0.16	0.52	0.03	0.04	0.01	0.46	0.52	0.46	1.0	0.73	0.76	0.43	0.44	0.54	0.45
Smo53650	0.51	0.5	0.48	0.51	0.55	0.48	0.47	0.53	0.47	0.48	0.48	0.46	0.33	0.33	0.42	0.38	0.3	0.23	0.42	0.15	0.3	0.01	0.31	0.33	0.14	0.97	0.93	1.0	0.32	0.32	0.29	0.28
Smo60006	0.69	0.8	0.78	0.82	0.82	0.71	0.84	0.77	0.77	0.77	0.76	0.68	0.57	0.76	0.94	0.74	0.5	0.27	0.63	0.32	0.08	0.02	0.5	0.47	0.16	0.73	0.97	1.0	0.5	0.55	0.58	0.63
Smo75160	0.43	0.51	0.5	0.68	0.73	0.68	0.85	0.84	0.77	0.67	0.58	0.54	0.43	0.41	0.65	0.56	0.37	0.22	0.48	0.0	0.0	0.02	0.46	0.47	0.04	0.56	1.0	0.94	0.45	0.51	0.31	0.3
Smo75384	0.75	0.68	0.67	0.75	0.81	0.84	0.89	0.85	0.77	0.81	0.67	0.71	0.68	0.63	0.9	0.79	0.48	0.33	0.7	0.17	0.11	0.09	0.65	0.7	0.33	0.91	1.0	0.94	0.55	0.56	0.46	0.45
Smo75592	0.55	0.52	0.6	0.58	0.65	0.64	0.62	0.62	0.63	0.59	0.58	0.56	0.41	0.39	0.54	0.52	0.37	0.32	0.46	0.02	0.01	0.06	0.46	0.47	0.24	1.0	0.76	0.87	0.4	0.4	0.26	0.25
Smo76216	0.39	0.45	0.45	0.49	0.43	0.46	0.57	0.63	0.57	0.63	0.58	0.52	0.34	0.25	0.2	0.34	0.33	0.19	0.57	0.01	0.0	0.0	0.4	0.44	0.03	1.0	0.74	0.84	0.47	0.48	0.35	0.34
Smo79275	0.56	0.58	0.63	0.72	0.71	0.63	0.55	0.58	0.55	0.53	0.53	0.49	0.4	0.44	0.44	0.52	0.45	0.3	0.59	0.2	0.17	0.07	0.48	0.45	0.33	0.94	0.9	1.0	0.39	0.42	0.36	0.39
Smo79454	0.68	0.77	0.87	0.85	0.93	0.8	0.84	0.81	0.85	0.83	0.83	0.72	0.63	0.47	1.0	0.66	0.54	0.26	0.71	0.63	0.13	0.42	0.5	0.54	0.24	0.71	0.83	0.95	0.55	0.6	0.52	0.52
Smo80442	0.51	0.55	0.63	0.78	0.79	0.73	0.88	0.92	0.87	0.82	0.78	0.72	0.68	0.67	0.59	0.61	0.52	0.31	0.44	0.08	0.17	0.05	0.55	0.59	0.26	0.99	0.9	1.0	0.56	0.58	0.54	0.46
Smo81184	0.55	0.59	0.58	0.65	0.66	0.61	0.68	0.67	0.67	0.66	0.6	0.6	0.36	0.55	0.49	0.41	0.51	0.33	0.56	0.2	0.16	0.08	0.45	0.44	0.57	0.69	0.89	1.0	0.48	0.48	0.42	0.41
Smo87970	0.58	0.58	0.64	0.58	0.57	0.64	0.61	0.66	0.57	0.56	0.56	0.51	0.46	0.56	0.8	0.53	0.39	0.46	0.43	0.13	0.07	0.02	0.53	0.46	0.14	0.6	0.79	1.0	0.42	0.44	0.32	0.32
Smo89622	0.55	0.57	0.55	0.77	0.71	0.67	0.67	0.7	0.7	0.71	0.75	0.62	0.41	0.52	0.47	0.44	0.45	0.42	0.7	0.16	0.07	0.0	0.47	0.48	0.45	0.89	1.0	0.97	0.44	0.5	0.27	0.27
Smo92982	0.5	0.46	0.57	0.65	0.79	0.98	0.87	0.97	0.85	0.85	0.74	0.57	0.29	0.46	0.62	0.35	0.47	0.31	0.53	0.06	0.11	0.01	0.4	0.35	0.43	0.8	0.98	1.0	0.44	0.43	0.53	0.41
Smo92995	0.52	0.54	0.55	0.64	0.69	0.71	0.76	0.81	0.73	0.73	0.66	0.64	0.48	0.63	0.62	0.52	0.47	0.32	0.49	0.1	0.16	0.11	0.48	0.5	0.44	0.77	0.89	1.0	0.5	0.52	0.4	0.26
Smo99407	0.42	0.42	0.49	0.58	0.52	0.51	0.45	0.48	0.45	0.44	0.44	0.4	0.36	0.36	0.24	0.49	0.29	0.19	0.47	0.01	0.02	0.0	0.38	0.39	0.07	1.0	0.66	0.74	0.29	0.28	0.5	0.36
Smo99725	0.45	0.43	0.46	0.51	0.52	0.46	0.51	0.62	0.57	0.65	0.61	0.57	0.39	0.3	0.28	0.5	0.35	0.18	0.51	0.0	0.16	0.09	0.36	0.35	0.24	1.0	0.63	0.67	0.49	0.51	0.48	0.48

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)