1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_131 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.13 0.03 0.0 0.33 0.0 0.07 0.04 0.0 0.11 0.0 0.12 0.0 0.11 0.0 0.0 0.35 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.36 0.11 0.08 0.0 0.0
0.06 0.03 0.0 0.07 0.17 0.02 0.13 0.08 0.05 0.47 0.08 0.15 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.27 0.26 0.52 0.1 0.0 0.0 0.0 0.02
2.38 2.54 2.88 2.51 3.35 2.61 1.73 2.73 2.65 3.95 3.14 2.48 1.94 1.97 3.31 3.57 1.54 0.22 1.26 0.71 2.34 1.69 1.34 1.66 0.88 2.57 1.42 2.5 1.24 1.2 1.02 0.89
0.39 0.09 0.11 0.16 0.21 0.26 0.48 0.76 0.34 0.95 0.76 0.57 0.0 1.48 1.08 0.12 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.43 1.11 0.89 0.49 0.05 0.05 0.05 0.0
16.25 14.3 15.76 15.82 15.57 16.68 16.85 16.54 17.74 18.74 16.96 16.08 9.1 11.28 14.26 11.73 11.8 10.66 12.97 0.67 24.56 15.44 10.14 10.23 5.4 16.17 15.58 15.88 11.64 11.69 9.03 8.86
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.92 0.0 15.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.04 18.73 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 3.03 0.0 0.0 1.7 2.26 1.0 2.52
0.55 0.0 1.41 0.0 0.0 1.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.8 0.94 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.36 2.15 0.66 0.0 0.0 0.81 0.6 1.01 0.95
0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.05 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.18 0.03 0.08 0.03 0.02 0.11 0.07 0.06 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.07 0.13 0.0 0.09 0.03 0.0
0.17 0.44 0.54 0.43 0.09 0.31 0.07 0.25 0.38 0.89 0.46 0.55 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.01 0.09 0.07 0.04 0.01 0.0 0.1 0.79 0.07 0.3 0.0 0.0 0.01 0.0
0.06 0.0 0.15 0.06 0.0 0.11 0.0 0.1 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.02 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.03 0.09 0.01 0.02 0.0 0.0
0.02 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.33 0.23 0.76 0.54 0.12 0.37 0.38 0.77 0.55 1.0 0.47 0.35 0.0 0.63 1.19 0.05 0.04 0.19 0.04 0.24 0.3 0.13 0.02 0.0 0.53 1.35 2.06 2.17 0.02 0.02 0.04 0.07
0.12 0.02 0.09 0.06 0.08 0.06 0.15 0.15 0.35 0.75 0.07 0.13 0.06 0.43 0.1 0.19 0.08 0.03 1.26 0.0 0.0 0.0 0.03 0.14 0.61 0.23 0.71 0.13 0.13 0.17 0.05 0.08
1.67 2.03 2.42 1.21 1.17 1.73 2.68 1.35 1.66 3.15 1.61 2.49 0.99 2.31 1.81 1.2 1.22 0.27 1.61 0.15 0.17 0.76 1.06 1.01 1.33 3.69 4.32 3.17 0.78 0.79 1.38 1.12
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.0 0.04 0.49 0.12 0.5 0.16 0.23 0.21 0.91 0.24 0.49 0.1 0.1 0.14 0.0 0.05 0.05 0.05 0.0 0.81 0.0 0.19 0.04 1.07 0.25 1.46 0.52 0.09 0.19 0.0 0.13
0.0 0.08 0.0 0.11 0.0 0.14 0.41 0.17 0.04 0.34 0.0 0.08 0.2 0.08 0.03 0.1 0.09 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.14 0.08 0.19 0.0 0.57 0.0 0.13 0.13 0.0 0.0
0.01 0.02 0.0 0.05 0.05 0.05 0.19 0.05 0.02 0.23 0.06 0.04 0.03 0.0 0.03 0.0 0.05 0.04 0.28 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.05 0.2
0.14 0.0 0.25 0.1 0.24 0.56 0.18 0.08 0.32 0.0 0.06 0.09 0.31 0.15 0.11 0.1 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.65 0.0 0.14 1.11 0.71 0.55 0.23 0.27 0.1 0.0 0.08
0.06 0.06 0.19 0.13 0.14 0.0 0.0 0.03 0.08 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.63 1.06 0.63 1.33 0.42 1.04 1.38 1.81 1.14 3.31 2.0 1.51 3.4 1.35 0.37 3.5 0.87 0.0 0.63 0.1 0.0 1.24 1.69 1.81 2.38 1.99 3.35 2.84 0.95 0.62 0.81 0.76
0.02 0.04 0.16 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.63 2.29 4.76 2.66 1.81 5.09 3.66 2.94 2.45 9.58 2.31 3.44 3.5 0.5 7.21 3.41 2.48 2.72 2.34 0.0 0.0 0.0 2.19 1.86 0.65 9.6 3.52 6.58 4.18 4.15 3.24 2.6
0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.23 0.0 0.54 0.08 0.12 0.05 0.04 0.05 0.05 0.31 0.5 0.21 0.0 0.42 0.0 0.35 0.2 0.0 0.0 0.0 0.2 0.41 0.29 0.37 0.28
0.01 0.02 0.04 0.05 0.03 0.03 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.18 2.69 3.15 2.06 2.02 2.31 3.1 2.84 2.92 5.33 3.32 3.58 0.44 0.21 0.3 0.79 1.01 1.33 1.74 2.02 2.81 1.54 2.29 1.89 8.13 1.46 0.67 0.94 1.61 2.16 1.39 1.67
0.07 0.0 0.23 0.27 0.0 0.0 1.21 0.46 0.56 1.36 0.83 0.29 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 2.0 0.41 1.09 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.06 0.14 0.18 0.0 0.15 0.0 0.0 0.03 0.0 0.07 0.0 0.14 0.03 0.03 0.09 0.0
0.0 0.0 0.05 0.0 0.07 0.03 0.04 0.0 0.02 0.35 0.0 0.06 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 1.16 0.02 0.02 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.07 0.79 0.18 0.0 0.34 0.0 0.32 0.0 1.0 0.0 0.46 0.17 0.0 0.0 0.18 0.0 1.29 0.31 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.94 1.05 0.45 0.0 0.23 0.39 0.23 0.0
1.44 1.78 2.39 0.86 0.62 1.23 1.0 1.04 1.54 2.84 2.41 1.05 0.97 0.93 0.95 0.28 0.15 0.22 0.24 0.0 0.0 0.0 0.29 0.45 0.25 1.52 0.51 0.17 0.24 0.0 0.24 0.17
0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 1.26 0.0 0.0 0.0 0.0 1.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 2.69 0.21 0.85 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0
0.18 0.09 0.08 0.04 0.05 0.3 0.24 0.0 0.12 0.16 0.05 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.08 0.15 0.0 0.0 0.0 0.23 0.21 0.37 0.19 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0
0.25 0.48 0.29 0.49 0.13 0.41 0.92 0.65 0.29 1.64 0.65 0.32 0.23 0.86 1.28 0.53 0.12 0.05 0.62 0.0 0.14 0.0 0.31 0.18 0.33 2.18 1.56 1.62 0.17 0.06 0.26 0.11
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.08 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02
0.0 0.1 0.34 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.16 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.17 0.11 0.06 0.04 0.42 0.14 0.0 0.14 0.08 0.0 0.25 0.04 0.12 0.08 0.0 0.04 0.05 0.1 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.24 0.14 0.0 0.0 0.03 0.07 0.0 0.03
0.0 0.19 0.35 0.16 0.0 0.28 0.21 0.0 0.18 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.26 0.0 0.14 0.0 0.07 0.08 0.27 0.05 0.63 0.41 0.28 0.07 0.0 0.07 0.07 0.39 0.48 0.72 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.7 0.38 0.72 0.18 0.18 0.06 0.0
0.19 0.07 0.06 0.29 0.0 0.16 0.08 0.06 0.13 0.85 0.3 0.29 0.17 0.0 0.0 0.36 0.4 1.12 0.23 0.0 0.0 0.0 0.17 0.08 0.93 0.68 0.22 0.39 0.78 0.08 0.08 0.07
0.04 0.18 0.18 0.26 0.15 0.43 0.28 0.04 0.0 0.39 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.72 0.11 0.27 0.25 0.0 0.0 0.0 0.05
0.0 0.03 0.03 0.02 0.12 0.0 0.27 0.0 0.0 0.54 0.03 0.0 0.1 0.08 0.16 0.15 0.2 0.12 0.05 0.0 0.0 0.0 0.09 0.05 0.38 0.0 0.2 0.14 0.07 0.1 0.16 0.17
1.8 2.77 2.0 0.62 3.19 1.6 3.83 9.65 7.21 17.81 7.26 1.93 0.02 1.22 3.15 3.09 3.18 3.99 3.85 11.03 0.12 0.24 9.85 9.86 3.34 23.06 3.12 0.0 4.12 3.91 2.24 4.48
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.04 0.24 0.04 0.0 0.04 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.27 0.08 0.1 0.18 0.11 0.0 0.0 0.0
0.12 0.14 0.18 0.04 0.1 0.22 0.1 0.21 0.23 0.11 0.02 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.06 0.03 0.09 0.03 0.63 0.57 0.34 0.13 0.64 0.03 0.4 0.0 0.14 0.11 0.17 0.2 0.16 0.29 0.0 0.0 0.0 0.27 0.3 1.23 0.77 1.07 0.52 0.45 0.4 0.11 0.1
6.2 6.97 9.59 7.8 7.53 9.08 9.13 10.39 10.72 14.74 12.99 9.06 2.86 3.74 11.02 1.78 3.48 0.28 2.65 3.68 10.57 1.97 3.17 3.5 6.82 10.79 8.74 12.64 1.91 3.44 1.59 1.42
0.29 0.19 0.0 0.49 0.0 0.1 0.3 0.67 0.22 1.1 0.59 0.58 0.05 0.18 0.03 0.1 0.45 0.58 0.42 0.0 0.0 0.0 0.1 0.38 1.4 0.32 0.24 0.46 0.05 0.23 0.28 0.53
0.05 0.15 0.13 0.04 0.0 0.02 0.03 0.09 0.06 0.21 0.04 0.06 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.16 0.18 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.15 0.19 0.0 0.04 0.0 0.06
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.95 1.1 0.68 0.9 1.17 2.68 2.88 1.18 0.85 0.87 0.76 1.0 0.1 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.55 0.24 0.59 0.38 0.1 0.64 0.25 0.19 0.43 0.26 0.05 0.3 0.2 1.12 0.59 0.25 0.42 0.2 1.36 0.0 0.91 0.6 0.61 0.73 2.02 1.54 1.56 1.29 0.79 0.68 0.58 0.81
0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.1 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
0.72 0.84 0.38 0.4 1.01 0.64 0.96 0.67 0.56 1.7 0.41 0.14 0.92 0.86 1.93 0.84 0.49 0.36 1.0 0.63 0.0 1.05 0.71 0.65 0.62 0.76 0.59 1.09 0.67 0.71 0.81 0.77
0.0 0.0 0.1 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0
0.02 0.0 0.12 0.16 0.0 0.23 0.26 0.88 0.33 0.86 0.36 0.32 0.94 0.5 0.04 0.21 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.47 0.07 0.16 0.0 0.0 0.03 0.0
0.05 0.08 0.22 0.14 0.08 0.05 0.18 0.06 0.32 0.92 0.19 0.31 0.74 0.06 0.07 0.55 0.1 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09 0.0 0.59 0.13 0.84 0.11 0.23 0.07 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.76 0.83 0.0 0.0 0.0 3.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.27 0.0 0.49 1.17 0.74 0.08 0.0 0.74 2.02 0.09 0.0 0.0 1.77 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.94 1.04 1.2 0.35 0.76 0.79 0.27 0.51 0.58 0.08 0.95 0.55 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.17 0.01 0.0 0.32 0.99 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.12 0.07 0.11 0.1 0.08 0.07 0.35 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.07 0.44 0.65 0.04 0.0 0.0 0.0
0.38 0.13 0.22 0.67 1.52 0.31 1.37 0.48 0.42 2.57 0.24 0.25 0.13 0.91 2.5 0.13 0.13 0.42 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.12 0.12
0.33 0.35 0.19 0.12 0.0 0.42 0.44 0.72 0.23 1.52 0.07 0.24 0.33 0.0 0.36 0.19 0.17 0.0 0.3 0.0 0.0 0.24 0.39 0.3 0.0 0.35 0.63 0.39 0.46 0.39 0.16 0.0
0.65 3.47 2.99 1.7 0.65 0.79 1.19 1.37 1.39 2.78 1.53 1.82 0.14 0.64 0.19 0.0 0.46 0.29 0.0 0.09 0.05 0.0 0.54 0.24 0.35 0.9 0.5 0.31 0.11 0.32 0.63 0.52
0.34 0.36 0.27 0.62 0.43 0.58 0.66 0.89 0.41 1.05 0.44 0.28 0.43 0.33 1.29 0.46 0.24 0.05 0.35 0.0 0.43 0.0 0.66 0.65 0.1 0.42 0.68 1.04 0.28 0.25 0.19 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.07 0.09 0.24 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)