1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_131 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.37 0.08 0.0 0.93 0.0 0.19 0.11 0.0 0.32 0.0 0.35 0.0 0.32 0.0 0.0 0.97 0.1 0.1 0.0 0.0 0.0 1.0 0.31 0.21 0.0 0.0
0.12 0.07 0.0 0.13 0.32 0.04 0.24 0.15 0.1 0.91 0.15 0.29 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.06 0.08 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.53 0.5 1.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.04
0.6 0.64 0.73 0.63 0.85 0.66 0.44 0.69 0.67 1.0 0.8 0.63 0.49 0.5 0.84 0.9 0.39 0.06 0.32 0.18 0.59 0.43 0.34 0.42 0.22 0.65 0.36 0.63 0.31 0.3 0.26 0.23
0.26 0.06 0.08 0.11 0.14 0.17 0.32 0.51 0.23 0.64 0.51 0.38 0.0 1.0 0.73 0.08 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.29 0.75 0.6 0.33 0.03 0.03 0.03 0.0
0.66 0.58 0.64 0.64 0.63 0.68 0.69 0.67 0.72 0.76 0.69 0.65 0.37 0.46 0.58 0.48 0.48 0.43 0.53 0.03 1.0 0.63 0.41 0.42 0.22 0.66 0.63 0.65 0.47 0.48 0.37 0.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.16 0.0 0.0 0.09 0.12 0.05 0.13
0.25 0.0 0.66 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.37 0.44 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.17 1.0 0.31 0.0 0.0 0.38 0.28 0.47 0.44
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.39 0.24 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.88 0.15 0.39 0.16 0.12 0.56 0.34 0.31 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.33 0.67 0.0 0.43 0.14 0.0
0.19 0.5 0.6 0.49 0.1 0.35 0.08 0.28 0.42 1.0 0.52 0.62 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.03 0.02 0.1 0.08 0.05 0.02 0.0 0.11 0.89 0.08 0.34 0.0 0.0 0.02 0.0
0.43 0.0 1.0 0.39 0.01 0.77 0.0 0.7 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.13 0.0 0.16 0.34 0.34 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.26 0.0 0.2 0.62 0.1 0.13 0.0 0.0
0.22 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0
0.15 0.1 0.35 0.25 0.06 0.17 0.17 0.35 0.25 0.46 0.22 0.16 0.0 0.29 0.55 0.02 0.02 0.09 0.02 0.11 0.14 0.06 0.01 0.0 0.25 0.62 0.95 1.0 0.01 0.01 0.02 0.03
0.1 0.02 0.07 0.05 0.07 0.04 0.12 0.12 0.28 0.6 0.06 0.1 0.05 0.35 0.08 0.15 0.07 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.11 0.48 0.18 0.57 0.1 0.1 0.13 0.04 0.06
0.39 0.47 0.56 0.28 0.27 0.4 0.62 0.31 0.39 0.73 0.37 0.58 0.23 0.53 0.42 0.28 0.28 0.06 0.37 0.03 0.04 0.18 0.25 0.23 0.31 0.85 1.0 0.73 0.18 0.18 0.32 0.26
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.0 0.03 0.34 0.08 0.34 0.11 0.15 0.14 0.62 0.17 0.34 0.07 0.07 0.09 0.0 0.04 0.04 0.03 0.0 0.55 0.0 0.13 0.03 0.73 0.17 1.0 0.36 0.06 0.13 0.0 0.09
0.0 0.13 0.0 0.17 0.0 0.23 0.67 0.28 0.07 0.55 0.0 0.14 0.32 0.14 0.05 0.17 0.14 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.14 0.31 0.0 0.93 0.0 0.22 0.22 0.0 0.0
0.04 0.07 0.0 0.18 0.17 0.17 0.68 0.18 0.08 0.81 0.2 0.14 0.09 0.0 0.11 0.0 0.17 0.13 1.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.25 0.16 0.7
0.13 0.0 0.23 0.09 0.22 0.5 0.16 0.07 0.29 0.0 0.06 0.08 0.28 0.14 0.1 0.09 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.59 0.0 0.13 1.0 0.64 0.49 0.2 0.25 0.09 0.0 0.08
0.31 0.33 1.0 0.67 0.77 0.0 0.0 0.14 0.42 0.14 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0
0.18 0.3 0.18 0.38 0.12 0.3 0.39 0.52 0.33 0.94 0.57 0.43 0.97 0.39 0.11 1.0 0.25 0.0 0.18 0.03 0.0 0.35 0.48 0.52 0.68 0.57 0.96 0.81 0.27 0.18 0.23 0.22
0.09 0.23 1.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.38 0.24 0.5 0.28 0.19 0.53 0.38 0.31 0.26 1.0 0.24 0.36 0.36 0.05 0.75 0.35 0.26 0.28 0.24 0.0 0.0 0.0 0.23 0.19 0.07 1.0 0.37 0.69 0.44 0.43 0.34 0.27
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.43 0.0 1.0 0.15 0.22 0.09 0.07 0.1 0.1 0.57 0.92 0.38 0.0 0.77 0.0 0.65 0.37 0.0 0.0 0.0 0.37 0.76 0.54 0.69 0.51
0.18 0.45 0.8 1.0 0.54 0.54 0.0 0.0 0.49 0.65 0.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.39 0.33 0.39 0.25 0.25 0.28 0.38 0.35 0.36 0.66 0.41 0.44 0.05 0.03 0.04 0.1 0.12 0.16 0.21 0.25 0.34 0.19 0.28 0.23 1.0 0.18 0.08 0.12 0.2 0.27 0.17 0.2
0.03 0.0 0.12 0.13 0.0 0.0 0.6 0.23 0.28 0.68 0.42 0.15 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 1.0 0.21 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.13 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.32 0.3 0.67 0.86 0.0 0.7 0.0 0.0 0.15 0.0 0.31 0.0 0.67 0.13 0.14 0.42 0.0
0.0 0.0 0.04 0.0 0.06 0.02 0.03 0.0 0.02 0.3 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 1.0 0.01 0.02 0.0 0.0
0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.06 0.62 0.14 0.0 0.26 0.0 0.25 0.0 0.78 0.0 0.36 0.13 0.0 0.0 0.14 0.0 1.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.73 0.82 0.35 0.0 0.18 0.31 0.18 0.0
0.51 0.63 0.84 0.3 0.22 0.43 0.35 0.37 0.54 1.0 0.85 0.37 0.34 0.33 0.33 0.1 0.05 0.08 0.09 0.0 0.0 0.0 0.1 0.16 0.09 0.54 0.18 0.06 0.09 0.0 0.09 0.06
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.08 0.32 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.5 0.25 0.22 0.1 0.15 0.82 0.65 0.0 0.32 0.44 0.15 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.22 0.41 0.0 0.0 0.0 0.62 0.57 1.0 0.52 0.0 0.0 0.13 0.14 0.0 0.0
0.12 0.22 0.13 0.23 0.06 0.19 0.42 0.3 0.13 0.75 0.3 0.15 0.1 0.4 0.59 0.24 0.06 0.02 0.28 0.0 0.07 0.0 0.14 0.08 0.15 1.0 0.72 0.74 0.08 0.03 0.12 0.05
0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.23 0.2 0.0 0.0 1.0 0.2 0.0 0.0 0.19 0.0 0.25 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.58 0.0 0.23 0.0 0.0 0.21
0.0 0.28 1.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.48 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.41 0.25 0.15 0.08 1.0 0.33 0.0 0.34 0.2 0.0 0.59 0.09 0.29 0.2 0.0 0.09 0.13 0.24 0.0 0.0 0.0 0.09 0.08 0.58 0.33 0.0 0.0 0.08 0.16 0.0 0.08
0.0 0.55 1.0 0.45 0.0 0.8 0.6 0.0 0.5 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.27 0.37 0.0 0.2 0.0 0.1 0.11 0.38 0.07 0.87 0.57 0.39 0.09 0.0 0.09 0.1 0.54 0.67 1.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.98 0.53 0.99 0.25 0.26 0.08 0.0
0.16 0.06 0.05 0.26 0.0 0.15 0.07 0.06 0.11 0.76 0.26 0.26 0.15 0.0 0.0 0.32 0.36 1.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.15 0.07 0.83 0.6 0.2 0.35 0.69 0.07 0.07 0.07
0.06 0.25 0.25 0.37 0.21 0.6 0.4 0.06 0.0 0.55 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 1.0 0.15 0.38 0.35 0.0 0.0 0.0 0.07
0.0 0.05 0.06 0.04 0.23 0.0 0.49 0.0 0.0 1.0 0.06 0.0 0.18 0.14 0.29 0.28 0.37 0.22 0.1 0.0 0.0 0.0 0.17 0.09 0.7 0.0 0.38 0.26 0.14 0.19 0.29 0.32
0.08 0.12 0.09 0.03 0.14 0.07 0.17 0.42 0.31 0.77 0.31 0.08 0.0 0.05 0.14 0.13 0.14 0.17 0.17 0.48 0.01 0.01 0.43 0.43 0.14 1.0 0.14 0.0 0.18 0.17 0.1 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.13 0.88 0.15 0.0 0.15 0.0 0.09 0.16 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 1.0 0.31 0.38 0.67 0.39 0.0 0.0 0.0
0.51 0.62 0.76 0.16 0.42 0.92 0.44 0.92 1.0 0.46 0.1 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.19 0.05 0.02 0.07 0.02 0.52 0.46 0.28 0.11 0.52 0.03 0.32 0.0 0.11 0.09 0.14 0.16 0.13 0.24 0.0 0.0 0.0 0.22 0.24 1.0 0.63 0.87 0.42 0.36 0.33 0.09 0.08
0.42 0.47 0.65 0.53 0.51 0.62 0.62 0.71 0.73 1.0 0.88 0.62 0.19 0.25 0.75 0.12 0.24 0.02 0.18 0.25 0.72 0.13 0.22 0.24 0.46 0.73 0.59 0.86 0.13 0.23 0.11 0.1
0.21 0.14 0.0 0.35 0.0 0.07 0.22 0.48 0.16 0.78 0.42 0.42 0.04 0.13 0.02 0.07 0.32 0.42 0.3 0.0 0.0 0.0 0.07 0.27 1.0 0.23 0.17 0.33 0.03 0.17 0.2 0.38
0.23 0.71 0.64 0.19 0.0 0.1 0.15 0.44 0.27 1.0 0.21 0.28 0.17 0.31 0.0 0.0 0.0 0.76 0.87 0.0 0.0 0.0 0.1 0.1 0.0 0.0 0.73 0.94 0.0 0.21 0.0 0.29
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.38 0.24 0.31 0.41 0.93 1.0 0.41 0.3 0.3 0.26 0.35 0.03 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0
0.27 0.12 0.29 0.19 0.05 0.32 0.12 0.09 0.21 0.13 0.02 0.15 0.1 0.55 0.29 0.13 0.21 0.1 0.67 0.0 0.45 0.3 0.3 0.36 1.0 0.76 0.77 0.64 0.39 0.34 0.29 0.4
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.35 0.72 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0
0.37 0.44 0.2 0.21 0.52 0.33 0.49 0.35 0.29 0.88 0.21 0.07 0.48 0.45 1.0 0.44 0.25 0.19 0.52 0.33 0.0 0.54 0.37 0.34 0.32 0.39 0.31 0.57 0.35 0.37 0.42 0.4
0.0 0.0 0.65 0.08 0.0 0.0 0.11 0.0 0.11 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.24 0.0
0.02 0.0 0.13 0.17 0.0 0.25 0.27 0.94 0.35 0.91 0.38 0.34 1.0 0.53 0.04 0.23 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.5 0.08 0.17 0.0 0.0 0.03 0.0
0.06 0.08 0.24 0.15 0.09 0.05 0.2 0.06 0.35 1.0 0.2 0.33 0.81 0.07 0.08 0.6 0.11 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.02 0.1 0.0 0.64 0.15 0.91 0.12 0.25 0.07 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.22 0.24 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.63 0.0 0.24 0.58 0.37 0.04 0.0 0.37 1.0 0.04 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.79 0.87 1.0 0.29 0.64 0.66 0.22 0.43 0.48 0.06 0.79 0.46 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.15 0.01 0.0 0.27 0.83 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.18 0.11 0.17 0.15 0.13 0.1 0.53 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.12 0.67 1.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.15 0.05 0.09 0.26 0.59 0.12 0.53 0.19 0.16 1.0 0.09 0.1 0.05 0.36 0.97 0.05 0.05 0.16 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.05
0.21 0.23 0.12 0.08 0.0 0.28 0.29 0.47 0.15 1.0 0.04 0.16 0.22 0.0 0.24 0.12 0.11 0.0 0.2 0.0 0.0 0.16 0.25 0.2 0.0 0.23 0.42 0.26 0.31 0.26 0.1 0.0
0.19 1.0 0.86 0.49 0.19 0.23 0.34 0.4 0.4 0.8 0.44 0.52 0.04 0.18 0.06 0.0 0.13 0.08 0.0 0.02 0.01 0.0 0.16 0.07 0.1 0.26 0.15 0.09 0.03 0.09 0.18 0.15
0.26 0.28 0.21 0.48 0.34 0.45 0.51 0.69 0.32 0.82 0.34 0.22 0.34 0.26 1.0 0.36 0.19 0.04 0.27 0.0 0.33 0.0 0.51 0.51 0.08 0.33 0.52 0.81 0.22 0.19 0.15 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.29 0.37 1.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)