Heatmap: Cluster_184 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.28 0.06 0.0 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.06 0.08 0.05 0.1 0.18 0.15 0.18 0.2 0.16 0.15 0.1 0.06 0.21 0.15 0.42 0.07 0.2 0.26 0.11 1.0 0.09 0.07 0.13 0.18 0.39 0.64 0.41 0.15 0.19 0.17 0.18
0.16 0.09 0.15 0.21 0.15 0.09 0.16 0.21 0.14 0.12 0.1 0.14 0.18 0.41 0.24 1.0 0.01 0.01 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.27 0.0 0.1 0.04 0.01 0.04 0.0 0.04
0.07 0.08 0.11 0.1 0.08 0.1 0.07 0.11 0.07 0.11 0.1 0.07 0.68 0.09 0.13 1.0 0.02 0.02 0.21 0.0 0.08 0.03 0.07 0.13 0.3 0.39 0.2 0.05 0.07 0.07 0.12 0.03
0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.07 0.06 0.0 1.0 0.03 0.26 0.39 0.01 0.05 0.02 0.01 0.09 0.02 0.67 0.69 0.21 0.15 0.13 0.44 0.33
0.1 0.1 0.11 0.09 0.12 0.1 0.1 0.12 0.12 0.12 0.12 0.1 0.34 0.41 0.2 1.0 0.08 0.1 0.34 0.05 0.02 0.0 0.07 0.2 0.14 0.16 0.18 0.25 0.11 0.17 0.04 0.06
0.14 0.12 0.13 0.17 0.16 0.17 0.15 0.2 0.26 0.24 0.27 0.21 0.46 0.28 0.15 1.0 0.07 0.02 0.08 0.0 0.0 0.03 0.12 0.13 0.05 0.23 0.09 0.08 0.09 0.11 0.09 0.11
0.08 0.1 0.09 0.07 0.11 0.07 0.09 0.1 0.13 0.09 0.12 0.1 0.05 0.16 0.0 1.0 0.17 0.11 0.48 0.0 0.0 0.0 0.07 0.29 0.01 0.3 0.25 0.11 0.2 0.3 0.11 0.37
0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.16 0.32 0.16 1.0 0.05 0.8 0.43 0.15 0.08 0.0 0.04 0.17 0.02 0.09 0.4 0.1 0.18 0.19 0.14 0.3
0.27 0.25 0.24 0.27 0.33 0.29 0.2 0.19 0.23 0.24 0.19 0.17 0.63 0.25 0.05 1.0 0.13 0.09 0.14 0.02 0.09 0.0 0.11 0.13 0.05 0.11 0.1 0.15 0.15 0.14 0.1 0.1
0.02 0.04 0.02 0.03 0.03 0.02 0.03 0.09 0.06 0.09 0.06 0.05 0.57 0.05 0.04 1.0 0.04 0.07 0.1 0.0 0.03 0.0 0.02 0.04 0.01 0.08 0.02 0.02 0.07 0.06 0.03 0.04
0.13 0.08 0.08 0.09 0.07 0.07 0.07 0.08 0.13 0.13 0.16 0.18 0.43 0.12 0.07 1.0 0.03 0.01 0.03 0.03 0.01 0.04 0.07 0.08 0.18 0.17 0.08 0.07 0.04 0.06 0.05 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.03
0.05 0.04 0.03 0.04 0.06 0.04 0.05 0.06 0.05 0.08 0.06 0.04 0.56 0.18 0.07 1.0 0.06 0.05 0.37 0.0 0.01 0.0 0.22 0.21 0.01 0.14 0.08 0.09 0.12 0.09 0.07 0.06
0.02 0.02 0.03 0.03 0.05 0.02 0.03 0.05 0.04 0.03 0.05 0.03 0.57 0.24 0.06 0.93 0.02 0.41 0.95 0.41 1.0 0.19 0.03 0.13 0.04 0.23 0.56 0.11 0.2 0.2 0.49 0.59
0.04 0.15 0.04 0.04 0.0 0.07 0.06 0.01 0.03 0.04 0.03 0.11 0.35 0.0 0.03 1.0 0.09 0.07 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.07 0.04 0.04 0.0 0.05 0.22 0.08 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.41 1.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.17 0.0 0.16
0.04 0.04 0.01 0.04 0.02 0.04 0.05 0.03 0.02 0.01 0.05 0.03 0.3 0.45 0.05 1.0 0.02 0.08 0.13 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.07 0.07 0.01 0.04 0.04 0.02 0.03
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.14 0.19 0.08 1.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.04 0.05 0.07 0.03 0.15 0.07 0.07 0.05 0.05 0.05 0.07 0.25 0.22 0.03 1.0 0.04 0.02 0.09 0.0 0.07 0.0 0.05 0.06 0.36 0.03 0.0 0.0 0.05 0.03 0.04 0.06
0.2 0.14 0.12 0.15 0.21 0.17 0.12 0.16 0.23 0.26 0.25 0.19 0.7 0.21 0.27 1.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.28 0.02 0.03 0.01 0.03 0.01 0.02
0.11 0.02 0.04 0.08 0.04 0.08 0.11 0.15 0.04 0.08 0.1 0.04 0.28 0.68 0.17 1.0 0.04 0.08 0.06 0.0 0.01 0.34 0.01 0.02 0.11 0.1 0.31 0.25 0.07 0.07 0.03 0.02
0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.04 0.07 0.1 0.45 0.47 0.37 1.0 0.01 0.0 0.01 0.12 0.0 0.15 0.01 0.03 0.0 0.18 0.0 0.04 0.01 0.04 0.0 0.0
0.01 0.06 0.03 0.04 0.0 0.03 0.03 0.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.02 0.06 0.14 1.0 0.01 0.36 0.97 0.0 0.29 0.0 0.02 0.13 0.03 0.03 0.1 0.12 0.12 0.18 0.2 0.58
0.26 0.13 0.14 0.12 0.18 0.1 0.12 0.17 0.14 0.15 0.13 0.21 0.1 0.03 0.04 1.0 0.25 0.26 0.43 0.07 0.0 0.0 0.12 0.27 0.06 0.09 0.05 0.08 0.2 0.3 0.07 0.05
0.09 0.05 0.13 0.12 0.04 0.13 0.11 0.02 0.11 0.03 0.08 0.11 0.18 0.02 0.06 1.0 0.03 0.01 0.07 0.03 0.05 0.05 0.07 0.09 0.08 0.02 0.05 0.01 0.02 0.06 0.05 0.08
0.02 0.02 0.08 0.14 0.09 0.07 0.02 0.05 0.05 0.05 0.0 0.08 0.1 0.14 0.07 0.9 0.02 0.09 1.0 0.0 0.19 0.0 0.11 0.23 0.47 0.24 0.0 0.0 0.25 0.24 0.54 0.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.46 0.43 0.44 0.4 0.45 0.39 0.4 0.34 0.41 0.4 0.45 0.42 0.41 0.66 0.31 0.85 0.23 0.37 0.53 0.16 1.0 0.51 0.25 0.42 0.39 0.72 0.65 0.35 0.32 0.35 0.35 0.39
0.03 0.05 0.04 0.04 0.0 0.0 0.05 0.02 0.1 0.0 0.19 0.04 0.13 0.42 0.25 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.0 0.0
0.07 0.0 0.0 0.0 0.07 0.08 0.0 0.0 0.09 0.17 0.0 0.0 0.17 0.36 0.0 1.0 0.04 0.0 0.37 0.0 0.17 0.0 0.11 0.0 0.0 0.36 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.03 0.03 0.05 0.02 0.03 0.03 0.01 0.09 0.1 0.02 0.03 0.48 0.33 0.17 1.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03
0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.23 0.26 0.12 1.0 0.04 0.28 0.59 0.02 0.56 0.16 0.02 0.19 0.04 0.32 0.28 0.1 0.19 0.17 0.22 0.39
0.18 0.19 0.09 0.22 0.32 0.23 0.24 0.27 0.25 0.25 0.2 0.2 0.93 0.32 0.3 1.0 0.14 0.06 0.42 0.0 0.0 0.0 0.21 0.23 0.11 0.37 0.29 0.15 0.31 0.26 0.3 0.16
0.18 0.15 0.21 0.18 0.15 0.18 0.33 0.31 0.38 0.21 0.25 0.24 0.35 0.18 0.08 1.0 0.04 0.1 0.03 0.0 0.01 0.0 0.23 0.23 0.18 0.01 0.08 0.07 0.06 0.11 0.03 0.04
0.02 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.05 0.0 0.24 0.0 0.0 0.12 0.5 0.35 1.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.19 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0
0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.22 0.0 0.71 0.25 0.11 1.0 0.27 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.28 0.27 0.0 0.0 0.35 0.0 0.25 0.0 0.14 0.0
0.04 0.04 0.05 0.05 0.05 0.04 0.05 0.06 0.06 0.05 0.05 0.05 0.18 0.11 0.09 1.0 0.04 0.02 0.04 0.05 0.06 0.0 0.05 0.08 0.02 0.09 0.09 0.08 0.08 0.08 0.06 0.06
0.08 0.08 0.15 0.06 0.07 0.1 0.2 0.16 0.22 0.17 0.18 0.09 0.18 0.58 0.22 0.62 0.12 1.0 0.31 0.27 0.16 0.18 0.29 0.59 0.15 0.18 0.83 0.45 0.31 0.31 0.39 0.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.08 0.17 0.25 1.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.16 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.2 0.0
0.23 0.23 0.14 0.16 0.18 0.23 0.21 0.17 0.19 0.22 0.2 0.27 0.18 0.49 0.29 0.75 0.14 0.55 1.0 0.29 0.78 0.23 0.12 0.3 0.4 0.37 0.25 0.17 0.34 0.4 0.31 0.4
0.24 0.18 0.13 0.19 0.17 0.17 0.17 0.13 0.14 0.19 0.18 0.16 0.57 0.54 0.51 1.0 0.11 0.09 0.51 0.0 0.0 0.0 0.08 0.09 0.01 0.37 0.24 0.26 0.13 0.14 0.08 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.22 0.03 1.0 0.0 0.08 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.47 0.1 0.04 0.04 0.03 0.04
0.14 0.14 0.13 0.18 0.13 0.14 0.13 0.16 0.14 0.13 0.13 0.15 0.92 0.31 0.24 1.0 0.08 0.06 0.33 0.0 0.01 0.0 0.31 0.37 0.07 0.38 0.26 0.3 0.1 0.12 0.12 0.08
0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.17 0.02 0.02 1.0 0.05 0.08 0.34 0.06 0.06 0.0 0.11 0.22 0.05 0.1 0.11 0.05 0.13 0.15 0.17 0.16
0.24 0.22 0.25 0.3 0.32 0.26 0.31 0.34 0.34 0.43 0.34 0.31 0.71 0.41 0.27 1.0 0.26 0.34 0.31 0.22 0.14 0.37 0.2 0.33 0.04 0.25 0.16 0.1 0.23 0.24 0.24 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 1.0 0.24 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.2 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.23 0.24 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.46 0.04 1.0 0.0 0.09 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0
0.14 0.16 0.19 0.15 0.15 0.15 0.14 0.13 0.16 0.17 0.17 0.13 0.79 0.27 0.1 1.0 0.17 0.12 0.37 0.15 0.07 0.19 0.31 0.3 0.21 0.54 0.36 0.29 0.23 0.3 0.25 0.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.1 0.08 0.0 0.07 0.29 0.1 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.09 0.07 0.12 0.02 0.11 0.1 0.05 0.06 0.11 0.09 0.08 0.36 0.2 0.19 1.0 0.07 0.42 0.76 0.04 0.04 0.0 0.09 0.18 0.08 0.25 0.57 0.11 0.16 0.14 0.08 0.14
0.04 0.04 0.04 0.05 0.02 0.05 0.04 0.05 0.04 0.04 0.03 0.02 0.25 0.2 0.05 1.0 0.02 0.07 0.1 0.01 0.01 0.0 0.1 0.2 0.03 0.02 0.07 0.07 0.06 0.07 0.04 0.06
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.06 0.01 0.21
0.08 0.09 0.08 0.06 0.07 0.07 0.06 0.07 0.07 0.06 0.06 0.07 0.25 0.33 0.16 1.0 0.14 0.26 0.63 0.06 0.02 0.04 0.22 0.44 0.23 0.29 0.18 0.11 0.21 0.23 0.18 0.2
0.1 0.09 0.06 0.05 0.07 0.08 0.09 0.15 0.04 0.09 0.16 0.05 0.1 0.18 0.15 1.0 0.14 0.11 0.58 0.0 0.0 0.06 0.53 0.7 0.09 0.08 0.04 0.14 0.74 0.38 0.13 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.9 0.4 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.27 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 1.0 0.89 0.14
0.28 0.26 0.24 0.2 0.3 0.2 0.25 0.19 0.17 0.26 0.25 0.28 0.44 0.5 0.49 1.0 0.12 0.13 0.4 0.0 0.12 0.11 0.08 0.09 0.17 0.3 0.2 0.21 0.23 0.23 0.16 0.15

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)