Heatmap: Cluster_186 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.23 0.18 0.36 0.37 0.38 0.48 0.41 0.4 0.35 0.16 0.31 0.34 -2.14 -1.95 -3.25 -1.86 0.51 0.27 -1.0 -1.15 0.77 -4.35 -0.08 -0.31 1.12 -0.83 0.11 0.22 0.25 0.15 -0.07 -0.54
-0.35 -0.43 -0.1 0.18 0.21 0.2 0.49 0.4 0.36 0.15 0.06 -0.12 -2.77 -1.53 -2.8 -2.16 0.36 -0.23 -1.49 -1.08 1.07 0.73 -0.67 -1.08 1.77 -0.34 -0.22 -0.13 0.12 -0.0 0.31 0.06
0.14 -0.28 -0.02 -0.26 -0.17 -0.13 0.11 0.15 0.35 0.39 0.32 0.28 -0.66 -0.6 -0.95 0.08 -0.4 -0.73 0.19 -2.15 1.39 -3.02 -0.15 -0.12 1.22 0.0 -0.15 -0.26 0.25 0.39 -0.41 -0.4
-0.08 -0.09 -0.28 -0.08 -0.19 -0.05 -0.21 0.15 0.01 -0.24 -0.19 -0.33 -0.16 -0.25 -0.55 0.06 -0.62 -1.12 0.32 -1.35 1.43 -0.03 0.2 -0.25 0.81 0.66 0.63 0.54 -0.58 -0.47 -0.41 -0.64
0.36 0.01 0.14 0.15 0.12 0.26 0.23 0.41 0.38 0.39 0.42 0.49 -2.48 -2.78 -5.43 -2.46 0.1 -0.43 -1.8 -0.28 1.58 -2.89 -0.31 -0.67 0.69 0.5 0.19 0.05 0.18 -0.02 0.02 0.0
0.24 0.07 -0.05 -0.03 -0.26 -0.33 -0.33 -0.26 -0.05 0.12 0.16 0.34 0.48 0.36 -1.49 0.56 0.04 -2.13 -0.47 -2.57 0.72 -2.35 -0.86 -0.72 1.66 -0.46 -0.04 0.2 0.3 0.52 -0.61 0.19
-0.85 -0.58 -1.33 -0.57 -0.76 -0.28 -0.33 0.33 0.38 0.36 0.12 0.16 -1.34 -0.95 -0.83 -0.53 -0.61 -0.43 -0.02 -2.95 1.5 - -0.47 -0.42 1.6 1.43 0.71 0.94 0.27 0.33 -1.3 -1.55
-0.09 -0.2 0.22 0.08 0.28 0.44 0.3 0.52 0.41 0.28 0.16 -0.27 -2.89 -2.09 -0.42 -1.33 0.2 -0.57 0.18 -1.35 0.55 -0.12 -0.21 -0.47 1.03 -0.46 0.07 0.26 0.3 0.44 -0.12 -0.2
-0.33 -0.54 -0.85 -0.62 0.17 0.59 0.93 0.61 0.55 0.6 -0.06 0.0 -2.66 -3.32 -1.23 -1.62 -0.36 -0.74 0.11 -3.97 0.79 -1.56 -0.58 -1.28 1.72 0.42 0.19 0.64 0.41 0.43 -0.3 -0.27
-0.16 -0.17 -0.27 0.04 0.39 0.44 0.56 0.33 0.18 0.3 0.1 -0.07 -0.28 -0.35 0.22 -0.09 -1.0 -1.06 -0.34 -0.3 1.63 -2.2 -0.83 -0.66 1.46 -0.17 -0.1 0.11 -0.67 -0.55 -1.26 -1.34
-0.21 -0.7 -0.79 -0.87 -0.81 -0.37 -0.03 0.08 0.36 0.33 0.33 0.57 -0.98 -1.6 -1.83 -0.99 -0.55 -0.62 0.04 -0.73 1.08 -0.27 -0.78 -0.55 1.85 -0.06 -0.17 -0.21 0.16 0.2 0.96 0.5
-0.29 0.09 0.29 0.19 0.29 0.48 0.26 0.28 -0.1 -0.06 -0.14 -0.25 -1.58 -1.49 -1.87 -1.87 -0.32 -0.46 -0.95 0.33 1.72 -0.5 -0.58 -1.01 2.08 -1.0 0.13 0.12 -0.55 -0.57 -0.86 -0.82
0.11 0.19 0.17 0.16 0.34 0.38 0.27 0.14 0.08 0.32 -0.06 -0.24 -0.63 -0.37 -0.27 -0.41 -0.96 -0.94 -0.5 -0.68 1.81 0.17 -0.82 -0.83 1.24 -0.03 -0.11 0.17 -0.84 -0.74 -1.24 -1.17
0.22 0.17 -0.06 -0.14 -0.35 -0.16 -0.04 0.26 0.51 0.56 0.38 0.4 -2.8 -0.58 -2.01 -2.11 -0.21 0.2 -0.23 -0.52 0.97 -2.02 -0.37 -0.55 1.44 -2.03 -0.81 -1.4 0.37 0.25 0.72 0.96
0.26 0.38 0.26 0.35 0.25 0.24 0.22 -0.18 -0.05 -0.11 -0.11 -0.13 -0.56 0.4 0.7 -0.32 -0.28 -0.77 -0.14 -0.28 1.12 -0.58 -0.54 -0.58 0.43 -0.2 0.28 0.06 -0.5 -0.45 -0.66 -0.81
-0.78 -0.71 -0.43 -0.12 0.3 0.46 0.83 0.57 0.53 0.09 -0.04 -0.44 -1.72 -1.78 -1.84 -1.96 0.22 0.23 -1.25 0.17 1.2 -1.43 -0.59 -0.91 1.98 -1.23 0.33 0.44 0.1 -0.01 -0.54 -1.22
0.66 0.08 -0.22 0.05 0.02 -0.11 0.12 0.11 0.39 0.45 0.63 0.65 -0.7 -0.54 -0.8 -0.57 -0.23 -0.19 0.08 -1.86 0.09 -1.44 0.03 0.09 1.03 0.39 -0.53 -0.36 -0.01 0.14 -0.38 -0.4
-1.09 -1.66 -1.15 -0.88 -0.5 0.44 0.6 0.76 0.39 0.16 -0.4 -0.75 -3.4 -3.49 -0.77 -2.65 -0.7 -0.51 -0.24 -4.85 1.1 0.42 -0.91 -1.55 2.32 -0.45 1.45 1.22 -0.23 -0.45 -0.38 -0.87
0.4 0.19 0.1 0.05 -0.11 -0.13 -0.26 -0.11 -0.04 0.01 0.18 0.45 -2.82 -2.52 -3.19 -2.16 0.27 0.99 -0.94 -1.17 1.17 -2.53 -0.39 -0.86 0.95 0.39 0.68 0.81 0.32 0.17 -0.07 -0.16
0.05 0.28 0.26 0.18 0.09 0.27 0.43 0.07 0.24 0.17 -0.07 0.24 -1.01 -1.17 -1.96 -0.58 0.21 0.01 0.1 -0.57 0.56 -0.47 -0.16 -0.27 0.83 -0.36 -0.05 -0.06 0.19 0.13 -0.06 -0.08
0.53 0.18 0.02 0.06 -0.03 0.0 0.18 0.43 0.5 0.52 0.58 0.64 -1.29 -0.65 -1.9 -1.34 0.15 -0.0 -0.54 -2.08 1.07 -3.56 -0.17 -0.7 0.99 -0.43 -0.18 -0.23 0.26 0.22 -0.03 -0.39
0.25 0.1 -0.07 0.04 0.12 0.11 0.25 0.24 0.37 0.22 0.12 0.36 -6.08 -2.08 -4.78 -3.0 0.24 -0.25 -0.44 -1.44 1.03 -3.02 -0.29 -0.61 2.07 -0.83 0.05 0.31 0.22 0.25 -0.11 -0.15
-0.03 -0.38 -0.58 -0.42 -0.51 0.07 0.3 0.58 0.78 0.56 0.22 0.07 -0.58 -1.52 -5.25 -1.41 -0.11 -0.95 -1.74 -1.75 1.8 - 0.02 -0.38 1.84 -1.65 -1.67 -1.6 0.85 0.7 0.06 0.26
0.57 0.67 0.79 0.8 0.59 0.71 0.35 0.32 0.51 -0.31 0.14 0.02 -4.69 -3.27 -7.32 -2.32 0.39 -0.55 -1.16 -2.33 1.48 -5.65 -0.54 -0.67 1.21 -1.83 0.41 -1.43 0.46 0.27 -0.17 -0.8
-3.46 -2.35 -3.14 -3.12 - -0.07 -2.4 -1.81 -4.31 -2.24 -2.03 - -2.74 -0.34 -1.49 -1.09 0.27 -2.05 1.66 -0.29 2.75 -0.94 -0.38 -1.61 2.46 0.54 1.22 1.38 -0.62 0.08 -1.71 -3.06
-0.7 0.12 -10.14 -0.22 -1.4 0.25 -0.5 0.78 -1.24 -0.23 0.36 0.36 - -3.17 -0.9 -2.21 -0.94 -0.88 1.09 - 2.52 - -1.27 -2.27 2.36 0.01 -0.49 1.68 -2.41 -3.35 -1.06 -1.45
-0.55 0.19 -0.39 0.04 -0.17 0.1 -0.06 0.04 -0.18 0.38 -0.06 0.05 -1.05 -2.48 -3.67 -0.29 -0.23 -1.12 0.54 -5.15 1.56 -5.65 -0.08 -0.16 1.84 0.89 0.57 0.69 -0.19 -0.13 -1.15 -1.64
-0.04 -0.13 -0.1 0.18 0.18 0.4 0.32 0.44 0.33 0.24 0.09 0.16 -1.59 -1.42 -1.18 -1.32 -0.17 -0.57 -0.29 -0.21 1.06 -1.16 -0.51 -0.65 1.14 0.12 0.49 0.54 -0.1 -0.17 -0.19 -0.21
-0.0 -0.33 -0.28 -0.24 -0.09 -0.05 -0.01 0.27 0.29 0.08 0.23 0.06 -0.65 -1.66 -2.29 -0.55 -0.1 -0.86 -0.36 -0.31 1.73 -0.91 -0.13 -0.23 1.4 0.31 -0.18 -0.16 0.08 0.03 -0.21 -0.3
0.43 0.19 -0.13 0.35 0.73 0.67 0.49 0.18 0.31 0.25 0.2 0.52 -1.49 -1.42 -1.57 -1.2 0.25 -0.78 -0.07 -2.37 0.77 -1.65 -0.03 -0.35 0.88 -0.24 0.03 0.2 -0.14 -0.11 -0.4 -0.2
-0.13 -0.61 -0.64 -0.94 -1.03 -0.11 -0.13 -0.2 0.25 0.46 0.24 0.51 -2.08 -2.9 -4.85 -1.3 0.73 1.06 -0.51 -3.58 1.19 -4.86 -0.33 -0.91 1.05 0.25 0.24 0.11 0.42 0.41 1.01 0.78
-0.81 -0.45 -1.32 0.08 -1.9 -0.58 -1.14 -0.22 0.35 -1.02 -1.18 -0.1 -1.4 -0.02 -0.3 -2.9 -0.67 -1.34 1.84 -2.14 2.32 - 0.03 -0.73 1.86 0.4 0.5 0.35 -0.05 -0.57 -1.2 -1.46
-0.26 0.1 0.33 -0.02 0.18 -1.02 -0.1 -0.32 -0.22 -0.55 -0.91 0.13 -1.09 -1.07 -0.01 -1.06 -1.22 0.03 -0.15 -1.39 2.25 0.63 -0.52 -0.7 1.8 0.24 -0.88 -0.38 -0.81 -0.69 -0.5 -0.52
0.54 0.26 0.97 0.49 0.67 1.05 0.66 0.3 0.65 1.02 0.68 0.37 - -2.57 -6.34 - -4.07 -5.41 -3.57 0.44 2.55 -2.69 -3.24 -3.18 2.05 -2.75 -2.13 -2.22 -4.5 -3.5 -3.09 -3.33
-0.25 -1.08 -1.97 -0.21 -0.21 0.16 -1.55 -0.49 0.17 0.14 0.28 0.22 -4.64 -1.56 -1.73 -2.05 -0.38 -1.46 -0.21 - 1.4 -1.0 -0.8 0.14 2.25 1.35 0.24 1.28 0.05 -0.27 -0.52 -0.46
0.14 -0.31 0.04 -0.43 -0.21 -0.06 -0.1 0.54 0.77 0.25 0.57 0.17 -6.37 -5.19 - -4.32 0.23 - -0.85 -0.76 1.6 -3.1 -0.98 -1.57 1.86 -0.04 0.93 0.78 0.05 -0.08 0.11 -0.11
0.25 -0.28 -0.49 -0.19 -0.27 -0.06 -0.02 0.32 0.41 0.53 0.42 0.57 -0.64 -1.22 -0.96 -0.43 -0.26 -1.11 -0.1 -1.07 0.55 -0.1 0.01 0.21 1.16 0.72 0.05 -0.33 -0.18 -0.03 -0.24 -0.42
-0.72 -0.77 -1.91 -0.78 -0.41 -0.76 -0.34 -0.52 0.04 -0.23 -0.1 -0.33 -2.56 -2.22 -1.76 -1.59 0.0 -1.23 0.18 -0.05 1.18 -1.47 -0.3 -0.93 1.83 1.68 1.25 1.17 -0.18 0.05 -0.39 -0.07
-0.01 0.04 -0.21 0.13 0.05 0.26 0.19 0.35 0.48 0.6 0.23 0.41 -0.97 -1.69 -0.36 -0.28 -0.24 -3.17 0.62 -0.22 0.67 -3.13 -0.23 -0.37 1.3 0.26 -0.22 -0.21 -0.18 -0.12 -0.26 -0.31
-0.45 1.14 -0.33 - - - - -0.81 - - - - - - -1.65 - - - -0.16 1.52 2.93 - - - 1.86 1.11 1.98 2.28 -1.08 -0.11 - -
-0.22 -0.92 -0.59 -0.44 -0.54 -0.4 -0.81 -0.2 -0.22 0.06 0.1 -0.01 -0.9 -0.92 -1.69 0.09 -0.28 -3.57 0.35 -0.03 1.03 -0.39 0.28 0.05 1.84 0.98 -0.23 -0.87 0.42 0.24 0.1 0.24
-0.92 -0.44 -0.47 -0.43 -0.97 -0.29 -0.96 -0.47 0.53 0.52 0.22 0.05 -1.11 -0.67 -0.71 -0.58 -0.16 -1.99 0.07 -1.12 1.55 - -0.19 -0.02 1.48 1.37 0.4 0.33 0.28 -0.11 -0.08 -0.35
-1.66 -2.19 - -0.43 -1.3 -0.04 - -3.48 -2.04 0.73 -0.92 0.04 - - - - -2.06 -0.79 - - -0.72 - 0.9 0.63 2.72 2.51 2.39 1.16 -1.67 -1.58 - -0.9
-1.36 -1.17 -0.75 -0.37 -0.3 0.01 -0.52 -0.58 -0.74 -0.55 -1.7 -1.12 -4.74 -4.1 -2.71 -3.91 -0.21 -0.38 0.45 - 2.51 -5.36 0.26 -0.81 1.56 1.26 1.27 0.72 0.09 0.24 0.41 -0.34
-0.71 -0.44 -0.17 -0.03 0.27 0.39 0.37 0.03 -0.19 -0.52 -0.61 -0.82 -1.41 -0.87 -0.81 -1.07 -0.37 -0.64 -0.2 -1.89 2.0 0.28 -0.47 -0.76 1.6 -0.04 0.59 0.71 -0.25 -0.18 -0.56 -0.8
-0.35 -0.25 -0.0 -0.04 -0.16 -0.01 0.17 0.45 0.62 0.57 0.59 0.31 -1.93 -1.98 -2.12 -1.04 -0.03 -3.34 0.2 -2.0 0.78 -6.11 0.28 0.17 1.6 0.97 0.08 0.2 -0.21 -0.32 -0.54 -0.08
0.78 -0.72 -1.16 -0.84 -1.71 0.32 0.04 0.92 0.38 0.66 0.67 -0.08 -1.76 -2.73 -0.69 -1.06 -0.39 0.62 0.18 - 1.44 - -0.29 -0.97 0.94 -0.38 0.52 0.28 0.15 0.26 0.2 -0.05
0.05 0.17 -0.02 0.1 0.14 -0.06 -0.19 -0.3 -0.26 -0.07 -0.11 -0.01 -0.18 0.22 0.2 0.23 -0.68 -0.38 0.11 -0.61 1.55 0.16 -0.35 -0.43 0.88 -0.09 -0.24 -0.23 -0.42 -0.6 -0.51 -0.54
0.31 -0.29 -0.95 -0.97 -0.24 0.08 -1.18 -0.4 0.18 0.17 0.12 -0.13 0.07 -0.32 -4.38 -0.09 0.29 -0.63 -0.56 -3.26 1.54 -5.63 0.66 0.59 1.76 -0.98 -0.42 -0.53 0.44 0.5 -0.02 -0.05
0.07 -0.09 0.33 0.61 0.53 0.5 0.81 0.65 0.58 0.3 0.33 0.2 -4.61 -2.69 -4.5 -3.47 0.14 -0.55 -1.53 -0.41 0.24 -2.75 -1.23 -1.78 2.04 -0.21 0.2 0.18 -0.17 -0.34 -0.32 -0.17
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-0.34 0.26 -0.02 0.05 0.43 0.65 -0.08 -0.28 -0.52 -0.42 -0.63 -0.63 -0.08 -0.58 0.02 0.01 -0.14 -0.31 0.07 -0.78 1.34 -1.77 0.12 0.0 1.16 -0.53 0.51 0.62 -0.28 0.05 -1.29 -1.01
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-0.25 -0.14 -0.2 -0.09 -0.06 0.35 0.43 0.48 0.21 -0.04 -0.05 -0.09 -1.81 -0.77 -0.99 -1.32 -0.21 -0.91 -0.13 -1.76 1.23 -3.3 -0.88 -0.98 1.38 0.21 1.13 1.0 -0.09 -0.13 -0.16 -0.21
0.56 0.6 0.44 0.27 0.18 0.18 0.03 0.18 0.19 0.29 0.32 0.45 -0.43 -0.42 -1.24 -0.53 -0.07 -0.08 -0.26 -1.04 0.24 -1.11 -0.16 -0.36 1.15 -0.81 -0.29 -0.1 0.03 0.16 -0.61 -0.84
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-0.7 0.08 -0.18 0.22 0.04 -0.09 0.26 0.21 0.51 0.26 0.12 0.19 -0.13 -1.66 -1.98 0.13 0.14 0.28 -0.09 -0.48 0.48 0.3 -0.31 -0.2 1.32 -0.3 -0.65 -0.88 0.09 0.13 -0.28 -0.36
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.