Heatmap: Cluster_95 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.4 0.24 0.25 0.17 0.1 0.19 0.57 0.25 0.38 0.43 0.38 0.26 -0.12 1.65 1.71 0.16 -0.02 -0.41 -0.45 -3.75 -5.59 -5.54 -0.89 0.0 -8.03 -0.74 -1.14 -1.2 -0.53 -0.22 -0.3 -0.44
0.23 0.09 -0.09 0.16 0.39 0.25 0.01 0.15 -0.07 -0.02 -0.19 -0.21 0.28 0.85 0.96 0.37 -0.48 -0.43 0.34 -2.46 -1.2 -1.8 -0.11 0.07 -0.64 0.12 0.25 0.11 -0.48 -0.37 -0.09 0.18
-0.28 -0.28 -0.01 0.12 0.24 0.04 0.05 0.21 0.58 0.74 0.49 0.14 1.04 1.32 1.35 0.99 -1.04 -1.59 -1.4 -1.32 -5.21 -3.13 0.47 0.36 -3.11 -0.27 -0.55 -0.46 -1.01 -0.73 -0.77 -0.57
-0.14 -0.32 -0.3 0.03 0.18 0.18 -0.11 0.23 0.45 0.86 0.67 0.29 0.96 1.23 1.02 1.01 -1.22 -1.5 -1.54 -1.14 -1.21 -0.84 0.3 0.51 -1.33 -0.53 -0.74 -0.85 -1.27 -0.81 -0.81 -0.44
0.01 -0.18 -0.23 -0.12 -0.25 -0.3 -0.1 0.09 -0.02 0.04 -0.02 -0.0 0.76 1.35 1.06 0.47 -0.26 -0.41 0.14 -2.1 -0.94 -2.06 -0.15 -0.01 0.0 0.27 -0.42 -0.58 -0.2 -0.21 0.01 0.06
0.28 -0.04 -0.1 -0.19 -0.23 -0.18 -0.22 -0.05 0.09 0.1 0.14 0.07 0.86 1.46 1.41 0.54 -0.47 -0.52 0.21 -4.25 -2.15 -3.2 -0.07 0.1 -0.98 0.1 -0.38 -0.66 -0.46 -0.48 -0.18 0.25
0.03 0.23 0.36 0.12 0.14 0.28 -0.04 -0.05 -0.2 -0.22 -0.13 -0.43 0.51 0.99 1.01 0.69 -0.29 -0.36 0.85 -2.45 -1.93 -3.03 0.02 0.19 -1.09 0.22 0.35 0.54 -0.63 -0.27 -1.37 -1.29
0.18 -0.05 -0.18 -0.11 0.09 0.04 -0.19 0.27 0.05 0.2 0.31 0.06 0.71 0.95 1.14 0.68 -0.57 -1.07 -0.17 -0.62 -0.54 -1.69 -0.24 0.06 -0.01 -0.32 -0.65 -0.64 -0.49 -0.47 -0.05 0.04
0.55 0.13 0.34 0.3 0.28 0.43 0.08 0.07 0.14 0.04 0.33 0.09 -0.03 0.81 1.15 0.06 -0.17 0.4 -0.11 -1.78 -2.05 -1.4 -0.27 -0.28 -2.35 0.01 0.1 -0.0 -0.5 -0.46 -0.66 -0.32
-0.49 -0.15 -0.01 0.18 0.27 0.5 0.24 0.01 -0.3 -0.36 -0.58 -0.73 0.98 1.41 1.0 0.77 -0.28 -0.37 0.28 -4.23 -2.67 -5.45 -0.15 -0.27 -0.0 -0.14 0.53 0.26 -0.34 -0.38 -0.67 -0.46
0.34 0.26 0.31 0.46 0.37 0.65 0.27 0.2 0.28 0.31 0.19 0.17 0.24 0.46 1.06 0.41 -0.25 -0.48 0.06 -1.7 -4.54 -3.7 -0.23 -0.06 -1.78 0.32 0.01 0.26 -0.55 -0.32 -1.01 -1.08
0.11 0.27 0.24 0.22 0.26 0.14 -0.02 0.08 0.02 -0.0 0.09 -0.18 0.42 0.94 1.13 0.56 -0.41 -0.94 0.11 -2.83 -2.06 -4.33 -0.01 0.07 -0.98 0.49 0.28 0.44 -0.53 -0.35 -0.59 -0.51
-0.67 -0.28 -0.07 -0.01 0.29 -0.09 -0.08 0.07 0.1 0.25 0.05 -0.01 0.73 0.77 1.16 0.84 -0.46 -1.21 -0.04 -0.6 -0.44 -0.4 -0.28 0.29 -0.68 0.5 -0.12 0.13 -0.46 -0.32 -1.31 -1.14
-0.02 -0.11 -0.27 -0.2 -0.35 -0.23 -0.34 -0.2 -0.07 0.01 0.11 0.14 0.41 1.1 0.98 0.59 -0.29 -0.0 0.02 -1.46 -0.89 -0.81 0.32 0.61 -1.17 0.67 -0.47 -0.5 -0.35 -0.25 -0.23 -0.05
-0.2 -0.21 -0.12 -0.16 -0.16 -0.18 -0.26 -0.09 -0.14 -0.2 -0.28 -0.38 0.82 1.54 1.31 0.67 -0.44 -0.25 0.37 -3.57 -2.03 -1.86 -0.03 0.18 0.07 -0.14 0.15 -0.17 -0.28 -0.17 -0.42 -0.32
0.08 0.09 0.02 0.19 0.19 0.05 0.04 0.15 0.18 0.09 0.03 -0.02 0.25 0.87 1.15 0.45 -0.31 -0.75 0.24 -3.62 -3.18 -4.18 -0.11 0.1 -1.06 0.48 0.3 0.42 -0.29 -0.18 -0.31 -0.28
-0.02 -0.08 -0.09 -0.07 0.01 0.1 0.13 0.22 0.27 0.25 0.21 0.06 0.41 0.95 1.08 0.54 -0.14 -0.2 0.04 -2.45 -1.11 -2.55 -0.03 0.05 -0.19 -0.05 -0.48 -0.57 -0.1 -0.01 -0.35 -0.24
0.23 -0.03 -0.02 0.05 0.01 0.21 0.07 0.09 0.14 0.07 -0.06 -0.13 0.3 0.94 1.01 0.61 -0.26 -0.21 0.33 -0.64 -2.36 -0.7 -0.22 0.01 -0.62 0.26 -0.28 -0.03 -0.1 0.07 -1.19 -1.01
0.45 0.37 0.45 0.32 0.29 0.22 0.28 0.17 0.25 0.37 0.3 0.28 0.5 0.46 0.79 0.61 -0.0 -0.45 -0.11 - -9.43 -6.39 0.08 0.28 -4.27 -0.53 -0.32 0.01 -0.04 0.05 -0.3 -0.47
-0.22 0.0 -0.08 -0.14 -0.02 -0.13 -0.25 -0.33 -0.17 -0.07 0.04 -0.31 1.07 1.66 1.39 1.26 -0.73 -0.98 0.13 -2.09 -1.64 -4.65 -0.11 0.07 -1.31 0.28 -0.09 0.2 -0.46 -0.27 -1.05 -1.96
-0.08 0.2 0.22 0.19 0.17 0.19 0.19 0.29 0.35 0.21 0.33 0.07 0.86 0.51 1.14 1.13 -0.29 -0.67 0.02 -1.72 -4.73 -4.27 0.05 0.03 -1.65 0.06 -0.64 -0.23 -0.1 0.14 -1.28 -1.3
0.05 0.3 0.3 0.47 0.34 0.18 0.26 0.3 0.28 0.26 0.24 0.08 0.22 0.67 0.89 0.3 -0.3 -0.9 -0.09 -3.89 -4.08 -3.72 0.09 0.04 -2.59 0.31 0.11 0.19 -0.33 -0.14 -0.18 0.01
-0.27 -0.25 -0.44 -0.23 -0.13 -0.08 -0.28 -0.17 -0.24 -0.27 -0.21 -0.53 1.12 1.42 1.55 0.92 -0.71 -0.71 0.1 -3.53 -3.44 -3.35 0.2 0.71 0.61 -0.05 -0.04 0.1 -0.67 -0.45 -1.07 -0.88
-0.19 0.09 0.09 0.18 0.19 0.13 0.1 -0.01 -0.07 -0.08 -0.15 -0.28 0.5 1.24 0.79 0.85 -0.15 -0.6 0.34 -2.91 -1.55 -1.27 0.19 0.12 -0.33 0.05 0.03 0.1 -0.29 -0.22 -0.82 -0.89
0.42 0.44 0.34 0.31 0.3 0.35 0.06 0.18 0.15 0.3 0.19 0.13 0.37 0.84 0.97 0.34 -0.62 -0.89 0.22 -1.59 -2.04 -1.76 0.01 0.06 -0.06 -0.54 -0.31 -0.13 -0.63 -0.48 -0.85 -0.55
-0.18 -0.05 0.05 -0.06 -0.08 -0.13 0.04 0.11 0.18 0.21 0.12 -0.05 0.52 0.88 1.17 0.53 -0.29 -0.42 0.24 -0.79 -1.77 -1.67 0.18 0.29 -0.99 0.19 -0.63 -0.42 -0.23 -0.07 -0.29 -0.09
-0.17 -0.2 -0.12 -0.04 -0.06 -0.04 -0.25 -0.28 -0.43 -0.42 -0.37 -0.54 0.71 1.16 1.32 0.8 -0.53 -0.5 0.37 -0.41 -2.8 -1.86 -0.07 0.09 -0.24 0.64 0.48 0.35 -0.63 -0.58 -0.56 -0.44
-0.11 -0.11 -0.06 0.03 0.14 0.07 0.07 0.1 0.08 0.06 -0.02 -0.23 0.67 0.71 1.09 0.67 -0.35 -0.8 0.21 -2.16 -1.93 -1.88 -0.05 0.08 -0.6 0.43 0.26 0.37 -0.22 -0.11 -0.5 -0.47
-0.44 -0.06 0.03 0.29 0.15 0.13 0.11 0.07 -0.05 -0.15 -0.28 -0.37 0.48 1.39 1.0 0.61 -0.15 -0.49 -0.11 -3.59 -1.85 -4.06 0.6 0.49 -0.44 -0.6 0.09 0.15 -0.38 -0.26 -0.33 -0.24
0.51 0.33 0.06 -0.08 -0.07 -0.18 -0.26 -0.22 -0.02 -0.02 0.04 -0.02 0.8 1.09 1.48 1.19 -0.48 -1.04 0.35 -4.46 -3.7 -4.81 -0.14 0.1 -2.0 0.53 -0.42 -0.29 -0.21 -0.03 -0.91 -0.69
0.06 0.24 0.26 0.44 0.46 0.48 0.16 0.21 0.21 0.1 0.02 -0.02 0.56 0.75 0.66 0.6 0.03 -0.54 0.54 -4.13 -4.91 -5.82 0.13 0.02 -2.48 0.2 -0.1 0.27 -0.15 -0.06 -1.2 -0.84
0.24 -0.06 0.09 -0.01 0.05 0.08 0.07 0.12 -0.02 0.06 0.06 -0.13 0.32 0.47 1.09 0.47 -0.42 -0.65 0.06 -0.92 -2.05 -0.83 -0.29 -0.05 -1.24 0.58 0.41 0.51 -0.33 -0.34 -0.32 -0.27
-0.46 -0.29 -0.43 -0.39 -0.34 -0.4 -0.34 -0.34 -0.36 -0.38 -0.58 -0.57 0.89 1.49 1.4 0.29 -0.23 0.01 0.78 -2.11 -3.11 -2.61 -0.11 0.27 0.25 0.39 0.33 0.05 -0.24 -0.06 -0.53 -0.15
-0.23 -0.03 0.03 0.16 0.11 0.13 -0.03 -0.16 -0.09 -0.26 -0.3 -0.4 0.68 1.06 1.3 0.71 -0.04 -0.58 0.1 -2.31 -2.25 -2.05 0.07 0.19 -1.34 0.23 0.42 0.53 -0.2 -0.13 -0.77 -0.82
0.04 0.08 0.13 0.17 0.14 0.16 0.18 0.29 0.12 0.2 0.08 0.0 0.32 0.61 0.99 0.41 -0.35 -0.64 0.3 -1.28 -2.41 -0.64 -0.14 0.02 -2.95 0.47 0.03 0.17 -0.3 -0.17 -0.35 -0.37
-0.18 -0.01 -0.09 -0.15 -0.28 -0.28 -0.06 0.06 0.27 0.39 0.28 0.18 0.53 0.59 0.43 0.65 -0.47 -0.7 0.06 -2.78 -1.57 -3.54 0.43 0.68 -0.59 0.83 -0.26 -0.11 -0.21 -0.08 0.0 0.01
0.08 -0.05 -0.06 0.2 0.22 0.07 0.06 0.23 0.19 0.09 0.12 -0.05 0.39 0.86 0.99 0.37 -0.35 -0.86 0.1 -2.89 -1.94 -3.42 -0.07 0.06 -0.68 0.62 0.35 0.44 -0.35 -0.23 -0.42 -0.47
-0.22 -0.14 -0.11 0.09 0.06 -0.02 -0.35 -0.07 -0.37 -0.56 -0.46 -0.67 0.72 1.34 1.21 0.9 -0.45 -1.0 0.61 -3.21 -2.26 -2.68 0.26 0.51 -0.0 0.13 0.53 0.74 -0.56 -0.33 -1.46 -1.4
-0.66 -0.44 0.06 0.05 0.24 0.24 0.27 0.29 0.24 0.15 0.08 -0.4 1.11 0.37 1.06 0.02 -0.51 -0.54 -0.07 -0.19 -0.85 -0.23 0.0 0.13 -0.75 -0.24 0.27 0.36 -0.58 -0.41 -0.96 -0.94
0.04 -0.05 -0.06 0.02 -0.16 0.11 -0.15 0.07 -0.02 -0.06 -0.04 -0.36 1.08 1.06 1.51 0.88 -0.52 -0.56 -0.17 -3.17 -1.54 -1.67 -0.02 0.24 -0.11 -0.16 -0.12 0.17 -0.57 -0.38 -1.0 -0.93
-0.19 0.04 0.15 0.01 0.13 -0.02 -0.17 -0.3 -0.16 -0.23 -0.29 -0.43 0.33 1.41 1.23 0.37 -0.15 -0.24 0.08 -0.97 -1.75 -0.82 -0.27 -0.37 -0.89 0.04 0.65 0.79 -0.48 -0.29 -0.97 -0.61
-0.22 -0.18 -0.1 0.02 -0.02 -0.07 -0.05 0.01 0.04 -0.05 -0.1 -0.21 0.64 1.01 1.12 0.74 -0.35 -0.76 0.1 -1.95 -1.02 -1.42 -0.02 0.17 -0.56 0.41 0.18 0.32 -0.31 -0.2 -0.41 -0.5
0.08 0.36 0.22 0.28 0.32 0.29 0.06 -0.15 -0.05 -0.01 -0.13 -0.11 0.49 0.93 0.99 0.68 0.05 0.14 0.17 -4.88 -3.39 -4.78 0.69 0.65 -1.96 -1.15 -0.86 -0.7 -0.18 -0.02 -0.21 -0.06
-0.27 -0.18 -0.01 0.12 0.07 0.17 0.05 -0.19 -0.24 -0.11 -0.25 -0.37 1.06 1.7 1.48 0.62 -0.9 -0.88 -0.01 -6.12 -3.97 -1.89 -0.5 -0.14 -0.27 0.26 0.65 0.86 -0.99 -0.71 -1.87 -2.08
0.11 0.16 0.17 0.1 0.02 0.04 0.16 0.13 0.22 0.24 0.19 0.07 0.72 1.08 0.77 0.71 -0.15 -0.17 -0.16 -2.61 -2.18 -3.51 0.11 0.3 -1.25 -0.54 -0.81 -0.67 -0.19 -0.02 0.11 0.01
-0.2 0.06 0.0 0.21 0.19 0.03 0.23 0.32 0.3 0.3 0.32 0.12 0.09 0.93 1.25 0.26 -0.39 -1.46 0.01 -1.57 -5.62 -2.28 -0.11 0.04 -1.19 0.72 0.21 0.47 -0.49 -0.36 -0.64 -0.75
0.0 -0.07 -0.08 -0.09 -0.02 -0.05 -0.08 0.0 -0.08 -0.04 -0.07 -0.2 0.75 1.1 1.43 0.63 -0.21 -0.44 0.3 -1.69 -2.09 -2.15 0.02 0.08 -0.56 0.08 -0.55 -0.58 -0.36 -0.27 -0.03 0.12
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0.15 0.28 0.36 0.36 0.43 0.4 0.18 0.17 0.08 0.11 0.26 0.02 0.16 0.47 1.18 0.47 -0.6 -1.16 0.07 -1.27 -1.24 -0.28 -0.42 -0.32 -1.44 0.22 0.13 0.38 -0.65 -0.56 -0.96 -0.85
-0.1 0.01 0.12 0.02 0.35 -0.02 0.14 -0.11 -0.09 -0.05 -0.08 -0.31 0.75 0.98 0.65 0.61 -0.04 -0.22 0.2 -1.24 -0.44 -0.3 -0.13 -0.03 -0.51 -0.37 -0.4 -0.32 -0.1 0.0 -0.58 -0.32
0.08 0.21 0.11 0.28 0.44 0.23 0.09 0.12 0.06 0.03 -0.02 -0.05 0.44 0.78 0.96 0.46 -0.42 -0.68 0.12 -2.69 -2.45 -0.66 -0.14 -0.16 -1.3 0.11 0.4 0.48 -0.57 -0.49 -0.35 -0.3
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0.0 0.21 0.21 0.41 0.25 0.31 0.28 0.38 0.25 0.18 0.21 0.01 0.25 0.72 1.19 0.37 -0.48 -1.08 -0.07 -2.26 -2.54 -2.75 -0.1 -0.16 -1.76 -0.33 0.21 0.39 -0.36 -0.24 -0.27 -0.01
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-0.15 0.06 -0.02 0.19 0.37 0.12 0.1 0.16 0.12 0.1 -0.03 -0.25 0.6 0.75 1.29 0.58 -0.4 -1.04 0.34 -3.69 -3.07 -4.32 0.29 0.49 -1.47 0.3 0.25 0.49 -0.32 -0.1 -1.25 -0.99
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0.04 0.2 0.19 0.16 0.39 0.05 0.14 0.12 0.08 0.1 0.19 0.01 0.45 0.38 1.0 0.92 0.08 -0.25 0.52 -4.86 -5.93 -7.27 0.2 0.17 -3.75 -0.1 -0.28 0.03 0.14 0.28 -0.56 -0.56
0.29 0.16 0.44 0.33 0.53 0.46 0.33 0.34 0.39 0.1 0.15 0.21 0.67 0.51 1.03 0.87 -0.28 -1.04 0.23 -4.48 -3.82 - -0.05 0.06 -2.64 -0.23 -0.32 -0.32 -0.28 -0.03 -0.93 -0.66
-0.11 0.19 0.13 0.12 0.21 0.3 -0.05 -0.07 -0.14 -0.21 -0.34 -0.33 0.67 0.8 0.85 0.92 -0.35 -0.54 0.23 -2.14 -1.69 -1.68 0.12 0.13 -0.17 0.28 0.07 0.24 -0.28 -0.22 -0.46 -0.61
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-0.11 0.02 0.16 0.27 0.11 -0.0 0.18 0.16 0.29 0.33 0.34 0.12 0.22 0.76 1.22 0.57 0.09 -0.94 0.31 -2.05 -9.0 -4.88 0.06 0.06 -4.65 -0.06 -0.05 0.1 0.03 0.17 -0.32 -0.46
-0.06 0.06 0.12 0.22 0.32 0.03 0.15 0.14 0.22 0.18 0.26 0.03 0.27 0.86 1.17 0.43 -0.25 -0.67 0.29 -3.13 -2.38 -1.79 0.07 0.05 -1.73 0.44 0.2 0.32 -0.29 -0.23 -0.93 -1.01
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-0.31 0.02 0.16 0.38 0.46 0.35 0.2 0.17 -0.08 0.2 -0.11 -0.27 0.53 0.68 1.26 0.67 -0.2 -0.51 0.02 -8.54 -0.48 -2.97 0.02 0.21 -0.47 0.16 0.06 0.06 -0.36 -0.14 -1.28 -1.6
0.11 0.37 0.24 0.41 0.38 0.24 0.25 0.14 0.16 0.14 0.13 -0.05 0.22 0.68 0.97 0.72 -0.11 -0.58 0.57 -4.73 -4.23 -6.71 0.18 0.02 -3.76 -0.2 0.12 0.3 -0.32 -0.13 -0.67 -0.38
-0.13 0.01 -0.1 0.1 0.0 -0.02 -0.12 -0.05 0.02 0.1 -0.02 -0.13 0.82 1.3 1.2 0.88 -0.43 -0.68 -0.15 -2.82 -2.06 -1.63 0.2 0.44 -1.03 0.16 -0.02 0.01 -0.52 -0.34 -0.8 -0.53
-0.16 0.0 0.05 0.04 0.02 0.03 -0.07 0.04 -0.03 -0.01 -0.04 -0.29 0.54 0.87 0.91 0.82 -0.17 -0.22 0.01 -2.01 -1.19 -1.87 0.41 0.43 -0.42 0.31 0.05 0.13 -0.51 -0.39 -0.57 -0.55
-0.11 0.16 0.37 0.38 0.42 0.64 0.42 0.31 0.16 0.16 0.02 -0.26 0.7 0.62 1.54 0.39 -0.34 -0.5 0.58 -3.39 -3.19 -2.33 -0.9 -1.29 -2.95 0.07 0.32 0.55 -0.38 -0.14 -2.17 -1.78
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0.09 0.09 0.2 0.28 0.26 0.35 0.24 0.23 0.08 0.06 0.03 -0.08 0.25 1.15 0.72 0.47 -0.12 -0.42 0.05 -2.46 -3.37 -3.59 0.11 0.16 -0.77 -0.15 0.19 0.27 -0.33 -0.17 -0.53 -0.51
-0.34 0.08 -0.02 -0.06 -0.04 -0.19 -0.42 -0.68 -0.82 -0.98 -0.9 -0.93 1.29 1.82 1.34 0.77 -0.32 -0.26 0.34 -2.09 -2.81 -2.94 -0.33 -0.31 -1.07 -0.01 0.82 0.79 -0.52 -0.42 -0.54 -0.91
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.