Heatmap: Cluster_216 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.2 0.03 -0.01 -0.01 0.03 -0.12 0.13 0.34 0.43 0.42 0.46 0.25 0.76 -0.03 0.21 0.41 -0.93 -0.92 -1.02 -3.31 -2.92 -1.57 -1.18 -0.87 -2.0 1.1 0.78 0.55 -0.6 -0.69 0.82 0.5
0.26 0.41 -0.12 0.61 0.6 0.23 0.4 0.36 0.65 0.48 0.21 0.25 0.17 -0.14 -0.46 0.4 -0.29 -1.14 0.21 -2.04 -4.84 -2.83 0.18 0.14 -1.76 0.28 0.05 0.08 -0.03 -0.02 -0.08 -0.49
0.24 -0.48 -0.59 -0.58 -0.47 -0.75 -0.68 0.31 0.38 0.72 0.74 0.55 0.94 0.9 -0.52 0.7 -2.1 -1.44 -0.12 -3.66 -3.44 -3.43 -0.63 -0.16 -0.14 2.05 0.61 0.19 -1.07 -0.94 -0.72 -0.41
-0.01 0.11 -0.01 0.16 0.14 0.19 0.23 0.12 0.2 0.2 0.08 0.11 0.19 -0.04 -0.08 0.26 -0.11 -0.48 -0.03 -1.27 -0.72 -2.38 0.02 -0.01 0.07 0.62 0.38 0.36 -0.21 -0.14 -0.17 -0.08
0.25 0.1 -0.07 0.28 0.28 0.38 0.21 0.41 0.38 0.42 0.18 0.25 0.09 -0.54 -0.48 0.3 -0.12 -1.07 0.59 -7.82 -2.71 -2.63 0.11 0.12 -0.95 0.39 0.43 -0.01 0.06 0.02 0.12 0.28
-0.0 0.02 0.05 0.21 0.16 0.01 0.16 0.22 0.32 0.21 0.22 0.1 0.24 0.38 -0.15 0.51 -0.25 -0.7 0.09 -3.58 -1.5 -2.1 -0.16 0.08 0.54 1.04 0.49 0.54 -0.46 -0.4 -1.05 -1.05
0.32 0.29 0.08 0.41 0.09 0.18 0.07 0.01 0.33 0.24 0.12 0.24 0.15 -0.68 -1.12 0.47 -0.02 -0.93 0.3 -3.83 -2.39 -2.91 0.26 0.39 -0.65 0.88 0.27 0.44 0.06 0.2 -0.06 -0.37
-0.25 -0.3 -0.22 -0.01 -0.09 -0.25 -0.04 0.26 0.22 0.38 0.25 0.04 0.77 0.59 -0.04 0.27 -0.94 -1.1 -0.52 -1.06 -1.03 -0.97 -0.44 -0.24 -0.09 1.2 0.65 0.55 -0.74 -0.69 0.09 0.21
-0.28 -0.63 -0.58 -0.32 0.0 -0.22 -0.13 0.69 0.45 0.41 0.14 0.01 0.35 0.63 -0.73 0.52 -1.21 -1.65 0.07 -2.82 -0.39 -7.32 -0.53 -0.25 0.44 2.12 0.44 0.29 -0.52 -0.7 -0.66 -0.85
0.13 -0.23 -0.3 -0.19 -0.12 -0.21 -0.18 0.15 0.12 0.24 0.05 -0.04 0.35 0.52 -0.63 0.98 -0.74 -0.49 1.07 -4.91 -2.0 -6.29 -0.8 -1.0 -1.41 1.51 0.56 0.67 -0.1 -0.22 0.13 0.04
0.02 0.19 0.17 0.23 0.25 0.2 0.22 0.26 0.17 0.29 0.2 0.16 0.42 0.15 0.13 0.68 -0.21 -1.23 0.46 -2.13 -2.06 -2.38 -0.01 0.08 -1.06 0.72 -0.01 0.28 0.08 0.09 -0.63 -0.75
0.01 -0.03 -0.15 0.03 0.09 0.03 -0.01 0.3 0.19 0.28 0.11 0.09 0.51 0.5 0.07 0.68 -0.56 -0.77 0.19 -2.13 -1.35 -1.7 0.03 0.2 0.23 0.77 0.16 0.12 -0.3 -0.28 -0.36 -0.35
0.08 0.1 0.05 0.13 0.11 0.1 0.16 0.2 0.21 0.36 0.29 0.16 0.34 0.41 0.51 0.52 -0.48 -0.76 0.22 -0.7 -2.48 -1.96 -0.19 -0.03 -0.27 0.75 0.17 0.32 -0.49 -0.42 -0.64 -0.51
-0.26 -0.42 -0.26 0.02 -0.18 -0.13 -0.18 0.22 0.23 0.33 0.08 0.01 0.53 1.19 -0.3 1.0 -1.1 -1.53 0.4 -2.48 -1.92 -2.8 -0.91 -0.37 -0.06 1.75 0.49 0.64 -0.53 -0.42 -0.91 -1.3
-0.27 -0.12 -0.12 0.23 0.17 0.1 0.15 0.31 0.22 0.22 0.11 0.21 -0.13 0.01 0.08 -0.02 -0.42 -0.61 0.3 -2.26 -0.52 -0.74 -0.22 -0.35 0.24 1.17 0.46 0.26 -0.13 -0.23 -0.4 -0.38
-0.2 -0.74 -0.67 -0.29 -0.08 -0.11 0.12 0.65 0.72 0.69 0.48 0.21 -0.19 -0.34 0.03 -0.2 -0.98 -1.1 0.18 -1.11 -1.09 -1.34 -0.54 -0.29 0.56 1.7 0.58 0.52 -0.4 -0.33 -0.85 -0.99
-0.05 0.04 -0.05 -0.1 -0.15 -0.14 0.15 0.11 0.38 0.37 0.29 0.23 -0.28 0.26 0.11 0.05 -0.5 -0.65 0.38 -2.44 -1.45 -2.55 -0.18 -0.3 0.33 0.95 0.75 0.52 -0.19 -0.08 -0.14 -0.15
-0.06 -0.19 -0.11 0.01 0.07 -0.15 -0.07 0.35 0.36 0.41 0.26 0.13 0.57 0.47 -0.25 0.48 -0.8 -1.12 0.59 -4.39 -2.51 -4.07 -0.29 -0.01 -0.48 1.6 0.44 0.38 -0.28 -0.25 -0.67 -0.53
0.2 0.14 0.24 0.51 0.55 0.25 0.39 0.4 0.27 0.25 0.19 0.29 0.12 -0.29 -0.47 0.43 0.04 -0.51 0.76 -2.91 -6.55 -5.38 0.25 0.2 -4.96 0.55 -0.17 0.12 0.16 0.15 -0.17 -0.75
0.08 0.1 -0.1 -0.07 -0.05 0.06 -0.16 0.15 0.17 0.15 -0.0 -0.06 -0.77 -0.42 -0.16 0.35 -0.41 -0.99 0.14 -1.15 -0.36 -0.43 -0.25 0.02 0.77 1.39 0.55 0.47 -0.24 -0.31 -0.7 -0.62
0.57 0.02 -0.17 -0.05 -0.12 0.04 -0.12 0.27 0.28 0.51 0.59 0.36 0.42 -0.08 -0.6 0.78 -0.43 -0.54 0.47 -4.0 -6.72 -4.14 -0.39 -0.42 -3.99 1.26 0.4 0.69 0.15 0.1 -0.56 -0.36
0.31 -0.17 -0.28 -0.03 0.0 -0.09 -0.04 0.53 0.66 0.62 0.72 0.65 -0.04 0.73 -0.68 -0.02 -0.98 -1.18 -0.17 -2.65 -0.87 -1.63 -0.77 -0.64 -0.1 1.6 0.25 0.38 -0.54 -0.53 -0.71 -0.77
-0.26 0.07 0.34 0.19 0.08 -0.23 0.26 0.25 0.2 0.36 0.45 0.23 -0.15 -1.52 -1.37 0.36 -0.49 -1.34 0.21 -1.52 -1.28 -0.52 -0.42 -0.48 -2.07 2.01 0.4 0.66 -0.26 -0.2 -0.47 -0.48
0.0 -0.04 -0.11 -0.08 0.03 0.0 0.06 0.31 0.46 0.46 0.43 0.16 0.39 -0.32 -0.77 0.38 -1.01 -1.33 0.23 -4.14 -1.58 -6.77 -0.05 0.18 -1.23 1.16 0.56 0.52 -0.09 -0.12 0.17 0.59
-0.23 -0.1 -0.24 -0.02 -0.04 -0.07 -0.08 0.37 0.45 0.45 0.34 0.33 0.15 -0.16 0.27 0.25 -0.41 -0.47 0.48 -7.91 -4.16 -4.44 -0.02 0.24 -0.58 0.72 0.15 0.19 -0.06 0.03 0.54 0.49
-0.16 0.0 0.16 0.36 0.26 0.14 0.31 0.58 0.4 0.43 0.29 0.13 0.1 -0.27 -0.52 -0.1 -0.5 -1.16 -0.28 -1.02 -1.49 -0.97 -0.54 -0.49 0.19 1.3 0.44 0.53 -0.41 -0.53 -0.39 -0.29
0.15 -0.24 -0.37 0.07 -0.23 -0.15 0.23 0.21 0.35 0.52 0.26 0.24 0.6 -0.61 -0.75 0.75 0.0 -0.77 0.74 -6.86 - - 0.18 0.31 -1.6 0.76 0.36 0.4 0.31 0.23 -0.04 -0.09
0.17 0.19 -0.0 0.19 0.3 0.13 0.46 0.58 0.5 0.61 0.44 0.32 -0.25 -1.11 -0.62 0.06 -0.42 -1.5 0.34 -2.98 -4.55 -7.17 -0.36 -0.34 -2.59 1.79 0.57 0.86 0.02 0.01 -1.22 -1.42
0.55 -0.02 -0.16 0.07 -0.06 -0.1 0.0 0.3 0.13 0.32 0.2 0.14 -0.13 0.41 -0.5 0.28 -0.46 -1.14 0.74 -5.15 -4.76 -5.32 -0.36 -0.2 -2.75 1.51 0.5 0.31 -0.17 -0.24 0.73 0.1
0.3 0.2 0.03 0.25 0.21 0.31 0.25 0.2 0.2 0.19 0.3 0.17 -0.06 -0.22 0.04 0.16 -0.37 -0.73 0.09 -2.87 -0.5 -1.36 -0.21 -0.29 0.14 0.46 0.55 0.33 -0.24 -0.26 -0.05 -0.2
-0.18 -0.14 -0.11 0.18 0.17 0.14 0.22 0.46 0.51 0.46 0.28 0.07 0.58 0.59 0.36 0.36 -0.94 -1.27 0.45 -2.23 -2.73 -3.03 -0.06 0.29 -0.8 1.03 0.36 0.32 -0.58 -0.53 -0.89 -0.46
0.13 -0.29 -0.37 -0.08 -0.11 -0.09 -0.12 0.19 0.36 0.45 0.4 0.28 0.14 0.0 -0.29 0.29 -0.82 -0.58 0.44 -2.16 -2.4 -2.06 -0.46 -0.33 0.14 1.02 0.61 0.49 -0.56 -0.55 0.35 0.7
-0.0 -0.23 -0.15 -0.08 -0.04 -0.19 0.16 0.25 0.38 0.35 0.31 0.12 -0.03 -0.34 -0.3 -0.1 -0.2 -0.69 0.42 -2.6 -3.24 -3.32 -0.1 -0.0 -2.0 1.28 0.52 0.53 0.06 0.14 0.7 0.36
-0.63 -0.71 0.48 0.23 0.59 -1.59 -0.42 -0.17 -0.08 1.2 0.29 0.26 - -0.87 -0.97 -4.21 -1.59 - -0.71 -1.72 -1.31 - -1.76 -1.85 -0.02 2.89 1.5 1.94 -2.54 -2.05 -3.65 -2.86
0.46 0.11 0.08 -0.02 0.11 -0.02 0.06 0.03 0.12 0.33 0.32 0.21 -0.3 -0.45 -0.64 0.03 -0.57 -0.68 0.64 -1.52 -0.58 -0.8 -0.3 -0.16 -0.27 1.07 0.51 0.46 -0.2 -0.2 -0.11 -0.22
-0.09 -0.28 -0.34 -0.21 -0.16 0.03 -0.05 0.49 0.24 0.28 0.3 0.17 -0.22 0.01 0.4 0.44 -1.02 -2.05 -0.19 -3.0 -0.29 -1.27 -0.38 -0.09 0.53 2.03 0.63 0.47 -0.97 -0.76 -1.25 -1.56
0.04 0.2 0.05 -0.01 -0.02 -0.15 -0.23 0.23 0.36 0.33 0.26 0.13 0.82 0.14 -1.94 0.9 -0.79 -1.2 0.49 -4.1 -2.61 -5.24 -0.17 0.02 -0.95 1.13 0.48 0.52 -0.27 -0.2 0.19 0.15
-0.05 -0.1 -0.14 0.11 0.31 0.07 0.42 0.44 0.47 0.47 0.62 0.31 -0.53 -1.25 -1.78 -0.07 -0.55 -1.19 0.81 -4.61 -4.05 -2.3 -0.18 -0.02 -1.47 1.76 0.78 0.55 -0.11 -0.03 -0.78 -0.38
0.07 -0.07 -0.21 -0.17 -0.37 -0.47 0.14 0.28 0.35 0.56 0.3 0.31 0.49 0.38 -0.77 0.74 -0.62 -0.76 0.32 -11.4 -5.69 - -0.25 0.08 -1.27 1.56 0.15 0.23 0.21 0.22 0.08 -0.27
0.07 0.14 0.12 0.13 0.43 -0.08 0.22 0.24 -0.04 0.33 0.14 0.22 0.4 -0.06 -0.46 0.76 -0.2 -2.24 0.48 -4.86 -4.92 -6.16 0.21 0.3 -3.75 1.12 0.33 0.38 0.34 0.28 -0.31 -0.33
0.51 0.2 -0.02 0.19 0.33 0.3 0.36 0.2 0.3 0.29 0.37 0.34 -0.19 -0.81 -0.2 -0.05 -0.46 -1.09 0.14 -1.29 -1.12 -1.12 0.1 0.44 -0.9 0.67 0.34 0.53 -0.22 -0.01 -0.58 -0.6
0.35 0.07 0.1 0.16 0.03 -0.04 -0.12 0.3 0.28 0.27 0.27 0.08 1.01 0.34 -0.61 0.99 -0.57 -1.1 0.22 -3.82 -2.28 -4.1 -0.28 -0.1 -1.14 1.18 0.15 0.36 0.19 0.09 -0.86 -1.09
0.08 -0.18 -0.3 -0.06 -0.06 -0.17 0.15 0.28 0.3 0.54 0.41 0.36 0.11 0.08 -0.52 0.41 -0.41 -1.04 0.47 -1.89 -1.31 -2.98 -0.18 -0.01 -0.42 0.67 0.21 0.19 0.05 0.0 0.7 0.07
-0.16 -0.3 -0.14 0.07 0.08 0.28 0.35 0.56 0.53 0.55 0.34 0.14 0.16 -0.15 -0.05 0.12 -0.84 -0.98 -0.12 -1.37 -1.34 -1.83 -0.26 0.01 -0.42 1.48 0.46 0.4 -0.45 -0.41 -0.58 -0.51
0.34 0.24 0.06 0.06 0.08 0.14 0.13 0.19 0.23 0.35 0.26 0.23 0.63 -0.04 -0.95 0.58 -0.96 -0.68 0.4 -3.82 -2.48 -4.25 0.01 0.1 -0.65 0.6 0.36 0.23 -0.41 -0.36 0.53 0.38
0.55 0.29 0.26 0.1 0.27 0.31 0.29 0.22 0.03 0.48 0.4 0.39 -0.11 -0.51 0.02 0.04 -0.55 -1.49 0.18 -0.98 -0.15 -0.65 0.15 0.58 -0.89 0.01 -0.18 0.05 -0.11 0.06 -0.69 -0.67
-0.05 -0.34 -0.43 -0.34 -0.37 -0.65 -0.51 0.09 0.28 0.49 0.58 0.31 0.55 0.15 -0.71 0.77 -0.74 -2.03 0.74 -3.83 -2.7 -4.62 0.39 0.81 -1.38 1.82 -0.3 -0.38 -0.09 -0.09 -0.08 0.19
0.43 0.22 0.17 0.03 -0.05 -0.29 -0.11 0.06 0.2 0.24 0.26 0.11 -0.11 0.01 -0.74 0.3 -0.27 -0.82 0.16 -1.68 -2.27 -3.19 0.19 0.13 -2.67 1.52 0.7 0.75 -0.09 0.02 -0.19 -0.57
0.41 -0.04 -0.31 -0.27 -0.07 -0.12 -0.08 0.06 0.35 0.44 0.31 0.5 0.17 -0.2 -0.78 0.32 -0.62 -0.51 0.34 -2.16 -1.65 -5.78 -0.27 -0.36 0.29 1.37 0.23 0.22 -0.29 -0.39 0.41 0.33
0.01 -0.0 -0.12 -0.0 -0.04 0.03 0.12 0.11 0.18 0.2 0.1 -0.02 0.38 0.22 0.25 0.43 -0.63 -2.37 0.38 -2.78 -2.32 -3.48 -0.12 0.12 -1.37 1.48 0.65 0.58 -0.16 -0.01 -0.03 -0.16
0.13 0.01 -0.08 0.03 0.17 -0.12 -0.01 0.31 0.47 0.02 0.4 0.13 -0.38 -0.78 -0.19 0.12 -0.78 -2.94 0.06 -2.21 -1.37 0.3 -0.43 -0.17 0.38 1.4 0.92 0.93 -0.61 -0.42 -0.95 -0.62
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0.18 0.12 0.07 0.13 -0.08 -0.09 -0.04 0.06 0.21 0.29 0.32 0.31 0.56 0.14 -0.48 0.33 -0.77 -0.44 -0.06 -10.26 -1.64 -3.65 -0.24 -0.22 0.25 0.99 0.36 0.21 -0.66 -0.5 0.35 0.76
0.08 -0.09 0.3 0.18 0.33 0.12 0.37 0.5 0.62 0.56 0.64 0.06 -2.77 -0.06 -0.31 -1.83 -0.75 -3.3 0.04 -0.71 -1.37 -1.2 -1.27 -1.07 -0.4 1.93 1.06 1.27 -1.01 -0.86 -1.45 -1.87
0.2 0.42 0.58 0.31 0.01 -0.14 0.66 0.65 0.64 0.66 0.68 0.58 -2.33 -0.11 -0.55 -1.15 -0.97 -1.71 -0.45 -0.81 0.0 -1.0 -2.04 -2.13 -0.23 1.2 0.35 0.49 -0.03 -0.04 -0.47 -0.66
-0.01 -0.13 -0.07 -0.13 -0.09 -0.36 -0.21 0.27 0.14 0.27 0.18 0.26 0.33 0.55 -1.06 0.67 -0.76 -0.73 0.83 -3.56 -2.13 -4.32 0.2 0.58 -1.25 1.15 0.33 0.22 0.17 -0.04 -0.01 -0.21
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0.14 0.12 0.05 0.17 0.1 0.02 0.03 0.05 0.05 0.04 0.02 -0.02 -0.26 -0.23 0.02 0.08 -0.26 -0.48 0.16 -1.7 -0.37 -1.71 -0.34 -0.14 0.55 0.74 0.69 0.68 -0.4 -0.38 0.11 -0.02
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.