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Heatmap: Cluster_164 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
-1.3 -1.73 -1.1 -1.96 -0.73 -0.25 -0.8 -0.4 -0.44 -1.14 -1.02 -1.01 -1.61 -2.49 -1.49 -0.63 -0.65 -1.47 -0.46 1.85 1.52 2.56 -0.67 -0.7 1.34 -0.93 0.48 0.08 -0.26 0.48 -0.79 -1.1
-0.51 -1.82 -1.28 -0.45 -0.0 0.68 1.07 1.01 0.83 0.81 0.32 -0.15 -2.21 -3.07 -0.49 -1.83 -0.29 -0.17 -1.07 1.48 0.54 0.98 -0.99 -1.7 -0.23 -1.5 0.13 -0.52 0.05 -0.1 0.14 -0.21
-0.11 -0.65 -0.99 -0.62 0.17 0.53 0.83 0.81 0.59 0.47 0.26 -0.08 -0.37 -0.96 0.08 -0.03 -0.74 -0.82 -1.3 0.82 0.36 0.81 -0.92 -0.91 -0.42 -0.75 0.44 0.44 -0.39 -0.33 -0.04 -0.29
0.24 -0.03 0.22 0.32 0.05 0.05 0.36 0.39 0.33 0.43 0.2 0.07 -0.14 -0.59 -1.39 -0.48 0.19 -0.88 -0.43 -0.29 0.14 -0.84 -0.27 -0.53 0.91 0.24 0.01 -0.14 0.01 -0.03 0.0 -0.15
-0.09 -0.66 0.08 -0.35 -1.15 0.17 0.22 1.05 0.16 0.91 0.57 0.5 -2.69 -3.7 -1.55 -4.11 -3.08 -4.31 -2.82 1.41 2.09 1.6 -2.0 -2.46 1.85 -3.43 0.33 0.27 -2.91 -3.87 -2.98 -3.88
-0.62 -0.3 -0.41 -0.05 0.18 0.34 0.3 0.46 -0.13 -0.32 -0.6 -0.78 -0.31 -0.64 0.29 0.09 -0.53 -1.48 0.06 0.08 -0.98 0.34 -0.16 -0.06 1.12 0.61 1.07 1.06 -0.15 -0.1 -1.26 -2.24
-0.13 -0.35 -0.24 -0.26 -0.08 0.14 0.17 0.05 0.28 -0.13 -0.04 -0.2 -0.43 -0.78 -0.09 -0.4 -1.2 -2.18 -0.61 1.39 -0.43 1.23 -0.71 -0.56 1.31 0.8 0.42 0.56 -1.01 -0.8 -1.23 -0.79
-1.19 -1.45 -1.01 -0.56 0.0 0.25 0.58 0.94 0.56 0.13 -0.35 -0.79 -1.22 -1.48 1.14 -0.99 -0.89 -1.48 -0.34 1.76 -1.11 0.96 -1.18 -0.66 -0.2 0.5 1.07 0.71 -0.8 -0.46 -0.88 -0.74
-0.07 -0.04 0.09 0.01 0.03 -0.02 -0.12 0.07 0.3 0.29 0.35 0.1 -0.06 -0.56 -0.23 -0.04 -0.33 -0.31 -0.21 0.29 0.14 0.19 0.04 0.2 0.42 0.6 -0.48 -0.34 -0.28 -0.22 -0.29 -0.32
-0.54 -0.71 -0.59 -0.25 -0.48 -0.32 -0.28 -0.04 -0.26 -0.29 -0.54 -0.46 0.23 0.57 0.64 0.0 -1.53 -1.85 -0.12 1.38 0.18 1.31 -0.71 -0.34 1.66 0.68 -0.11 0.18 -0.95 -0.73 -2.25 -1.79
0.08 0.03 -0.29 0.26 0.32 0.28 0.13 0.15 0.29 0.25 0.22 0.2 -0.05 0.13 0.28 0.18 -0.3 -0.99 0.07 0.06 0.06 -0.79 -0.16 -0.25 0.16 0.26 0.05 -0.08 -0.36 -0.19 -0.47 -0.59
-0.0 0.1 0.01 0.06 -0.1 -0.05 0.08 0.15 0.15 0.51 0.13 -0.19 -0.5 0.05 0.06 -0.33 -0.68 -1.26 0.15 0.69 -1.01 0.38 -0.59 -0.56 1.33 -0.19 0.32 0.36 -0.71 -0.3 -0.5 -0.4
-0.86 -1.89 -1.87 -1.0 0.24 0.58 0.95 1.05 0.44 0.29 -0.32 -0.76 -2.96 -2.72 -0.45 -2.37 -0.61 -0.69 -0.89 0.92 -0.24 1.16 -0.73 -1.65 0.54 -0.15 1.54 1.51 -0.23 -0.1 -0.89 -1.33
-1.53 -1.24 -1.01 -1.03 -0.96 0.48 0.25 0.1 0.46 0.12 -0.25 -0.35 -0.88 -1.34 -0.56 -0.62 -1.0 -1.06 0.12 2.02 -0.2 1.66 -0.58 -0.25 1.36 0.73 0.21 -0.41 -0.63 -0.69 -1.53 -1.81
-0.14 -0.08 0.04 0.22 0.33 0.28 0.12 0.26 0.06 -0.05 -0.05 -0.17 -0.26 -0.18 -0.52 -0.36 -0.69 -0.06 -0.31 0.44 -0.23 0.37 -0.36 -0.37 -0.23 0.77 0.88 0.78 -0.63 -0.66 -0.78 -0.45
-0.1 -0.36 -0.37 -0.24 -0.12 0.05 0.02 0.34 0.19 0.06 0.12 -0.08 -0.06 0.2 0.9 -0.08 -0.94 -1.38 0.14 0.39 0.73 -1.36 -0.28 -0.01 0.93 0.75 0.25 0.06 -0.32 -0.41 -1.34 -1.64
-0.58 -0.27 -0.35 -0.1 0.12 0.3 0.34 0.34 0.23 0.22 -0.2 -0.26 -0.02 -0.3 0.97 -0.08 -0.71 -0.59 -0.13 0.91 0.26 -0.06 -0.53 -0.55 0.89 -0.0 0.18 0.07 -0.64 -0.52 -0.77 -0.67
-0.89 -0.42 -1.59 -0.61 -0.01 0.17 -0.57 0.56 -0.01 -0.42 -0.62 -0.52 0.14 -0.98 0.7 -0.13 -0.89 -2.16 0.24 0.84 1.33 -2.32 -0.39 0.01 1.85 0.59 0.23 0.38 -0.56 -0.19 -1.24 -1.13
0.36 -0.13 -0.55 -0.45 -0.8 -0.57 -0.1 -0.2 0.47 0.33 0.56 0.84 -5.47 -2.28 -3.11 -2.28 0.39 -0.63 -0.17 1.84 -0.46 -0.76 -0.79 -1.09 0.73 0.74 -0.41 0.1 0.57 0.66 0.05 -0.25
-0.55 0.06 0.09 0.15 0.36 0.45 0.4 0.06 0.0 -0.29 -0.31 -0.5 -0.57 -0.36 0.96 -0.09 -0.2 -1.14 -0.33 1.22 -0.29 -0.68 0.29 0.24 1.11 -0.59 -0.11 0.03 -0.32 -0.23 -1.31 -1.86
0.13 -0.07 -0.04 -0.1 0.12 0.18 0.1 0.12 -0.0 -0.03 -0.05 -0.21 -0.32 -0.07 1.09 -0.32 -0.25 -0.25 -0.07 1.33 -0.54 -0.8 -0.27 -0.27 0.67 -0.44 0.18 0.05 -0.27 -0.19 -1.03 -1.22
-0.83 -0.37 -0.46 -0.25 -0.27 -0.0 -0.16 -0.36 -0.47 -0.69 -0.74 -0.84 -0.19 0.56 1.32 0.09 -0.85 -1.12 -0.18 1.38 0.53 0.49 -0.57 -0.28 1.0 0.36 0.75 0.69 -0.93 -0.74 -1.74 -1.57
-0.65 -0.22 -0.33 -0.19 0.21 0.01 -0.18 -0.18 0.05 -0.14 -0.44 -0.47 -0.24 -0.18 0.88 -0.47 -0.69 -1.26 0.61 1.05 1.37 -0.33 -0.61 -0.54 1.41 -0.07 -0.34 -0.37 -0.64 -0.55 -0.71 -0.45
0.05 0.2 0.07 0.16 0.25 0.23 0.01 0.17 0.27 0.12 -0.0 0.04 -0.33 -0.17 0.27 -0.21 -0.44 -0.68 0.09 -0.02 0.26 0.14 -0.25 -0.11 0.38 0.02 0.12 0.05 -0.61 -0.62 -0.27 0.03
-0.04 0.18 0.29 0.32 0.4 0.17 0.24 0.18 0.14 -0.05 0.07 -0.16 -0.12 -0.17 0.01 -0.18 -0.16 -0.62 0.3 0.35 -1.31 0.24 0.05 -0.03 0.9 -0.38 0.19 0.03 -0.37 -0.34 -1.12 -1.03
-0.04 0.29 0.28 0.16 0.7 0.56 0.05 0.14 0.32 0.04 0.32 0.06 -1.0 -1.57 0.08 -0.78 -0.31 -0.32 0.16 1.37 -0.14 1.51 -1.02 -1.28 -0.71 -0.61 -0.75 -0.64 -0.42 -0.18 -0.76 -0.98
-0.51 0.01 0.09 0.16 0.38 0.25 0.04 -0.26 -0.7 -0.66 -0.94 -1.04 -0.46 -0.41 1.24 -0.07 -0.49 -0.39 -0.05 0.4 -1.02 1.15 -0.53 -0.36 0.55 -0.12 1.21 0.97 -0.89 -0.73 -1.05 -1.08
0.14 0.08 -0.08 0.15 0.24 0.15 0.33 0.29 0.42 0.4 0.12 0.29 -0.22 -0.36 0.23 -0.17 -0.13 -0.68 -0.03 0.38 -0.27 -2.25 -0.21 -0.25 0.86 0.28 -0.6 -0.24 -0.01 -0.14 -0.46 -0.67
-0.64 -1.61 -2.89 -1.72 -0.89 0.83 1.09 1.1 0.3 0.23 -1.8 -1.12 -2.53 -4.8 -0.91 -2.01 -0.41 -0.42 -1.02 0.65 0.75 1.23 -0.31 -1.33 0.13 -0.13 1.24 1.54 -0.09 0.44 -0.22 -0.62
-0.18 -0.18 0.01 -0.03 -0.22 -0.05 -0.12 0.15 0.1 0.18 0.04 0.01 -0.83 -0.49 0.52 -0.84 -0.92 -0.69 -0.46 1.4 0.45 1.13 -0.78 -0.62 1.11 0.15 -0.02 -0.09 -0.78 -0.69 -0.73 -0.74
-0.44 -0.17 -0.24 0.14 0.11 0.1 0.24 0.05 0.13 -0.18 -0.25 -0.34 -0.29 0.26 0.99 -0.26 -0.64 -0.68 -0.6 1.41 -0.18 0.14 -0.39 -0.37 0.36 -0.03 0.41 0.48 -0.74 -0.6 -0.58 -0.75
0.46 -0.12 -0.13 -0.39 0.17 0.25 0.14 0.17 0.47 0.51 0.56 0.36 -0.28 -3.7 -4.23 -0.9 -1.07 -4.87 -0.48 0.96 -1.7 - 1.22 0.92 1.21 1.27 -0.15 -0.46 -0.86 -1.03 -0.44 -0.74
-0.54 -1.3 -1.4 -0.98 0.02 0.49 0.51 0.75 0.74 0.32 0.17 -0.38 -1.83 -2.76 -0.59 -1.42 -0.61 -0.48 -0.77 1.2 0.42 0.61 -0.51 -0.55 -0.7 0.28 1.22 1.09 -0.24 -0.06 -0.22 -0.41
-0.45 -0.31 -0.09 -0.14 -0.17 -0.07 0.08 0.09 0.1 -0.03 -0.05 -0.23 -0.37 0.26 0.94 -0.16 -0.67 -0.72 -0.31 0.9 0.54 0.58 -0.5 -0.49 0.39 0.54 0.39 0.34 -0.71 -0.69 -0.78 -0.81
0.18 0.23 -0.05 0.08 -0.11 -0.01 0.15 0.26 0.4 0.38 0.39 0.31 -0.37 -0.27 -0.15 -0.12 -0.67 -0.93 0.37 0.02 -0.74 -2.0 -0.29 -0.02 1.16 0.45 0.01 -0.12 -0.35 -0.37 -0.38 -0.18
-0.93 -1.67 -1.13 -0.89 -0.95 0.04 0.32 0.5 0.18 0.08 -0.4 -0.75 -2.14 -1.96 -0.42 -1.77 -0.85 -0.83 -0.65 1.19 1.82 1.91 -1.08 -1.11 1.17 0.09 0.58 0.53 -0.7 -0.53 -0.71 -1.12
0.09 -0.26 -0.37 -0.34 -0.45 -0.48 -0.71 -0.27 0.01 0.15 0.14 0.08 0.01 -0.38 -0.75 -0.19 -0.48 -0.97 0.27 1.08 0.23 1.16 -0.4 -0.18 0.34 0.65 -0.05 -0.27 -0.32 -0.25 0.0 0.33
-0.19 -0.28 -0.17 -0.11 -0.3 -0.08 0.27 0.46 0.42 0.49 0.35 0.18 -0.31 -0.81 -0.4 -0.37 -0.86 -1.19 -0.18 0.77 1.24 -0.6 -0.83 -0.66 0.64 0.81 0.05 0.15 -0.63 -0.52 -0.47 -0.4
0.13 0.62 0.18 0.64 0.76 0.3 0.61 0.46 0.24 0.48 0.23 -0.02 -0.56 -0.33 0.39 -0.07 -1.03 -0.15 -0.77 0.28 0.35 -2.03 -0.37 -0.28 0.33 -0.1 0.21 -0.42 -1.07 -0.86 -1.12 -1.04
-1.16 -1.53 -0.38 -0.29 -0.73 -0.15 0.06 -0.65 -1.07 -0.97 -1.34 -1.2 -2.45 -2.94 2.12 -0.89 -0.15 0.93 0.91 1.79 -0.36 0.93 -1.04 -1.99 -3.09 -1.08 1.4 1.4 -0.34 -1.15 -1.1 -1.93
0.69 -0.66 -0.43 -0.18 0.3 -0.34 0.16 0.63 -0.02 -0.17 -0.37 0.04 -2.42 -4.02 -1.56 -2.35 -2.52 -2.36 0.84 2.27 2.01 - -1.35 -0.32 0.66 -0.34 0.22 0.55 -1.14 -1.31 -1.43 -0.86
0.28 -0.17 0.02 0.12 0.67 0.19 0.26 0.46 0.35 0.06 0.31 0.04 -0.98 -1.01 0.32 -0.59 -0.77 0.31 -0.54 1.16 0.7 1.44 -1.33 -1.31 -1.8 -0.46 0.37 -0.15 -1.36 -1.1 -0.79 -1.14
-0.57 -0.87 -1.5 -0.4 -0.98 -0.64 0.07 0.13 0.23 0.48 -0.22 0.24 -1.09 -0.75 -1.09 -2.94 -2.52 -0.38 -3.17 1.54 0.61 2.11 -2.31 -4.04 1.86 0.68 1.3 0.71 -2.46 -2.79 -2.38 -2.51
-0.3 -0.08 -0.13 -0.01 -0.07 0.02 -0.13 0.01 -0.1 -0.33 -0.57 -0.69 -0.17 -0.22 0.35 -0.06 -0.51 -0.83 0.29 1.21 -1.0 0.94 -0.38 -0.33 0.74 0.54 0.64 0.61 -0.56 -0.69 -1.07 -0.55
-0.74 -1.33 -1.67 -0.95 0.12 0.49 1.11 0.89 0.63 0.44 0.01 -0.47 1.22 -4.13 -2.28 -1.34 -1.19 -0.64 -0.99 -0.38 -1.69 0.95 -1.39 -0.69 0.78 0.2 1.29 1.23 -0.06 -0.01 -1.02 -1.51
-0.38 0.01 -0.18 -0.16 0.84 0.26 0.26 0.31 -0.32 -0.17 -0.54 -0.83 -1.86 -1.2 0.73 -0.88 -1.22 -1.57 0.89 1.73 -1.6 1.53 -1.34 -1.8 -0.7 0.83 0.87 0.22 -1.41 -1.12 -1.05 -0.72
0.01 0.19 -0.18 0.01 0.37 0.27 0.37 0.13 0.29 0.58 0.18 0.16 -0.46 -0.55 0.15 -0.14 -0.98 -0.65 -0.2 1.01 0.68 1.11 -0.56 -0.76 -0.54 -0.44 -0.25 -0.3 -0.82 -0.72 -0.49 -0.56
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-0.78 -0.28 -0.01 0.04 0.42 0.34 0.46 0.45 0.25 0.07 -0.07 -0.54 -0.43 -0.56 1.04 -0.8 -0.96 -1.21 0.15 1.53 -2.11 0.29 -0.37 -0.02 -0.07 -0.11 0.66 0.61 -0.45 -0.38 -1.47 -1.81
-0.08 -0.12 -0.41 0.03 0.09 0.14 -0.13 -0.31 -0.21 -0.19 -0.54 -0.59 -0.14 -0.01 0.97 -0.14 -0.45 -0.51 -0.18 0.67 -0.29 1.1 -0.08 0.11 1.02 -0.67 0.35 0.25 -0.68 -0.45 -0.83 -0.61
-0.65 -0.65 -0.6 -0.38 -0.04 0.01 0.12 0.23 0.12 -0.06 -0.18 -0.26 -0.15 -0.02 1.11 0.13 -0.94 -0.78 -0.23 1.28 -0.34 0.38 -0.4 -0.11 0.48 0.67 0.41 0.47 -0.66 -0.55 -0.97 -1.08
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-0.19 0.03 -0.11 0.06 0.22 -0.08 -0.22 -0.01 0.05 -0.12 -0.14 -0.22 -0.35 0.17 0.43 -0.25 -0.54 -1.19 -0.17 0.11 -0.03 1.25 -0.57 -0.57 0.67 0.47 0.6 0.47 -0.7 -0.62 -0.48 -0.51
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.