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Heatmap: Cluster_84 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

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Gene
Aerial tissue - Light - ZT1
Aerial tissue - Light - ZT3
Aerial tissue - Light - ZT5
Aerial tissue - Light - ZT7
Aerial tissue - Light - ZT9
Aerial tissue - Light - ZT11
Aerial tissue - Dark - ZT1
Aerial tissue - Dark - ZT3
Aerial tissue - Dark - ZT5
Aerial tissue - Dark - ZT7
Aerial tissue - Dark - ZT9
Aerial tissue - Dark - ZT11
Roots
Root elongation and differentiation zone
Root meristematic zone
Aerial roots and rhizophores
Shoot tips
Microphyll
Strobili
Shoot apical meristem - AC
Shoot apical meristem - Core
Shoot apical meristem - P1
Stem - Top
Stem - Bottom
Whole plant
Aerial tissue - Stress - Dark
Aerial tissue - Stress - High light
Aerial tissue - Stress - Cont
Aerial tissue - Stress - 37C 1h
Aerial tissue - Stress - 37C 3h
Aerial tissue - Stress - 4C 1h
Aerial tissue - Stress - 4C 3h
0.7 0.75 0.86 0.76 0.83 0.72 0.82 0.89 1.0 0.85 0.84 0.78 0.79 0.62 0.82 0.81 0.55 0.41 0.79 0.11 0.1 0.14 0.67 0.71 0.09 0.85 0.79 0.73 0.57 0.67 0.68 0.8
0.78 0.77 0.84 1.0 0.95 0.96 0.88 0.81 0.93 0.92 0.98 0.86 0.88 0.7 0.83 0.85 0.64 0.41 0.62 0.1 0.29 0.05 0.65 0.74 0.68 0.7 0.72 0.75 0.52 0.55 0.53 0.55
0.79 0.8 0.75 0.79 0.74 0.69 0.73 0.83 0.9 0.94 0.93 0.88 0.88 0.86 0.8 1.0 0.45 0.32 0.73 0.02 0.05 0.02 0.69 0.71 0.11 0.8 0.53 0.56 0.56 0.61 0.59 0.68
0.74 0.78 0.79 0.88 0.88 0.74 0.82 0.92 0.92 0.95 0.94 0.81 0.78 0.78 0.65 0.81 0.55 0.34 0.83 0.08 0.06 0.09 0.77 0.77 0.14 1.0 0.79 0.77 0.61 0.66 0.54 0.59
0.95 0.9 0.79 0.9 1.0 0.85 0.78 0.76 0.66 0.77 0.78 0.72 0.82 0.56 0.61 0.88 0.61 0.53 0.84 0.0 0.1 0.0 0.67 0.66 0.03 0.84 0.87 0.96 0.65 0.68 0.55 0.49
0.64 0.67 0.69 0.82 0.85 0.72 0.79 0.95 0.87 0.82 0.8 0.72 0.79 0.66 0.95 0.87 0.55 0.37 0.65 0.01 0.11 0.01 0.74 0.76 0.37 1.0 0.75 0.96 0.62 0.66 0.32 0.4
0.46 0.54 0.5 0.52 0.53 0.44 0.46 0.46 0.45 0.42 0.46 0.41 0.32 0.43 0.55 0.49 0.34 0.22 0.38 0.08 0.16 0.08 0.3 0.3 0.27 1.0 0.66 0.73 0.31 0.35 0.29 0.28
0.64 0.6 0.59 0.61 0.63 0.58 0.61 0.72 0.75 0.8 0.8 0.71 0.65 0.47 0.65 0.63 0.42 0.36 0.5 0.07 0.06 0.07 0.53 0.65 0.24 1.0 0.7 0.71 0.5 0.54 0.52 0.51
0.92 0.85 0.86 0.9 0.95 0.87 0.87 0.93 0.92 0.95 0.91 0.92 1.0 0.9 0.97 0.98 0.52 0.38 0.68 0.1 0.12 0.07 0.58 0.7 0.56 0.94 0.76 0.8 0.61 0.66 0.56 0.53
0.68 0.59 0.51 0.56 0.59 0.49 0.44 0.55 0.61 0.61 0.65 0.64 0.51 0.74 0.52 0.62 0.41 0.24 0.58 0.06 0.12 0.06 0.5 0.52 0.27 1.0 0.73 0.74 0.47 0.49 0.46 0.37
0.59 0.53 0.6 0.66 0.77 0.54 0.55 0.62 0.59 0.65 0.62 0.55 0.39 0.32 0.63 0.51 0.39 0.24 0.57 0.0 0.0 0.0 0.4 0.43 0.02 0.75 0.92 1.0 0.36 0.34 0.47 0.54
0.48 0.42 0.42 0.45 0.51 0.46 0.53 0.61 0.66 0.76 0.69 0.64 0.51 0.4 0.56 0.51 0.34 0.26 0.59 0.01 0.01 0.0 0.42 0.48 0.11 1.0 0.61 0.63 0.46 0.48 0.44 0.46
0.68 0.62 0.71 0.69 0.71 0.58 0.7 0.8 0.85 0.89 0.86 0.73 0.62 0.49 0.53 0.62 0.4 0.33 0.69 0.01 0.01 0.01 0.52 0.54 0.01 1.0 0.78 0.78 0.47 0.48 0.78 0.77
0.75 0.69 0.67 0.68 0.59 0.66 0.73 0.7 0.73 0.71 0.68 0.71 0.61 0.4 0.85 0.61 0.44 0.47 0.73 0.04 0.0 0.0 0.47 0.5 0.08 0.97 1.0 0.88 0.46 0.48 0.73 0.87
0.78 0.76 0.84 0.8 0.87 0.8 0.8 0.88 1.0 0.92 0.82 0.75 0.69 0.49 0.37 0.55 0.41 0.23 0.51 0.01 0.04 0.03 0.38 0.31 0.06 0.66 0.75 0.81 0.54 0.55 0.48 0.51
0.83 0.85 0.79 0.91 0.86 0.92 0.81 0.9 0.9 0.93 0.91 0.88 0.9 0.63 0.57 0.99 0.64 0.49 0.9 0.04 0.1 0.01 0.74 0.81 0.24 1.0 0.57 0.69 0.71 0.76 0.56 0.56
0.53 0.58 0.55 0.7 0.75 0.72 0.59 0.66 0.68 0.65 0.7 0.5 0.48 0.4 0.59 0.69 0.46 0.52 0.78 0.0 0.01 0.05 0.6 0.76 0.24 0.94 0.88 1.0 0.53 0.59 0.27 0.34
0.58 0.49 0.48 0.45 0.47 0.4 0.32 0.42 0.43 0.46 0.5 0.49 0.59 0.52 0.38 0.66 0.31 0.21 0.57 0.0 0.0 0.0 0.37 0.41 0.0 1.0 0.65 0.74 0.4 0.43 0.31 0.28
0.64 0.48 0.57 0.64 0.69 0.67 0.65 0.77 0.81 0.77 0.82 0.68 0.58 0.58 0.57 0.61 0.51 0.29 0.77 0.0 0.01 0.02 0.51 0.47 0.26 1.0 0.66 0.66 0.52 0.49 0.47 0.47
0.42 0.49 0.52 0.63 0.61 0.53 0.64 0.74 0.75 0.73 0.71 0.62 0.68 0.73 0.85 0.74 0.4 0.23 0.61 0.02 0.01 0.01 0.61 0.63 0.03 1.0 0.73 0.79 0.48 0.52 0.48 0.54
0.65 0.67 0.67 0.81 0.88 0.73 0.7 0.86 0.78 0.74 0.78 0.65 0.59 0.51 0.67 0.75 0.61 0.29 0.75 0.01 0.03 0.0 0.67 0.62 0.15 1.0 0.79 0.89 0.68 0.73 0.5 0.43
0.55 0.59 0.52 0.56 0.67 0.67 0.65 0.73 0.78 0.77 0.81 0.7 0.42 0.45 0.76 0.48 0.26 0.14 0.44 0.02 0.05 0.07 0.35 0.39 0.13 1.0 0.65 0.59 0.31 0.34 0.31 0.3
0.72 0.66 0.55 0.63 0.78 0.68 0.58 0.62 0.63 0.56 0.58 0.61 0.49 0.42 0.59 0.79 0.47 0.43 0.76 0.14 0.09 0.13 0.53 0.65 0.39 1.0 0.87 0.91 0.51 0.49 0.32 0.34
0.6 0.71 0.75 0.83 0.84 0.82 0.96 1.0 0.96 0.97 0.89 0.79 0.72 0.61 0.98 0.7 0.56 0.34 0.88 0.05 0.01 0.02 0.63 0.68 0.11 0.85 0.86 0.9 0.63 0.68 0.71 0.7
0.65 0.82 0.79 0.92 0.94 0.86 0.86 0.92 0.85 0.82 0.75 0.72 0.56 0.67 0.76 0.62 0.51 0.27 0.57 0.13 0.09 0.13 0.54 0.53 0.36 0.77 0.9 1.0 0.49 0.51 0.43 0.41
0.76 0.7 0.72 0.8 0.79 0.68 0.67 0.84 0.86 0.89 0.88 0.8 0.61 0.55 0.76 0.66 0.43 0.22 0.65 0.09 0.01 0.02 0.63 0.63 0.26 1.0 0.81 0.75 0.46 0.51 0.69 0.91
0.68 0.82 0.82 0.81 0.79 0.87 0.9 0.93 0.86 0.93 0.85 0.72 0.83 0.77 0.77 0.96 0.43 0.37 0.92 0.13 0.13 0.14 0.58 0.63 0.19 1.0 0.94 0.98 0.47 0.52 0.51 0.46
0.55 0.55 0.56 0.59 0.58 0.55 0.6 0.61 0.66 0.7 0.67 0.64 0.47 0.65 0.73 0.53 0.48 0.39 0.43 0.24 0.14 0.2 0.43 0.47 0.2 1.0 0.63 0.75 0.48 0.52 0.41 0.36
0.71 0.77 0.86 0.84 0.91 0.82 0.85 0.95 0.89 0.91 0.9 0.78 0.95 0.63 0.73 1.0 0.56 0.38 0.92 0.03 0.05 0.04 0.75 0.84 0.14 0.94 0.68 0.73 0.73 0.78 0.68 0.7
0.71 0.71 0.74 0.79 0.82 0.82 0.9 1.0 0.92 0.97 0.9 0.78 0.74 0.8 0.95 0.89 0.5 0.37 0.69 0.16 0.31 0.39 0.6 0.68 0.21 0.89 0.79 0.79 0.56 0.58 0.68 0.6
0.73 0.65 0.6 0.74 0.71 0.67 0.65 0.8 0.83 0.84 0.8 0.74 0.88 0.93 1.0 0.94 0.43 0.27 0.9 0.0 0.01 0.01 0.7 0.83 0.19 0.95 0.63 0.62 0.54 0.54 0.43 0.5
0.71 0.7 0.76 0.82 0.88 0.84 0.75 0.91 0.9 0.87 0.77 0.73 0.84 0.7 0.64 0.97 0.56 0.42 0.82 0.11 0.05 0.2 0.75 0.8 0.69 1.0 0.91 0.98 0.66 0.69 0.55 0.6
0.64 0.69 0.71 0.79 0.86 0.8 0.84 0.9 0.82 0.81 0.76 0.71 0.63 0.67 0.69 0.7 0.51 0.35 0.77 0.13 0.23 0.21 0.58 0.59 0.37 0.77 0.89 1.0 0.57 0.59 0.53 0.5
0.98 0.91 0.88 0.92 0.9 0.78 0.79 0.87 0.89 0.96 0.95 0.91 0.96 0.88 0.78 1.0 0.54 0.36 0.98 0.02 0.02 0.03 0.67 0.69 0.09 0.92 0.74 0.76 0.64 0.68 0.7 0.67
0.84 0.89 0.92 0.91 0.99 0.93 1.0 0.89 0.9 0.88 0.87 0.73 0.8 0.66 0.9 0.93 0.62 0.45 0.85 0.24 0.05 0.12 0.69 0.67 0.06 0.74 0.79 0.82 0.62 0.67 0.54 0.5
0.77 0.89 0.85 0.9 0.91 0.77 0.94 0.91 0.91 0.95 0.89 0.81 0.71 0.67 0.58 0.9 0.51 0.29 1.0 0.05 0.04 0.04 0.68 0.67 0.1 0.98 0.84 0.87 0.65 0.68 0.77 0.78
0.91 0.91 0.87 0.92 0.98 1.0 0.91 0.86 0.88 0.91 0.86 0.8 0.69 0.5 0.36 0.79 0.57 0.54 0.73 0.0 0.03 0.0 0.63 0.62 0.08 0.86 0.76 0.83 0.59 0.62 0.52 0.49
0.88 0.86 0.92 0.86 1.0 0.94 0.87 0.83 0.85 0.87 0.86 0.84 0.62 0.64 0.82 0.72 0.53 0.39 0.84 0.11 0.13 0.12 0.58 0.58 0.24 0.84 0.87 0.8 0.59 0.64 0.56 0.63
0.57 0.59 0.51 0.59 0.62 0.57 0.57 0.66 0.67 0.75 0.66 0.67 0.58 0.35 0.48 0.67 0.35 0.27 0.58 0.0 0.02 0.0 0.43 0.47 0.12 1.0 0.61 0.6 0.5 0.46 0.59 0.59
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0.62 0.73 0.77 0.81 0.79 0.73 0.9 0.91 0.94 1.0 0.92 0.8 0.75 0.58 0.44 0.8 0.43 0.26 0.68 0.03 0.1 0.07 0.57 0.57 0.13 0.8 0.67 0.69 0.53 0.56 0.65 0.68
0.6 0.48 0.48 0.53 0.56 0.48 0.51 0.68 0.64 0.67 0.59 0.61 0.74 0.65 0.37 0.74 0.31 0.19 0.54 0.09 0.1 0.09 0.39 0.44 0.27 1.0 0.64 0.63 0.4 0.39 0.41 0.37
0.79 0.78 0.8 0.86 0.87 0.83 0.86 1.0 0.94 0.93 0.85 0.81 0.69 0.56 0.59 0.68 0.57 0.42 0.66 0.01 0.09 0.04 0.57 0.54 0.44 0.82 0.82 0.86 0.57 0.59 0.59 0.61
0.66 0.67 0.63 0.57 0.62 0.57 0.57 0.63 0.58 0.64 0.6 0.59 0.62 0.47 0.4 0.64 0.32 0.29 0.69 0.07 0.04 0.02 0.42 0.47 0.18 1.0 0.79 0.78 0.42 0.46 0.4 0.42
0.43 0.41 0.41 0.43 0.39 0.38 0.45 0.52 0.53 0.59 0.6 0.56 0.48 0.42 0.41 0.54 0.34 0.23 0.5 0.03 0.04 0.02 0.34 0.36 0.13 1.0 0.6 0.6 0.43 0.44 0.43 0.44
0.46 0.51 0.47 0.55 0.6 0.44 0.53 0.62 0.63 0.71 0.56 0.58 0.71 0.6 0.49 0.72 0.46 0.35 0.63 0.0 0.0 0.0 0.52 0.51 0.27 1.0 0.75 0.77 0.57 0.62 0.58 0.41
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Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)