Heatmap: Cluster_235 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Ovary
Microspore
Generative cell
Pollen
Sperm cell
Pollen grain
Pollen tube
Pollen tube (1.5h)
Pollen tube (3h)
Pollen tube (9h)
Pistil
Style (before flowering)
Style (after flowering)
Style (pollinated, after flowering)
Flower (buds)
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Pericarp/Exocarp (4 DPA)
Pericarp
Pericarp (5 DPA)
Pericarp (7 DPA)
Pericarp (10 DPA)
Fruit (mature green)
Fruit (breaker stage)
Septum (7 DPA)
Septum (10 DPA)
Septum/Seed (4 DPA)
Seed (5 DPA)
Seed (7 DPA)
Seed (10 DPA)
Seeds (10 DPA)
Seeds (20 DPA)
Seeds (30 DPA)
Seeds (Pk-stem)
Seeds (Br-stem)
Seeds (Pk-equatorial)
Seeds (Pk-stylar)
Seeds (Br-stylar)
Seeds
Seeds (RR)
Seeds (LR)
Seeds (MG-equatorial)
Hypocotyl
Seedling (leaves)
Seedling (roots)
Callus
Meristem (vegetative)
Meristem
Apical meristem
Leaf
Root
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root hair cells
1.66 1.98 0.86 1.41 -1.95 - -5.58 -11.69 -11.0 - - - -0.59 -1.33 -0.37 -0.21 -0.76 -0.28 1.77 2.45 -0.3 0.95 0.68 0.38 -0.14 1.31 1.48 -0.9 -1.07 -1.32 -1.7 -1.44 -0.87 0.52 -1.2 -1.78 -1.52 -1.61 -1.53 -1.1 -1.24 -1.12 -0.81 -1.2 -1.19 -1.55 -1.73 1.54 -0.39 -0.93 -1.06 -2.29 -0.85 1.08 1.33 -0.08 -1.58 -0.48
-0.79 -1.72 1.08 -2.59 -4.22 - -1.82 - -11.07 - - - 0.3 -0.75 -0.82 -0.76 -0.94 1.07 1.66 2.14 1.3 0.63 0.96 1.14 1.42 2.19 0.83 1.01 1.8 0.54 -1.29 0.19 0.39 -3.96 -0.09 -1.26 -0.51 -0.98 -0.81 -0.82 -1.77 -1.08 -0.21 -0.82 -2.01 0.4 -2.89 -0.12 0.18 -2.12 -0.93 -1.4 1.17 0.15 -4.08 -6.09 - -4.19
0.81 1.2 1.15 0.18 0.09 -1.54 -1.05 -1.0 -0.16 -0.39 -0.48 -0.52 0.4 -1.33 -1.11 -0.46 0.16 -0.42 0.48 2.38 0.34 1.05 0.67 0.65 -0.36 0.56 1.38 0.12 -0.6 -0.2 0.15 0.27 -0.18 -3.1 -0.68 0.48 -0.3 -0.23 -0.34 -0.4 -0.42 -0.23 -0.44 -0.68 0.62 -0.45 -2.6 -0.37 -2.07 -0.23 0.49 -2.15 -0.69 -1.51 -2.98 -0.58 -1.18 -2.73
1.35 1.04 0.53 -0.42 -3.42 -6.26 -3.46 -5.77 -5.9 -6.49 -6.79 -7.02 0.98 0.32 0.15 0.09 0.25 0.26 0.94 1.55 -0.32 0.39 -0.16 -0.13 -0.36 0.5 0.53 -0.07 -0.24 -0.33 -0.22 -0.19 -0.05 -0.01 0.44 -0.52 -0.63 -0.61 -0.81 0.08 -0.18 -0.45 -0.02 -0.34 -0.36 -0.39 -0.4 0.72 0.3 -0.18 0.34 -0.67 0.08 0.06 0.22 1.02 0.28 0.71
0.28 1.07 0.46 0.0 -3.01 - -3.26 -9.96 -9.86 - - - 0.88 -0.16 -0.54 -0.11 -0.36 -1.0 -0.32 0.59 -0.11 0.46 -0.12 0.04 0.16 0.89 0.94 0.01 0.4 -0.03 -0.21 0.01 0.3 1.53 0.16 -0.62 -2.5 -1.93 -1.72 -1.8 -1.39 -1.54 -1.85 -1.8 -1.36 -0.03 -0.99 1.12 2.1 -0.4 0.37 -1.33 -0.32 1.53 1.26 1.2 0.15 0.41
-0.14 1.23 0.02 -1.78 -5.25 - -7.96 -8.89 -10.78 -9.99 - -10.94 -0.55 -0.93 0.17 0.1 -0.26 -0.03 0.08 0.36 -0.43 1.32 -0.69 -0.42 -0.39 0.97 1.57 -0.35 0.05 -0.37 -0.62 -0.51 -0.26 -0.78 -0.44 -0.39 0.61 0.61 0.62 1.06 0.35 0.53 0.94 0.77 0.03 -0.71 -1.8 1.46 0.42 -0.91 -0.62 -1.37 -0.64 1.06 1.39 -0.1 -1.51 0.54
1.2 0.83 1.0 -0.97 -0.06 - -1.96 -8.49 -12.3 -8.98 -9.37 - 1.07 -0.36 0.18 0.22 -0.24 -0.51 0.91 0.63 -0.09 1.55 -0.22 -0.11 -0.23 0.18 0.13 -0.11 0.39 -0.09 -0.34 -0.16 -0.0 -5.4 -0.11 -1.34 0.31 0.08 0.08 0.27 -0.6 -0.32 0.88 0.46 -0.92 0.08 -0.58 1.58 1.53 -1.17 -0.35 -0.66 -0.17 0.61 0.01 -1.03 -2.04 -0.47
-1.15 -1.78 -0.2 -1.93 -3.88 -6.89 -3.72 - -10.39 -8.11 - -7.87 -1.86 -0.96 -1.12 -1.54 -1.48 -0.61 0.15 -0.73 -3.0 1.87 -1.89 -2.34 -2.23 -1.29 0.71 -2.86 -1.67 -2.61 -2.13 -2.25 -2.08 -4.88 -3.18 -4.95 -0.85 -0.81 -0.36 -0.8 -0.16 -1.21 -0.46 -1.06 -2.95 0.0 -1.54 0.83 -0.34 -2.3 -2.07 -1.91 -0.46 1.0 3.8 3.72 -0.54 1.79
0.36 0.7 0.43 -0.83 0.01 -4.16 -0.85 -4.58 -4.22 -3.75 -3.92 -3.65 -0.62 -0.31 -0.78 -1.05 0.74 -0.34 -0.35 1.13 0.64 0.44 1.06 1.05 0.66 1.09 0.16 0.57 0.61 0.48 0.39 0.48 0.46 0.58 0.93 1.08 -1.3 -1.15 -1.26 -0.7 -0.87 -0.46 -1.04 -1.2 0.7 -1.1 0.47 0.96 -0.4 -1.03 -1.54 -1.09 -0.92 0.71 0.28 0.1 -0.89 -0.3
0.04 0.1 0.57 -1.33 -4.98 - -8.84 -12.17 -12.11 - -11.0 -11.77 0.76 -0.57 -0.83 -0.57 0.16 -0.29 0.29 1.23 0.56 0.49 0.83 0.64 0.47 0.51 0.4 0.43 0.76 0.33 -0.47 -0.04 0.05 -2.4 0.11 -0.13 0.25 0.01 0.16 0.3 -0.23 -0.0 0.17 0.42 0.44 -0.08 -1.13 1.74 1.08 -0.11 -0.23 -0.83 -0.17 0.55 0.52 -0.05 -1.29 -0.44
-0.23 -0.35 0.74 0.05 -4.36 -10.48 -4.82 -9.36 -10.51 -10.82 -11.23 -10.31 0.43 0.34 0.18 0.69 0.67 -0.87 0.54 0.5 -0.86 0.7 -0.76 -0.75 -0.82 -0.45 0.43 -0.55 -0.37 -0.64 -0.75 -0.6 -0.44 -1.55 0.67 0.69 -0.57 -0.86 -0.64 -0.01 -0.71 -0.41 -0.38 -0.63 0.04 0.37 -1.63 1.14 1.21 0.2 0.24 -0.76 -0.44 1.05 1.9 2.26 -0.01 0.65
1.26 1.57 0.23 -1.12 2.13 -4.7 0.34 -3.75 -4.07 -3.28 -3.21 -3.24 -0.51 -1.57 -0.91 -0.65 -0.41 -1.34 0.87 1.89 -1.19 0.3 -0.63 -0.78 -1.12 -0.29 1.21 -0.89 -0.85 -1.2 -0.83 -0.58 -0.35 -2.65 -0.29 -1.12 0.66 0.21 0.28 0.6 0.05 0.01 1.17 0.47 -0.58 -1.18 -0.62 0.67 -0.47 0.97 1.01 -1.19 -0.51 0.16 -1.5 -0.95 0.54 -0.47
0.38 1.14 0.24 -0.48 -5.6 -5.82 -6.86 -5.4 -5.22 -5.51 -5.17 -4.97 -0.07 -0.68 -0.25 -0.28 -0.33 0.12 0.32 1.12 -0.61 1.0 -0.25 -0.41 -0.53 0.08 0.78 -0.41 -0.21 -0.52 -0.25 -0.21 -0.19 -1.87 -0.41 -1.18 0.25 0.24 0.25 0.53 0.06 0.01 0.66 0.46 -0.23 0.01 -1.8 1.55 1.2 0.42 1.12 -1.92 -0.98 1.06 1.64 0.62 -1.24 -0.03
0.3 0.41 0.06 -3.9 -6.6 - -5.37 -14.87 -14.61 - - - -1.78 -2.26 -2.15 -2.07 -1.15 -1.28 0.84 1.0 -0.79 2.55 -1.08 -0.82 -0.9 0.85 2.33 -0.66 -0.31 -0.72 -0.92 -0.73 -0.72 0.34 -0.23 -0.17 0.45 0.44 0.75 1.24 0.83 0.54 1.1 0.56 0.58 -1.53 -1.58 1.58 -0.16 -0.58 -0.8 -1.66 -0.99 1.57 0.12 -1.14 -2.98 -0.6
-1.55 -0.46 0.19 2.04 - - - - - -2.82 - - - -0.34 1.73 0.27 0.91 -0.08 -0.46 -0.71 - 1.22 -1.12 -0.56 -0.73 1.15 1.94 -2.32 0.03 - - -3.72 -1.64 - 2.31 -0.71 - -1.06 1.06 - - -1.5 - - - 1.54 -3.14 1.47 1.62 - -2.09 -0.89 1.17 3.05 0.72 - - -
-2.13 -4.67 -1.55 3.4 -4.08 - -3.74 - - - - -6.15 -2.92 0.4 1.87 0.75 0.89 -0.53 -1.27 -1.48 -0.94 0.76 -2.8 -1.25 -0.57 0.81 1.39 -1.59 -0.09 -0.45 -2.32 -1.86 -0.31 -2.28 1.09 -0.07 -2.12 -4.19 - -0.16 -2.08 -1.2 -1.01 - -3.04 -0.07 -4.02 2.08 1.05 -2.18 -3.06 -1.55 1.91 2.55 0.47 - - -0.45
0.42 0.78 -0.34 -2.51 -1.6 - -4.13 -9.86 -9.58 -9.54 -9.83 -10.39 -1.33 -1.15 -1.19 -1.02 -1.06 0.58 -0.4 0.77 0.01 2.16 0.6 0.63 0.43 1.14 1.91 -0.01 -0.08 0.04 -0.06 0.11 0.06 -3.67 -2.15 -2.18 -1.02 -1.04 -1.39 -0.57 -0.76 -1.2 -1.31 -1.67 -1.41 0.62 1.56 1.3 0.49 -1.07 -1.2 0.1 0.02 0.36 1.67 0.87 -1.63 1.49
-0.49 -0.12 -0.22 1.67 2.17 -1.04 2.2 -0.95 -0.37 -1.12 -1.19 -1.15 0.08 -0.58 -0.19 0.02 -0.73 0.05 -0.38 -0.48 -0.95 0.08 -1.2 -1.09 -1.03 -0.13 0.72 -1.28 -0.7 -1.27 -1.34 -1.11 -0.77 -1.67 -0.9 -1.28 -0.05 -0.14 -0.67 0.1 -0.4 -0.26 0.84 0.1 -0.53 -2.88 -1.17 0.93 1.82 -2.25 -0.65 -1.79 -0.65 0.94 1.44 -0.83 -1.07 0.57
1.65 1.04 0.68 -2.12 -5.5 -6.33 -7.52 -4.92 -5.82 -6.98 -6.95 -6.67 0.04 -0.5 0.12 0.19 0.52 0.14 0.62 0.32 0.01 1.15 -0.17 0.19 -0.05 1.02 0.67 0.09 0.07 0.03 0.47 0.54 0.33 -3.1 -0.11 -0.2 -0.69 -0.67 -0.71 0.04 -0.61 -0.5 -0.2 -0.41 -0.24 1.02 -1.69 1.29 0.28 0.49 0.41 -0.59 -0.01 0.76 0.18 0.54 -1.16 -0.35
1.75 2.33 0.38 2.4 -4.19 -5.12 -4.16 -5.4 -5.55 -5.37 -5.39 -5.5 0.86 -0.03 0.34 0.15 0.03 -1.04 0.19 1.13 -0.89 0.16 -0.94 -0.91 -1.26 0.91 0.92 -0.82 -0.71 -0.98 -0.85 -0.74 -0.48 -1.3 -0.37 -0.37 -0.18 -0.26 -0.52 0.16 -0.42 -0.3 -0.13 0.05 0.01 0.12 -2.88 1.24 0.89 -0.8 -0.67 -1.61 -1.34 0.03 0.96 -0.39 -0.58 -0.8
-0.32 -0.18 -0.01 -1.12 -6.23 - - -12.56 -10.18 -11.54 - - -0.03 -0.36 -0.26 -0.28 0.06 0.03 -0.64 -0.17 -0.58 0.53 -0.82 -0.53 -0.47 -0.13 1.12 -0.64 0.0 -0.72 -1.31 -1.09 -1.0 -0.57 0.94 0.76 -0.32 -0.24 -0.39 0.39 -0.23 0.14 0.74 1.0 0.13 1.15 -1.61 1.76 1.02 -0.83 -0.7 -1.35 -0.04 1.04 1.99 1.06 -0.56 1.58
-2.29 -2.04 0.37 -2.86 -2.98 -7.5 -5.6 -6.67 -5.67 -6.38 -6.4 -6.48 0.38 -0.48 -1.93 -0.98 1.71 0.91 1.06 1.15 -0.19 2.09 0.1 0.78 1.24 2.05 2.12 -0.79 0.66 -0.95 -1.32 -0.68 -0.04 -3.92 -0.87 -1.12 -2.87 -1.4 -2.14 -2.0 -1.45 -1.72 -1.81 -2.3 -0.69 0.2 0.83 1.69 -0.1 -1.4 0.05 0.54 1.61 1.5 -2.79 -4.29 -8.59 -1.46
2.13 2.24 1.18 -3.39 -5.36 -10.65 -8.11 -8.97 -9.91 -11.65 - - -0.39 0.34 1.15 1.67 -0.23 -0.14 1.56 1.47 -2.37 1.32 -1.5 -1.54 -2.03 -0.03 0.98 -1.91 -1.18 -1.87 -1.04 -0.83 -0.7 -2.97 -0.71 -1.59 -0.96 -1.1 -0.75 -0.39 -0.72 -0.94 -0.61 -0.84 -0.56 -2.18 -1.82 1.72 1.93 -0.83 -0.52 -1.44 -0.67 0.64 1.27 -1.17 -1.75 0.46
0.62 0.2 0.03 -0.96 -2.16 - -6.43 -9.02 -10.85 -10.74 -9.7 -10.54 0.09 -0.34 -0.43 -0.25 -0.25 -0.68 0.57 0.21 0.01 1.74 -0.43 -0.21 -0.14 0.66 1.57 -0.1 0.32 -0.03 -0.3 -0.09 -0.09 -1.21 0.02 -0.03 0.47 -0.34 0.05 0.42 -0.44 0.02 0.79 0.68 -0.06 1.2 -1.77 1.42 0.65 -0.54 0.33 -1.61 -0.28 0.94 0.48 -0.62 -1.59 0.55
0.42 0.56 1.4 -3.88 -5.87 -4.51 -5.65 -3.58 -4.04 -4.11 -4.25 -4.11 0.08 0.16 0.55 0.46 0.44 0.2 0.85 0.63 0.61 0.44 0.62 0.68 0.53 0.74 1.53 0.62 0.59 0.53 0.01 0.29 0.36 -0.12 0.43 -0.21 -1.27 -0.74 -0.58 -1.15 -0.42 -0.73 -1.32 -1.66 -0.41 0.69 -1.52 0.25 -0.22 2.15 -0.75 -1.29 -0.86 0.29 -0.59 -0.48 -3.75 -1.38
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-2.84 -3.03 -2.05 -2.61 -5.74 - -6.49 - -11.38 - - - -3.56 -1.87 -2.38 -2.45 0.22 0.21 -1.31 -0.79 -0.93 2.59 -0.25 0.18 0.04 0.75 2.1 -1.17 -1.36 -1.56 -1.3 -0.71 -0.66 -5.25 -1.2 -0.64 0.4 0.27 0.34 1.14 0.12 0.23 0.95 0.76 -1.28 0.5 -1.99 1.55 1.45 -0.48 -0.42 -0.44 0.02 1.33 2.29 0.91 -4.41 0.7
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0.93 0.24 0.73 -0.62 -5.54 -9.9 -10.06 -9.08 -11.19 -11.62 - -9.13 0.22 0.43 0.46 0.22 0.57 0.4 0.99 0.58 -0.84 0.54 0.27 -0.2 -0.73 -0.52 0.06 -0.69 -1.66 -1.37 -0.3 -0.77 -0.96 -0.0 -0.43 -1.1 0.1 -0.08 0.2 0.12 -0.38 -0.14 0.63 0.46 -0.41 1.08 -1.15 0.5 0.74 1.07 1.69 0.25 0.62 1.06 0.22 -0.8 -0.18 0.43
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.