Heatmap: Cluster_174 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Ovary
Microspore
Generative cell
Pollen
Sperm cell
Pollen grain
Pollen tube
Pollen tube (1.5h)
Pollen tube (3h)
Pollen tube (9h)
Pistil
Style (before flowering)
Style (after flowering)
Style (pollinated, after flowering)
Flower (buds)
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Pericarp/Exocarp (4 DPA)
Pericarp
Pericarp (5 DPA)
Pericarp (7 DPA)
Pericarp (10 DPA)
Fruit (mature green)
Fruit (breaker stage)
Septum (7 DPA)
Septum (10 DPA)
Septum/Seed (4 DPA)
Seed (5 DPA)
Seed (7 DPA)
Seed (10 DPA)
Seeds (10 DPA)
Seeds (20 DPA)
Seeds (30 DPA)
Seeds (Pk-stem)
Seeds (Br-stem)
Seeds (Pk-equatorial)
Seeds (Pk-stylar)
Seeds (Br-stylar)
Seeds
Seeds (RR)
Seeds (LR)
Seeds (MG-equatorial)
Hypocotyl
Seedling (leaves)
Seedling (roots)
Callus
Meristem (vegetative)
Meristem
Apical meristem
Leaf
Root
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root hair cells
- 2.01 - 2.62 - - - - - - - - 1.7 - - - - 1.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.33 - 4.64 - 3.2 - - - - - - 2.43 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.3 - 4.53 3.03 - - - - - - -1.05 -0.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.48 - - - -1.46 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 4.4 - - - - - -0.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.2 - - - -0.17 - - - - 5.04
4.1 1.68 4.01 - - - - - - - - - 1.93 - - - - 1.08 - 2.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.5 - - 2.53 0.78 - - - - -
- - 3.18 - - - - - - 4.28 3.58 4.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -4.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.7 - - - - 5.76
- - 2.12 - - - - - 0.41 3.68 4.11 4.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.12 - - - - - - - - 4.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.31 2.58 - - - - - 2.11 -0.32 1.01 0.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.16 - - - - 5.39
- - 5.09 2.92 - - - - - - - - - 2.25 - 0.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.87 - - - - - - 2.43 - - - -0.49 - - - - -
- - 5.75 - - - - - - 0.33 0.46 0.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.16 3.79 - - - - - - 3.35 3.68 3.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 5.68 - - - - - - 1.69 - 1.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.51 -2.66 0.08 1.17 3.71 - 2.55 -2.02 -1.83 -4.19 -2.17 -2.25 -1.31 -4.63 -1.98 -1.56 -0.16 -0.49 - -2.82 -1.1 -0.28 -2.19 -1.94 -1.11 0.04 -0.75 -1.86 -0.79 -0.37 -1.04 -0.1 0.33 -0.19 2.18 -0.18 -1.09 -1.12 0.6 -0.51 - 0.3 - - -0.4 0.17 - -0.9 2.1 -3.05 -0.83 -0.95 1.17 -0.46 - -1.57 -1.67 -
- - - - - - - - - - - - - - - 2.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.68 - - - 0.64 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.25 - - 4.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.65 2.04 1.8 2.62 3.03 2.43 1.43 1.91 0.88 0.52 - - -1.82 - 0.01 - - - - - - - - - -1.09 - - - - - - - - - - - 0.99 - -1.0 - - - - - - 0.33 - - - 0.5 0.52 - - - -
- - 4.14 - - - - - 1.74 3.85 3.5 3.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.94 - - - - - - - - - - 4.77 - - - - -
- - 1.51 2.6 - - - - - - - - 2.94 - -0.81 - - 0.19 - 2.04 - 3.44 - - - - 1.37 - - - - - - - - - 2.23 - - - - 0.48 - - - 0.41 - -0.53 2.19 - - 1.33 -1.1 0.28 - - - 2.41
- - - - - - - - - - 3.61 5.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.68 3.27 - - - - - - -1.82 -0.78 -0.86 - - - - - - - 0.46 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.46
0.01 1.83 3.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.45
2.36 - 0.89 - - - - - -1.53 3.84 3.65 3.67 - - - - - - - -0.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.1 - - - - 3.33
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.65 - 1.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.62
- - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.47 -2.77 - - - -3.72 - - - - 2.92 0.87 0.05 -0.31 -0.21 0.0 - - - - - -4.87 -3.02 - - -3.17 -2.51 - -3.53 - - - - - - - - - - - - - - -1.18 2.47 -3.58 -3.54 - - -1.02 1.89 3.4 - - - 3.61
- - 5.1 - - - - - - - - 2.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.21 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.24 - - - - - - - - 4.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.42 -0.15 2.52 1.11 - - - - - -1.98 -2.9 -4.72 - 0.4 0.58 0.3 - 0.24 1.29 4.04 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.47 0.17 - - - -1.57 - 2.55 - - - - 1.14 - - - 0.61 - - - - 3.04
- - 3.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.4
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.6 - - - 3.23 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
3.12 1.87 2.51 - -1.06 - -0.77 -1.86 2.04 3.06 2.83 2.9 - -0.69 -0.86 -1.72 - -0.5 0.66 0.83 - -1.59 - - - - - - - - - - - - -0.36 - - - - - - -3.16 - - - - - - -2.71 - - -1.95 -1.1 - - - - 1.96
1.82 - 3.16 - - - 1.11 -0.9 2.0 3.33 3.32 3.2 1.18 - - - - -1.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.97 - - - - - 0.31 -0.82 - - - - 0.35
- 1.95 4.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.18 - - - - 4.74
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - -
- - - 3.41 - - - - - - - - 1.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.3 - - 1.05 - - - 1.83 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.47 - - - - - - - - 4.79 - - - - 3.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.0 - - - - -
- - - - 5.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.78 - - - - - - - - -
- - 2.31 - - - - - 0.48 3.89 4.25 4.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.41 - - - - - 1.22 4.17 3.95 4.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 5.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.34
-2.98 -2.6 0.93 -4.93 -5.69 - -6.88 -7.12 -5.94 -7.42 -7.75 -7.51 -1.21 0.51 0.15 1.32 -2.53 -1.52 -1.33 1.04 -2.81 -4.82 -1.14 -1.95 -3.31 -1.67 -4.27 -2.11 -3.74 -3.33 -4.0 -4.38 -4.35 -4.44 - - - - -5.24 - -5.24 -6.97 - - - -2.87 1.25 0.47 0.71 -4.3 -0.72 2.53 -0.06 -0.95 0.09 2.91 2.14 4.23
- - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 0.36 - 2.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.56 - - - - - - - - - - 3.96 - - 3.66 - - - -0.35 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86
2.54 - 2.11 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.41
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.58 4.75 2.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.98 - 3.13 - - - - - - -0.85 -2.81 - - 1.5 - 0.65 - 0.99 3.46 4.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.22 - - - 1.64 - - - - 1.42
- - - 5.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.0 - - - - - - - - - - - - - - - 2.81 - - - 1.01 - - - - -
2.46 - 2.87 - - - - - - 0.13 -0.99 0.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.71 0.21 - - - - 5.31
0.82 0.98 0.55 2.0 1.34 - 1.64 -0.03 1.34 0.91 1.45 1.57 - 0.94 0.81 0.95 - -0.4 - - - 3.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.29 - - - - - - - - - 0.46 1.08 - - - - 3.51
- - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.53 - - - - - - - - 2.99 - - - - 4.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.64 - - - - -
1.78 2.82 3.86 - - - - - 1.8 3.39 3.53 2.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.18 - - - - - 1.26 4.02 4.38 4.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.13 - - - - - -0.38 0.94 1.34 0.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.41
- - 2.07 3.86 - - - - - - - - 4.51 - 1.79 - - 1.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.28 - 0.03 - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.