Heatmap: Cluster_103 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -3.41 - - - - - - - - - - - - 5.54 - - - -1.69 - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.04 -4.69 - - - - - - - - - -
- 0.92 2.06 - 1.63 1.43 - - - - - - - -2.29 5.09 - - - -0.19 - - - - -2.96 - - - - -0.89 - -1.99 - - - - - - -3.95 - - - - - - - - - -
3.82 4.56 - - - - - - - - - 3.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.48 1.71 - - - -3.04 - -1.5 - - - - - 4.54 -0.44 1.4 -0.45 -0.12 2.39 -3.17 0.64 -1.3 - -1.06 -1.91 -2.44 1.0 -2.46 0.89 -2.37 -1.04 -4.99 -3.33 - -3.09 - - -2.21 - - 1.18 - - - - - - -2.33
- - - - - - - - 4.52 3.05 4.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.02 - - - - - - - - - - - - - - - 3.21 1.91 4.23 - - - - - - - - - - - - - -
5.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.67 0.16 1.16 - - - - - 2.05 -2.61 - 2.13 - - - - - - -2.93 -
- - - - - - - - - - - - - 2.31 5.32 - - - 1.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.18 - - -1.91 - - - - - - - 1.56 -0.98 - -2.36 -1.52 - - -0.77 1.34 - -1.47 -2.23 -0.71 -3.53 0.26 -1.33 - 0.26 -1.86 -0.9 -1.06 -1.72 -0.78 -1.44 -1.62 0.1 1.61 - - 3.01 3.67 1.55 1.22 - - 1.38
- - - - - - - 4.79 - - - - 2.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.39 - - - - -0.03 3.43 - - - - - - - - -
1.94 -0.04 1.08 2.37 1.98 1.97 2.6 -3.67 -0.44 - -3.52 -2.53 -2.53 -0.88 -1.35 -0.91 -2.5 -1.44 -3.09 -0.65 -0.15 -1.09 -1.79 -2.44 - -3.54 -3.29 -2.3 0.53 -4.19 -0.62 -1.07 -0.96 -1.49 -0.17 -1.09 -0.86 0.55 -1.5 -1.38 1.25 -0.1 -0.17 0.06 1.06 - - -0.34
AT1G71920 (HISN6B)
-0.34 1.45 -0.68 4.23 1.67 0.61 3.89 -1.8 -2.48 -5.75 -28.37 -4.95 -4.81 - - - - - -0.92 -3.77 - - - -5.29 - - - 0.28 -0.37 - -1.14 - -1.24 -3.16 -4.4 - - -0.14 -2.92 - -3.94 - - - - - -2.1 -
3.1 - - - - - - - - - - - 2.41 - - - - - - 1.94 - - - - - - - - 4.21 - - - - 3.28 -0.42 - - 0.46 - - - - - - - - - -
- 4.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.41 - - - - - - - - - - - - - 4.27
-1.83 1.0 - 3.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.25 - - - - 1.91 1.4 - 0.72 - - - - - - - 4.34 - - - 2.93 - - - -
- - - - - -2.45 - 2.4 4.79 -0.56 3.69 - -0.97 - - - - - -0.66 - - - - - - - -3.2 - - - - - - - -7.03 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 5.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.31 2.12 - - - -0.25 - - - - - - - - - -
- - - 1.95 - - 3.29 -2.16 4.28 -0.93 3.48 - 1.52 - - - - - -3.46 - - - - - - - - - -3.18 - - - - - - - - -7.73 - - - - - - - - - -
1.78 1.23 -2.55 -1.08 -2.68 - -1.22 - -0.45 - - - - 0.81 2.32 -1.99 -0.21 -2.4 -1.56 1.48 - -0.75 -0.48 0.27 - -0.82 -0.95 0.36 -1.04 - -0.14 -0.6 1.18 -0.21 -1.23 - 2.92 1.3 1.04 - - - 1.32 0.6 - 0.35 - 0.31
2.63 -0.23 -0.59 0.46 -1.01 -3.56 -0.02 -8.51 -3.14 -6.85 -4.22 -8.73 -7.13 -0.24 1.31 0.52 0.28 -0.06 -2.89 -0.45 -1.33 0.99 0.74 0.93 -3.5 1.83 0.29 -0.99 -2.11 -6.01 -0.69 -2.26 -0.38 -2.2 0.72 1.35 2.65 1.01 0.47 0.19 -7.83 -1.94 -3.25 -2.44 -1.96 -5.71 - -2.6
-1.15 1.11 -4.7 - - - - - - - - - - -5.15 1.24 0.16 1.75 - 0.36 0.88 5.12 - -4.19 -3.79 - -3.94 -2.51 - -5.49 - -3.8 -4.15 - -6.45 -6.05 - - -4.39 -4.83 - - - - - - - - -
- 0.53 - 3.53 - 0.73 4.03 - - - - - - - - 0.2 - - - - - - - 0.03 0.8 - - - 3.57 - - -0.79 -0.63 - - - - - - - - - - - - - - -
- -2.66 - -1.36 1.7 0.63 - -1.84 -1.7 - - - - - 5.2 - - - - - - 0.0 - -1.08 - -0.61 - - 1.41 - - - - -3.38 - - - - - - - - -1.24 - - - - -
- - 1.1 - 2.49 1.6 - - - - - - -1.26 - - - - - -4.24 - - - - -4.05 - - - -3.35 - - - 2.52 -0.87 -0.21 - - - -7.81 - - - 4.38 -1.38 - 3.04 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.97 1.37 2.99 2.03 3.58 - - - - - 1.69 - - - - - 0.9 -3.09 - - - -5.13 - - - - -0.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AT3G20400 (EMB2743)
2.63 1.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.36 - - - -1.17 - - - - - - - - 3.24 4.19 1.41 - - 2.64 - - - - - - - - - -
-0.41 1.2 1.75 - 2.46 1.04 - 1.38 - -1.56 - - 0.91 0.12 3.62 - - - - - - - - -2.72 - - - - -0.59 - - - 0.42 1.22 - - - 0.12 -3.03 - - 0.09 -0.82 - - - -0.64 2.97
-0.29 2.01 0.58 - 2.59 2.46 -1.64 -0.21 -1.64 0.26 - 0.57 0.03 0.38 1.8 -1.24 -0.41 -1.59 - 0.34 - -1.7 -1.2 0.27 - -1.35 -0.15 - -0.59 - 0.31 -1.31 -0.99 -0.22 0.86 0.31 -1.16 -1.02 -2.44 -1.08 - 0.73 -1.21 - -1.19 - 1.21 -0.04
-0.17 4.03 - - - - - - - - - - - 3.55 - - - - - 2.49 - - - 1.86 - - - - - - 1.84 - 2.66 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.7 2.74 - - - - - - - - 3.64 - - - - - - - - - - - - - 2.62 - 1.48 - - - - - - - - - - 2.79 - - - - - - - -
- 3.56 - - - - - - - - - - 3.16 - - - - - - 1.26 - - - -3.14 - 0.37 - - 4.15 - 2.49 - - - - - - -3.33 - - - - - - - - - -
- - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 3.47 3.18 3.06 2.85 - - - - - - - - 1.83 0.41 - - - - - 2.35 - - - - - - - - - - - -0.72 0.74 - - - - - - - - -
AT3G53290 (CYP71B30P)
- - - 3.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.84 - - - 0.33 -0.05 - - - - - 5.05 - - - - - - - -
3.43 5.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.2 -
- -1.02 3.24 1.72 3.46 2.58 2.22 -2.59 -2.27 -3.99 -4.96 - -2.81 1.79 -1.04 -0.79 -1.12 -1.73 -1.42 -1.09 - -1.25 -0.45 -2.62 -2.53 -1.97 -2.9 -3.22 -2.22 -4.1 -2.31 -2.57 -0.48 -0.88 -5.16 -3.91 0.08 -1.28 -0.33 - - -3.92 - - - - - -5.01
-3.21 1.53 1.14 - 1.75 - - - - -2.16 - - -0.51 -0.7 0.25 0.14 - 0.45 -0.76 0.99 -1.17 - 1.21 -1.49 -1.22 -1.91 - 1.62 2.18 - -0.7 -1.74 -0.77 -1.73 -0.44 0.19 0.79 -0.72 0.86 2.26 - 1.18 - 0.86 1.59 - - -0.95
3.23 -1.92 -0.66 2.84 -1.65 0.36 1.46 -0.57 - 1.17 0.74 -1.82 -0.04 -2.64 - -1.14 - - 0.41 -2.56 - - - -3.29 - - - 1.27 3.19 - -3.6 - - - -1.71 -0.16 -0.07 -3.33 -2.96 1.99 - - - - - - -2.36 -
-0.64 - - - 4.28 - 2.96 - - - - 1.68 - - - - - - 0.83 - - - 3.03 - - - - - - 0.36 2.03 - - - -0.86 - - -0.06 -2.35 - - - - - - - - -
AT4G04030 (OFP9)
- -0.02 - - 0.51 - 2.3 0.81 0.17 - - - - 4.01 - -0.23 - - 1.04 -0.09 - -1.59 0.6 0.09 0.05 0.55 - - - - -0.24 -0.45 0.38 -0.96 -2.35 -0.26 2.16 -1.09 - - - - 0.83 0.41 - - - -
- - - - - 0.54 - 0.77 4.6 1.06 3.75 - - - 2.09 - - - - - - - - - - - - - -0.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.18 1.84 1.77 - 0.21 - - -1.41 - -3.62 - - - 1.21 1.62 1.61 -0.11 - -1.07 1.26 0.16 2.06 0.29 0.19 -0.33 0.84 -1.16 0.89 - 0.15 -0.09 0.15 0.53 0.37 0.48 -1.04 -2.2 1.31 -0.97 - - - -1.97 -1.36 0.38 - - -0.32
- - - - - - - - - - - - - - 4.73 - 3.46 - 2.05 - - - - - - - - - - - - - 1.25 1.41 - - - 0.28 - - - - - - - - - -
3.26 0.78 3.72 - - - - - - - - - - 1.94 - - - - - 0.43 - - - - - - - - 3.57 - - - - - 0.42 - - -0.11 - - - - - - - - - 2.06
-2.19 -1.46 0.51 3.92 2.42 -1.05 4.24 - 0.75 -2.59 - - - - - - - - - - - - - - -3.22 -5.05 - - 1.19 -2.7 - - -1.81 -2.03 - - -2.84 -0.71 -3.18 - - - -1.87 - - - - -
-0.03 -0.34 -1.23 -3.02 -0.7 -1.08 -5.44 -0.43 - -0.97 - -5.83 -0.87 -0.18 -0.1 -0.66 -2.69 -1.36 -0.9 -0.94 -1.9 -1.1 -0.32 -1.66 -2.57 -1.25 0.21 0.55 -0.6 -2.75 -1.1 -0.21 -0.54 -0.06 -0.43 0.43 2.91 0.55 2.51 -2.51 -1.25 1.12 1.68 1.47 0.1 -2.73 0.22 1.0
0.72 1.07 - - 2.39 3.25 - -0.41 - -0.35 1.92 - 4.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.4 - - - 1.1 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.25 -1.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.54 - - - 1.72 - - 4.15 - 3.24 1.29 - - - - - - - -1.88 - 3.18 - - - - - - 2.18 -
- - 3.27 0.35 4.14 3.24 2.13 - - - - - - - 1.43 - - - - -1.64 - -0.07 - - - - - - - - - - - - 0.29 - - -2.79 -1.64 - - - - - - - - -
-7.33 -0.87 -2.05 - - -3.34 -4.62 0.9 -0.83 -0.77 1.08 - 0.97 -3.43 4.35 -1.71 3.58 -4.94 -2.62 0.63 -2.87 -2.6 - -5.32 - -4.3 - 0.24 -3.56 - - -0.1 -0.98 -0.15 -1.78 -4.5 -3.52 -2.39 -4.44 -3.25 - -1.63 -2.07 - -2.26 - -9.13 -
- - 4.37 3.52 - - - - - - - - - - - - - - 2.44 - - - - - - - - - 2.08 - 1.05 - - - 2.05 - - - - - - - - - - - - -
- - - - -0.36 -1.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - -6.27 3.05 - - - 1.01 2.33 - 2.08 3.84 3.35 -1.65 - - -0.43 -4.15 - - - -0.69 -0.08 - - -4.38 -
- 1.81 - - 3.17 3.74 - - - - - - - - - - - - - 0.6 - - - 1.58 - 1.56 - - - - 0.27 - - - - - - - - - - 3.63 - - - - 0.24 -
-1.44 - - - - - - - - - - -2.4 - 2.74 - - - 4.11 - 3.3 - - - - - 0.19 - - - - 1.18 - 2.42 1.79 -0.22 - - -0.73 - - - - - - - - - -
- -0.0 - - - 0.19 0.51 - - - - - - - - - - - - -0.22 - 0.04 - - - - - - - - - 0.7 -0.35 0.56 0.06 - 0.58 -2.52 - - - 1.47 0.56 - 4.96 - - -0.53
-3.79 -4.54 - -0.35 - - 1.12 - 4.0 - 4.02 - -2.17 - - -2.24 - - 2.75 -3.77 - - - -2.17 - -3.45 - -1.21 1.39 - -4.78 - - -2.8 -5.3 -2.33 -2.21 -4.82 -4.62 - - -1.32 -2.24 - -2.23 -0.9 - -
- - - - - - 5.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.25 - - - - - - - - - -0.05 - - - - - - - - -
- -0.24 - 3.06 - - 3.72 - 2.2 - -0.76 - -2.33 -2.73 - - - - - -3.28 - - - -3.4 - - - - 4.3 - -3.85 - - -3.24 - - - - - - - - - - - - - -
- -5.48 2.92 - 3.28 2.37 - 3.89 -3.32 -0.57 - -1.71 - -4.65 0.7 - -3.03 - 1.86 -4.21 - - - -5.24 - - - - 1.76 - - -2.69 -3.23 -2.55 - - - -3.4 - - - - - - - - - -3.02
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
AT5G56330 (ACA8)
0.32 1.83 - - - -0.27 1.63 - - - - - - 0.85 2.08 - - - 1.06 0.21 0.65 - - -4.51 - - - - 3.5 - 3.86 - - - 0.8 - - -0.72 -2.6 - - - - - - - - -
0.25 - 2.47 2.96 - - 1.84 - - - - 0.82 - 0.55 - 2.47 - - -0.14 1.0 - - - -0.21 - - - - - - 0.97 - -0.26 - 0.57 - - -1.52 - - - - - 3.48 - - - 0.67
1.3 -3.3 - 3.92 0.37 - 4.78 - - - -0.1 - - -1.57 - - - - - - - - - -1.9 - - - - - - - - - - - - - -3.99 - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.