Heatmap: Cluster_222 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Ovary
Microspore
Generative cell
Pollen
Sperm cell
Pollen grain
Pollen tube
Pollen tube (1.5h)
Pollen tube (3h)
Pollen tube (9h)
Pistil
Style (before flowering)
Style (after flowering)
Style (pollinated, after flowering)
Flower (buds)
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Pericarp/Exocarp (4 DPA)
Pericarp
Pericarp (5 DPA)
Pericarp (7 DPA)
Pericarp (10 DPA)
Fruit (mature green)
Fruit (breaker stage)
Septum (7 DPA)
Septum (10 DPA)
Septum/Seed (4 DPA)
Seed (5 DPA)
Seed (7 DPA)
Seed (10 DPA)
Seeds (10 DPA)
Seeds (20 DPA)
Seeds (30 DPA)
Seeds (Pk-stem)
Seeds (Br-stem)
Seeds (Pk-equatorial)
Seeds (Pk-stylar)
Seeds (Br-stylar)
Seeds
Seeds (RR)
Seeds (LR)
Seeds (MG-equatorial)
Hypocotyl
Seedling (leaves)
Seedling (roots)
Callus
Meristem (vegetative)
Meristem
Apical meristem
Leaf
Root
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root hair cells
1.99 1.87 0.97 0.19 -4.11 -6.4 -5.15 -6.0 -6.52 -6.39 -6.3 -6.2 -0.19 -1.26 -2.21 -2.14 -0.43 -1.4 1.56 1.79 -0.06 -1.7 0.15 -0.01 -0.1 0.35 -0.37 0.11 -0.16 -0.09 0.21 -0.04 -0.09 0.27 -0.64 -1.93 -1.14 -1.21 -0.97 -1.49 -1.42 -1.44 -1.1 -1.08 -2.1 0.81 -0.26 0.1 0.33 0.9 0.84 0.13 -0.1 -0.87 0.07 1.17 2.03 0.27
1.76 1.84 0.6 0.54 -3.61 -9.27 -4.26 -7.8 -8.61 -8.81 -8.43 -8.62 -0.45 -1.53 -2.97 -2.98 -0.2 -2.16 1.67 2.02 -0.01 -1.11 0.38 0.18 -0.01 0.49 -0.03 0.2 -0.09 0.04 0.43 0.16 0.05 -1.01 -0.46 -1.54 -0.27 -0.7 -0.48 -0.49 -0.86 -0.9 -0.42 -0.22 -1.61 0.12 -0.11 0.16 -0.38 0.51 0.71 0.06 -0.46 -0.53 -0.44 0.89 1.98 -0.02
1.11 1.16 0.64 0.61 -0.45 -5.02 -1.83 -4.42 -5.03 -5.13 -5.09 -5.08 -0.78 -1.53 -2.63 -2.7 -0.75 -1.74 2.0 1.85 0.08 -0.46 0.14 0.08 0.35 0.26 -0.69 0.02 0.64 0.12 0.03 -0.02 0.22 -0.21 -0.43 -1.56 -0.89 -0.96 -1.16 -1.06 -1.35 -1.34 -0.79 -0.55 -1.55 0.66 0.5 -0.38 -0.15 0.81 1.12 -0.0 -0.29 -0.68 -0.34 0.89 1.97 0.85
0.71 0.99 0.77 0.76 -4.67 -6.6 -4.97 -7.17 -6.49 -5.86 -6.0 -5.95 0.05 -0.71 -1.49 -1.45 0.18 -1.28 1.06 1.06 0.26 -0.84 0.4 0.35 0.39 0.55 -0.53 0.38 -0.11 0.28 0.52 0.39 0.21 1.03 -0.1 -1.65 -0.71 -0.47 -0.4 -0.82 -0.87 -0.83 0.13 -0.63 -1.41 0.38 -1.27 0.35 -0.3 1.3 1.36 0.46 -0.38 -1.29 -0.13 0.58 1.77 0.25
1.31 1.65 0.78 0.65 -3.01 -6.66 -3.32 -6.05 -6.25 -6.24 -6.22 -6.27 -0.0 -0.75 -1.88 -2.03 -1.05 -1.56 1.78 1.81 -0.28 -1.11 0.22 -0.21 -0.34 0.56 -0.01 0.07 -0.6 -0.28 0.28 -0.19 -0.37 0.65 -1.96 -3.22 -0.96 -1.2 -1.02 -1.69 -1.61 -1.61 -1.7 -1.89 -2.71 -1.65 0.66 0.03 -0.09 1.4 0.61 0.33 -0.54 1.48 0.08 1.0 2.01 1.0
0.65 0.56 -0.16 2.48 -3.96 -8.99 -4.68 -8.19 -8.57 -7.54 -7.93 -8.12 -0.04 -1.19 -2.42 -2.46 0.32 -2.61 0.64 -0.08 -0.01 -1.28 0.63 0.43 0.14 0.39 -1.93 0.17 -0.1 0.12 0.4 0.39 0.28 0.07 0.46 -1.92 -1.65 -1.79 -1.69 -1.68 -2.51 -2.04 -0.88 -1.22 -2.5 0.42 -2.53 0.6 -0.61 1.11 1.8 0.6 -0.09 -0.67 0.16 0.91 2.86 -0.82
1.89 1.72 1.13 -0.79 -6.71 -7.98 -6.74 -7.71 -8.35 -7.57 -6.84 -6.97 -0.13 -1.33 -2.45 -2.56 0.28 -1.21 1.61 1.53 0.12 -1.6 0.28 -0.02 -0.19 -0.16 -0.76 0.39 -0.07 0.3 0.76 0.32 0.08 0.3 -0.26 -1.4 0.09 0.0 0.29 -0.41 -0.2 -0.37 -0.27 -0.23 -1.22 -0.95 -0.82 -0.17 -0.92 1.83 1.08 -0.03 -0.42 -1.07 -0.73 -0.4 1.33 -0.04
1.79 1.64 0.72 1.08 -2.02 -5.14 -3.97 -5.16 -5.29 -4.54 -4.48 -4.16 0.19 -0.49 -0.65 -0.75 -0.57 -0.45 1.7 1.69 -0.3 -0.51 0.18 -0.01 -0.19 0.15 -0.73 0.13 -0.16 -0.01 0.14 -0.05 -0.21 -1.1 -0.7 -1.28 -0.59 -0.69 -0.74 -0.62 -0.67 -0.64 -1.22 -1.05 -0.36 0.18 -0.02 0.81 -0.28 0.64 1.0 -0.12 -0.26 -0.7 -0.03 0.15 1.6 0.32
1.31 1.43 0.59 0.17 -2.85 -7.58 -3.68 -8.71 -8.75 -7.47 -9.54 -8.23 -0.1 -0.71 -0.97 -1.15 0.29 0.47 1.01 1.39 -0.31 -0.57 0.48 0.15 -0.19 0.0 -0.03 -0.11 -0.7 -0.23 0.74 0.33 0.1 1.07 0.5 -0.56 -0.42 -0.37 -0.29 -0.32 -0.58 -0.42 0.02 -0.23 -0.53 0.48 -0.58 0.17 -0.54 0.99 0.56 0.13 0.15 -0.71 -0.04 0.24 1.18 0.12
1.05 1.08 0.23 0.28 -4.91 -8.66 -5.9 -7.16 -7.01 -8.22 -7.94 -8.14 -0.82 -1.02 -2.07 -2.08 -0.04 -1.5 1.05 1.16 0.19 -0.75 0.27 0.15 0.24 -0.34 -0.76 0.33 0.28 0.19 0.25 0.11 0.06 1.41 0.21 -1.04 0.3 -0.24 -0.21 0.03 -0.63 -0.34 0.71 0.44 -1.34 0.2 -0.84 0.62 -0.16 0.32 0.66 -0.12 -0.32 0.61 -0.19 0.75 1.66 0.72
1.11 1.29 0.64 -0.46 -0.49 -5.91 -1.63 -6.34 -5.53 -4.9 -5.01 -4.66 -0.36 -0.89 -1.57 -1.66 0.05 -0.85 0.99 0.63 -0.1 -0.5 -0.6 -0.45 -0.42 -1.11 -0.87 -0.07 -0.05 0.06 -0.17 -0.11 0.0 1.06 0.79 0.0 0.65 0.3 0.51 0.38 0.47 0.19 0.34 0.31 -0.03 0.87 -1.34 -0.24 -0.65 1.88 1.56 -0.68 -0.22 -1.11 -0.71 -0.87 0.09 0.5
1.09 1.42 0.29 -0.69 -6.18 -10.98 -6.72 -9.54 -10.53 -11.86 -11.29 -11.06 -0.9 -0.77 -2.4 -2.55 -0.78 -1.57 1.7 1.98 0.62 -1.5 0.53 0.44 0.63 0.59 0.29 0.55 0.77 0.52 0.44 0.46 0.55 0.43 -0.27 -1.59 -1.51 -1.84 -1.76 -1.42 -1.98 -1.76 -1.28 -1.09 -2.27 -0.33 0.63 0.26 -0.29 0.71 1.63 -0.12 -0.84 -0.01 -0.2 0.37 1.8 0.42
0.94 1.15 0.49 1.3 -5.92 -7.58 -4.01 -6.14 -5.37 -7.51 -7.86 -6.7 0.61 0.13 -0.93 -0.58 0.54 -1.96 0.52 0.91 0.55 -0.61 0.22 0.15 0.36 0.12 -0.29 0.84 0.31 0.66 0.46 0.43 0.3 0.25 0.3 -1.17 -0.54 -0.87 -0.61 -0.5 -0.92 -0.9 -0.24 -0.31 -1.49 -0.06 -2.31 0.07 -0.57 0.56 1.95 0.32 -0.23 -0.61 0.33 0.06 1.24 -0.54
0.67 1.31 -0.07 1.36 -4.28 -5.29 -4.32 -5.08 -4.78 -3.7 -3.77 -3.77 -0.62 -1.3 -2.05 -1.97 0.21 -1.87 1.03 1.35 0.43 -1.22 0.94 0.81 0.6 0.15 -1.16 0.57 0.19 0.35 0.67 0.61 0.57 -1.96 0.28 -1.38 -0.68 -1.09 -1.11 -0.87 -1.41 -1.14 -0.31 -0.29 -1.25 0.12 -2.65 0.26 -0.22 0.55 1.69 0.02 -0.75 -0.0 -0.18 0.87 2.24 -0.88
1.51 1.53 0.5 0.7 -3.77 -3.6 -3.56 -3.64 -3.46 -2.88 -2.95 -2.86 -0.31 -0.57 -1.31 -1.35 0.26 -0.75 1.46 1.57 0.03 -0.55 0.07 0.02 -0.02 0.73 0.92 0.26 -0.02 0.11 0.34 0.21 0.12 0.31 0.24 -0.97 -0.89 -0.99 -0.92 -0.77 -0.93 -0.87 -0.71 -0.69 -1.17 0.79 0.26 0.05 -0.96 0.77 0.77 0.3 0.18 -0.67 -0.38 0.11 0.89 0.14
0.68 1.19 -0.27 1.36 -2.18 -9.02 -3.08 -8.38 -9.25 -8.7 -8.39 -8.67 -0.44 -0.82 -1.8 -1.81 -0.04 -1.53 0.87 1.18 0.55 -0.9 0.96 0.72 0.68 0.12 -0.16 0.65 0.44 0.55 0.86 0.6 0.61 0.54 -0.2 -1.59 -1.7 -1.85 -1.94 -1.53 -1.96 -1.87 -1.51 -1.37 -1.93 -0.72 -0.23 0.43 0.42 0.35 1.37 0.53 -0.21 -0.12 0.13 1.0 2.03 -0.22
1.74 1.55 0.65 0.2 -4.23 -9.01 -4.62 -8.03 -8.77 -9.13 -9.2 -8.96 -0.37 -1.59 -2.6 -2.57 -0.04 -1.48 1.76 1.86 0.33 -0.69 0.44 0.29 0.26 0.3 0.28 0.39 0.62 0.32 0.57 0.32 0.25 -0.76 -0.27 -1.18 -0.91 -0.95 -0.91 -1.14 -1.06 -1.18 -1.05 -0.98 -1.56 -0.15 0.61 -0.18 -0.1 0.95 0.86 -0.14 -0.29 -0.64 -0.48 0.63 1.67 0.08
0.67 1.02 0.72 0.95 -4.37 -10.66 -4.02 -6.55 -7.35 -8.23 -9.1 -8.13 -0.52 -0.6 -1.49 -1.62 -0.7 -1.37 1.97 1.62 -0.05 -0.62 -0.75 -0.48 -0.24 0.0 -0.99 0.06 0.3 0.22 -0.04 0.13 0.2 1.39 0.5 -0.75 -1.03 -1.35 -0.95 -1.25 -1.2 -1.22 -0.85 -0.9 -1.56 -0.83 -0.57 -0.2 -0.53 0.87 1.15 0.22 -0.35 -0.81 0.15 0.91 2.3 1.42
1.4 1.31 0.48 -1.12 -6.63 -8.05 -8.64 -8.52 -8.65 -7.8 -7.82 -7.76 -1.56 -2.35 -3.93 -3.99 0.47 -1.96 1.79 1.82 0.89 -1.55 0.65 0.59 0.56 -0.87 -1.31 0.98 1.13 0.87 0.89 0.69 0.69 0.18 -0.08 -1.23 -0.27 -0.72 -0.38 -0.68 -1.17 -0.82 0.04 -0.08 -1.74 0.18 -0.21 -0.51 -0.93 1.03 1.24 -0.42 -0.28 -1.49 -1.06 -0.09 1.38 -0.41
0.96 1.17 0.05 0.69 -4.17 -9.98 -4.85 -9.56 -10.2 -10.36 -10.39 -10.74 -0.28 -1.38 -2.35 -2.39 0.17 -1.75 1.16 1.33 0.44 -1.38 0.71 0.61 0.64 0.66 -0.29 0.57 0.58 0.46 0.71 0.51 0.6 0.02 0.36 -0.89 -0.67 -1.11 -0.86 -1.0 -1.4 -1.12 -0.46 -0.51 -1.47 -0.33 -0.84 0.41 -0.04 0.47 1.19 -0.0 -0.44 -0.86 -0.15 0.89 2.18 -0.05
1.07 0.93 0.84 0.57 -5.71 -5.17 -6.61 -4.31 -5.14 -4.7 -4.82 -4.6 -0.52 -0.97 -1.92 -1.92 -0.49 -1.16 0.8 0.47 -0.05 -1.02 0.04 -0.24 -0.23 -0.26 -0.36 -0.01 -0.05 -0.05 -0.04 -0.23 -0.26 1.24 -0.7 -1.49 -0.77 -0.7 -0.61 -1.0 -0.86 -1.06 -0.93 -1.17 -1.55 -0.15 0.22 0.35 0.36 1.4 0.72 0.44 -0.2 1.53 -0.02 1.33 2.41 1.14
0.47 0.64 -0.16 0.42 -6.8 -10.51 -7.42 -8.6 -10.26 -10.86 -11.26 -10.57 -0.89 -1.25 -2.48 -2.56 0.58 -1.57 0.62 0.86 0.73 -1.54 1.04 0.72 0.68 0.24 -0.48 0.78 0.46 0.68 0.99 0.6 0.57 0.79 0.32 -2.07 -1.96 -1.94 -2.06 -2.15 -2.11 -1.99 -1.66 -1.87 -2.55 0.0 -0.52 0.25 -0.53 1.23 1.38 0.72 0.07 0.79 -0.04 0.99 2.31 0.11
0.63 0.79 0.07 1.01 -5.5 -7.39 -5.96 -6.56 -7.42 -7.4 -7.58 -7.63 -0.27 -1.16 -2.0 -2.0 0.25 -1.64 0.73 1.09 0.42 -1.05 0.9 0.58 0.56 -0.9 -0.89 0.63 0.4 0.43 0.85 0.44 0.4 -0.21 -0.28 -1.62 -1.03 -1.3 -1.45 -1.44 -1.45 -1.45 -1.23 -1.15 -1.93 0.66 0.22 0.2 0.2 1.35 1.24 0.53 -0.02 -0.62 0.31 1.23 2.22 0.39
1.21 1.35 0.53 1.21 -5.31 -8.25 -5.98 -6.46 -7.76 -8.4 -8.25 -8.0 -0.09 -0.96 -1.62 -1.63 0.26 -1.04 1.17 1.58 0.31 -1.67 0.63 0.4 0.27 -0.94 -1.21 0.58 -0.03 0.32 0.68 0.35 0.24 0.04 -0.26 -1.78 -2.04 -2.24 -2.12 -2.09 -2.32 -2.17 -2.25 -2.16 -2.2 0.74 0.38 -0.01 -0.11 1.13 1.22 1.0 0.52 -0.76 0.29 0.99 1.98 0.29
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1.11 1.4 1.22 0.44 -2.86 - -4.94 -8.0 -9.12 -9.89 -7.48 -7.96 0.27 -1.0 -3.43 -3.28 0.09 -1.59 1.45 1.54 0.0 -0.96 0.54 0.29 -0.1 -1.12 -1.68 0.36 -0.21 0.21 0.34 0.12 -0.21 -0.6 -0.72 -2.49 -1.95 -1.99 -1.5 -2.19 -2.98 -2.37 -1.83 -2.02 -3.09 -0.93 -0.72 0.38 -0.21 1.8 1.26 0.98 -0.11 -0.26 0.62 1.15 2.62 0.76
1.65 2.03 0.62 1.23 -5.57 -5.82 -6.83 -5.96 -6.2 -6.68 -6.45 -6.18 -0.23 -0.56 -1.83 -2.0 -0.1 -1.84 1.69 2.02 0.22 -1.05 0.34 0.03 0.01 -0.39 -0.49 0.41 0.09 0.3 0.45 0.11 0.03 -0.09 -0.97 -2.82 -1.62 -1.79 -2.25 -2.19 -1.95 -2.0 -2.2 -2.06 -2.29 -3.03 0.58 -0.31 -0.3 1.08 0.78 0.44 -0.65 -0.11 0.11 1.02 2.16 0.38
1.46 1.79 0.5 0.32 -3.98 -6.84 -4.77 -6.03 -6.24 -6.48 -6.48 -6.37 -0.75 -1.26 -2.33 -2.33 -0.39 -1.49 1.61 1.97 -0.23 -1.82 0.01 -0.25 -0.27 0.7 -0.22 -0.11 -0.44 -0.21 0.13 -0.25 -0.23 1.13 -1.16 -2.21 -1.01 -1.25 -0.82 -1.58 -1.4 -1.48 -1.58 -1.56 -2.41 0.61 0.61 -0.18 -0.19 1.23 0.65 0.69 0.04 -0.75 0.21 1.38 2.22 0.26
1.23 1.67 0.62 0.88 -6.22 -10.75 -7.58 -10.42 -11.52 -11.23 -12.21 -11.5 0.19 -1.53 -2.84 -2.97 -0.64 -1.62 1.78 2.13 -0.12 -1.76 0.01 -0.24 -0.25 -0.0 -1.19 0.16 -0.23 -0.1 0.3 -0.03 -0.18 0.68 -0.86 -2.81 -1.32 -1.52 -1.5 -1.54 -1.76 -1.78 -1.5 -1.3 -2.59 -0.84 0.98 -0.25 -0.12 1.52 1.31 0.53 -0.31 -0.76 0.25 0.38 2.5 0.42
1.32 0.97 0.75 0.11 -1.86 -7.94 -3.73 -7.39 -7.26 -6.59 -6.75 -6.82 -0.82 -1.39 -1.76 -1.95 -0.55 -1.91 1.39 1.26 0.42 -1.84 0.33 0.32 0.13 0.66 -0.56 0.63 0.17 0.31 0.32 0.2 0.1 0.22 0.17 -1.88 -1.33 -1.62 -1.33 -1.57 -1.78 -1.44 -0.27 -0.68 -1.75 1.48 -1.15 0.38 -0.4 1.75 1.14 0.27 -0.12 -0.38 0.18 1.13 1.87 -0.16
1.54 1.49 0.48 0.12 -2.29 -9.38 -3.45 -8.4 -8.88 -8.37 -8.53 -8.29 -0.23 -1.78 -2.66 -2.6 -0.11 -1.53 1.58 1.48 0.29 -1.21 0.24 0.17 0.24 0.73 0.05 0.41 0.47 0.29 0.26 0.12 0.21 -0.62 0.12 -0.83 -0.01 -0.45 -0.35 -0.55 -0.77 -0.63 0.04 -0.23 -1.41 -0.93 0.11 0.48 -0.12 0.76 0.93 -0.11 -0.4 -0.12 -0.12 0.68 1.6 0.15
1.13 1.33 0.45 0.69 -4.13 -7.72 -4.92 -7.69 -7.82 -7.15 -7.3 -7.14 -0.3 -1.13 -1.58 -1.77 -0.89 -0.88 1.1 1.17 -0.11 -0.18 -0.04 -0.16 -0.07 -0.64 0.26 -0.06 -0.05 -0.07 0.12 0.02 0.01 1.69 0.5 -0.91 -0.37 -0.34 -0.12 -0.56 -0.49 -0.47 -0.27 -0.22 -0.72 0.19 0.11 0.11 0.0 0.95 0.75 0.13 -0.1 0.63 0.11 0.55 1.6 0.32

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.