Heatmap: Cluster_74 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Ovary
Microspore
Generative cell
Pollen
Sperm cell
Pollen grain
Pollen tube
Pollen tube (1.5h)
Pollen tube (3h)
Pollen tube (9h)
Pistil
Style (before flowering)
Style (after flowering)
Style (pollinated, after flowering)
Flower (buds)
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Pericarp/Exocarp (4 DPA)
Pericarp
Pericarp (5 DPA)
Pericarp (7 DPA)
Pericarp (10 DPA)
Fruit (mature green)
Fruit (breaker stage)
Septum (7 DPA)
Septum (10 DPA)
Septum/Seed (4 DPA)
Seed (5 DPA)
Seed (7 DPA)
Seed (10 DPA)
Seeds (10 DPA)
Seeds (20 DPA)
Seeds (30 DPA)
Seeds (Pk-stem)
Seeds (Br-stem)
Seeds (Pk-equatorial)
Seeds (Pk-stylar)
Seeds (Br-stylar)
Seeds
Seeds (RR)
Seeds (LR)
Seeds (MG-equatorial)
Hypocotyl
Seedling (leaves)
Seedling (roots)
Callus
Meristem (vegetative)
Meristem
Apical meristem
Leaf
Root
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root hair cells
-1.65 -0.08 -2.85 2.06 2.68 - 0.43 -1.02 -2.57 -2.46 -2.15 -1.09 -0.12 -0.72 -2.19 -1.36 -3.73 -2.09 - -1.13 -2.99 -1.23 -5.4 -5.48 - -2.27 -0.15 - -2.43 -6.79 - -4.2 -3.25 4.16 1.3 -1.81 -2.55 0.19 0.96 -0.11 - -1.03 -0.93 - -0.08 1.83 -1.37 -0.23 2.45 -7.33 - - 0.06 - -6.03 - -3.0 -
- - - - - - - 1.53 2.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.56 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 1.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.76 - - - - - - - - - - - - - -2.14 - - - - -
3.57 4.71 - - 4.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.42 - - - - - - - - -
- - - 3.77 4.69 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.0 - - - 3.39 - - - - -
- - - -0.02 -15.34 - -15.35 - - - - - - 0.35 -15.69 -17.32 -15.24 -8.72 -16.89 -23.06 -12.71 - -1.96 -1.27 -13.0 - -19.79 0.78 -14.93 -4.43 3.35 4.26 0.37 - - -11.57 - -16.32 - - - -13.72 - - - -22.88 - - 4.49 - -18.36 - -2.59 - - - -12.78 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.65 - - - - - - - - -
- - - - 2.56 - 1.98 0.92 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - 1.36 - - - - 2.69 4.64 3.0 - 0.14 - - - - - - 0.89 - - - -2.24 - - - - -
2.19 3.27 -0.3 2.68 - - - - - - - - 2.03 - - - - -2.37 2.18 2.42 - - - - - - - - - - - - -2.04 - 2.89 0.32 1.07 1.13 - - - 0.52 - - 2.06 - - - -0.53 - 1.4 - -1.99 - - - - -
- 4.8 - - - - - - - - - - - - - 2.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.48 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.83 - - - 0.2 - - - - -
- - - - 4.4 - - 0.48 - - - - 2.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.74 - - - - - - 4.72 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.9 - - - - 0.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.71 - - - - - - - 1.41 - - - - - - 3.47 - - - 0.82 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
- - - - 3.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.78 - - - - - - 1.55 - - - - - - - - - 2.39 - - - - - - 4.88 - - - 2.2 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 2.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.19 - 5.11 - - - - - - -
- - - 3.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.28 - - - - - - 3.46 - -
- - - 1.6 2.48 - - - - - - - - - - - - - - - 2.62 - - 2.75 1.85 2.97 - - 3.94 2.16 1.32 -0.22 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.83 - - - -3.25 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.91 0.07 - - - 2.25 - - 3.86 4.71 1.14 - - - - - - - - - - - - - - - 2.23 - - - -0.29 - - - - -
- - - - 5.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.79 - - 2.02 - - - - - - - - - - - - - - - 3.67 - 1.95 - -3.36 - - - - -
- - - 1.43 - 1.84 - 2.17 1.14 - 0.98 1.39 2.95 -1.18 - -0.19 - - 1.93 - - 0.84 - - - - -0.46 - - - - - 0.43 4.25 - - - - - - - - - - - 0.58 - - 1.69 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.83 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.89 - - - - - - - - -
- - 2.22 3.71 2.66 - - - - - - - - - - - 2.8 2.81 - 2.04 - - - 0.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.98 - - 2.98 2.24 - - - - -
- - - - - - - 3.08 - 2.49 - - 3.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.01 - - 4.12 - - - -0.92 - - - - -
- - - - 1.66 - - - - - - - - - - - 1.4 -1.02 - - - - 1.29 0.63 - 2.76 2.96 - - - 2.04 -0.01 0.98 - 2.92 - - - - - - - - - - - - 2.11 0.87 2.99 - - -0.13 - 1.28 - 0.05 -
- - - - 4.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.76 - - - -1.04 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.75 - - - 2.04 - - - - -
- - - - 2.77 - - - -0.91 - -0.98 -1.46 - 1.15 - - - - - - - - - -1.13 - - - - - - - -0.72 1.58 - - 3.0 - 1.67 4.78 - - 1.47 - - - - - -0.02 0.02 - - - -4.19 - - - - -
2.39 - 1.12 2.56 - - - - - -0.37 - -0.32 - - - -0.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.12 - - -1.37 - - - - - - 2.74 - - - -0.69 - - - - -
- - - - 3.17 - - - - - - - - - -1.62 - - - - - 0.74 - -2.11 1.07 2.23 1.95 4.06 -0.1 0.44 -0.4 2.24 -0.79 0.6 - 1.67 - - - - - - -2.25 - - - - - - 0.43 - - - -3.0 - 1.04 -0.13 0.82 -
2.58 - - 2.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.86 - - - - - 5.22 - - - - - - - - - 3.05 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 3.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.37 - - - -0.35 - - - - -
- - - 2.63 - - - - - - - - 2.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.32 - - - 2.12 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
1.71 - 2.6 2.53 - - - 0.88 -0.84 - - - - - - - - - - - - - - 0.99 - 1.58 - - 1.74 - - - 0.26 4.32 - - - - - - - -0.68 - - - - - - 3.35 - - - -2.15 - - - - -
1.85 - - 4.37 2.12 - - - - - - - 1.64 - - - - - - - - - 0.94 - - - - - - - - 0.02 - - - - - 3.08 - - - -1.09 - - - - - - 1.47 - - - 0.3 - 2.85 1.64 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.21 - - 4.38 - - - - - - - - -
1.59 1.2 3.05 -3.59 -2.64 - - - - - - - 0.76 -2.33 -2.67 0.39 2.47 1.17 2.02 1.02 -2.36 -0.09 - -1.41 -2.9 -0.95 2.12 -1.45 2.01 -3.17 - -3.04 -0.57 - 0.29 -0.55 -1.7 -2.59 - -2.05 0.39 -0.97 -0.93 -1.57 - -4.47 - -0.38 -2.17 1.63 2.06 - -1.54 -2.17 -1.11 -3.01 - -1.47
- - - - - - - 1.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.12 - - - - 0.93 - - - - - - - - - - - - - - - 0.91 - - - - - - 2.44 - - - - - - - - - - - - - - 1.9 - 3.22 - - - -0.11 - - - - -
- 3.39 1.04 3.78 - - - - - - - - 3.6 - - - - - 2.93 2.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.53 -2.26 1.46 - - - -
- - - - - - - -1.57 - - - - 1.03 - - - 2.47 - - - - - 1.15 1.0 -0.21 - - 2.89 - 3.74 -0.28 2.47 3.33 - - - - - - - - - - - - - - - 2.31 0.48 - - 0.59 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.21 - - - - - - 5.56 - - - 2.65 - - - - -
- - - 3.38 - - 3.16 - - - - - 2.07 - - - 1.73 - - - - - - -0.11 - - - - - - - 1.81 0.68 - - - 3.75 - - - - 0.46 - - - - - - 3.36 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.97 - - - - - - 5.4 - - - - - - - - -
2.92 - - 2.59 - - - - - - - - - - - - 2.92 - - - - 4.09 - - - - - - 2.15 - - 0.86 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.81 - - - -2.24 - 2.59 - 1.93 -
- - - - 3.67 - 3.55 1.56 1.08 2.43 - -0.0 1.14 - - - - - - - - - 1.15 - - - - - - - - 2.09 0.82 - - - - - - - - - - - - - - - 3.54 - - - - - - - - -
- - - - 5.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.68 - - - - -
- - - - - - 3.34 - - - - - - - 1.39 0.81 - - 3.61 - - - - - - - - 1.75 - 2.34 - - - - - - - - - - - -0.6 - - - - 2.14 - 3.96 - - - 1.15 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.71 - - - 2.53 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 3.02 3.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.17 - - - 2.2 - - - - -
- - - - 2.68 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.19 -0.34 - - - 1.15 1.06 - 4.59 3.83 1.98 - - - - - - - - - - - - - - - 0.99 - - - - - - - - -
-0.88 - - - 3.42 - -1.78 -19.73 - - - - 0.0 - -1.81 -2.19 - -1.46 - - - - - - -1.28 - - -1.15 - - - -3.32 - - - - - -0.21 - - - -0.49 - - - 0.04 -0.28 - 5.21 - - - 1.11 - -12.44 - -0.04 -
- 3.0 - 3.64 3.66 - - - - - - - 3.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.36 - - - - - - 3.91 - - - - - - - - -
1.58 - -1.37 4.18 0.36 - 0.64 - -3.24 - - - -1.14 - - - - -1.05 2.07 0.71 - - 1.4 1.93 0.37 - - - - - - -0.5 1.26 - - - - - - - - - - - - 2.74 - - 2.5 - - - -1.4 0.66 0.71 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.69 - - - 1.34 - - - - - - 4.89 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.73 - - - 2.25 - - - - -
-1.65 -0.08 -2.85 2.06 2.68 - 0.43 -1.02 -2.57 -2.46 -2.15 -1.09 -0.12 -0.72 -2.19 -1.36 -3.73 -2.09 - -1.13 -2.99 -1.23 -5.4 -5.48 - -2.27 -0.15 - -2.43 -6.79 - -4.2 -3.25 4.16 1.3 -1.81 -2.55 0.19 0.96 -0.11 - -1.03 -0.93 - -0.08 1.83 -1.37 -0.23 2.45 -7.33 - - 0.06 - -6.03 - -3.0 -
- - 1.75 3.54 2.9 - - -0.82 - - - - 1.06 -0.35 - - - - - - - - - - - - - 1.41 - 2.39 0.71 -0.74 0.13 - - - - - - - - - - - - 0.71 -0.23 1.83 3.48 - - 1.37 0.16 - - - - -
1.19 -0.09 -0.96 3.16 4.62 - 0.7 -3.44 - - - - 0.16 -2.28 - -1.97 0.45 -2.31 - 1.63 -0.76 - -1.2 -2.38 - -0.66 0.32 0.6 - - -0.88 - - - - - - 0.41 - - - - - - 1.4 -1.24 - - 0.6 -0.25 - - -2.7 -0.37 - - - -
- - - - - - - - - - - 0.87 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.6 - - - - - - - - - - 2.87 - - - -1.34 - - - - -
- 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.72 - - 0.37 - - - - - - 1.97 - - - - - - - - -
- - - - - - 3.39 0.06 - - - - 3.33 - - - 2.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.62 - - - 1.97 - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.