Heatmap: Cluster_158 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Egg apparatus cell (small)	Egg apparatus cell (medium)	Egg apparatus cell (large)	Ovary	Uninuclear microspore	Generative cell	Pollen	Sperm	Pollen tube (bicellular)	Pollen tube (tricellular)	Flower (bud, female)	Flower (bud, male)	Flower (female)	Flower (male)	Flower (tepals)	Fruit (female)	Apical meristem	Shoot (female)	Shoot (male)	Leaf (male)	Leaves	Root (male)
AMTR_s00001p00032080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.15)	0.0	0.0	0.0	0.02	0.12	0.0	0.01	0.07	0.51	0.12	0.35	0.48	0.06	0.01	0.01	0.01	1.0	0.05	0.01	0.0	0.0	0.24
AMTR_s00006p00208070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.88)	0.0	0.0	0.23	0.31	0.14	0.03	0.12	0.26	0.51	0.31	0.66	0.83	0.25	0.07	0.09	0.03	1.0	0.11	0.03	0.05	0.01	0.36
AMTR_s00010p00254750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.382)	0.04	0.03	0.06	0.03	0.09	0.29	0.05	0.16	0.53	0.26	0.64	0.83	0.12	0.05	0.12	0.04	1.0	0.1	0.01	0.01	0.0	0.3
AMTR_s00010p00266210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.520)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.16	0.0	0.14	0.1	0.28	0.15	0.26	0.2	0.09	0.03	0.08	0.08	1.0	0.02	0.03	0.02	0.0	0.21
AMTR_s00012p00242760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.222)	0.0	0.0	0.22	0.0	0.24	0.0	0.15	0.06	0.23	0.18	0.59	0.93	0.21	0.09	0.15	0.03	1.0	0.12	0.03	0.05	0.0	0.41
AMTR_s00013p00246030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.210)	0.27	0.02	0.0	0.08	0.07	0.03	0.06	0.16	0.49	0.21	0.69	0.97	0.16	0.08	0.08	0.1	1.0	0.18	0.12	0.11	0.11	0.26
AMTR_s00013p00249940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.222)	0.14	0.0	0.0	0.01	0.04	0.64	0.13	0.08	0.22	0.2	0.45	0.55	0.07	0.04	0.04	0.04	1.0	0.1	0.03	0.03	0.05	0.22
AMTR_s00022p00227480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.298)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.16	0.0	0.73	0.32	0.58	0.77	0.07	0.02	0.05	0.0	1.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.32
AMTR_s00024p00187980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.152)	0.0	0.0	0.05	0.03	0.08	0.0	0.25	0.02	0.24	0.26	0.78	0.68	0.23	0.24	0.17	0.17	1.0	0.53	0.44	0.05	0.15	0.31
AMTR_s00024p00191310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.157)	0.01	0.0	0.0	0.01	0.1	0.0	0.15	0.15	0.13	0.16	0.52	0.63	0.24	0.02	0.03	0.01	1.0	0.04	0.04	0.01	0.0	0.24
AMTR_s00027p00148580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00027.47)	0.01	0.0	0.22	0.02	0.04	0.06	0.16	0.09	0.29	0.21	0.46	0.62	0.1	0.05	0.03	0.08	1.0	0.29	0.19	0.03	0.07	0.19
AMTR_s00029p00190040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.256)	0.03	0.01	0.0	0.0	0.09	0.0	0.01	0.07	0.36	0.1	0.29	0.4	0.07	0.0	0.07	0.0	1.0	0.04	0.01	0.0	0.0	0.27
AMTR_s00033p00213100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.187)	0.07	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.09	0.04	0.54	0.22	0.56	0.46	0.08	0.02	0.02	0.05	1.0	0.07	0.02	0.02	0.02	0.11
AMTR_s00039p00150310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00039.102)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.22	0.16	0.31	0.22	0.41	0.43	0.09	0.03	0.04	0.0	1.0	0.07	0.01	0.02	0.0	0.24
AMTR_s00041p00052230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.23)	0.23	0.0	0.24	0.0	0.24	0.0	0.03	0.11	0.42	0.12	0.7	0.55	0.09	0.04	0.07	0.02	1.0	0.11	0.1	0.06	0.03	0.25
AMTR_s00045p00123820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.121)	0.0	0.0	0.0	0.04	0.29	0.0	0.0	0.18	0.24	0.07	0.47	0.51	0.05	0.0	0.05	0.0	1.0	0.06	0.0	0.0	0.01	0.2
AMTR_s00049p00213820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.245)	0.0	0.0	0.66	0.0	0.12	0.0	0.19	0.14	0.41	0.27	0.52	0.52	0.06	0.03	0.06	0.0	1.0	0.05	0.03	0.01	0.01	0.2
AMTR_s00055p00149080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00055.66)	0.04	0.02	0.02	0.13	0.03	0.02	0.14	0.1	0.59	0.34	0.56	0.51	0.15	0.07	0.11	0.06	1.0	0.13	0.07	0.04	0.06	0.26
AMTR_s00056p00185680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.166)	0.02	0.07	0.16	0.34	0.18	0.11	0.32	0.09	0.32	0.26	0.45	0.64	0.14	0.09	0.05	0.07	1.0	0.16	0.04	0.03	0.01	0.31
AMTR_s00057p00116280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.93)	0.0	0.0	0.04	0.07	0.13	0.0	0.0	0.17	0.5	0.11	0.33	0.38	0.04	0.01	0.03	0.0	1.0	0.09	0.01	0.0	0.0	0.21
AMTR_s00057p00116410 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.94)	0.0	0.0	0.01	0.2	0.1	0.0	0.01	0.09	0.58	0.17	0.39	0.41	0.07	0.01	0.05	0.0	1.0	0.1	0.01	0.0	0.0	0.25
AMTR_s00061p00037320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.15)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.02	0.0	0.39	0.12	0.39	0.49	0.14	0.02	0.04	0.02	1.0	0.08	0.03	0.02	0.05	0.34
AMTR_s00069p00159090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.132)	0.0	0.04	0.0	0.0	0.08	0.0	0.1	0.02	0.38	0.21	0.32	0.35	0.09	0.04	0.07	0.02	1.0	0.07	0.03	0.04	0.04	0.38
AMTR_s00077p00183190	0.09	0.04	0.63	0.0	0.39	0.23	0.07	0.25	0.67	0.26	0.48	0.55	0.21	0.07	0.11	0.07	1.0	0.15	0.11	0.07	0.06	0.34
AMTR_s00092p00077320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.39)	0.4	0.37	0.5	0.03	0.1	0.01	0.03	0.02	0.51	0.21	0.41	0.58	0.06	0.03	0.03	0.02	1.0	0.1	0.03	0.01	0.02	0.19
AMTR_s00093p00057150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00093.9)	0.06	0.05	0.13	0.02	0.21	0.0	0.0	0.32	0.56	0.23	0.51	0.43	0.05	0.0	0.02	0.0	1.0	0.06	0.01	0.0	0.0	0.23
AMTR_s00095p00135200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00095.96)	0.25	0.4	0.41	0.19	0.25	0.04	0.24	0.02	0.35	0.33	0.88	0.73	0.4	0.35	0.41	0.25	1.0	0.34	0.27	0.22	0.17	0.55
AMTR_s00095p00167190 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00095.147)	0.09	0.17	0.24	0.0	0.41	0.0	0.11	0.21	0.35	0.23	0.48	0.56	0.2	0.11	0.12	0.18	1.0	0.14	0.11	0.06	0.08	0.23
AMTR_s00098p00155820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00098.45)	0.18	0.15	0.13	0.01	0.07	0.29	0.16	0.26	0.32	0.24	0.61	0.58	0.11	0.06	0.03	0.02	1.0	0.1	0.03	0.02	0.01	0.27
AMTR_s00106p00146200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00106.118)	0.03	0.0	0.05	0.03	0.09	0.0	0.2	0.02	0.5	0.4	0.88	0.82	0.39	0.13	0.11	0.02	1.0	0.44	0.26	0.04	0.04	0.5
AMTR_s00117p00044080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00117.11)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.1	0.0	0.37	0.31	0.54	0.48	0.31	0.05	0.14	0.02	1.0	0.11	0.06	0.03	0.06	0.53
AMTR_s00144p00066150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00144.32)	0.0	0.12	0.03	0.02	0.16	0.0	0.06	0.21	0.64	0.25	0.5	0.84	0.22	0.07	0.11	0.15	1.0	0.17	0.14	0.18	0.1	0.36
AMTR_s00147p00098270 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00147.56)	0.12	0.0	0.14	0.0	0.05	0.0	0.01	0.0	0.39	0.12	0.41	0.56	0.04	0.0	0.01	0.0	1.0	0.12	0.01	0.0	0.01	0.09
AMTR_s00154p00016840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00154.4)	0.01	0.13	0.08	0.04	0.12	0.0	0.19	0.06	0.28	0.22	0.6	0.33	0.13	0.06	0.03	0.03	1.0	0.07	0.04	0.03	0.02	0.29
AMTR_s00164p00024370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00164.6)	0.14	0.0	0.0	0.05	0.09	0.0	0.2	0.0	0.65	0.41	0.56	0.34	0.08	0.04	0.13	0.03	1.0	0.05	0.01	0.02	0.01	0.38
AMTR_s00164p00024520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00164.7)	0.06	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.06	0.0	0.37	0.17	0.4	0.24	0.02	0.02	0.05	0.01	1.0	0.02	0.01	0.01	0.02	0.19
AMTR_s00169p00060710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00169.37)	0.0	0.0	0.01	0.01	0.04	0.02	0.06	0.26	0.56	0.3	0.58	0.55	0.02	0.02	0.03	0.01	1.0	0.12	0.01	0.01	0.01	0.12
AMTR_s00171p00029360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00171.6)	0.23	0.16	0.29	0.05	0.11	0.41	0.4	0.28	0.29	0.24	0.49	1.0	0.12	0.06	0.08	0.01	1.0	0.11	0.05	0.06	0.01	0.32
AMTR_s00171p00035960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00171.13)	0.0	0.0	0.04	0.02	0.05	0.0	0.0	0.05	0.38	0.1	0.49	0.67	0.07	0.0	0.03	0.02	1.0	0.12	0.03	0.02	0.02	0.24
AMTR_s00182p00053870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00182.33)	0.25	0.0	0.02	0.0	0.06	0.0	0.0	0.2	0.31	0.07	0.47	0.45	0.17	0.01	0.03	0.01	1.0	0.08	0.03	0.02	0.01	0.32
AMTR_s00235p00019150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00235.3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.11	0.01	0.48	0.21	0.71	0.35	0.16	0.06	0.1	0.19	1.0	0.22	0.18	0.1	0.17	0.15
AMTR_s00978p00000980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00978.1)	0.12	0.23	0.02	0.02	0.22	0.11	0.02	0.11	0.34	0.13	0.36	0.53	0.07	0.02	0.07	0.02	1.0	0.04	0.01	0.01	0.0	0.22

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)