Heatmap: Cluster_172 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Ovary
Microspore
Generative cell
Pollen
Sperm cell
Pollen grain
Pollen tube
Pollen tube (1.5h)
Pollen tube (3h)
Pollen tube (9h)
Pistil
Style (before flowering)
Style (after flowering)
Style (pollinated, after flowering)
Flower (buds)
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Pericarp/Exocarp (4 DPA)
Pericarp
Pericarp (5 DPA)
Pericarp (7 DPA)
Pericarp (10 DPA)
Fruit (mature green)
Fruit (breaker stage)
Septum (7 DPA)
Septum (10 DPA)
Septum/Seed (4 DPA)
Seed (5 DPA)
Seed (7 DPA)
Seed (10 DPA)
Seeds (10 DPA)
Seeds (20 DPA)
Seeds (30 DPA)
Seeds (Pk-stem)
Seeds (Br-stem)
Seeds (Pk-equatorial)
Seeds (Pk-stylar)
Seeds (Br-stylar)
Seeds
Seeds (RR)
Seeds (LR)
Seeds (MG-equatorial)
Hypocotyl
Seedling (leaves)
Seedling (roots)
Callus
Meristem (vegetative)
Meristem
Apical meristem
Leaf
Root
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root hair cells
- - - - - - 1.16 -2.18 - - - - 2.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.86 3.82 - - 1.71 - - - - - - 4.87 - - - 0.18 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.85 - - - - - - 5.73 - - - 0.42 - - - - -
- - - 1.79 3.27 - - - - - - - 2.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.03 - - - - - - 5.23 - - - 0.24 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.54 - - - - - - 5.68 - - - 0.08 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.13 - - - - - - 5.29 - - - 0.25 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.75 - - - - - - - - - - 2.11 - - - - -
0.36 1.92 1.35 -2.78 1.33 -5.53 2.03 -1.26 -2.22 -6.16 -7.83 -5.29 0.46 0.85 1.39 1.44 -3.23 -1.73 2.52 -1.38 -1.87 -0.23 -3.17 -2.69 -1.8 0.77 -1.08 -2.41 -1.67 -2.37 -3.6 -2.84 -1.93 2.24 -1.87 -1.6 -0.01 0.78 0.34 0.28 -0.23 0.27 -0.88 0.32 -1.1 -3.71 -1.12 -3.05 2.01 -3.72 -2.43 -3.9 -1.19 -4.77 -2.86 -2.34 -1.99 0.96
- - - 2.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.98 - - - - - - 5.53 - - - 1.16 - - - - -
- - - 0.99 0.32 - 2.0 -0.61 - - - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.36 - - - 1.51 - - - - - - 5.38 - - - 0.57 - - - - -
- - - - 4.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.29 - - - - - - 4.62 - - - -0.01 - - - - -
- - - - 3.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.24 - - 4.69 - 1.73 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.45 3.71 - - - - - - - - - 4.13 2.29 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.89 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.0 3.27 - - 0.63 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.61 - 1.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.36 - - - - - - 2.1 - - - -2.11 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 0.87 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.15 -0.92 - 2.05 - 2.34 - - 4.71 - 1.95 2.43 - 2.48 - - - 1.88 - - - -0.36 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.48 - - - 1.93 - - - - - - 5.0 - - - - - - - - -
- - - - - - 2.74 - - - - - 1.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.33 - - - - - - 5.36 - - - 1.02 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.3 2.06 - 3.88 - 1.49 - - 4.44 - - - 2.23 - - - - - - - - -
-0.86 - - -0.76 0.04 - - - -7.89 - - - -0.56 - - - -0.82 -8.18 - - - - - -4.2 -19.93 - -0.47 - - - - -2.99 -1.97 - - - 2.84 0.25 2.26 3.26 - 2.54 3.19 3.15 - -0.79 - 2.35 - - - - -5.97 -0.27 -1.6 - - -
2.83 - - 2.52 - - - - - - - - - - - - - - 3.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.45 2.21 - 3.9 - 0.36 - - - - - - 1.0 - - - 0.44 - - - - -
-7.98 - -4.36 -3.85 -7.18 - - - - - - - -2.01 -2.52 -3.23 -5.02 -0.53 1.52 - -5.54 0.23 -0.26 -0.8 -0.58 -1.26 -5.63 3.03 -0.37 -3.64 -1.43 -3.21 -2.14 -2.02 -5.38 -6.56 -6.03 2.11 1.75 1.9 3.0 1.65 2.4 1.99 2.06 -3.93 -5.12 -6.1 -5.95 -4.54 -4.58 -6.77 -4.84 1.93 -8.17 - - -5.64 -
- - - 1.4 2.38 - - -1.03 - - - - 1.08 0.45 - -0.52 -7.56 - - - - - 2.01 -0.7 -0.43 - - - - - - - - - - - - 0.16 - - - 2.61 - - - - - - 4.82 - 2.21 - - - - - - -
- - - - - - - 1.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.3 - - - - - - 5.63 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.13 - - - 2.61 - 2.39 - 5.16 - - - - 2.69 - - - - - - - - -
- - - - - - - - -1.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.36 - 3.86 2.28 - - 4.0 - - 2.21 4.07 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 0.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.66 - - - - - - 5.72 - - - -0.11 - - - - -
-8.27 - -5.14 -5.46 -2.13 0.68 -3.24 1.1 1.31 1.23 1.1 1.4 -3.38 -7.61 -9.55 -3.2 -2.74 -0.05 -5.83 -5.38 -4.73 1.87 -3.46 -4.26 -4.73 -5.83 -1.75 -4.91 -4.98 -5.52 -5.4 -5.27 -4.45 -5.66 -5.26 -5.27 1.63 2.33 2.92 2.72 2.19 2.11 1.85 1.73 -4.57 - - -4.0 -3.72 -6.45 -6.18 -6.7 -5.18 -3.68 -7.71 - - -5.44
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.74 - - - - - - 5.48 - - - - - - - - -
- - - 3.86 - - - - - - - - - - - 0.43 - - - - - - - - - - - - - - 1.58 - - - - - - - - 4.56 - 2.67 - - - - - - 3.17 - - - -2.69 - - - - -
- - 0.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.28 - 5.8 - - - - - - - - -2.58 - - - - -
- - 3.45 - - - - - - - - - 4.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.26 - - - - - - 4.59 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 1.43 - 2.63 - - - - - - - - - - - - - - 2.94 - - - - 1.87 - - - - - - - - 1.03 - - - - - - 5.14 - - - -1.43 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.92 - - - - - - 5.66 - - - - - - - - -
- - - 2.65 - - 1.98 - - - - - 3.64 1.69 - 0.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.67 - - - - - - - - -3.26 - 2.44 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.44 - - - - - - 5.18 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.03 - - - - - - 5.36 - - - -0.44 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.83 - - - - - - 4.57 - - - - - - - - -
- - - - - - - 2.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.41 - - - - - - 5.16 - - - 2.07 - - - - -
- 1.96 - - - - - - - - - - 0.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.52 - 5.44 - - - - 2.89 - - - -0.32 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.69 - - - - - - 4.91 - - - 1.1 - - - - -
-3.75 - -3.54 -2.88 -1.16 -5.15 - -2.28 -3.35 - -6.18 - -6.22 2.43 1.78 1.5 -2.07 -6.71 - -3.84 -2.22 - -5.81 -2.18 -4.11 -2.12 -1.45 -1.22 -2.53 -2.05 -3.53 -2.59 -3.97 -0.27 -1.22 0.18 2.76 2.98 1.66 2.36 2.04 2.43 0.68 1.08 0.87 -4.91 -5.92 -0.91 -1.58 -5.28 -4.25 - -2.6 -2.08 -1.85 -2.29 -4.4 -1.73
- 1.16 - - 1.6 - 0.95 - - - - - 1.04 - - - - - - - - - - - - - -3.14 - - - - - - - - - - 1.27 4.61 - - 0.78 - - - - - - 4.25 - - - 0.2 - - - - -
- - - - 3.55 - 1.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.07 - 2.66 - - 2.09 - 4.86 - 1.61 - - - - - - - - - - -2.87 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.62 1.44 - - - - - - 4.86 - - - 0.64 - - - - -
- - - - - - - 0.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.48 - - - - - - 5.64 - - - 0.08 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.81 3.57 - - - 3.76 - - - - - - 2.15 - - - - - - - - -
- - - 3.6 3.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.4 - 5.04 - - 0.8 - - - - - -0.83 - - - - -
- - -9.25 -4.16 -8.9 - -10.24 -7.34 -10.64 -12.79 - - -5.61 -8.71 -3.57 -2.28 -4.64 -7.59 - -11.14 -11.13 -4.2 -9.36 -11.89 -11.83 -5.57 0.92 -9.5 - - -9.78 -11.7 - -7.07 -9.4 -5.9 2.82 2.75 2.69 3.49 2.86 2.35 2.52 2.43 -0.9 -6.57 - - -8.86 -11.93 -10.6 - -5.86 -8.94 - - -4.07 -11.01
- - - - - - - - - - - - 5.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.31 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 0.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.87 - 4.7 - 2.17 - - - - - - 3.45 - - - -1.38 - - - - -
- - 2.62 3.28 - - - -0.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.22 - - - - - - 5.28 - - - -1.29 - - - - -
- - - - 3.73 - 3.29 - - - -3.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.26 - 3.67 - -0.06 3.21 3.25 - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.44 0.47 1.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.64 - - - - - - - - 0.23 - - - - 2.39 - 3.55 - 2.09 - 3.56 2.37 0.66 - - 2.94 - - - -0.63 1.69 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - -1.4 - - - - - - - - - - - - - -1.42 -1.12 - 2.5 - 3.35 1.11 - 4.88 - 2.02 2.4 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 2.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.89 - 5.43 - - - - 2.64 - - - -2.57 - - - - -
- - - - 1.15 - - - - - - - - - - - - - 1.63 - -0.05 - - -1.39 - - - -0.44 - - - 1.22 0.67 - - 1.16 - 1.2 - 3.09 - 1.66 3.15 - - - - - 2.2 - - - -1.32 0.44 2.4 1.21 2.94 -
- - - 4.19 - - 4.0 - - - - - 0.06 2.77 0.5 1.16 - - - - - - - - 0.11 1.71 - - - - - -0.36 1.36 - - - - - - - - -1.39 - - - 0.71 - - 1.21 - - - -1.79 - - - - -
- - 3.47 - - - - - 2.75 1.33 2.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.63 - - - - - - - - 2.52 - - - - - - - - -
- - - - - - - 2.93 1.68 -0.09 -0.06 0.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.36 - 1.3 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.51 - - - - - - - 0.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.26 - 2.23 - 0.91 2.59 4.64 - - - - 3.17 - - - - - - - - -
-9.15 - - -4.34 -6.9 -5.93 -7.73 -5.21 -5.11 -10.91 -10.31 - -9.57 -5.47 -3.28 -0.5 -6.49 0.87 -6.88 - -10.76 3.14 - -12.57 -10.79 - -1.21 - - -9.93 -11.04 -11.75 -10.74 -6.27 -9.04 -5.55 2.92 2.77 -0.74 3.14 3.09 1.56 2.81 1.74 -2.12 - - - -7.96 - - - -8.59 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.71 - 2.54 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.48 - - -0.45 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.35 - - - - - 3.03 - -1.18 - - 3.59 - - - 3.38 - - - -2.42 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.6 - - - 2.8 3.85 4.75 - 1.85 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 1.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.7 - - - 3.35 1.81 - - - - - - - - - 2.1 - - - - - - 4.91 - - - -1.36 - - - - -
- - - 5.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.91 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - -1.2 - -9.09 - - - - - - - - -9.38 -1.87 - -0.47 0.69 - -2.11 -3.42 - - -0.55 -0.83 -3.96 - - -3.5 - - - 2.27 -8.37 2.34 2.45 -11.38 1.37 4.05 4.12 - -3.91 - -1.68 - -19.77 - - -4.23 -0.1 - - - -
- - - 0.99 - - - -2.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.48 -0.59 - - - 2.93 2.86 - 2.6 3.97 3.18 3.11 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.22 - - - - - - 4.38 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.36 - - - - - - 5.69 - - - 0.07 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.91 - - - - - - 5.66 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.37 - - - - - - 5.7 - - - -0.1 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 3.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.7 - - - - - - - - - 1.91 - - - - - - 5.24 - - - - - - - - -
- - - 0.91 0.89 - - - - - - - - - - - - -0.97 - - - - - - 0.24 - - 0.16 -0.8 - - 0.28 0.19 - 1.51 - - 0.78 - 2.39 - 2.65 5.0 - - - - - -0.86 - - - -5.07 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.66 - - - - - - 4.41 - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.