Heatmap: Cluster_113 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Ovary
Microspore
Generative cell
Pollen
Sperm cell
Pollen grain
Pollen tube
Pollen tube (1.5h)
Pollen tube (3h)
Pollen tube (9h)
Pistil
Style (before flowering)
Style (after flowering)
Style (pollinated, after flowering)
Flower (buds)
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Pericarp/Exocarp (4 DPA)
Pericarp
Pericarp (5 DPA)
Pericarp (7 DPA)
Pericarp (10 DPA)
Fruit (mature green)
Fruit (breaker stage)
Septum (7 DPA)
Septum (10 DPA)
Septum/Seed (4 DPA)
Seed (5 DPA)
Seed (7 DPA)
Seed (10 DPA)
Seeds (10 DPA)
Seeds (20 DPA)
Seeds (30 DPA)
Seeds (Pk-stem)
Seeds (Br-stem)
Seeds (Pk-equatorial)
Seeds (Pk-stylar)
Seeds (Br-stylar)
Seeds
Seeds (RR)
Seeds (LR)
Seeds (MG-equatorial)
Hypocotyl
Seedling (leaves)
Seedling (roots)
Callus
Meristem (vegetative)
Meristem
Apical meristem
Leaf
Root
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root hair cells
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 3.47 - - - - - - - - - - - - - - - 3.56 - - - - - - - - - 3.73 - - - - - - 4.3 - - - 1.09 - - - - -
- - - - 5.46 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.7 - - - 0.04 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 5.12 - - 1.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.68 - - - - - - - - - 1.68 - - - - - - 3.43 - - - -0.61 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
- - - 5.0 3.69 - - - - - - - 1.78 - - - - 1.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.93 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
2.6 1.37 0.99 - -0.8 - -0.46 - -2.63 - - - - - - - - -0.78 2.67 1.9 -1.91 1.44 -1.97 -2.16 - - - -1.24 -1.75 - -0.17 -0.2 -0.7 - - - 0.16 1.2 1.2 1.18 2.78 1.85 1.78 1.24 0.04 - - -2.6 0.92 - - - -1.09 -0.21 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.27 3.44 - - - - -0.51 -0.54 -0.64 0.87 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.27 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.15 - 3.28 3.32 - - - - 4.36 - - - -
- - - 3.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.18 2.79 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.39 - - - - - - - - -
- - - 5.18 - - - - - - - - - - - - - 2.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.04 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.64 3.05 - - - - -
- - - 4.41 - - - - - - - - 4.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.71 - - - - - - - - -
- - - 5.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.07 - - - - - - - - -
4.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.94 - - - - - - 4.42 - - - -0.72 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 5.06 - - - - - 1.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.39 - - - - - - - - -
- - - - 4.4 - - - - - - - 2.9 - - 1.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.72 - - - -1.49 - - - - -
- - - 3.15 - - 4.34 - 0.82 - - - - 2.02 2.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.96 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
- - - 5.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.41 - - - - - - - - -
- - - 2.65 - - - - - - - - - - - - - 0.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.67 3.15 - 0.4 - - - - 1.58 - 2.58 - - - 0.84 1.84 - - - -
- - 0.28 2.55 - - - -2.2 -1.77 - - - - - -0.6 - - -0.4 - - - 0.98 0.52 0.68 - - 1.63 0.51 - - - - -0.87 - - - - - - - - 0.78 3.48 3.63 - - - - 2.08 - - 2.29 1.02 - 1.34 - - -
- - 1.3 2.99 - - - 1.15 0.08 - - - 1.83 0.44 - - 2.31 - - - - 4.32 - 0.71 - - 0.85 - - - - - - - - - - - - - - -0.91 - - - - - - 1.65 - - - 1.07 2.4 - - - -
- - - 4.38 - - - - - - - - 3.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.68 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.17 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.62 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 4.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.97 - - - -1.24 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 5.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.89 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.2 4.16 - - 0.26 0.26 - - - 1.88 2.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.62 - - - 0.01 - - - 1.01 0.25 - 3.21 - - - 0.08 - - - - -
- - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.31 4.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.77 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.91 - - - - - - 5.43 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.54 - - - 0.6 - - - - - 2.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.41 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.42 - - - 1.51 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.86 - - - - - - 5.42 - - - -0.31 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.65 - - - - - - - - - - 2.94 - - - - -
- - - 3.37 4.34 - - 0.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.67 - - - -0.42 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 1.1 1.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.71 - - - -0.7 - - - - -
- - - - - - - - - - 2.91 - 4.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.56 - - - - - - - - -
- - - 2.72 4.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.62 - - - - - - 4.11 - - - -0.03 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.34 - - - - - - - - -
- - - - 4.39 - - - - - - - 2.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.13 3.41 2.55 - - - - - - - - - - - - - - - 2.63 - - - - - - - - -
- - - - - - - 0.58 - - - - 2.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.63 - - - -0.36 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.25 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.02 - - - - - - - - -
- - - - - - - - -14.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.41 - - - - - 5.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.5 - - - - - - 5.61 - - - 0.06 - - - - -
- - - 3.03 - - - - - - - - 4.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.23 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.57 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.42 - - - - - - - - -
- - - - 3.76 - 2.19 - - - - - - - - - - - 3.33 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.85 - - - - - - - - - - - - 4.09 - - - -0.34 - - - - 2.29

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.