Heatmap: Cluster_189 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Ovary
Microspore
Generative cell
Pollen
Sperm cell
Pollen grain
Pollen tube
Pollen tube (1.5h)
Pollen tube (3h)
Pollen tube (9h)
Pistil
Style (before flowering)
Style (after flowering)
Style (pollinated, after flowering)
Flower (buds)
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Pericarp/Exocarp (4 DPA)
Pericarp
Pericarp (5 DPA)
Pericarp (7 DPA)
Pericarp (10 DPA)
Fruit (mature green)
Fruit (breaker stage)
Septum (7 DPA)
Septum (10 DPA)
Septum/Seed (4 DPA)
Seed (5 DPA)
Seed (7 DPA)
Seed (10 DPA)
Seeds (10 DPA)
Seeds (20 DPA)
Seeds (30 DPA)
Seeds (Pk-stem)
Seeds (Br-stem)
Seeds (Pk-equatorial)
Seeds (Pk-stylar)
Seeds (Br-stylar)
Seeds
Seeds (RR)
Seeds (LR)
Seeds (MG-equatorial)
Hypocotyl
Seedling (leaves)
Seedling (roots)
Callus
Meristem (vegetative)
Meristem
Apical meristem
Leaf
Root
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root hair cells
- - 0.54 3.38 3.0 0.63 1.06 -1.35 -0.64 -1.68 -0.83 -1.99 -2.33 -2.38 - -4.24 2.74 -0.77 - - -0.49 - -0.4 -0.49 -1.48 -2.57 - 0.94 -0.51 1.14 0.06 2.28 2.13 0.66 - -1.48 - -3.54 1.02 - - -0.0 - - - - - - 0.81 - - - - - - - - -
- - - 2.09 2.3 2.62 2.86 3.15 3.72 1.85 0.91 1.22 - - - - -0.15 -1.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.01 1.85 - - - -2.29 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.13 - - - 4.53 - - - - - - - - -
- - - 3.14 - - - - - - - - 4.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.42 3.29 1.28 - - - - - - - - -0.14 - - - - - - 2.41 - - - 0.5 2.17 - 2.4 - -
- - - - 3.45 - - - - - - - - - 2.0 - - - - - - - - 1.01 - - - - - - 1.99 - - - - - - - - - - 0.06 - - - 4.95 - - 1.76 - - - 0.8 - - - - -
- - - 4.68 2.1 - 1.87 -2.28 -3.46 - -3.2 -2.46 - 3.88 - - 1.34 - - - - - - - - - - - - - - - -2.13 - - - - - - -0.53 - -4.53 - - - - - - 2.44 - - - -2.38 - - - - -
- - - 3.1 - - - 0.42 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.12 - - - - 3.65 - - - -0.23 - - - - -
- - - 4.62 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.65 - - - 2.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.59 - - - 0.15 - - - - -
-0.35 - - 2.35 - - - - -1.88 - - - -0.11 1.36 - 3.32 - - - - -1.13 - - -0.4 1.18 1.09 - - 2.4 1.93 - 0.14 1.85 - 1.07 - - - - - - - - - - - - 2.37 - - - - 0.4 2.11 0.53 - - 2.22
- - - 2.75 - - - - - - - - 3.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.29 4.41 - - - - - - - - - - - - - - - 3.99 - - - - - - - - -
1.03 - - - - - - -2.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.78 - 1.28 -0.07 - - 3.48 - - 2.63 - - - - -1.51 - - 3.62 3.39 - - 0.92 1.56 - - 1.85 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.71 - - - 2.5 - - - - -
2.35 - - - - - - - - -0.44 - - - - - - - - - - - 4.35 - - - 3.38 3.96 - - - - - 2.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.14 - - -0.24 - - 1.96 - - - - - - 0.29 0.13 - - -0.02 - - -0.83 3.41 - 0.17 -0.39 3.01 1.4 - 1.93 1.37 - -0.51 2.1 - 2.61 0.76 - - - - - -0.07 - - - - - - 1.58 - - - 0.06 -0.08 - - - -
- - - - - - - - - - - - - 1.07 - - - - - - - - - 0.11 - - - - 2.21 2.4 3.05 3.55 2.58 - 4.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.11 - - 0.6 0.83 - - 1.31 - 2.3 - 3.14 2.72 4.49 - - - - - - - 0.56 - - - - - - 2.52 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - -0.51 - - - -0.03 0.78 - - 0.87 - -0.53 -1.49 0.88 - - 2.16 -0.71 1.93 4.05 2.9 2.91 2.6 0.67 - - - - 0.54 - - - - - - - - -1.42 - - - - - - - - -
- - -4.29 -0.32 -0.97 - 2.05 - - - - - -1.62 -0.95 -0.38 -0.03 -3.47 -2.31 - -3.25 -1.68 1.11 - -4.19 -3.61 - -4.38 -1.61 -1.22 -2.31 - -3.25 -2.63 3.64 2.57 1.83 2.04 0.68 - 1.49 0.52 1.35 1.92 -0.44 -1.64 -0.47 -3.68 - -2.57 -0.65 1.96 - -1.44 -1.25 - - - -
-2.61 -3.15 -1.55 -1.55 - - -1.76 -6.21 -5.91 - - - -1.39 -2.82 -2.68 -1.25 3.09 0.92 0.05 -3.28 -3.1 3.04 -2.7 -2.45 -3.81 -2.66 -2.33 -1.59 -0.75 -3.39 - -3.34 -2.64 1.42 -2.94 -3.32 1.18 0.32 -0.56 0.38 - -0.88 0.93 1.29 -1.51 1.13 -2.64 -1.11 -2.94 -5.17 0.13 -0.54 0.13 -1.18 2.24 2.09 0.73 1.66
- - - 3.31 - - 3.7 2.28 - - - - 4.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.61 2.57 3.32 - 2.46 1.88 -0.25 -0.44 - - - - - - - - - - - - - - 1.74 - - - - - -0.21 1.25 - - - - - - - - 0.19 - - 3.5 - - - 0.91 - - - -0.8 - - - 1.9 -
- - - 3.82 4.72 - - - - - - - 2.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.63 - - - -1.17 - - - - -
0.68 -0.03 -1.29 3.63 - - - -1.07 -1.35 - - - -0.43 -1.41 -1.57 -2.3 3.03 1.64 - - -2.33 - -2.4 -2.91 -0.98 - -2.39 -1.61 -2.1 - 1.46 -0.01 -1.17 1.68 - - - - - - - -4.31 - - - -2.05 -1.01 - 0.26 -1.24 3.79 0.03 -1.01 0.87 - - - -
- - -1.0 -0.16 0.81 2.16 1.4 2.52 2.31 0.68 0.65 0.97 -2.87 0.38 -2.12 0.03 3.01 -0.7 - -1.8 1.25 - 0.55 0.07 -0.12 -3.65 -4.18 0.65 -0.22 0.81 -0.73 -1.18 -1.49 -1.31 -3.05 - - - - - - -7.77 - - - 0.87 -1.75 -1.91 -2.69 -5.72 -4.7 1.53 1.31 -4.9 -2.41 - - -
- - 0.07 - - - - - - - - - - 2.81 3.05 3.9 2.65 -0.44 - - 0.62 - 1.59 2.28 2.78 - - - - - 0.62 -0.99 0.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 1.09 - - 0.51 - - - - - 3.05 1.58 - 0.26 - - - - - 0.91 -0.44 2.21 - 4.78 - - - - - - 0.65 - - - - - - 2.49 - - - - - - - - -
- - - 1.66 - - - - - - - - -0.41 - - - 0.24 1.29 - - 0.77 - -0.75 0.29 0.6 1.81 - 1.9 2.19 0.77 3.96 2.32 1.83 - - 1.57 - - - - - -0.98 - - - - - - 0.23 - - - -1.43 - 0.13 0.74 - -
- 4.38 - - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - -0.4 0.71 - - - -6.01 - 0.9 1.09 4.79 0.6 -0.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -9.21 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.86 0.02 0.38 -0.15 2.1 3.36 2.05 -0.8 -0.79 -0.19 0.52 -1.48 -2.62 -1.24 1.79 0.81 - - 0.36 - -1.47 -2.05 -0.97 - - -1.92 0.35 0.99 - -0.66 -0.0 - - - - - - -0.05 - -3.83 0.46 - - - - 0.28 2.52 - - -1.46 -4.5 -1.53 -0.73 -0.11 2.73 -
- - 3.31 - - 3.59 - 1.86 1.67 0.39 -0.38 -0.08 - - - 0.13 - 0.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.89 1.83 - 0.34 - - - - - 0.55 - 3.33
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.57 - - - - - - - - - - - - - - - - 5.53 - - - - - - - - -
-1.58 -2.9 0.47 -1.46 -0.81 - -2.64 -4.47 -7.47 -4.3 -5.33 -5.65 0.48 1.96 1.87 1.34 1.84 1.56 0.36 -0.95 1.29 -1.99 0.68 0.51 0.98 0.26 -2.93 1.28 0.17 1.27 0.13 0.01 -0.42 -2.12 -1.99 - -3.02 -4.26 - - -1.92 -4.43 - - -2.08 1.51 -3.4 1.28 -1.94 -1.32 0.28 0.01 0.22 1.79 -3.28 - - 1.62
- - - - - - - - - - - - 5.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.05 - - - - -
-0.03 - - 4.71 - - - - - - - - 3.41 - - - -0.64 -1.34 - - - - - -1.93 - -0.34 1.25 -0.16 - - - - - - - 0.58 - - - - - 0.47 3.26 - - - - - -0.18 - - - -1.68 - 0.35 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
- - - 4.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.19 - - - -0.44 - - - - -
0.79 - -2.65 1.41 1.31 - - - - - - - - -0.93 - - 4.65 - - - 2.19 - - -3.9 - 0.48 - 0.96 - 1.75 0.39 2.83 2.45 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.44 - - - - -
-2.07 0.29 -2.77 3.68 2.18 -2.08 2.73 3.02 2.08 - - -3.44 0.84 -0.05 -0.98 0.53 -1.3 - - - -2.56 - -0.47 -2.21 -2.34 - - -1.03 - -0.39 3.11 0.13 -3.88 - - - - - - - - - - - - -3.06 - -1.64 0.11 - -2.06 -1.21 -3.7 - - - - -
- - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -2.19 2.89 0.71 - 2.13 -0.63 -0.47 -2.05 -1.3 -1.93 1.19 2.87 2.22 3.22 1.71 -1.17 - - 0.66 - -1.8 -2.11 -3.13 -1.79 -1.58 -1.44 - -0.45 -1.1 -0.1 -0.05 - -0.26 - - -0.99 1.13 - - -1.42 0.12 - - -1.74 -3.15 - 0.97 -1.57 -2.02 - -0.75 - - - - -
-1.86 -1.9 - - - - - - - - - - -2.82 -0.4 0.21 -0.73 - - - - -2.87 - -2.22 -2.93 -2.5 - - - -2.97 - -1.67 -0.26 0.92 - 2.27 -0.17 1.34 1.03 1.71 2.05 0.7 0.71 2.65 3.19 -0.23 3.59 - - -1.45 - - - -0.01 - - -1.36 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.65 - - - 2.96 - - - - -
0.75 -0.37 -0.79 0.59 - - - - - - - - -1.36 -5.54 - - -3.87 -1.59 - - 2.53 - 0.21 1.83 -0.04 - -4.08 2.67 1.79 2.63 0.31 0.82 -0.38 - - - - - - - - - - - - -2.64 - 2.85 -2.49 - - - -3.68 -0.08 3.5 -1.49 -4.45 -0.01
- - - 1.15 1.17 - - -2.21 -2.34 - - - - - - -0.54 - - - - 1.05 - - 0.35 -1.26 - - -0.39 - - - -0.24 -0.21 - - - 2.08 - 3.17 1.52 - 0.86 3.31 - - - 0.69 - 2.0 -0.24 - - 0.33 - - 1.81 2.84 -
- - - 1.34 3.93 - 2.6 -0.99 - - -0.5 - - - - - 2.95 -0.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.39 - 3.44 - - - 1.64 - - - - - - - - -
1.34 0.8 1.92 - -1.05 - - -2.72 -2.43 - - -4.56 -1.77 - -2.56 - - -2.53 - 0.21 -1.73 - - - -1.8 -2.07 - -2.64 - - - - -3.71 0.76 -0.43 -0.83 3.21 2.26 0.96 0.44 0.95 1.48 2.3 1.99 1.8 - - 1.39 0.42 0.78 - - 0.1 0.51 - - -0.69 -
3.22 - - 2.05 - - - - - - - - 2.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.46 - 4.83 - - - - - - - 0.11 - - - 2.44 - - 1.27 - - - -0.21 - - - - -
- - 2.21 4.52 4.44 - - -0.47 0.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.77 - - - - - - - - -
- - - 1.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.67 2.81 3.86 2.64 - - - - - - - - - - - - - - - 3.89 - - - - - - - - -
- - - - 4.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.09 - 0.73 - - - - - - 0.3 - - - - - - - 3.79 - - - - - - 0.97 - 3.99 - - - 0.29 - - - - -
- - -3.6 -0.2 - - - - -5.09 - - - -3.69 - - - - - - -1.45 3.78 - 1.7 2.39 2.02 - - 3.28 -2.08 1.21 - 0.46 1.03 - - - - - - - - - - - - - - - -3.55 - -2.93 - - 0.17 - 1.04 3.21 1.05

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.