Heatmap: Cluster_82 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Ovary
Microspore
Generative cell
Pollen
Sperm cell
Pollen grain
Pollen tube
Pollen tube (1.5h)
Pollen tube (3h)
Pollen tube (9h)
Pistil
Style (before flowering)
Style (after flowering)
Style (pollinated, after flowering)
Flower (buds)
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Pericarp/Exocarp (4 DPA)
Pericarp
Pericarp (5 DPA)
Pericarp (7 DPA)
Pericarp (10 DPA)
Fruit (mature green)
Fruit (breaker stage)
Septum (7 DPA)
Septum (10 DPA)
Septum/Seed (4 DPA)
Seed (5 DPA)
Seed (7 DPA)
Seed (10 DPA)
Seeds (10 DPA)
Seeds (20 DPA)
Seeds (30 DPA)
Seeds (Pk-stem)
Seeds (Br-stem)
Seeds (Pk-equatorial)
Seeds (Pk-stylar)
Seeds (Br-stylar)
Seeds
Seeds (RR)
Seeds (LR)
Seeds (MG-equatorial)
Hypocotyl
Seedling (leaves)
Seedling (roots)
Callus
Meristem (vegetative)
Meristem
Apical meristem
Leaf
Root
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root hair cells
- - - 3.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.41 - - - 0.12 - - - - -
- - - 2.75 3.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.75 - - - 4.87
- - - - 4.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.76 - - - -1.04 - - - - -
- - - 3.95 1.27 - - - - -1.81 - -3.21 -0.21 - -0.16 -1.18 - - - - - - -0.12 -1.38 - - - -0.24 - - - - 0.04 4.16 2.41 - - - - 1.71 - 0.34 - - - - - - 1.92 0.65 0.21 - -2.65 - - - - -
-5.18 -3.75 -2.08 -3.98 - - -5.33 - - - - - -1.92 -0.56 -2.88 -3.53 4.05 0.58 -4.37 -0.64 1.31 -3.09 -0.35 0.5 -0.4 0.79 -1.32 1.73 2.97 2.09 0.83 0.68 0.3 0.07 0.98 0.4 -4.61 -5.51 -3.54 -4.42 -2.96 -1.49 -3.86 -3.5 -0.17 0.83 -3.54 0.21 -6.29 -6.65 -5.38 -4.2 -1.74 -1.65 -5.87 -5.31 - -5.1
- - - - - - - - - - - - 2.8 - 2.63 - - 4.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.78 - - - 4.33 - - - - - - 2.18 - - - - -
- - - 5.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.02 1.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.35 3.72 - - - -
1.7 - 1.98 2.25 - - - 2.09 1.17 - - -0.31 - - - -0.14 4.79 2.53 - - - - - - - - - - - - - - 0.42 - - - - - - - - - - - - - - - 1.55 - - - -3.59 - - - - -
- - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.16 - - 1.28 - - - - - - - - - - -0.46 - - - - - - - - - - - - - - - 5.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.02 - - - - -
-3.38 -5.64 -3.63 3.74 2.96 0.3 3.67 1.11 0.63 0.47 0.93 0.56 -1.75 -1.79 -4.38 -1.77 2.69 2.2 -5.77 -6.59 -4.66 - - -4.92 -6.15 -5.54 -7.04 -4.95 -5.41 -4.96 -6.41 -4.69 -3.87 -4.61 -3.47 -6.27 -6.45 -6.44 -5.41 -6.79 -4.41 -5.83 -4.74 -3.37 -6.57 -3.82 -9.7 -3.09 -3.78 -7.09 -6.12 -6.8 -5.44 -4.48 -3.01 -4.38 -5.52 -0.15
1.42 - 2.18 3.85 3.95 - 1.37 - -1.32 -0.93 -0.72 0.17 - - - - - -0.63 - - - - - - - 1.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.17 - - 1.87 - - - - 1.04 - - 1.35 -
3.2 - - - - - - - - - - - 4.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.05 - 2.66 3.88 -2.09 - - - - -
-4.1 -5.36 -3.8 -0.37 -0.97 - -0.79 -6.81 -9.38 - - -9.08 -2.04 -2.52 -4.62 -4.46 2.71 -5.79 - -6.84 -4.34 - -7.39 -5.6 -4.61 -0.07 -3.76 -4.21 -4.17 -5.2 -4.87 -4.55 -3.59 -3.66 -2.81 0.61 2.52 2.34 1.86 2.48 2.24 2.35 2.26 1.92 2.57 -7.97 -3.58 -1.66 -2.52 - -6.4 -5.81 -3.52 -4.62 -2.12 -3.79 -1.52 -5.6
- - - 5.11 - - - - 1.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.69 - - - - - -0.9 - - - - - - 2.24 - - - - 3.23 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - 3.87 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.44 - - - - - - - - -
- - - - - - 4.0 - - - - - 1.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.56 4.65 - - 2.79 - - 1.9 - - - - - - - - -
- - - - 3.97 - 3.4 - 0.35 - - - 2.49 - - - - 2.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.3 - - - - - - - - -
-2.09 -4.17 -0.16 5.3 -2.6 - -4.16 -7.46 -7.8 -6.69 -7.46 -8.55 -0.36 0.69 1.83 2.1 2.1 0.54 -3.87 -6.87 - - -4.42 -6.04 -8.48 -6.06 - -5.13 - -6.8 -3.61 -5.11 -6.28 - - - - - - -5.42 - -8.35 - - - -4.65 -6.33 -3.98 -3.13 -2.63 -2.23 - -6.5 -4.19 -4.69 - -5.15 -
- - - 4.41 - - - - - - - - 0.91 - - - - - - - 2.53 - 1.34 0.08 - 1.89 - - - - - - - - - - - - - - - 0.45 - - - - - 2.63 2.72 - 1.67 - -2.75 2.09 - - - -
- 2.73 - 2.27 3.26 - - - - - - - 3.96 0.7 - - - - - - - - - 0.24 - - - - 2.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.57 - 3.49 - -2.47 - - - - -
2.41 - - - - - - - -1.11 - - - 2.02 - - - - - - - - 2.02 - - - - 1.02 - - - - - 1.64 - - - - - - - - - - - - - - 2.38 3.35 4.55 - - -3.47 - - - - -
- - - - - - - - - 3.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.64 - - - - -
- - - 4.49 - - - - - - - 0.27 1.44 - - - - -0.5 - - - - - - -0.07 - - - - - 0.93 - - - - - - 2.05 - - 4.16 -0.94 - - - - - - 2.41 - - - -3.63 - - - - -
-1.86 -1.67 -0.4 4.36 3.57 - -0.39 -7.87 - - -4.54 -5.89 -2.03 -5.13 -5.35 -5.31 0.62 -0.17 0.02 0.54 -1.79 0.54 -2.01 -1.3 -0.94 -0.12 1.26 -2.43 -0.72 -2.81 -1.91 -2.12 -1.24 -1.07 -1.67 -2.75 -1.97 -2.29 - -1.85 - -3.09 -2.88 - -1.93 -1.47 -2.12 0.66 -0.48 -1.21 0.11 -3.83 0.37 0.93 -4.36 -3.45 - -4.43
-5.54 - -6.8 -0.44 -6.0 - - - - - - -8.57 -4.6 0.63 -4.68 -3.51 5.79 -7.49 -5.14 - -7.38 - -7.33 -8.65 - -4.55 -5.06 -5.56 - - -6.29 -7.27 - - - - - - - - - -7.05 - - -5.07 -5.96 -8.27 - -4.48 -5.56 - - -5.57 - - - - -6.47
- - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.17 3.0 - - - - - -0.09 - - - -0.23 - - - 0.26 2.99 1.56 2.01 3.03 - - 0.26 - 0.57 - - - - 0.75 - 0.58 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.42 - - 0.56 0.37 3.08 - 0.95 - -
- - - 1.48 2.4 - 2.67 - - - - - 1.9 - - - - - - - 1.35 - 1.05 0.05 1.63 - - - 2.63 - 2.74 1.32 1.83 - - - - - - - - -0.46 - - - - - - 3.52 - - - - - - - - -
- - 2.47 - - - - - - - - - - - - - 5.04 - - - - - 2.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.79 - - - - -
1.77 - - 1.35 - - - -1.59 - - - - 2.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.98 -0.39 - - - - - - 4.41 - - 0.33 - - - - - 2.27 3.65 - - - 0.73 - - - - -
- - - 3.02 - - - 1.53 0.51 2.51 0.27 2.68 - - - - 2.96 3.49 - - - - - - - - - - - - 1.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.29 - - - -0.04 - - - - -
- - - 5.5 - - - - - - - - -4.73 -1.88 - - 3.54 -0.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 3.84 3.21 - - - - - - - - 0.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.05 - - - - - - 3.8 4.18 - - - - - - - -
- - - 4.64 -0.23 - -1.96 2.86 0.88 -4.5 - - -0.11 0.33 -0.82 0.92 2.49 -0.81 - - - - -3.1 -3.23 - - - -2.9 - - 1.29 0.88 -3.47 - -1.11 - - -1.14 - - - -1.84 - - - -3.42 -4.37 -2.35 2.33 - - -3.14 -1.7 -2.89 - -2.43 - -
- - - 5.09 1.62 - - - - - - - - 1.36 - -0.41 0.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.53 1.51 - - - - - - - - - - 2.88 - - - -3.17 - - - - -
- - - 5.31 -5.6 - - -1.03 -5.78 - - - 1.32 -3.72 -4.99 -4.47 -2.47 -6.69 - - - -3.58 -8.0 - - - -8.95 - - -5.14 -0.64 -8.28 - - -1.16 - - - - - - -0.61 - - - - - - 3.65 - - - -1.35 - - - - -
- - - 4.64 1.33 - - - - - - - -0.17 3.08 2.52 2.51 0.76 -1.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.36 - - - - -2.1 - - - - - - 1.2 - - - - - - - - -
- - - 0.54 - - - - - - - - - - - - - -1.04 - - 1.29 - 2.51 1.18 1.48 0.69 -0.03 2.1 0.79 3.19 2.92 2.57 2.62 - - - - - - 2.14 - -2.21 - - - - - - -0.24 - - - -4.45 - - - - -
- - - 5.35 - - - - - - - - - 1.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.86 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.87 - - - - - - - - - - - - - 2.27 2.78 - - - - - - - - - - - - - - - 4.69 - - - 2.55 - - - - -
- - - 2.71 0.04 - - - - - - - - - - - - - - - -0.46 - - -2.56 0.59 - - 1.97 0.02 1.05 3.59 3.58 2.93 1.93 0.74 - - - - - - -1.52 - - - - - - 1.83 - - - -4.81 - - - - -
- - - 1.8 - - - -1.2 - - - - - - - - - - - - - - - 0.26 - - - - - - - - 2.23 - - - - - - - - - - - - 3.75 - - 4.89 - - - 0.71 1.8 - - - -
- - -0.17 4.69 1.36 - - - -2.91 - - - 1.01 -0.79 - 0.54 1.16 1.4 - - 1.63 - - -1.68 - 0.28 - - 1.27 1.6 - -0.56 - - - - - - - - - -2.59 - - - - - 1.31 2.17 - - -0.48 0.12 - - - - -
- - - - 3.14 - - - - - - - 2.54 1.18 - 3.16 - - - - - - - - - - - - 0.2 - - - - - - 3.03 - - - - - - 3.01 - - - - - 1.38 - - - 0.2 - 1.55 3.01 - -
- - -1.6 4.09 1.73 -2.28 2.4 0.62 -0.1 0.56 0.86 0.83 -3.72 0.16 -3.17 -2.23 4.36 1.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -7.46 -2.6 - - - - - -3.18 - - - -4.85 - - - - -
- - - 5.4 - - - - - - - - - - - - 0.84 - - - - - - - - - - - - - - -0.19 - 3.5 - - - - - - - - - - - - - - 0.94 - - - - - - - - -
- - -0.68 -2.26 -1.83 - -3.38 - - - - - -0.51 3.14 1.84 2.28 4.58 -2.92 - - -0.81 - 0.23 3.21 -0.95 - - -0.42 - -1.92 -3.14 -1.18 -1.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.75 - -0.42 -4.56 - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.29 - - - 4.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.04 - - - - - - - - 2.43 - - - - - - - - - - -24.05 - - - - - - - 1.32 - - - - - - - - - - - - - - - 2.99 4.63 3.71 - - -2.88 - - - - -
- - - 1.52 - - 1.13 -2.62 - - - - - - - - - 1.16 - - - - - -1.4 -1.3 0.85 - - - - 0.3 - 1.43 - - - 2.31 2.81 2.77 2.8 - 1.4 - 2.8 - - - 1.7 1.89 - - - -0.65 0.1 - - - -
3.65 1.0 - 4.1 - - - - - -3.43 - - 2.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 1.92 - 4.88 - - - - -0.86 - - - - - - - 1.37 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.32 - - - - - - - -1.57 - - - - - - 3.42 - - - -0.47 - - - - -
- - - 4.14 - - - 1.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.37 - - - 2.05 - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.