Heatmap: Cluster_48 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Ovary
Microspore
Generative cell
Pollen
Sperm cell
Pollen grain
Pollen tube
Pollen tube (1.5h)
Pollen tube (3h)
Pollen tube (9h)
Pistil
Style (before flowering)
Style (after flowering)
Style (pollinated, after flowering)
Flower (buds)
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Pericarp/Exocarp (4 DPA)
Pericarp
Pericarp (5 DPA)
Pericarp (7 DPA)
Pericarp (10 DPA)
Fruit (mature green)
Fruit (breaker stage)
Septum (7 DPA)
Septum (10 DPA)
Septum/Seed (4 DPA)
Seed (5 DPA)
Seed (7 DPA)
Seed (10 DPA)
Seeds (10 DPA)
Seeds (20 DPA)
Seeds (30 DPA)
Seeds (Pk-stem)
Seeds (Br-stem)
Seeds (Pk-equatorial)
Seeds (Pk-stylar)
Seeds (Br-stylar)
Seeds
Seeds (RR)
Seeds (LR)
Seeds (MG-equatorial)
Hypocotyl
Seedling (leaves)
Seedling (roots)
Callus
Meristem (vegetative)
Meristem
Apical meristem
Leaf
Root
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root hair cells
- - - 0.51 - - - - - - - - - - - - 1.23 - - - 1.06 - - 2.59 0.72 0.75 - - - - 2.56 1.51 1.2 3.54 - - - 1.51 - 3.56 - 1.5 - - - - - - - - - - -0.31 - - 0.88 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.98 - - - - - - - - - 3.29 - - - - - - 5.28 - - - 0.57 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.68 4.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.25 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 2.92 - 2.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.4 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.57 - - - -17.11 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.32 - - - - - - - - - - - - - - - 1.3 - - - - - - 3.96 - - - - - - - - -
- - - - 4.36 - - - -1.54 - - - - 2.71 1.74 1.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.66 - - - 4.06 - - - -1.41 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.05 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.89 - - - - -0.81 - - - 0.98 3.45 4.33 2.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.8 - - - - - - - - -
3.33 - - 2.89 - - 3.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.85 - - - - 0.96 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.85 - 0.9 1.22 - - - - 2.31 - - 4.42 1.39 - - - - - - 4.12 - - - -1.9 - - - - -
- - - - 2.27 - - -1.73 - - - - - 2.89 - 1.49 2.19 - - - 0.46 - - - -0.17 - - - 2.9 - 1.22 2.42 1.08 - 3.47 - - 0.71 - - - -1.32 - - - - - - 2.45 - - - - - - - - -
-2.62 - -2.77 0.48 2.42 -0.71 4.19 1.0 -0.31 -0.19 -0.57 -0.41 -1.83 -3.34 - - -2.34 -0.25 - - -1.94 - - -3.02 -1.87 - - -3.86 -0.33 -0.79 -1.83 0.31 2.34 1.54 0.81 - 0.68 -2.37 -0.26 -1.91 0.74 -2.44 - - - -0.32 - -0.67 -0.47 -1.6 -3.41 -3.23 -1.34 -1.98 -1.6 -0.59 1.67 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.46 - - - 0.36 - - - - -
1.99 1.1 2.07 3.48 - - - - - - - - 1.6 -0.94 - - - -0.63 2.17 - - - - - 1.83 - - - 0.72 - 0.27 -0.0 - - - 1.7 2.65 - - - - - - - 2.73 - - - 2.0 - - - -2.17 - - - - -
- - - 5.4 - - - - - - - - - - - - - 2.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.1 - - - - - - 2.88 - - - - - - - - -
- - - 4.22 - - - - - - - - 4.15 - - - - - - - - - - - - - 2.69 - - - - 1.85 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.48 - - - -1.56 - - - - -
- - - 5.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.54 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.55 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.27 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.18 - - - - - 5.05 - - - - - - - - - - - - 2.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.63 - - - - - - - - - 0.94 0.82 - - -0.45 - - 1.01 0.69 - 0.47 - - - 2.31 2.46 - - 0.32 0.37 - -9.77 - 2.56 - - - - 0.23 - - - - - 1.74 2.28 1.98 - - -3.2 - 3.41 1.34 - -
- -5.04 -2.21 -1.55 -0.6 -2.1 -1.07 -1.02 -1.49 -0.94 -1.23 -0.82 - 4.13 3.07 2.81 3.28 -0.13 -2.67 -5.14 -2.98 -1.4 - -4.02 -2.91 -4.42 -3.23 -2.67 -1.76 -2.22 -4.26 -2.49 -0.9 -2.65 0.15 -1.29 -0.18 -0.73 0.14 -0.91 -1.45 -0.98 -0.75 0.17 -1.95 - - - -5.2 - - - -4.21 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.98 - - - - - - 3.06 - - - - - - - - - - - - - - - - 5.08 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.39 - - - - - - - - 2.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.85 - - - -0.65 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
- - - 4.23 2.58 - - 0.49 - - - - - 0.03 3.18 2.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.08 - - - -0.79 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
- - - - - - - -0.67 - - - - 3.42 - - - 2.77 2.4 - - 2.67 - 1.79 1.78 1.5 3.09 2.13 - - - - 0.97 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.57 - - - -0.53 - - - - -
- -1.27 0.52 0.97 - - - 0.56 -1.63 - - - -2.51 3.39 3.34 3.07 -1.59 -2.44 - -1.37 -0.02 3.59 - - -2.97 -1.62 - - - -0.97 - -3.17 -1.41 - 0.6 - - - - - - - - - - -0.27 -1.37 - -0.36 -1.3 - 1.37 -0.32 - - -0.86 - -
- - - - - - 2.3 - 0.44 - - 0.69 1.06 - - - - - - 2.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.97 2.86 - - - 1.45 4.17 - - - -
- - - - 3.37 1.28 1.8 2.81 0.02 -0.33 - -2.23 - - - - - 1.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.47 - - - 0.82 - - 4.5 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
1.11 1.25 - 3.26 - - - - -1.6 - - -0.71 - -0.72 - - - - - - - - 2.58 - - - - 1.97 - - 0.17 -0.82 -0.16 - - - 2.82 1.58 3.92 - - 0.23 - - - - - - 0.16 1.22 - - -3.88 - - - - -
- - - 3.9 - - - - - - - - - 2.33 - - - - - - - - - 2.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.2 - 3.81 - - - - - - -
- - - - - - - - - - -0.44 - 3.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.61 - - - - - - - - - - - - -
- - 1.36 2.19 3.08 - - - -0.53 -1.78 - -1.96 - 1.22 1.66 1.95 - - - 2.48 - - - 1.39 2.91 - - 2.61 - - 1.64 2.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.8 - - - - - - - - - - - 2.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.23 - - - - - - 4.33 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.05 3.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.19 - - - - - - 2.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.02 - - - - -
- - -0.77 1.14 - - - - -1.34 - -3.47 -3.6 1.0 4.33 3.91 3.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.77 - - - - -0.08 - -0.56 - - - 1.73 0.2 - - - -
2.1 0.18 -0.94 - 0.11 - - -1.31 - - - - 1.29 - - -2.46 -0.12 - 1.85 2.24 1.17 - -0.04 -1.71 0.2 0.7 - 0.3 3.44 0.33 0.52 -0.18 0.69 - 1.4 - - - - 0.97 - -3.15 1.62 - - - -1.26 - 1.98 0.89 - - -2.83 - - - -0.06 -
- - - 0.08 3.17 - - 1.51 -0.12 - 1.48 - - 1.29 - 2.82 - 0.57 - - - - - 0.5 0.87 - - 2.16 - 2.84 - 0.97 -0.59 - - - - - - - - 1.92 - - - - - - - - - - -0.2 - 3.04 - - -
- -3.15 - -6.23 - - - - - - - - - - - -4.01 - - - - -3.25 - 1.23 -6.36 - - - -4.38 -5.22 -0.85 4.87 4.54 -1.54 0.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -7.58 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.43 - - - 3.66 - - - - - 4.8 2.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 1.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.45 - 0.27 - - - - 0.2 2.12 - - - 2.77 3.38 3.81 - - 1.81 - - 3.76 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.19 - - - - - 4.43 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.66 2.94 - - - - - - - - - - - - - - - - 5.24 - - - - - - - - -
- - 0.4 - - - -0.19 -4.05 - - - - -3.36 -1.3 - - 0.01 -0.46 1.83 -0.62 1.48 - 0.49 -0.02 0.48 1.29 0.08 1.7 1.51 1.63 -5.52 1.34 -0.07 - - 0.98 - 0.79 3.95 -0.1 - 0.32 - - 1.4 - - -6.24 - - - 0.07 -0.71 - -0.24 - - -
- - - - - - - - - - - - 0.85 - - - - - - - - - - 1.39 1.74 - - - 5.11 - - 0.99 1.4 - - - - - - 3.04 - 1.32 - - - - - - - - - - -1.73 - - - - -
- - - 2.75 - - 4.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.47 2.71 - - - - 1.99 - - - - - - - - - - 0.81 - - - - - - 3.56 - - - -0.74 - - - - -
- - - 3.76 - - - - 2.3 - - - - - - - - 1.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.82 - - - 0.55 - - - - - - 4.34 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 1.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.8 - - - - -
- - - 4.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.45 2.72 - - - - - - - - - -0.04 - - - - - - 4.15 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 1.82 - - - - 3.39 - - - - 3.57 - - 3.85 2.61 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.54 - - - - - - - - -
1.16 1.44 1.22 2.47 1.84 - - - - - - - 1.24 - - - - -0.17 - 1.13 -0.33 - 0.72 1.32 - - - 1.38 - - -0.38 -0.88 - - 2.08 2.09 1.79 - - 2.51 - -0.7 - - 1.92 - - - 1.71 - - -0.09 0.14 - - - - -
- - - - - 1.56 - -1.26 1.36 - - - - - - - - 3.03 - - 1.64 - 1.31 - 1.88 - - - 1.78 - 2.72 1.86 0.27 - - - - - - 3.36 - - - - - - - 2.8 1.29 - - - -2.83 - - - - -
- - 2.79 2.76 - - - - - - - - 1.84 - - - - - 4.23 - - - - - - - - - - - - 0.57 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.36 - - - - - - - - -
- - - 1.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.63 - - - - 3.2 - - 3.07 2.17 - 4.57 - - - - - - - - - - - - - - 1.02 - - - -1.14 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.11 0.34 - - - - -
- - - - 4.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.12 - 2.6 1.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.21 - - - - - 3.57 -
1.54 - - - - - - - - - - - 0.6 - - -0.69 - - - - 1.66 - - - 0.08 - - - 4.53 - - 0.15 0.5 - - - - 3.07 - - - 0.57 - - - - - 2.16 3.03 - - - -0.74 - - - - -
- - - - - - - -3.62 - - - - -1.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.63 2.94 - 2.51 - 2.79 3.76 2.42 - - - 1.24 1.79 - - - -3.18 - - - - -
- - - 4.52 - - - - - - - - 3.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.2 - - - - - - 3.75 - - - 0.78 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - -
- - - 3.6 - - - - - - - - - 4.01 - 2.54 - - - - - - 2.03 - 3.73 -5.41 - - - - - 1.39 - - - - - - - - - - - - - - - - 1.85 - - - -1.3 - - - - -
- - - 2.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.84 - - - - 5.36 - - - - - - - - - - - - - - 1.81 - - - -2.33 - - - - -
- - - - 4.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.67 - - - -0.08 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 2.27 - - - - - - 4.07 - - - - - - - - - - - 1.44 - - - - - - - - - - - - - - - - 5.08 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 0.31 3.92 4.68 3.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.44 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 2.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.48 - - - - - - - - 4.69 - - - 1.04 - - - - -
- - - 4.33 - - - - - - - - 5.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.65 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.0 - - - 0.73 - - - - -
- - - - - - 5.46 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.7 - - - - - - 1.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.3 3.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.72 - - - - - - - - - - - - - - - 5.49 - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.79 4.39 2.09 - - 0.56 0.66 - - - - - - - - - - - - 3.47 - - 3.16 - - - 0.51 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.85 0.32 - - - - - - - - 0.66 3.44 3.88 2.78 - -0.84 2.69 1.53 - 1.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.2 - -0.91 - - - -1.67 -1.63 0.32 - - - 1.87
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.01 - - 4.28 - - - - - - - - - - 2.64 - - - - - - - - -
2.3 1.26 1.76 0.87 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.56 3.56 1.27 -0.43 - 3.12 1.93 - - - 2.28 - 0.22 - - 2.97 0.33 - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.