Heatmap: Cluster_199 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Ovary
Microspore
Generative cell
Pollen
Sperm cell
Pollen grain
Pollen tube
Pollen tube (1.5h)
Pollen tube (3h)
Pollen tube (9h)
Pistil
Style (before flowering)
Style (after flowering)
Style (pollinated, after flowering)
Flower (buds)
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Pericarp/Exocarp (4 DPA)
Pericarp
Pericarp (5 DPA)
Pericarp (7 DPA)
Pericarp (10 DPA)
Fruit (mature green)
Fruit (breaker stage)
Septum (7 DPA)
Septum (10 DPA)
Septum/Seed (4 DPA)
Seed (5 DPA)
Seed (7 DPA)
Seed (10 DPA)
Seeds (10 DPA)
Seeds (20 DPA)
Seeds (30 DPA)
Seeds (Pk-stem)
Seeds (Br-stem)
Seeds (Pk-equatorial)
Seeds (Pk-stylar)
Seeds (Br-stylar)
Seeds
Seeds (RR)
Seeds (LR)
Seeds (MG-equatorial)
Hypocotyl
Seedling (leaves)
Seedling (roots)
Callus
Meristem (vegetative)
Meristem
Apical meristem
Leaf
Root
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root hair cells
- - - 1.37 - - - - - -0.05 - - - - - - - - - - - 0.26 - - - - - - - - - 0.77 2.69 - 4.56 3.56 - - - - - -1.0 - - - - - - 3.17 - - - -2.97 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.88 1.3 - - 2.37 - - - - - - - - - - - - - 5.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 3.13 2.58 3.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.98 - - - - - - 0.86 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 4.48 - - - - - - - - - 2.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.76 - - - - - - 1.49 - - - - - - - - - - -1.64 - - - - -
- -0.35 - 1.54 - - - -0.17 -0.19 0.23 0.93 0.62 0.94 -2.05 -0.53 - -0.69 0.26 - - - 1.26 -0.69 - - - - -1.35 - - -1.51 -0.83 -0.83 3.04 3.86 0.47 1.2 0.26 2.24 0.87 - 0.09 - - - -1.01 - - 1.36 - - - -3.79 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.47 - - - - - - - - - - - - 3.97 - - 5.2 - - - - - - - - - - - - -
- - -0.49 -0.17 1.74 - 1.03 - - - - - - - - - - - - - 0.5 - - - -0.44 - -1.08 - -0.13 0.43 -0.41 -0.79 - - 2.44 - - 3.47 - 2.38 2.82 2.77 - - 1.87 - - - 2.45 - - - -4.06 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.0 - - - 4.17 2.68 - 3.22 3.66 1.33 - - 2.51 - - - 1.49 - - - -4.3 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.61 - - - - - - 5.16 - - - 3.33 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 2.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.69 - - - - - - - - - - - - - - - -
3.12 - - 3.28 - - - - - - - - 3.38 - 1.94 - - - - 1.86 - - - - - - - - - - - - - - 3.3 - - - - 3.31 - 0.49 - - - - - - - - - - -0.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 2.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.12 - 1.2 - - - - - - 3.74 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.16 - - - - - - 5.33 - - - - - - - - -
- - - 0.53 - - - - - - - - 2.37 - - - - - - - - - - - 0.29 - - - - - - 1.02 1.44 - - - 2.47 2.56 - 3.13 3.51 0.25 - 3.55 - - - - -0.25 - - - -2.5 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.89 - - - - - - 4.88 - 0.83 - - - - - - 4.49 - - - -0.63 - - - - -
- - - - - - 1.94 0.86 - - - - 2.03 - - - - -0.07 - - - - - - - - - - - - - - 0.23 - - - - 3.46 - - - 2.8 3.59 - 3.64 - - - 1.84 - - - -3.37 - - - - -
- - - - - - -13.54 - - - - - - - - - - - - - - - 1.29 -4.34 - - - - - - -1.31 - 0.89 - - - - 2.99 - 3.84 4.21 0.86 3.21 - - - - - 0.46 - - - - - - - - -
- - - 1.75 1.08 - 2.6 -8.07 -7.41 - - - -2.54 -6.02 - -5.79 0.48 -0.83 - - - -1.69 - 0.66 -0.71 0.41 - -4.51 -5.77 - -5.5 -5.66 - - -1.39 2.91 -0.12 -0.95 - 0.38 0.92 1.1 0.2 -0.04 2.39 3.78 -4.79 -2.29 -1.08 -3.34 -5.22 0.02 1.37 - -4.56 -4.65 - -
- - - - - - - -0.24 0.21 - - -1.16 - - - -0.48 - 0.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.59 - 4.04 4.55 0.26 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.27 1.09 - - - - - - - - 3.09 -0.56 1.58 0.6 - 1.31 - 2.88 - - - - - - - - 1.13 - - - - - - - - - - 3.71 - -0.05 - - - 1.22 - 1.9 2.33 - - - 1.94 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 1.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.88 - - - - - 3.69 - 4.3 - -0.05 - - - - - - 4.24 - - - -1.18 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 1.93 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.69 - - - - - - - - - - - - - 4.74 - - - 0.79 - - - - -
2.63 1.56 - 1.66 1.04 - - -2.89 - - - - 0.38 - - - - - 1.89 - - - - -1.62 - - - - 0.14 - - - - - - 1.34 2.07 1.89 3.11 2.53 - 1.97 - - - - - - 2.16 1.84 - - -1.85 - - - - -
- - - 2.97 - - - - - - - - 3.04 2.17 - - - - - - - - 2.88 - - - - - - - - 2.31 - - - - - - - - - 1.03 - - - - - - 3.19 2.34 - - -1.85 3.11 - - - -
- - - 3.18 - - - - - - - - 3.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.31 - - - - 1.88 - 4.48 - 3.09 - -0.65 - - - - -
- - - - - - - 1.33 -0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.72 0.79 - 4.46 - - - - - - - - - - - - - 4.8 - - - 0.54 - - - - -
- - - - 1.05 0.64 - - - -1.22 - - - - - - - - - - -0.45 - - - - - - - - - -0.39 0.69 - 2.94 4.21 - - 1.19 - 1.62 - 0.93 2.13 3.18 - - - - 1.97 - - - -4.83 - - - - -
- - - - - - 2.88 -1.33 - - - - - - 2.05 0.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.29 - -0.63 - - - - - - 4.61 - - - -1.8 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.11 - - 3.62 - - - - - - - - - 3.49 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.81 2.78 - - - - - - - - - - - 1.8 - - - - 2.45 - 0.45 - - - 2.3 - - - - - 4.67 - - - - - - - 1.76 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.07 - - - - 3.79 - - - - - - 3.41 - - - - - - - - -
- - - 4.23 - - 2.27 - - - - - 1.34 0.94 - - - 0.2 - - 0.48 - - - - - - - - - 0.64 - - - - - - - - 4.19 - -0.23 - - - - - - 1.97 - 1.47 - -3.78 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 0.05 - - - - - - - - - -0.27 -2.61 - - - - - - - - - - - 2.12 3.2 3.16 2.64 3.16 0.23 2.15 - 3.2 - - - 1.72 - - - -1.74 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 2.84 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.53 - - - - - - - - 4.74 - - - 0.19 - - - - -
- - - 3.32 - - - - - - - - 2.02 - - - - - - - - - - 0.83 0.89 - - - - - 2.78 1.97 - - 4.68 - - - - - - - - - - - - - 1.99 - - - - - - - - -
- - - 2.03 1.7 - - - - - - - - - -2.05 - 0.96 - - - 1.1 - 0.71 0.46 1.11 2.31 1.02 - - - 0.62 1.51 0.5 - - 0.92 - - - - - 1.5 3.28 - - - - - 3.78 - - - -2.09 - - - - -
- - - 3.41 - - - - 0.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.02 - 1.47 - - - - 2.13 - 2.64 - - - - - - - - -
- - - - - - - - 1.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.41 - 3.01 - - - - - 2.12 - - - - - - - - - -
- - - 3.77 4.67 - - - - - - - 4.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.14 - - - - -
- - - - - - - 1.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.72 - - - - 1.41 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 1.87 - - 1.2 - -1.59 - - - - - - - - - - - - - - -1.22 -0.37 - - - 0.17 - - -0.91 2.14 3.66 4.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.98 2.98 - - - - 3.8 3.76 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.78 - - - 1.64 - - - - -
- - - 3.09 - - - - - - - - 0.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.71 - 4.45 - - - - -0.79 - - - 1.65 - - 3.13 - - - -3.28 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.54 - - 1.78 - - - - - - 2.86 - - - -0.61 - - - - -
- - 0.74 3.2 - - - - - - - - 1.9 - 0.16 - - - - - - - - - -0.64 - -0.28 - 0.65 - - - - - 2.24 1.84 - - - 4.19 - 1.02 - - - - - - 1.45 - - 0.7 -0.65 0.63 - - - 2.07
- - - 0.67 - - - - - - - - - - - - 1.64 - - - - - - - - - - - 0.03 - - - 1.79 3.53 4.66 - - - - - - -1.94 - - - - - - 3.55 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.75 - - - - - - - - - - - 2.04 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 2.5 - 0.92 - - - - - - - 0.18 - - - - - - - - -0.0 - - - - 1.01 - 5.1 - 1.62 - - - - - - 1.23 - - - - - 2.71 - - -
- - - 3.0 - - - - - - - - 2.67 - - - - - - - - - - 1.11 - - - - 1.45 - 0.87 0.21 1.47 - - - - 3.93 - 2.75 - 1.89 - - - - -0.8 2.26 - - - - -2.49 - - 0.82 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - 3.98 - - - - 3.01 - - - - - - 3.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.19 - - - -1.86 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.71 - - - 5.18 - - - - 2.76 - - - - - - 3.52 - - - -1.69 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.84 - - - - - - - - - - - - -0.68 - - - - -
- 0.57 - - - - - -0.8 - - - - -0.4 - - - - - - - - 2.14 - - - - - - - - - - - 3.96 3.01 - - 1.21 3.16 3.72 - -0.63 - - - - - - 0.99 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.59 - - - - 1.33 - - - - - - 2.87 - - - - - - - - -
- - - - - - - 3.47 3.86 - - - - - - 2.88 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.5 - - - - - - 4.25 - - - -1.54 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.34 - - - 1.36 4.46 - - - - - 3.71 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.24 - - - - - - - 1.49 - 5.44 - - - - - - 1.52 - - - - - - 2.74 - - - - - - - - -
- - - - - - - 1.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.54 - - - - - - - - - - - - 2.21 - - - - - - 4.76 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.25 - - - - - - - - - - - - - 4.3 - - - -1.91 - - - - -
- - - - 3.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.87 - - - - - - - - - - 5.18 - - - - - - - - - - - - - 2.22 - - - -1.82 - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.