Heatmap: Cluster_188 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Ovary
Microspore
Generative cell
Pollen
Sperm cell
Pollen grain
Pollen tube
Pollen tube (1.5h)
Pollen tube (3h)
Pollen tube (9h)
Pistil
Style (before flowering)
Style (after flowering)
Style (pollinated, after flowering)
Flower (buds)
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Pericarp/Exocarp (4 DPA)
Pericarp
Pericarp (5 DPA)
Pericarp (7 DPA)
Pericarp (10 DPA)
Fruit (mature green)
Fruit (breaker stage)
Septum (7 DPA)
Septum (10 DPA)
Septum/Seed (4 DPA)
Seed (5 DPA)
Seed (7 DPA)
Seed (10 DPA)
Seeds (10 DPA)
Seeds (20 DPA)
Seeds (30 DPA)
Seeds (Pk-stem)
Seeds (Br-stem)
Seeds (Pk-equatorial)
Seeds (Pk-stylar)
Seeds (Br-stylar)
Seeds
Seeds (RR)
Seeds (LR)
Seeds (MG-equatorial)
Hypocotyl
Seedling (leaves)
Seedling (roots)
Callus
Meristem (vegetative)
Meristem
Apical meristem
Leaf
Root
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root hair cells
-0.83 -0.1 0.63 3.73 -0.44 -6.12 -4.54 -5.78 -6.05 -6.31 -5.99 -6.39 0.81 -0.92 -1.64 -1.24 -2.5 -1.12 0.63 0.06 -2.35 0.25 -4.82 -3.2 -3.97 -0.43 -1.12 -2.64 -2.09 -3.04 -3.29 -3.37 -3.11 1.58 -1.61 -3.73 -0.41 -0.76 -0.92 0.97 -0.7 -0.37 -1.09 -0.66 -1.34 -0.73 -1.71 -0.2 3.73 0.66 -1.02 -1.09 -0.43 -0.49 -0.39 -1.84 -1.3 -1.45
0.7 0.91 0.2 4.02 3.37 - 2.24 -2.61 -3.28 - - - 0.65 - - - - -1.84 1.18 - - - -2.15 -1.73 -1.73 -0.25 - -0.01 -0.64 - -2.26 -2.09 -3.1 0.92 0.17 - - - - 0.6 - -1.65 - - 1.06 - - - 2.49 - - - -1.07 - - - -0.56 -
-0.26 - - 3.48 4.38 -1.13 - 0.63 -1.99 -0.9 -2.63 -2.76 -0.63 -1.5 - - - -0.05 - -1.41 - - - - - -1.56 -2.19 - - - - -3.75 -2.49 - - - - -0.99 - - - -1.06 - - - 0.64 - - 3.32 - - - -0.17 2.45 - - - -
- - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.13 5.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.42 - - - -2.21 - - - - -
- - - 4.88 2.86 - - - - - - - 1.36 - - - - - - - - - - - - - - - -9.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.22 - - - -2.16 - - - - -
- - - 4.38 5.0 - - - -0.45 - - - - 0.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.66 - - - - - - 1.3 - - - - - - - - -
- - - 5.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.9 - - - - -
- - - 4.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.36 - - - - - - - - -
- - - 4.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.12 - - - - - - - - - - - - - - 1.56 - - - -2.56 - - - - -
- - - 4.42 - - - - - - - - 3.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.66 - - - - - - - - -
- - - 5.32 3.66 - - - - - - - 0.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.14 - - - - - - - - -1.44 - - - - - - 1.4 - - - - - - - - -
- - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-0.25 0.38 0.52 3.22 0.82 - -0.5 -3.2 -4.76 - -4.63 -4.34 1.55 -3.35 -3.98 - -1.36 -1.53 0.69 0.0 -0.64 - -1.11 -2.32 -1.78 -0.19 -0.98 -2.79 -1.08 -1.28 -2.42 -0.91 -2.23 - 0.32 -0.4 1.51 0.5 0.76 2.15 -0.25 0.07 - - -0.4 -0.24 -4.52 -1.38 3.37 0.82 -0.49 -1.04 -1.28 -0.83 - -1.29 - -
- - - 4.98 3.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.47 - - - - - - 3.22 - - - - - - - - -
1.1 0.35 0.46 3.56 3.49 -4.28 1.29 -3.67 -3.46 -3.56 -3.62 -3.89 0.8 -0.94 -0.95 -1.07 -0.72 -1.15 0.7 0.65 -1.34 -0.1 -1.28 -1.65 -1.69 -2.17 -3.15 -1.2 -0.91 -1.07 -1.1 -1.51 -1.56 -0.52 -1.27 -2.34 -1.59 -1.51 -2.17 -0.14 -2.85 -1.25 -1.25 -0.61 -1.32 0.25 -2.22 -0.05 1.45 -1.49 -0.59 -0.92 -0.4 -1.08 -1.42 -1.26 -1.15 -2.11
- - - 2.93 3.98 - - - - - - - 2.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.81 - - - 1.14 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 3.25 - 1.0 - - - - - - - - - - - - - - - - 0.9 4.54 - - - - - - - -0.85 - - - - - 2.56 3.57 - - - 1.61 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.64 - - - 3.04 - - - - - - - - -
- - - 5.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.9 - - - - -
- - - 4.83 - - - - - - - - 1.28 - - - - - - - - - - - - 2.16 - - - - - - - - - - - - - - - 1.03 - - - - - - 3.86 - - - - - 2.61 - - -
- - - 5.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.42 - - - - - - - - -
-2.86 -3.1 -0.89 -1.18 1.14 - -0.57 -1.63 -2.4 -0.22 -1.03 -0.56 0.44 -2.44 -1.57 -0.24 -1.48 -0.02 -2.02 - -2.21 -3.11 -1.76 -2.33 -1.46 -0.17 0.73 -1.07 -0.58 -0.89 -0.77 -0.84 -0.36 - - 0.03 2.03 2.26 2.31 1.98 2.08 1.35 2.01 -0.46 -0.07 -0.75 -2.54 -1.05 2.2 -3.99 -0.4 - -1.48 -2.33 -1.86 - - -0.11
- - - 4.34 4.06 - - -2.31 -1.82 - - - - 1.16 - - - - 2.46 - - - - - - - -0.22 - - - - -1.11 - - - - - - - - - - - - - - - - 2.87 - - - -2.5 0.89 - 1.11 - -
- - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 3.29 0.64 - 0.05 -2.67 - - - - 0.15 - - - - -1.79 - - - - - - - - - - - - - -2.08 - 3.51 - - 1.67 0.73 - 1.5 2.71 0.27 2.87 - - -0.54 - - 3.12 - - - -1.58 - - - - -
- - - 4.48 4.0 - 1.45 - - - - - 1.16 1.44 -0.5 0.24 - - - 0.42 - - - -1.67 - 0.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.66 - - - -2.59 - - - - -
- - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.99 4.26 2.07 - - -1.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.31 - - - -0.24 - - - - - - 4.62 0.67 - - -1.83 - - - - -
- - - 5.68 - - - -2.41 - - - - 0.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.29 - - - - - - 0.2 - - - - - - 1.96 - -
- - - 5.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.74 - - - - - - - - -
- - - 4.68 - - - - - - - - 4.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.92 - - - - - - - - -
- - - 4.11 3.96 - -22.71 -23.62 - - - - 2.45 - - - - - - - - - - -6.07 - - - - - -1.47 - -8.72 - - - - - - - 2.92 - - - - - - - - 3.54 - - - -2.44 - - - - -
- - - 4.55 - - - 0.89 - - - - - - - - - 0.56 - - - - - - - - - - - - - 0.51 - - - - - - - - - - - - - 3.68 - - 4.06 - - - -1.24 - - - - -
2.05 -0.66 1.3 3.23 4.43 - 2.4 -1.29 -2.79 - - -2.25 2.6 - 0.05 0.51 - 0.35 - - - - - - - - - - - - - - -2.88 - - - - - - - - -2.27 - - - - - -0.32 1.19 - - - -4.14 -0.93 - - - -
- - - 4.09 4.75 - 1.14 -1.99 -1.51 0.27 0.28 - 1.99 - - 0.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.5 - - - - - - 1.04 - - - -0.71 - - - - -
- - - 4.88 4.38 - - - - - - - - -0.88 0.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.31 - - - - - - 2.47 - - - -1.99 - - - - -
- - - 3.29 5.0 - 2.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.95 - - - 2.17 - - - - -
- - -2.18 5.13 0.73 - - - - - - - 1.86 - -0.96 - - - - - - - - - - - - - - - -1.6 -2.68 - - 1.63 - - 0.83 - 0.4 - -0.4 0.77 1.82 0.82 - - - 1.03 - - - -3.58 -1.21 - - - -
-0.89 - - 5.5 0.39 - - - - - - - 2.46 -3.17 - -1.15 - -1.49 - - - - - - - - - - - - - -3.27 - - - - - - - - - -3.8 - - - - - - 1.96 - -1.68 - -2.85 - - - - -
- - - 2.76 3.74 - - - - - - - 3.62 - - 1.67 - - - - - - - - - - 1.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.06 - - - 0.91 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.53 - 0.64 4.04 - - - - - 4.46 - - - 2.69 - - - - -
- -0.27 0.1 4.87 1.08 0.1 -3.16 -1.64 -3.1 -2.75 - -4.88 0.28 - -0.57 - - 0.55 - - -3.54 - - - -5.76 -6.55 - -3.84 - -4.81 -4.09 -0.22 1.92 - 2.11 0.45 - 0.23 - - - -3.42 - - 1.22 0.31 - - 1.6 - - - -1.28 - - -0.4 - -
- - - 4.03 0.48 2.09 -0.1 -1.16 -1.23 -2.4 -1.52 - 1.72 - - - - -0.13 - - -0.69 - - - -1.7 - - 0.54 - -0.19 2.15 1.81 1.67 3.36 - - - - - - - -2.8 - - - 1.64 - - 0.39 - - - -2.28 - - - - -
- - - 5.0 3.37 - - 1.72 - - - - 1.75 - - - - -0.01 - - - - - - - 0.92 - - 0.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.04 1.87 - - - -4.13 - - - - -
- - - 5.75 2.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 4.84 - - - - 0.57 - - - 3.54 0.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.46 - - - -1.22 - - - - - - 3.12 - - - -1.94 - - - - -
- - - 4.85 - - - - - - -0.32 -1.05 - - - 0.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.08 - - - 0.76 3.59 - 3.43 - -
- - - 5.31 - - - - - - - - 2.77 - - - - - - - - - - - - - 1.31 - - - - - - - - - - - - - - -0.65 - - - - - - 2.09 - 1.71 - 0.01 - - - - -
- - - 5.73 1.15 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.48 - - - - - - - - -
- - - -1.07 -1.14 - - -3.05 - - - - -0.29 0.57 -0.5 -1.28 - - - - - - - - - -2.07 -1.95 - -2.74 - - -3.62 -1.63 - 0.15 - 2.47 2.41 2.95 1.4 - 1.61 3.33 1.99 -0.21 - - -1.23 3.48 -1.54 - - -1.99 - - - - -
- - - 5.47 - - - - - - - - 2.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - 2.91 - - - -0.81 - - - - -
- - - 5.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.42 - - - - - - - - -
- - - 5.53 - - - - - - - - - - -0.66 - -0.96 - - - - 1.43 - - - - - -20.15 - - - -2.7 - - - - 2.03 - - - - -2.03 - - - 0.15 - - 1.26 - - - - - - - - -
- - - 5.8 - - 0.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.7 - - - -1.91 - - - - -
- - - 4.74 2.14 - - - - - - - 3.18 - - - - - 1.09 - - - - - - 0.59 - - - - - - - - 1.23 - - - 2.61 - - -0.75 - - - - - 0.47 1.44 - - - -2.73 - - - -0.18 -
- - 1.88 4.89 3.75 - - - - - - - 0.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.35 - - - - - - 3.06 - - - -0.1 - - - - -
- - - 5.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.44 - - - - - - - - -
- - - 5.55 - - - - - - - - 1.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.93 - - - -0.91 - - - - -
- - - 5.0 - - - - - - - -0.35 0.84 2.28 - 0.4 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.11 - - - - - - - - -
- 2.4 - 5.3 2.78 - - - - - - - 1.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.09 - - - -0.87 - - - - -
- - - 5.85 - - - - - - - - - - - - - -2.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- -0.24 - 3.6 4.54 - 2.04 -3.18 -2.23 -2.26 -2.44 - -1.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.9 - 2.0 0.82 - - - - - - -1.88 - - - - - - 3.25 - - - -0.11 - - - - -
- 0.02 - 5.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.29 - - - -2.62 - - - - -
- 2.64 -0.51 4.59 0.89 - 1.26 - - - - - -0.67 - - - - -0.81 2.68 1.74 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.15 - - 3.05 - - - 0.28 - - - - -
- - - 5.07 - - - 0.47 1.11 - - - 2.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.71 - - - -1.5 - - - - -
- 2.2 - 4.61 - - 1.01 0.31 0.24 -1.39 0.21 0.73 1.36 - - - - -1.08 - - - - - -1.63 - -0.22 -1.11 - - - -0.43 - -1.27 - - - - - - - - - - - - - - - 3.64 - - - -3.08 - 0.61 0.54 - -
- - - 5.06 - - - - - - - - 2.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.04 - - - 0.58 - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.