Heatmap: Cluster_214 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Egg apparatus cell (small)	Egg apparatus cell (medium)	Egg apparatus cell (large)	Ovary	Uninuclear microspore	Generative cell	Pollen	Sperm	Pollen tube (bicellular)	Pollen tube (tricellular)	Flower (bud, female)	Flower (bud, male)	Flower (female)	Flower (male)	Flower (tepals)	Fruit (female)	Apical meristem	Shoot (female)	Shoot (male)	Leaf (male)	Leaves	Root (male)
AMTR_s00001p00258260 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.356)	0.32	0.92	1.0	0.09	0.11	0.01	0.03	0.32	0.13	0.13	0.42	0.6	0.47	0.03	0.13	0.15	0.66	0.41	0.48	0.22	0.17	0.63
AMTR_s00002p00023650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.10)	0.03	1.0	0.28	0.2	0.34	0.0	0.04	0.0	0.04	0.04	0.45	0.27	0.21	0.15	0.29	0.14	0.26	0.16	0.18	0.22	0.21	0.19
AMTR_s00002p00096860 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.54)	0.59	0.7	0.73	0.01	0.32	0.01	0.25	0.24	0.31	0.28	0.65	0.94	0.16	0.33	0.21	0.09	0.11	1.0	0.27	0.06	0.09	0.38
AMTR_s00003p00024290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.10)	0.31	0.49	0.62	0.05	0.44	0.12	0.07	0.06	0.06	0.07	0.7	1.0	0.27	0.18	0.16	0.1	0.4	0.6	0.22	0.12	0.06	0.41
AMTR_s00003p00232080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.229)	0.63	0.89	1.0	0.03	0.33	0.01	0.12	0.37	0.27	0.23	0.47	0.65	0.27	0.15	0.1	0.13	0.45	0.48	0.27	0.06	0.1	0.29
AMTR_s00004p00084710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.68)	0.33	1.0	0.79	0.2	0.25	0.02	0.18	0.04	0.15	0.12	0.22	0.25	0.19	0.21	0.24	0.14	0.11	0.17	0.22	0.13	0.16	0.13
AMTR_s00004p00165390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.182)	0.27	0.86	1.0	0.0	0.12	0.2	0.02	0.03	0.02	0.03	0.51	0.22	0.24	0.04	0.55	0.02	0.32	0.14	0.14	0.17	0.03	0.0
AMTR_s00006p00256840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.194)	0.01	1.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.29	0.35	0.15	0.04	0.2	0.19	0.41	0.39	0.41	0.25	0.27	0.16
AMTR_s00007p00256610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.302)	0.0	1.0	0.02	0.05	0.54	0.0	0.2	0.17	0.41	0.28	0.51	0.5	0.3	0.28	0.35	0.17	0.6	0.29	0.24	0.15	0.37	0.32
AMTR_s00009p00264000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.363)	0.5	0.79	0.77	0.1	0.37	0.26	0.33	0.19	0.34	0.38	0.81	0.89	0.56	0.58	0.45	0.37	0.49	1.0	0.57	0.33	0.28	0.78
AMTR_s00010p00121230	0.0	1.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.27	0.11	0.04	0.1	0.21	0.27	0.13	0.21	0.2	0.18	0.15
AMTR_s00010p00228620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.258)	0.58	0.59	0.45	0.16	0.18	0.06	0.04	0.07	0.02	0.02	0.83	1.0	0.38	0.2	0.15	0.08	0.67	0.28	0.33	0.29	0.09	0.38
AMTR_s00012p00114570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.57)	0.0	0.97	1.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.31	0.1	0.11	0.17	0.04	0.14	0.49	0.09	0.13	0.1	0.04	0.27
AMTR_s00013p00254450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.240)	0.06	1.0	0.66	0.0	0.22	0.0	0.0	0.1	0.01	0.0	0.47	0.81	0.19	0.11	0.46	0.01	0.36	0.09	0.08	0.11	0.03	0.06
AMTR_s00016p00241830 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.256)	0.0	1.0	0.3	0.05	0.63	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.12	0.11	0.08	0.03	0.08	0.05	0.08	0.19	0.29	0.35	0.13	0.42
AMTR_s00016p00245620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.279)	0.48	0.72	0.68	0.05	0.51	0.24	0.12	0.16	0.26	0.25	0.78	1.0	0.62	0.55	0.72	0.35	0.61	0.82	0.46	0.6	0.38	0.72
AMTR_s00017p00195640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.115)	0.0	1.0	0.0	0.01	0.52	0.0	0.02	0.27	0.04	0.05	0.43	0.91	0.05	0.02	0.12	0.02	0.34	0.05	0.03	0.01	0.03	0.17
AMTR_s00018p00255530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00018.170)	0.0	1.0	0.86	0.34	0.01	0.01	0.12	0.04	0.06	0.03	0.29	0.24	0.3	0.16	0.04	0.02	0.27	0.35	0.43	0.11	0.09	0.27
AMTR_s00021p00104980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.52)	0.02	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.7	0.18	0.0	0.01	0.59	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21
AMTR_s00021p00162900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.116)	0.4	0.53	1.0	0.0	0.07	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.63	0.43	0.41	0.08	0.23	0.0	1.0	0.65	0.19	0.29	0.15	0.0
AMTR_s00021p00189010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.149)	0.01	1.0	0.19	0.09	0.2	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.74	0.29	0.04	0.01	0.53	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00024p00160570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.116)	0.25	0.84	0.33	0.01	1.0	0.01	0.26	0.0	0.51	0.38	0.69	0.85	0.46	0.44	0.52	0.34	0.99	0.39	0.34	0.48	0.48	0.47
AMTR_s00024p00241030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.284)	0.01	1.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.39	0.14	0.04	0.28	0.07	0.11	0.03	0.08	0.18	0.11	0.14
AMTR_s00025p00143720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.157)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.03	0.0	0.06	0.03	0.0	0.94	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0
AMTR_s00025p00167790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.196)	0.29	1.0	0.15	0.3	0.55	0.05	0.29	0.01	0.11	0.14	0.52	0.38	0.49	0.4	0.44	0.31	0.64	0.29	0.32	0.5	0.22	0.43
AMTR_s00025p00247140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.396)	0.0	1.0	0.0	0.03	0.5	0.02	0.03	0.0	0.04	0.03	0.58	0.78	0.36	0.2	0.28	0.04	0.32	0.08	0.02	0.09	0.02	0.05
AMTR_s00029p00110740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.119)	0.31	1.0	0.25	0.01	0.72	0.03	0.16	0.2	0.22	0.18	0.53	0.66	0.27	0.27	0.34	0.2	0.32	0.26	0.26	0.26	0.13	0.3
AMTR_s00029p00216670 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.326)	0.0	1.0	0.0	0.05	0.06	0.0	0.03	0.0	0.02	0.03	0.21	0.43	0.4	0.04	0.05	0.0	0.35	0.19	0.25	0.04	0.01	0.23
AMTR_s00030p00047430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.18)	0.47	1.0	0.45	0.26	0.35	0.01	0.18	0.15	0.25	0.22	0.37	0.37	0.4	0.45	0.53	0.3	0.43	0.32	0.33	0.28	0.32	0.41
AMTR_s00030p00048680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.19)	0.54	1.0	0.52	0.17	0.3	0.01	0.15	0.07	0.32	0.21	0.32	0.38	0.27	0.49	0.6	0.32	0.78	0.44	0.3	0.36	0.49	0.48
AMTR_s00032p00165380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.138)	0.0	1.0	0.17	0.12	0.27	0.01	0.02	0.0	0.02	0.02	0.34	0.45	0.26	0.29	0.36	0.15	0.24	0.16	0.14	0.12	0.12	0.17
AMTR_s00036p00222220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00036.159)	0.49	0.54	0.35	0.0	0.36	0.18	0.14	0.0	0.11	0.11	0.55	1.0	0.2	0.1	0.15	0.23	0.41	0.68	0.56	0.13	0.2	0.28
AMTR_s00038p00032370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00038.11)	0.01	0.67	1.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.21	0.1	0.16	0.07	0.04	0.0	0.12	0.09	0.26	0.14	0.08	0.18
AMTR_s00038p00052930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00038.18)	0.18	1.0	0.0	0.06	0.47	0.0	0.21	0.0	0.17	0.16	0.37	0.26	0.31	0.32	0.17	0.25	0.41	0.24	0.13	0.26	0.07	0.28
AMTR_s00043p00200240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00043.61)	0.11	1.0	0.35	0.12	0.22	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.4	0.15	0.1	0.23	0.15	0.06	0.03	0.08	0.06	0.0	0.05
AMTR_s00045p00117730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.114)	0.37	1.0	0.0	0.0	0.52	0.24	0.03	0.0	0.03	0.02	0.36	0.51	0.37	0.22	0.14	0.2	0.21	0.09	0.17	0.06	0.21	0.3
AMTR_s00046p00101090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00046.56)	0.21	1.0	0.5	0.11	0.1	0.0	0.09	0.16	0.26	0.23	0.25	0.33	0.22	0.11	0.06	0.07	0.27	0.1	0.06	0.04	0.1	0.22
AMTR_s00057p00065600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.40)	0.71	0.81	0.54	0.0	0.2	0.07	0.13	0.08	0.31	0.22	0.91	1.0	0.29	0.28	0.17	0.2	0.39	0.84	0.4	0.13	0.11	0.47
AMTR_s00058p00105900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.60)	0.0	0.82	1.0	0.0	0.08	0.0	0.09	0.0	0.07	0.07	0.33	0.33	0.22	0.06	0.18	0.19	0.57	0.34	0.29	0.22	0.37	0.2
AMTR_s00059p00058530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.36)	0.65	1.0	0.0	0.0	0.67	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.32	0.47	0.43	0.33	0.17	0.25	0.13	0.1	0.24	0.36	0.28	0.2
AMTR_s00064p00190010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00064.84)	0.0	1.0	0.87	0.0	0.45	0.07	0.0	0.0	0.01	0.01	0.18	0.28	0.12	0.06	0.06	0.06	0.2	0.25	0.37	0.06	0.09	0.08
AMTR_s00070p00120070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00070.61)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.49	0.0	0.05	0.0	0.03	0.04	0.4	0.84	0.34	0.08	0.06	0.0	0.13	0.29	0.13	0.1	0.26	0.0
AMTR_s00074p00124400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00074.39)	0.19	1.0	0.7	0.01	0.44	0.2	0.04	0.05	0.06	0.08	0.52	0.79	0.34	0.34	0.2	0.11	0.37	0.52	0.24	0.12	0.06	0.36
AMTR_s00077p00098910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.81)	0.0	0.7	0.0	0.0	0.11	0.0	0.14	0.0	0.17	0.17	0.47	1.0	0.04	0.02	0.08	0.02	0.12	0.08	0.0	0.01	0.1	0.02
AMTR_s00077p00180970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.204)	0.06	1.0	0.0	0.0	0.95	0.0	0.2	0.04	0.3	0.29	0.6	0.48	0.62	0.26	0.38	0.12	0.61	0.52	0.36	0.4	0.29	0.3
AMTR_s00078p00092270 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.64)	0.0	1.0	0.52	0.0	0.12	0.02	0.03	0.0	0.03	0.04	0.35	0.76	0.13	0.03	0.06	0.04	0.34	0.14	0.16	0.09	0.03	0.12
AMTR_s00092p00117570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.79)	0.64	1.0	0.0	0.4	0.55	0.0	0.05	0.0	0.21	0.11	0.4	0.61	0.35	0.22	0.46	0.14	0.82	0.07	0.21	0.12	0.1	0.44
AMTR_s00103p00156950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00103.114)	0.1	1.0	0.03	0.22	0.76	0.04	0.03	0.08	0.04	0.05	0.37	0.66	0.26	0.22	0.34	0.22	0.48	0.26	0.34	0.2	0.36	0.15
AMTR_s00104p00131890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00104.59)	0.42	1.0	0.0	0.27	0.5	0.0	0.17	0.01	0.18	0.18	0.24	0.32	0.21	0.22	0.27	0.21	0.33	0.27	0.22	0.21	0.23	0.27
AMTR_s00105p00011070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00105.2)	0.14	1.0	0.39	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.48	0.22	0.02	0.12	0.05	0.16	0.38	0.21	0.01	0.04	0.01
AMTR_s00109p00086600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00109.70)	0.03	1.0	0.18	0.02	0.3	0.0	0.19	0.04	0.19	0.14	0.37	0.32	0.25	0.18	0.3	0.18	0.24	0.22	0.28	0.21	0.14	0.16
AMTR_s00110p00097130 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00110.57)	0.07	1.0	0.06	0.21	0.25	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.45	0.4	0.36	0.14	0.23	0.16	0.48	0.13	0.21	0.19	0.03	0.28
AMTR_s00111p00072010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00111.42)	0.91	1.0	0.0	0.06	0.49	0.0	0.04	0.17	0.06	0.07	0.65	0.68	0.38	0.44	0.2	0.2	0.18	0.24	0.53	0.34	0.56	0.35
AMTR_s00112p00047400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00112.11)	0.03	1.0	0.75	0.04	0.12	0.01	0.07	0.0	0.03	0.09	0.28	0.24	0.08	0.02	0.08	0.0	0.45	0.44	0.27	0.05	0.01	0.18
AMTR_s00120p00077200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00120.34)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.18	0.28	0.12	0.07	0.04	0.38	0.07	0.05	0.2	0.03	0.13	0.21
AMTR_s00120p00079170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00120.36)	0.22	1.0	0.04	0.01	0.47	0.0	0.07	0.26	0.05	0.07	0.4	0.42	0.33	0.04	0.07	0.41	0.53	0.34	0.25	0.22	0.15	0.29
AMTR_s00126p00124980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00126.63)	0.55	0.87	1.0	0.0	0.34	0.02	0.23	0.25	0.15	0.19	0.24	0.22	0.22	0.18	0.17	0.23	0.31	0.21	0.21	0.14	0.14	0.14
AMTR_s00134p00089540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00134.29)	0.0	1.0	0.33	0.0	0.13	0.0	0.13	0.0	0.13	0.11	0.17	0.15	0.16	0.15	0.11	0.07	0.35	0.3	0.22	0.29	0.25	0.17
AMTR_s00140p00050120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00140.21)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.23	0.72	0.19	0.03	0.05	0.0	0.13	0.07	0.0	0.02	0.06	0.11
AMTR_s00157p00053920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00157.19)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.43	0.0	0.11	0.0	0.1	0.1	0.22	0.44	0.21	0.13	0.15	0.06	0.22	0.15	0.32	0.26	0.28	0.16
AMTR_s00180p00023300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00180.9)	0.28	1.0	0.02	0.28	0.33	0.0	0.09	0.0	0.16	0.14	0.3	0.3	0.28	0.23	0.29	0.08	0.75	0.22	0.15	0.14	0.08	0.26
AMTR_s00220p00015010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00220.1)	0.0	1.0	0.26	0.12	0.29	0.0	0.07	0.0	0.07	0.08	0.32	0.55	0.22	0.19	0.17	0.17	0.17	0.23	0.18	0.13	0.12	0.22
AMTR_s00284p00011000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00284.1)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.11	0.34	0.07	0.07	0.08	0.06	0.16	0.11	0.16	0.08	0.1	0.1
AMTR_s03073p00008220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold03073.2)	0.02	1.0	0.0	0.07	0.32	0.0	0.04	0.0	0.05	0.04	0.08	0.08	0.08	0.05	0.04	0.0	0.34	0.09	0.03	0.02	0.06	0.04

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)