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Heatmap: Cluster_67 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Ovary
Microspore
Generative cell
Pollen
Sperm cell
Pollen grain
Pollen tube
Pollen tube (1.5h)
Pollen tube (3h)
Pollen tube (9h)
Pistil
Style (before flowering)
Style (after flowering)
Style (pollinated, after flowering)
Flower (buds)
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Pericarp/Exocarp (4 DPA)
Pericarp
Pericarp (5 DPA)
Pericarp (7 DPA)
Pericarp (10 DPA)
Fruit (mature green)
Fruit (breaker stage)
Septum (7 DPA)
Septum (10 DPA)
Septum/Seed (4 DPA)
Seed (5 DPA)
Seed (7 DPA)
Seed (10 DPA)
Seeds (10 DPA)
Seeds (20 DPA)
Seeds (30 DPA)
Seeds (Pk-stem)
Seeds (Br-stem)
Seeds (Pk-equatorial)
Seeds (Pk-stylar)
Seeds (Br-stylar)
Seeds
Seeds (RR)
Seeds (LR)
Seeds (MG-equatorial)
Hypocotyl
Seedling (leaves)
Seedling (roots)
Callus
Meristem (vegetative)
Meristem
Apical meristem
Leaf
Root
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root hair cells
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.0 - - - 1.48 - - - - - - 5.49 - - - 1.25 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.65 - - - 2.95 - - - - -
- - - 2.02 2.92 - - -0.99 0.57 - - - 1.44 - - - - - - - - 2.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.28 - - - 1.75 - - 4.83 - - - 2.26 - - - - -
- - - - - - - - 2.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.28 - - - - - - 5.42 - - - 2.5 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 3.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.16 - - - 2.77 - - - - -
- - - - - - - 1.93 1.81 - - - 3.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.14 - - - 2.23 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - -
- - - 2.78 3.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.02 - - - 2.35 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - -
- - - 5.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.22 - - - 2.89 - - - - -
- - - 2.62 - - - - - - - - 2.89 - - 1.11 - - - - - - - - 1.75 - - - - - - 1.11 - - - - - - - - - -0.16 - - - - - - 5.02 - - - 1.72 - - - - -
- - - 3.84 - - - - - - - - - 1.62 3.09 -2.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.22 - - - - - - 4.08 - - - 2.01 2.66 - - - -
- - - - - - - - - - - - 2.63 - - - - - 3.31 2.01 - - - 0.43 0.28 - - 2.39 - - - -0.35 1.53 - - - - - - - - -0.67 - - 3.87 - - - 3.07 - - - 1.45 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.6 - - - 3.27 - - - - -
- - - - - - - - 1.69 - - - - - 3.46 - - - - - - - - - - - - - - - 4.15 2.7 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.44 - - - 3.12 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.6 - - - 3.27 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.72 - - - 2.39 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.17 - - - - - - 5.33 - - - 3.11 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 4.13 - - - - 4.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.61 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.37 - - - 4.05 - - - - -
- - - - 5.17 - - - - - - - 2.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.48 - - - 2.16 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.97 - - - - - - - - - -0.04 - - - - - - 5.69 - - - 1.71 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.64 - 1.79 - - - - - - - - - - 2.21 - - - - -
- - - 3.78 - - - - - - - - - - - - - 1.26 - - - - - -0.15 0.74 - - - - - - - - 4.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.98 - - - - -
- 4.1 - - - - - -0.25 - - - - - - - - 2.61 - - - - - - - - - - - - - - 2.15 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.79 - - - 2.56 - 3.3 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.6 - - - 3.27 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.35 - - - 4.11 - - - - -
- - - 4.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.75 - - - 4.43 - - - - -
- - - 5.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.46 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.6 - - - 3.27 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - -
- - - 2.29 - - - - - - - - 3.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.93 2.46 - - - 2.32 4.03 3.46 - - -
- - - 5.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.48 - - - 3.15 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.31 - - - - - - - - - - - - - - 4.07 - - - 0.63 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.6 - - - 3.27 - - - - -
3.11 - - 2.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.81 2.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.77 - - - 1.94 - - - - -
- - - 4.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.93 - - 4.2 - - - 2.32 - - - - -
- - - 4.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.26 - - - 2.93 - - - - -
- - - 5.15 - - - - - - - - - - - 3.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.47 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.12 - - - - - - 4.86 - - - 3.53 - - - - -
- - - 3.23 - - - - - - - - 2.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.99 - - - - - - - - - - - - - - 2.96 - - 4.04 - - - 1.13 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.45 - - 4.21 - - - 5.07 - - - 1.64 - - - - -
- 2.64 - - - - - - - - - - 1.53 - - - - 0.61 - - - - - - - - - - - - - - - 4.89 - - - - - - - - - - - - - - 3.92 - - - 1.34 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.28 - - - - - - 5.66 - - - 2.35 - - - - -
- - - - 4.08 - - - 0.76 - - - - - - - - - - - 3.0 - - - - - - - - - 2.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.4 - - - 1.28 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 1.63 - - - - - - - - - - 1.14 - 3.29 2.27 - - - 2.79 0.82 1.7 - - - - - - - - - - - - - - - 4.62 - - - 0.64 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.01 - - - 4.69 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - -
- - - 3.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.84 - - - - - - 4.89 - - - 3.65 - - - - -
- - - - 1.81 - 4.49 -2.1 - - - - 0.33 - - - - - - 1.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.95 - - - 1.0 - - - - - - 4.39 - - - 0.7 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.37 - - - 4.05 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.18 - - - 4.44 - - - - -
- - - - 4.79 - - - - - - - 3.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.1 - - - 1.77 - - - - -
- - 2.18 - - - - - - - - - 3.29 2.14 - 0.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - 2.34 - 0.41 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.86 - - - - -
- - - - 3.33 - 2.63 - - - - - 0.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.25 - - - - - - 5.16 - - - 1.07 - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.