Heatmap: Cluster_43 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule (0-1 DPA)
Ovule (2 & 5 DPA)
Ovary
Microspore
Generative cell
Pollen
Sperm cell
Pollen grain
Pollen tube
Pollen tube (1.5h)
Pollen tube (3h)
Pollen tube (9h)
Pistil
Style (before flowering)
Style (after flowering)
Style (pollinated, after flowering)
Flower (buds)
Flowers
Ovary wall/pericarp (0-1 DPA)
Ovary wall/pericarp (2 & 5 DPA)
Pericarp/Exocarp (4 DPA)
Pericarp
Pericarp (5 DPA)
Pericarp (7 DPA)
Pericarp (10 DPA)
Fruit (mature green)
Fruit (breaker stage)
Septum (7 DPA)
Septum (10 DPA)
Septum/Seed (4 DPA)
Seed (5 DPA)
Seed (7 DPA)
Seed (10 DPA)
Seeds (10 DPA)
Seeds (20 DPA)
Seeds (30 DPA)
Seeds (Pk-stem)
Seeds (Br-stem)
Seeds (Pk-equatorial)
Seeds (Pk-stylar)
Seeds (Br-stylar)
Seeds
Seeds (RR)
Seeds (LR)
Seeds (MG-equatorial)
Hypocotyl
Seedling (leaves)
Seedling (roots)
Callus
Meristem (vegetative)
Meristem
Apical meristem
Leaf
Root
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root hair cells
- - - - - - - - - 4.0 2.9 5.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.82 4.01 3.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 1.52 4.18 4.04 4.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -0.81 0.97 -0.76 1.44 2.02 4.04 3.81 3.65 - -3.51 -5.26 -2.15 -4.74 0.54 1.55 - - - - - - - - - - - - - - -1.95 - - - - - - - - - - - - - - -3.19 - - - -9.72 - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 5.22 3.42 3.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.63 - - - - - - 4.23 4.0 4.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.89 3.92 3.71 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 3.19 3.49 5.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.99 3.41 3.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.5 4.22 4.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -7.0 -6.02 -4.53 1.92 -1.03 0.9 3.87 3.63 3.6 3.58 - -4.54 -5.26 -2.65 - -1.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -6.21 - - -7.01 -9.9 - - - - -
- - - - - - - - - 4.51 3.94 4.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.19 4.56 4.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 5.35 2.96 3.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.28 4.26 4.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.77 - - - - - -1.76 4.24 4.28 4.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-8.48 -8.04 -4.6 -1.29 1.28 -0.13 -0.96 1.91 1.49 4.01 3.71 3.67 -3.15 -0.07 -0.73 0.1 -4.59 -2.83 - -8.76 -3.62 -3.8 -4.1 -3.48 -3.38 -7.11 -4.4 -3.38 -3.72 -3.22 -3.57 -3.18 -3.0 -5.62 -3.38 -4.41 -5.68 -5.47 -4.42 -4.11 -5.84 -4.53 -4.6 -5.07 -3.74 -9.35 -5.87 -6.79 -2.24 -5.06 -3.4 -5.15 -4.71 -5.88 -3.88 -3.84 -4.75 -3.38
1.7 1.38 0.46 -0.56 -1.21 0.85 -2.85 0.6 1.95 2.43 2.22 2.26 -0.07 -0.47 -0.54 -0.7 -8.22 0.36 0.32 0.65 -3.74 -0.56 -2.89 -3.45 -3.54 -2.66 -3.16 -3.67 -3.78 -3.97 -2.87 -2.96 -2.88 -1.97 0.31 0.16 0.37 0.36 0.35 0.37 0.65 0.38 0.6 -0.29 0.56 -1.95 -4.21 -2.01 -0.99 -1.55 -0.72 -1.54 -1.92 -2.66 -4.26 -3.26 -4.05 0.07
1.51 - 0.06 - - - - - 1.26 4.38 3.91 3.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 5.27 4.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 3.65 3.99 4.88 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.61 -0.66 1.01 - - - - - 3.12 3.53 3.35 3.41 - - - - - - -0.21 -0.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -3.37 - - - - 3.49
- - - - - - - - - 4.23 4.23 4.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 3.87 3.38 5.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.84 - - - - - 3.27 4.02 3.86 3.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -3.88 - - - - -
- - - - - - - - - - 4.87 4.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.39 4.48 3.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.12 2.97 5.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -1.33 - - - - - 0.28 4.21 4.16 4.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.46 4.25 4.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - -0.58 4.23 4.47 4.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 5.1 2.89 4.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.34 4.79 3.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.5 4.38 3.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.17 1.14 -0.54 -2.56 1.24 - 1.07 1.28 2.75 3.36 3.3 3.17 -1.7 -2.84 -3.46 -1.84 - 1.01 -0.04 1.05 - -3.72 - - - - -5.86 - - - - - - -1.16 -2.41 -1.98 -3.04 -2.47 -3.54 -1.5 -2.55 -2.08 -4.41 -1.51 -2.3 -3.97 - -5.02 -2.4 - - -2.39 -2.94 -2.36 - - - -0.71
0.16 -2.39 0.0 -0.45 2.36 - -1.14 0.94 3.64 3.26 3.11 3.24 -2.4 -3.45 -3.26 -2.52 - -0.43 -1.98 -2.45 - - - - - - - - - - - - - -0.96 - - - - - - - -5.22 - - - - - -2.98 -1.42 - - -0.69 -1.84 -1.07 - - - 1.69
- - - 0.55 - - - 1.45 3.39 3.94 3.83 3.63 - - -2.73 -3.84 - 0.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.05 -0.69 - - - - - -0.46 3.95 4.02 4.46 - - - - - - - 0.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -0.99 - - 1.92 3.74 3.65 3.71 3.71 - - - -0.89 - 0.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 5.03 4.51 1.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.73 4.12 3.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 0.22 - - - - - 0.95 3.99 4.14 4.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.28
- - - - - - - - - 4.14 4.14 4.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 0.34 4.32 4.16 4.21 - - - -5.55 - - - - - - - - - - - - -3.32 - - - - - - - - - - - - -6.73 - - - - - - -2.4 - - - -5.04 - - - - -
- - - - - - - - - 2.7 5.07 4.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 2.8 4.09 4.06 4.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.1 4.22 4.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 4.84 4.88 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.11 4.35 4.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.81 - 4.91 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.26 4.28 4.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.94 1.96 4.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - 2.92 5.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 0.41 4.27 4.22 4.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.28 4.17 4.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -6.7 -3.03 - -0.99 - -2.95 2.0 4.23 4.02 4.13 -4.08 -4.48 -4.4 -5.23 - - - - - - - - - - -6.22 - - - - - - - - - - - -2.33 -3.97 - -7.27 - - -3.28 -2.98 - - -4.52 - - - -6.97 - - - - -
- - - - - - - - - 3.68 4.17 4.76 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 1.99 3.92 3.04 4.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.68 - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 4.08 3.86 4.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 5.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - 5.22 4.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.