Heatmap: Cluster_178 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Egg apparatus cell (small)	Egg apparatus cell (medium)	Egg apparatus cell (large)	Ovary	Uninuclear microspore	Generative cell	Pollen	Sperm	Pollen tube (bicellular)	Pollen tube (tricellular)	Flower (bud, female)	Flower (bud, male)	Flower (female)	Flower (male)	Flower (tepals)	Fruit (female)	Apical meristem	Shoot (female)	Shoot (male)	Leaf (male)	Leaves	Root (male)
AMTR_s00002p00143910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.106)	0.44	1.0	0.41	0.07	0.15	0.01	0.02	0.0	0.07	0.06	0.19	0.23	0.19	0.13	0.11	0.28	0.23	0.14	0.15	0.21	0.18	0.23
AMTR_s00002p00260590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.445)	1.0	0.88	0.33	0.1	0.17	0.01	0.03	0.09	0.11	0.12	0.42	0.47	0.28	0.3	0.27	0.23	0.51	0.27	0.29	0.34	0.11	0.49
AMTR_s00003p00103470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.68)	0.37	1.0	0.06	0.02	0.16	0.02	0.05	0.08	0.09	0.05	0.24	0.17	0.2	0.12	0.14	0.09	0.26	0.1	0.06	0.04	0.04	0.15
AMTR_s00005p00187550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00005.68)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.01	0.0	0.57	0.21	0.33	0.22	0.12	0.02	0.01	0.0	0.96	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56
AMTR_s00006p00131670 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.50)	1.0	0.7	0.26	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.06	0.07	0.35	0.15	0.06	0.05	0.07	0.04	0.04	0.04	0.06
AMTR_s00006p00250170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.148)	0.4	0.32	0.59	0.16	0.07	0.15	0.35	0.13	1.0	0.63	0.29	0.26	0.26	0.12	0.13	0.23	0.57	0.33	0.21	0.12	0.06	0.15
AMTR_s00006p00251640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.156)	0.11	1.0	0.15	0.15	0.06	0.01	0.04	0.0	0.21	0.12	0.29	0.24	0.18	0.18	0.09	0.1	0.21	0.19	0.19	0.17	0.11	0.21
AMTR_s00007p00250850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.283)	0.88	1.0	0.23	0.09	0.13	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.2	0.21	0.14	0.14	0.04	0.62	0.08	0.19	0.16	0.26	0.18	0.29
AMTR_s00009p00257620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.295)	1.0	1.0	0.36	0.01	0.25	0.0	0.0	0.21	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00010p00099690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.55)	1.0	0.55	0.46	0.05	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
AMTR_s00012p00082210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.36)	1.0	0.41	0.9	0.0	0.06	0.02	0.1	0.15	0.44	0.16	0.36	0.09	0.06	0.02	0.01	0.01	0.2	0.13	0.06	0.0	0.01	0.21
AMTR_s00013p00072590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.32)	0.69	1.0	0.24	0.0	0.21	0.0	0.06	0.0	0.13	0.1	0.53	0.16	0.31	0.19	0.1	0.21	0.53	0.18	0.18	0.18	0.09	0.24
AMTR_s00016p00159040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.116)	0.7	0.52	0.0	0.02	0.09	0.0	0.17	0.1	0.35	0.25	0.41	0.43	0.47	0.55	0.4	0.16	1.0	0.47	0.41	0.44	0.25	0.67
AMTR_s00017p00041150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.15)	0.41	0.46	1.0	0.04	0.05	0.01	0.2	0.09	0.44	0.28	0.15	0.17	0.07	0.08	0.13	0.01	0.34	0.05	0.04	0.01	0.01	0.34
AMTR_s00017p00203890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.123)	0.15	1.0	0.14	0.0	0.02	0.01	0.0	0.02	0.01	0.01	0.04	0.06	0.03	0.01	0.01	0.06	0.09	0.09	0.08	0.08	0.05	0.21
AMTR_s00017p00239550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.211)	0.67	0.02	0.66	0.12	0.04	0.01	0.33	0.06	0.53	0.48	0.44	0.49	0.22	0.19	0.06	0.12	1.0	0.2	0.14	0.27	0.08	0.15
AMTR_s00019p00170070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.169)	1.0	0.93	0.59	0.04	0.26	0.15	0.3	0.04	0.44	0.44	0.44	0.59	0.57	0.51	0.13	0.18	0.38	0.27	0.24	0.21	0.18	0.53
AMTR_s00019p00251420 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.417)	0.7	1.0	0.0	0.08	0.05	0.0	0.03	0.09	0.21	0.13	0.51	0.4	0.36	0.2	0.09	0.08	0.38	0.32	0.15	0.11	0.04	0.59
AMTR_s00023p00112140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.57)	0.21	1.0	0.07	0.05	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.23	0.15	0.15	0.08	0.07	0.12	0.28	0.16	0.14	0.23	0.23	0.11
AMTR_s00024p00233110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.254)	0.02	1.0	0.18	0.04	0.08	0.0	0.07	0.0	0.03	0.03	0.35	0.23	0.24	0.16	0.1	0.18	0.37	0.15	0.13	0.18	0.13	0.11
AMTR_s00024p00234030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.256)	0.34	1.0	0.45	0.2	0.15	0.12	0.09	0.01	0.07	0.08	0.4	0.19	0.23	0.16	0.16	0.16	0.51	0.05	0.08	0.1	0.03	0.24
AMTR_s00027p00219390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00027.84)	0.82	1.0	0.85	0.03	0.25	0.01	0.15	0.05	0.53	0.48	0.35	0.38	0.36	0.27	0.23	0.21	0.46	0.49	0.33	0.16	0.17	0.39
AMTR_s00033p00038120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.15)	0.89	1.0	0.16	0.01	0.08	0.0	0.17	0.04	0.22	0.18	0.32	0.31	0.23	0.23	0.17	0.11	0.18	0.15	0.16	0.06	0.14	0.19
AMTR_s00033p00232580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.232)	0.96	0.72	0.0	0.11	0.38	0.02	0.56	0.0	0.42	0.46	1.0	0.75	0.73	0.54	0.34	0.57	0.55	0.53	0.33	0.68	0.43	0.48
AMTR_s00034p00211880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00034.82)	0.14	1.0	0.72	0.19	0.23	0.0	0.09	0.06	0.15	0.11	0.43	0.45	0.23	0.21	0.18	0.29	0.41	0.28	0.56	0.21	0.14	0.2
AMTR_s00034p00211890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00034.83)	0.0	1.0	1.0	0.02	0.23	0.02	0.06	0.0	0.11	0.08	0.53	0.37	0.14	0.16	0.14	0.21	0.48	0.23	0.3	0.21	0.06	0.13
AMTR_s00037p00221920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00037.127)	1.0	0.65	0.02	0.05	0.33	0.0	0.36	0.0	0.37	0.37	0.51	0.45	0.43	0.31	0.15	0.35	0.48	0.18	0.24	0.26	0.34	0.45
AMTR_s00039p00107450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00039.61)	0.88	1.0	0.92	0.0	0.17	0.01	0.14	0.09	0.27	0.26	0.18	0.22	0.22	0.25	0.37	0.24	0.26	0.19	0.13	0.38	0.17	0.27
AMTR_s00043p00204240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00043.66)	0.79	1.0	0.0	0.14	0.38	0.0	0.34	0.0	0.35	0.4	0.62	0.34	0.29	0.33	0.41	0.16	0.45	0.52	0.49	0.56	0.22	0.62
AMTR_s00044p00150270 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.154)	0.68	1.0	0.05	0.05	0.2	0.13	0.38	0.22	0.34	0.32	0.35	0.61	0.33	0.32	0.27	0.17	0.35	0.32	0.25	0.26	0.19	0.41
AMTR_s00045p00154250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.166)	1.0	0.69	0.48	0.16	0.19	0.07	0.03	0.0	0.1	0.09	0.29	0.21	0.15	0.17	0.18	0.13	0.42	0.13	0.14	0.23	0.05	0.24
AMTR_s00045p00194650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.250)	0.0	1.0	0.0	0.01	0.13	0.0	0.03	0.0	0.05	0.05	0.29	0.09	0.27	0.08	0.07	0.04	0.17	0.07	0.08	0.1	0.11	0.15
AMTR_s00049p00144890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.125)	0.31	1.0	0.18	0.18	0.12	0.01	0.13	0.06	0.17	0.16	0.29	0.29	0.33	0.24	0.13	0.17	0.42	0.21	0.16	0.14	0.1	0.33
AMTR_s00054p00051700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00054.20)	0.99	0.57	0.83	0.35	0.4	0.62	0.48	0.41	0.82	0.8	0.74	0.66	0.59	0.48	0.32	0.71	1.0	0.58	0.51	0.27	0.29	0.72
AMTR_s00058p00121880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.83)	0.76	1.0	0.28	0.07	0.61	0.05	0.62	0.09	0.37	0.41	0.67	0.71	0.69	0.79	0.43	0.47	0.51	0.39	0.47	0.55	0.15	0.69
AMTR_s00061p00126570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.102)	0.61	1.0	0.47	0.03	0.19	0.04	0.18	0.1	0.36	0.25	0.32	0.25	0.22	0.24	0.17	0.06	0.36	0.36	0.24	0.1	0.1	0.11
AMTR_s00061p00162330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.154)	1.0	0.27	0.63	0.01	0.14	0.01	0.11	0.01	0.64	0.29	0.35	0.36	0.2	0.02	0.06	0.02	0.97	0.22	0.27	0.05	0.04	0.21
AMTR_s00062p00017730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.3)	0.75	1.0	0.62	0.2	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.01	0.05	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.19	0.0	0.0
AMTR_s00062p00021100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.5)	0.98	1.0	0.53	0.06	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.04	0.01	0.03	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.11	0.0	0.0
AMTR_s00066p00112310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.103)	1.0	0.75	0.4	0.04	0.14	0.01	0.06	0.01	0.1	0.11	0.16	0.42	0.07	0.12	0.15	0.08	0.09	0.09	0.07	0.09	0.06	0.13
AMTR_s00067p00108200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00067.87)	0.4	0.18	1.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.11	0.32	0.1	0.2	0.23	0.02	0.0	0.01	0.0	0.43	0.03	0.0	0.0	0.0	0.08
AMTR_s00067p00169770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00067.173)	1.0	0.96	0.57	0.01	0.16	0.13	0.19	0.08	0.34	0.26	0.08	0.11	0.03	0.16	0.13	0.01	0.07	0.06	0.04	0.1	0.05	0.08
AMTR_s00068p00156710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00068.107)	1.0	0.51	0.44	0.16	0.03	0.01	0.0	0.0	0.03	0.04	0.11	0.07	0.11	0.06	0.07	0.02	0.05	0.05	0.05	0.04	0.02	0.09
AMTR_s00075p00154970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00075.45)	0.71	1.0	0.47	0.03	0.18	0.0	0.22	0.06	0.22	0.23	0.31	0.35	0.21	0.19	0.1	0.23	0.16	0.19	0.2	0.17	0.22	0.14
AMTR_s00077p00191360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.228)	1.0	0.91	0.52	0.09	0.2	0.17	0.18	0.05	0.13	0.11	0.1	0.13	0.09	0.29	0.19	0.04	0.07	0.12	0.09	0.1	0.06	0.06
AMTR_s00099p00039670 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00099.25)	1.0	0.48	0.17	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.11	0.0	0.0	0.06	0.0	0.05
AMTR_s00099p00064830 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00099.44)	1.0	0.77	0.53	0.09	0.02	0.01	0.02	0.03	0.06	0.07	0.03	0.01	0.01	0.17	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.0	0.01
AMTR_s00102p00039710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00102.11)	0.67	0.62	0.75	0.06	0.23	0.02	0.3	0.34	0.4	0.38	0.66	0.57	0.68	0.36	0.49	0.35	0.83	0.47	0.29	0.3	0.26	1.0
AMTR_s00106p00069950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00106.44)	0.51	0.45	0.5	0.24	0.1	0.39	0.29	0.03	1.0	0.77	0.36	0.5	0.23	0.26	0.19	0.26	0.27	0.25	0.23	0.3	0.18	0.32
AMTR_s00127p00049350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00127.11)	0.69	1.0	0.53	0.0	0.04	0.0	0.01	0.0	0.03	0.06	0.05	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.08	0.07	0.04	0.04
AMTR_s00200p00021070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00200.8)	0.85	0.3	0.25	0.05	0.08	0.1	0.35	0.09	1.0	0.44	0.27	0.39	0.31	0.32	0.12	0.08	0.93	0.21	0.16	0.12	0.04	0.22
AMTR_s00234p00015090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00234.2)	1.0	0.55	0.62	0.17	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.08	0.04	0.03	0.06	0.01	0.01	0.0	0.01	0.14	0.01	0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)