Heatmap: Cluster_258 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00002p00272090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.661)
0.06 0.0 0.3 0.08 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.86 1.0 0.14 0.06 0.05 0.22 0.36 0.27 0.2 0.1 0.14 0.21
AMTR_s00010p00190960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.172)
0.61 0.06 0.51 0.36 0.29 0.09 0.03 0.06 0.1 0.07 1.0 0.62 0.6 0.22 0.46 0.29 0.95 0.61 0.47 0.25 0.25 0.48
AMTR_s00011p00219510 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00011.94)
0.09 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.59 0.08 0.08 0.01 0.13 0.21 0.39 0.45 0.07 0.28 0.08
AMTR_s00011p00264790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00011.215)
0.36 0.09 0.44 0.36 0.12 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 1.0 0.74 0.36 0.06 0.13 0.14 0.55 0.28 0.25 0.17 0.17 0.24
AMTR_s00012p00184040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.114)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.07 0.07 1.0 0.56 0.11 0.12 0.02 0.08 0.39 0.21 0.21 0.03 0.28 0.19
AMTR_s00012p00239180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.208)
0.21 0.04 0.05 0.03 0.12 0.0 0.13 0.03 0.09 0.13 1.0 0.47 0.33 0.11 0.12 0.19 0.65 0.34 0.38 0.37 0.21 0.16
AMTR_s00013p00187300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.118)
0.45 0.15 0.86 0.42 0.26 0.01 0.03 0.03 0.05 0.04 1.0 0.81 0.52 0.24 0.39 0.21 0.85 0.43 0.37 0.3 0.26 0.34
AMTR_s00014p00206750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00014.75)
0.02 0.0 0.0 0.23 0.24 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 1.0 0.63 0.31 0.15 0.1 0.19 0.49 0.43 0.57 0.3 0.08 0.31
AMTR_s00016p00166940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.126)
0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.65 0.25 0.0 0.03 0.48 0.81 0.38 0.29 0.06 0.02 0.25
AMTR_s00016p00258500 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.358)
0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.7 0.08 0.02 0.02 0.04 0.26 0.24 0.29 0.2 0.1 0.05
AMTR_s00021p00199620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.164)
0.51 0.17 0.9 0.39 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.99 0.2 0.15 0.24 0.01 0.79 0.62 0.44 0.05 0.02 0.33
AMTR_s00023p00231010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.186)
0.0 0.0 0.78 0.2 0.17 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.89 0.71 0.46 0.33 0.32 0.28 1.0 0.57 0.61 0.22 0.34 0.28
AMTR_s00024p00237440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.267)
0.04 0.09 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.78 0.17 0.01 0.03 0.02 0.55 0.08 0.08 0.06 0.03 0.02
AMTR_s00025p00198750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.251)
0.55 0.18 0.36 0.07 0.12 0.03 0.07 0.08 0.15 0.18 1.0 0.95 0.39 0.25 0.21 0.22 0.38 0.62 0.64 0.6 0.5 0.52
AMTR_s00026p00131400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00026.58)
0.94 0.0 0.0 0.01 0.28 0.02 0.11 0.07 0.16 0.14 1.0 0.58 0.27 0.23 0.14 0.26 0.18 0.17 0.41 0.17 0.19 0.23
AMTR_s00030p00146410 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.93)
0.05 0.54 0.17 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.51 0.11 0.0 0.01 0.0 0.29 0.59 0.11 0.03 0.15 0.16
AMTR_s00030p00186860 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.119)
0.08 0.35 0.3 0.08 0.03 0.2 0.21 0.19 0.2 0.21 1.0 0.59 0.23 0.11 0.11 0.26 0.48 0.55 0.39 0.15 0.12 0.3
AMTR_s00033p00127000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.66)
0.3 0.31 0.64 0.11 0.05 0.01 0.06 0.0 0.07 0.06 1.0 0.65 0.19 0.18 0.06 0.18 0.52 0.31 0.3 0.15 0.23 0.16
AMTR_s00039p00237910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00039.230)
0.18 0.08 0.98 0.53 0.12 0.01 0.06 0.01 0.06 0.05 1.0 0.78 0.4 0.16 0.18 0.22 0.83 0.56 0.41 0.38 0.31 0.42
AMTR_s00048p00196650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.161)
0.16 0.0 0.01 0.07 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 1.0 0.64 0.39 0.08 0.23 0.72 0.57 0.23 0.17 0.07 0.03 0.3
AMTR_s00049p00203600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.220)
0.1 0.12 0.04 0.02 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 1.0 0.49 0.18 0.03 0.03 0.04 0.49 0.26 0.3 0.07 0.2 0.31
AMTR_s00052p00146690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00052.52)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.75 0.15 0.05 0.04 0.15 0.58 0.47 0.25 0.26 0.21 0.2
AMTR_s00053p00090160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00053.46)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 1.0 0.71 0.28 0.04 0.09 0.16 0.39 0.21 0.79 0.24 0.37 0.2
AMTR_s00056p00029160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.15)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.53 0.05 0.0 0.0 0.0 0.28 0.17 0.22 0.11 0.05 0.55
AMTR_s00056p00030070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.16)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 1.0 0.41 0.03 0.0 0.01 0.0 0.23 0.24 0.22 0.11 0.0 0.34
AMTR_s00056p00069610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.46)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.22 0.01 0.01 1.0 0.51 0.25 0.04 0.02 0.15 0.46 0.59 0.51 0.07 0.13 0.28
AMTR_s00057p00077370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.48)
0.39 0.48 0.1 0.36 0.08 0.01 0.01 0.03 0.06 0.02 0.96 0.66 0.19 0.04 0.26 0.03 1.0 0.73 0.41 0.17 0.12 0.17
AMTR_s00059p00170320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.165)
0.02 0.33 0.18 0.05 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.69 0.45 0.13 0.12 0.22 0.62 0.59 0.57 0.18 0.17 0.32
AMTR_s00061p00138150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.116)
0.0 0.55 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.43 0.05 0.0 0.01 0.01 0.4 0.12 0.15 0.04 0.03 0.12
AMTR_s00065p00212850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00065.213)
0.17 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.07 0.0 0.12 0.09 1.0 0.5 0.1 0.03 0.02 0.06 0.49 0.23 0.24 0.04 0.06 0.1
AMTR_s00067p00148600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00067.141)
0.23 0.06 0.08 0.13 0.18 0.0 0.08 0.14 0.1 0.11 1.0 0.74 0.43 0.35 0.09 0.24 0.34 0.77 0.66 0.26 0.26 0.19
AMTR_s00069p00204810 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.224)
0.64 0.72 0.49 0.08 0.14 0.01 0.03 0.0 0.03 0.03 1.0 0.81 0.38 0.13 0.21 0.18 0.47 0.53 0.55 0.49 0.21 0.32
AMTR_s00072p00119650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00072.60)
0.04 0.26 0.3 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.43 0.13 0.0 0.04 0.09 0.43 0.31 0.22 0.12 0.17 0.21
AMTR_s00086p00040290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00086.18)
0.0 0.0 0.0 0.3 0.13 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.58 0.2 0.01 0.02 0.0 0.52 0.08 0.03 0.02 0.3 0.0
AMTR_s00086p00173170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00086.110)
0.02 0.01 0.16 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.45 0.1 0.0 0.01 0.01 0.29 0.12 0.32 0.23 0.45 0.0
AMTR_s00089p00149830 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00089.85)
0.77 0.47 0.3 0.03 0.12 0.01 0.03 0.0 0.04 0.03 1.0 0.43 0.19 0.17 0.1 0.25 0.28 0.13 0.12 0.09 0.11 0.11
AMTR_s00092p00120720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.84)
0.0 0.23 0.0 0.06 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.71 0.34 0.19 0.11 0.17 0.49 0.56 0.56 0.16 0.21 0.37
AMTR_s00095p00032720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00095.13)
0.19 0.11 0.0 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.35 0.15 0.0 0.02 0.17 0.25 0.31 0.16 0.04 0.04 0.39
AMTR_s00109p00126330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00109.128)
0.47 0.29 0.27 0.04 0.24 0.0 0.02 0.0 0.04 0.04 1.0 0.69 0.35 0.29 0.15 0.15 0.31 0.24 0.45 0.21 0.1 0.36
AMTR_s00116p00025230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00116.2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.62 0.24 0.0 0.16 0.28 0.29 0.54 0.09 0.02 0.0 0.12
AMTR_s00129p00087850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00129.63)
0.37 0.03 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.53 0.25 0.05 0.03 0.04 0.29 0.11 0.08 0.04 0.04 0.23
AMTR_s00130p00074440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00130.32)
0.55 0.36 0.4 0.01 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.79 0.22 0.08 0.13 0.3 0.45 0.36 0.27 0.09 0.13 0.28
AMTR_s00138p00056480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00138.27)
0.85 0.72 0.0 0.3 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.93 0.3 0.03 0.18 0.09 0.9 0.63 0.45 0.32 0.26 0.56
AMTR_s00152p00086970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00152.34)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.76 0.11 0.03 0.03 0.0 0.41 0.22 0.11 0.0 0.2 0.15
AMTR_s00154p00033550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00154.14)
0.0 0.85 0.11 0.47 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.75 0.04 0.0 0.07 0.0 0.19 0.22 0.08 0.02 0.0 0.1
AMTR_s00218p00018510 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00218.4)
0.01 0.11 0.16 0.14 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.62 0.34 0.06 0.14 0.16 0.55 0.08 0.09 0.03 0.04 0.37
AMTR_s00474p00009440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00474.1)
0.74 0.4 0.36 0.11 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.44 0.16 0.05 0.06 0.02 0.72 0.23 0.11 0.03 0.01 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)