Heatmap: Cluster_135 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Egg apparatus cell (small)	Egg apparatus cell (medium)	Egg apparatus cell (large)	Ovary	Uninuclear microspore	Generative cell	Pollen	Sperm	Pollen tube (bicellular)	Pollen tube (tricellular)	Flower (bud, female)	Flower (bud, male)	Flower (female)	Flower (male)	Flower (tepals)	Fruit (female)	Apical meristem	Shoot (female)	Shoot (male)	Leaf (male)	Leaves	Root (male)
AMTR_s00001p00070870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.46)	0.45	1.0	0.38	0.0	0.58	0.09	0.25	0.23	0.19	0.2	0.46	0.43	0.33	0.38	0.36	0.58	0.21	0.22	0.43	0.24	0.16	0.29
AMTR_s00001p00230390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.243)	0.08	0.0	1.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.04
AMTR_s00002p00263090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.473)	0.91	1.0	0.84	0.05	0.55	0.33	0.08	0.07	0.1	0.12	0.44	0.44	0.45	0.59	0.42	0.73	0.29	0.49	0.58	0.43	0.26	0.36
AMTR_s00002p00269620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.552)	0.78	1.0	0.62	0.12	0.47	0.01	0.05	0.06	0.15	0.12	0.24	0.26	0.3	0.26	0.4	0.13	0.13	0.19	0.18	0.15	0.1	0.23
AMTR_s00003p00042000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.24)	0.96	1.0	0.94	0.33	0.48	0.14	0.17	0.03	0.18	0.15	0.63	0.43	0.6	0.61	0.94	0.51	0.43	0.41	0.37	0.47	0.23	0.58
AMTR_s00003p00093660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.57)	0.36	0.76	0.42	0.29	0.76	0.23	0.14	0.0	0.1	0.09	0.41	0.25	0.46	0.71	1.0	0.35	0.27	0.14	0.18	0.24	0.08	0.23
AMTR_s00004p00059320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.40)	0.34	0.29	1.0	0.2	0.51	0.02	0.03	0.0	0.05	0.06	0.37	0.89	0.31	0.88	0.34	0.09	0.17	0.23	0.21	0.46	0.23	0.64
AMTR_s00004p00065720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.49)	0.41	0.54	1.0	0.06	0.35	0.01	0.03	0.01	0.09	0.08	0.2	0.54	0.1	0.06	0.51	0.24	0.12	0.1	0.04	0.05	0.09	0.09
AMTR_s00004p00260240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.253)	0.44	0.76	1.0	0.1	0.79	0.11	0.16	0.04	0.21	0.24	0.33	0.44	0.43	0.43	0.66	0.39	0.32	0.33	0.33	0.3	0.08	0.34
AMTR_s00006p00259390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.216)	0.2	0.35	1.0	0.04	0.45	0.21	0.08	0.04	0.09	0.08	0.24	0.47	0.28	0.17	0.28	0.3	0.15	0.19	0.19	0.15	0.09	0.3
AMTR_s00008p00085400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00008.29)	0.36	1.0	0.62	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.16	0.31	0.47	0.29	0.62	0.18	0.13	0.06	0.08	0.15	0.1	0.09
AMTR_s00009p00243600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.227)	0.37	0.61	1.0	0.11	0.35	0.03	0.24	0.34	0.29	0.28	0.36	0.52	0.27	0.4	0.22	0.28	0.21	0.36	0.34	0.17	0.21	0.28
AMTR_s00014p00253070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00014.136)	1.0	0.65	0.48	0.23	0.84	0.32	0.17	0.02	0.13	0.14	0.55	0.59	0.44	0.68	1.0	0.75	0.53	0.22	0.23	0.22	0.14	0.24
AMTR_s00016p00157750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.113)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.3	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.14	0.02	0.0	0.26	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02
AMTR_s00018p00174580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00018.97)	0.61	1.0	0.64	0.26	0.64	0.08	0.09	0.09	0.07	0.09	0.38	0.32	0.36	0.31	0.35	0.12	0.18	0.15	0.14	0.12	0.04	0.21
AMTR_s00019p00250990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.414)	0.21	0.34	1.0	0.07	0.24	0.07	0.17	0.0	0.15	0.14	0.24	0.34	0.38	0.5	0.13	0.17	0.25	0.22	0.24	0.13	0.16	0.27
AMTR_s00021p00249390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.278)	0.0	0.66	1.0	0.0	0.42	0.0	0.06	0.0	0.06	0.04	0.26	0.58	0.22	0.16	0.25	0.25	0.11	0.09	0.15	0.14	0.04	0.15
AMTR_s00022p00120000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.112)	0.58	1.0	0.9	0.11	0.49	0.11	0.03	0.11	0.21	0.17	0.46	0.56	0.11	0.16	0.4	0.08	0.07	0.33	0.13	0.11	0.05	0.12
AMTR_s00022p00228120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.301)	0.39	0.75	1.0	0.09	0.48	0.03	0.08	0.13	0.1	0.09	0.26	0.25	0.37	0.3	0.37	0.37	0.16	0.34	0.44	0.23	0.21	0.42
AMTR_s00029p00200280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.280)	0.0	0.87	1.0	0.44	0.32	0.02	0.06	0.2	0.09	0.1	0.55	0.38	0.54	0.51	0.57	0.4	0.48	0.3	0.44	0.53	0.33	0.44
AMTR_s00033p00101470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.45)	0.0	0.73	0.84	0.0	0.32	0.0	0.01	0.0	0.13	0.09	0.0	0.0	0.21	0.74	1.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.35	0.0	0.39
AMTR_s00033p00119410 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.58)	0.14	1.0	0.38	0.0	0.43	0.44	0.01	0.0	0.02	0.02	0.17	0.11	0.1	0.29	0.25	0.84	0.08	0.23	0.26	0.13	0.22	0.31
AMTR_s00036p00218590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00036.151)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00041p00158160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.111)	0.16	1.0	0.92	0.17	0.43	0.01	0.11	0.03	0.1	0.13	0.4	0.24	0.28	0.76	0.79	0.3	0.26	0.26	0.26	0.29	0.17	0.27
AMTR_s00041p00232290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.276)	0.53	1.0	0.81	0.02	0.59	0.21	0.2	0.09	0.21	0.25	0.38	0.41	0.39	0.39	0.46	0.52	0.21	0.37	0.36	0.27	0.31	0.42
AMTR_s00044p00174020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.191)	1.0	0.75	0.51	0.0	0.34	0.01	0.03	0.0	0.04	0.04	0.24	0.2	0.48	0.31	0.33	0.21	0.53	0.13	0.11	0.07	0.1	0.32
AMTR_s00045p00037700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.15)	0.21	1.0	0.58	0.04	0.81	0.33	0.29	0.06	0.37	0.32	0.55	0.51	0.49	0.67	0.68	0.49	0.57	0.51	0.39	0.32	0.29	0.33
AMTR_s00045p00175590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.210)	0.21	0.85	1.0	0.0	0.45	0.02	0.13	0.15	0.11	0.11	0.39	0.38	0.27	0.55	0.34	0.38	0.19	0.37	0.33	0.31	0.18	0.31
AMTR_s00045p00228140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.330)	0.19	0.81	1.0	0.32	0.3	0.01	0.08	0.08	0.15	0.1	0.55	0.31	0.33	0.37	0.58	0.28	0.49	0.33	0.28	0.29	0.46	0.25
AMTR_s00045p00230850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.334)	0.33	0.36	1.0	0.08	0.09	0.01	0.0	0.04	0.0	0.01	0.05	0.1	0.2	0.56	0.34	0.07	0.03	0.01	0.03	0.26	0.05	0.19
AMTR_s00053p00036280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00053.15)	1.0	0.69	0.6	0.04	0.48	0.03	0.13	0.02	0.15	0.15	0.29	0.35	0.32	0.22	0.44	0.16	0.24	0.15	0.16	0.19	0.11	0.29
AMTR_s00053p00144400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00053.91)	0.36	1.0	0.94	0.22	0.67	0.43	0.07	0.07	0.06	0.06	0.53	0.47	0.65	0.53	0.5	0.46	0.29	0.59	0.65	0.66	0.33	0.61
AMTR_s00056p00105160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.77)	1.0	0.97	0.74	0.09	0.53	0.02	0.25	0.07	0.28	0.38	0.35	0.48	0.47	0.34	0.38	0.28	0.31	0.33	0.31	0.25	0.2	0.35
AMTR_s00058p00173040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.161)	0.39	0.38	1.0	0.01	0.55	0.0	0.08	0.0	0.13	0.12	0.18	0.46	0.34	0.22	0.29	0.24	0.21	0.37	0.19	0.25	0.41	0.3
AMTR_s00067p00144730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00067.136)	0.04	0.61	1.0	0.0	0.69	0.03	0.05	0.08	0.06	0.07	0.23	0.24	0.42	0.41	0.43	0.34	0.35	0.16	0.15	0.1	0.1	0.25
AMTR_s00070p00200840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00070.138)	0.32	0.91	0.64	0.34	0.55	0.24	0.15	0.07	0.08	0.08	0.33	0.29	0.26	0.21	0.48	1.0	0.26	0.34	0.37	0.33	0.17	0.2
AMTR_s00071p00062380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00071.34)	0.12	0.77	1.0	0.02	0.79	0.01	0.16	0.29	0.16	0.15	0.28	0.41	0.5	0.27	0.21	0.19	0.33	0.22	0.31	0.19	0.12	0.25
AMTR_s00078p00032530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.11)	0.07	1.0	0.51	0.08	0.1	0.69	0.14	0.01	0.21	0.13	0.0	0.13	0.22	0.28	0.34	0.35	0.18	0.11	0.11	0.29	0.2	0.23
AMTR_s00078p00121310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.96)	0.24	0.23	1.0	0.01	0.18	0.0	0.01	0.02	0.03	0.03	0.31	0.32	0.37	0.98	0.29	0.29	0.26	0.2	0.23	0.28	0.11	0.31
AMTR_s00092p00050170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.21)	0.1	0.78	1.0	0.07	0.18	0.01	0.1	0.07	0.11	0.18	0.16	0.34	0.15	0.84	0.51	0.16	0.07	0.1	0.18	0.35	0.16	0.13
AMTR_s00092p00114580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.74)	0.35	1.0	0.75	0.4	0.4	0.34	0.29	0.0	0.25	0.22	0.45	0.32	0.28	0.4	0.65	0.38	0.36	0.32	0.29	0.43	0.32	0.23
AMTR_s00097p00117970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00097.27)	0.75	1.0	0.72	0.16	0.27	0.02	0.15	0.01	0.15	0.16	0.21	0.2	0.39	0.39	0.52	0.3	0.33	0.16	0.21	0.44	0.12	0.23
AMTR_s00122p00108900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00122.48)	1.0	0.86	0.64	0.11	0.43	0.01	0.04	0.0	0.09	0.06	0.22	0.16	0.52	0.26	0.62	0.2	0.49	0.16	0.19	0.27	0.12	0.22
AMTR_s00130p00050470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00130.19)	0.0	1.0	0.42	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.01	0.1	0.0	0.0	0.1	0.11	0.01	0.0	0.11
AMTR_s00133p00097780 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00133.43)	0.63	0.26	1.0	0.01	0.69	0.02	0.15	0.2	0.23	0.27	0.54	0.67	0.6	0.89	0.72	0.34	0.25	0.52	0.38	0.28	0.26	0.38
AMTR_s00133p00113640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00133.58)	0.74	1.0	0.74	0.03	0.67	0.0	0.05	0.0	0.07	0.06	0.31	0.26	0.32	0.22	0.55	0.17	0.28	0.28	0.22	0.16	0.2	0.24
AMTR_s00135p00087760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00135.44)	0.3	1.0	0.21	0.19	0.54	0.0	0.03	0.04	0.05	0.06	0.27	0.23	0.24	0.32	0.62	0.14	0.17	0.03	0.02	0.02	0.04	0.15
AMTR_s00165p00063860 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00165.41)	0.4	1.0	0.49	0.08	0.65	0.21	0.1	0.08	0.08	0.1	0.38	0.43	0.51	0.39	0.34	0.4	0.21	0.28	0.38	0.35	0.12	0.32
AMTR_s00169p00043580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00169.26)	0.05	0.66	1.0	0.0	0.32	0.0	0.03	0.08	0.03	0.02	0.35	0.38	0.16	0.15	0.12	0.3	0.17	0.31	0.24	0.12	0.13	0.17
AMTR_s00182p00027270 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00182.10)	0.44	1.0	0.93	0.0	0.88	0.01	0.29	0.04	0.31	0.29	0.41	0.52	0.42	0.88	0.59	0.57	0.19	0.44	0.42	0.28	0.36	0.36

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)