Heatmap: Cluster_230 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00001p00218870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.226)
0.11 0.0 0.03 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 1.0 0.13 0.03 0.11 0.0 0.19 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0
AMTR_s00001p00242250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.279)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.74 1.0 0.25 0.03 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
AMTR_s00002p00230630 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.264)
0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 1.0 0.72 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00002p00269950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.566)
0.4 0.16 0.04 0.12 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.42 0.41 0.02 0.02 0.2 0.54 0.21 0.44 0.1 0.05 0.14
AMTR_s00003p00166850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.143)
0.32 0.0 1.0 0.11 0.41 0.0 0.04 0.06 0.07 0.05 1.0 0.93 0.28 0.35 0.28 0.38 0.33 0.28 0.26 0.2 0.37 0.26
AMTR_s00003p00204700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.192)
0.0 0.0 0.02 0.06 0.13 0.07 0.18 0.08 0.18 0.18 1.0 0.9 0.32 0.13 0.14 0.14 0.4 0.22 0.19 0.08 0.09 0.18
AMTR_s00003p00261400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.344)
0.86 0.0 0.88 0.01 0.4 0.01 0.04 0.02 0.04 0.04 0.3 0.6 0.29 0.06 0.06 1.0 0.24 0.09 0.1 0.07 0.09 0.42
AMTR_s00003p00271270 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.453)
0.39 0.51 0.18 0.42 0.19 0.0 0.18 0.01 0.17 0.17 1.0 0.75 0.71 0.53 0.36 0.51 0.59 0.39 0.42 0.37 0.22 0.47
AMTR_s00005p00139520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00005.44)
0.0 0.0 0.07 0.01 0.1 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 1.0 0.81 0.3 0.08 0.03 0.13 0.45 0.4 0.39 0.06 0.19 0.24
AMTR_s00005p00207120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00005.83)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.16 0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
AMTR_s00006p00257300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.197)
0.34 0.04 0.68 0.12 0.59 0.0 0.08 0.02 0.17 0.14 1.0 0.57 0.37 0.32 0.46 0.24 0.43 0.33 0.34 0.18 0.25 0.26
AMTR_s00007p00181450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.144)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.02 0.0 0.06 0.08 0.1 0.38 1.0 0.63 0.36 0.87 0.04 0.01 0.01 0.04 0.04 0.18
AMTR_s00008p00103090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00008.37)
0.0 0.03 0.0 0.77 0.05 0.57 0.03 0.08 0.08 0.06 1.0 0.85 0.46 0.03 0.14 0.15 0.56 0.32 0.16 0.1 0.33 0.1
AMTR_s00009p00076890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.24)
0.07 0.09 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.16 0.6 0.0 0.01 0.09 0.34 0.08 0.09 0.1 0.11 0.01
AMTR_s00009p00097980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.42)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.14 0.0 0.05 0.0 0.08 0.06 0.91 0.48 0.22 0.22 0.19 0.65 0.12 1.0 0.63 0.12 0.38 0.16
AMTR_s00009p00104890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.50)
0.0 0.0 0.0 0.02 0.11 0.0 0.02 0.0 0.07 0.03 0.27 0.37 0.13 0.12 0.11 0.13 1.0 0.32 0.08 0.13 0.73 0.14
AMTR_s00010p00242000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.312)
0.04 0.05 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.72 0.42 0.17 0.11 0.23 0.34 0.25 0.35 0.09 0.38 0.19
AMTR_s00010p00243760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.317)
0.22 0.0 0.0 0.48 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.54 0.27 1.0 0.58 0.28 0.85 0.2 0.54 0.55 0.73 0.35 0.04
AMTR_s00011p00100920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00011.28)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.21 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.87 0.76 0.2 0.19 0.05 0.25 0.76 1.0 0.34 0.04 0.08 0.38
AMTR_s00018p00255520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00018.169)
0.0 0.1 0.0 0.38 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.6 0.57 0.28 0.09 0.11 0.41 0.33 0.48 0.18 0.11 0.13
AMTR_s00019p00061190 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.39)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 1.0 0.06 0.02 0.1 0.35 0.21 0.1 0.27 0.23 0.17 0.05
AMTR_s00019p00168610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.167)
0.0 0.15 0.0 0.25 0.1 0.0 0.07 0.08 0.07 0.1 1.0 0.55 0.41 0.17 0.09 0.17 0.54 0.41 0.29 0.08 0.15 0.11
AMTR_s00019p00242980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.362)
0.08 0.29 0.14 0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 1.0 0.84 0.17 0.68 0.04 0.09 0.16 0.49 0.1 0.01
AMTR_s00019p00243070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.362)
0.06 0.0 0.03 0.13 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.09 0.92 0.47 0.1 1.0 0.06 0.14 0.16 0.4 0.19 0.0
AMTR_s00019p00245700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.381)
0.45 0.25 0.65 0.3 0.05 0.38 0.04 0.13 0.02 0.02 1.0 0.48 0.48 0.06 0.06 0.04 0.28 0.31 0.32 0.1 0.07 0.18
AMTR_s00021p00254030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.296)
0.52 0.55 0.46 0.15 0.3 0.0 0.03 0.06 0.04 0.04 0.77 0.61 1.0 0.85 0.42 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00023p00032550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.10)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.1 0.0 0.03 0.0 0.03 0.05 1.0 0.47 0.24 0.08 0.02 0.19 0.74 0.55 0.53 0.06 0.2 0.27
AMTR_s00024p00167140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.121)
0.14 0.07 0.04 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.19 1.0 0.85 0.3 0.13 0.0 0.02 0.05 0.04 0.04 0.01
AMTR_s00024p00237090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.265)
0.0 0.0 0.0 0.02 0.2 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 1.0 0.56 0.42 0.2 0.08 0.57 0.76 0.91 0.62 0.2 0.24 0.23
AMTR_s00025p00125190 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.115)
0.11 0.32 0.03 0.17 0.17 0.0 0.02 0.01 0.04 0.03 1.0 0.93 0.31 0.16 0.14 0.06 0.26 0.08 0.06 0.01 0.02 0.27
AMTR_s00027p00230930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00027.112)
0.01 0.0 0.0 0.19 0.3 0.0 0.28 0.01 0.16 0.16 1.0 0.66 0.44 0.42 0.25 0.28 0.36 0.61 0.57 0.56 0.27 0.27
AMTR_s00033p00073720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.30)
0.23 0.31 0.19 0.02 0.18 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 1.0 0.99 0.33 0.21 0.28 0.58 0.21 0.2 0.3 0.15 0.24 0.24
AMTR_s00034p00237620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00034.121)
0.16 0.09 0.11 0.09 0.18 0.36 0.35 0.28 0.41 0.49 0.61 0.45 0.78 0.41 0.22 0.13 1.0 0.26 0.28 0.28 0.08 0.48
AMTR_s00036p00058820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00036.16)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.19 0.02 0.17 0.22 1.0 0.57 0.24 0.08 0.06 0.05 0.26 0.07 0.12 0.02 0.09 0.16
AMTR_s00040p00100620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.63)
0.01 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 1.0 0.33 0.04 0.08 0.18 0.11 0.12 0.09 0.1 0.1 0.06
AMTR_s00040p00108280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.78)
0.0 0.09 0.15 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.59 0.46 0.14 0.05 0.0 0.01 0.56 0.18 0.13 0.04 0.11
AMTR_s00044p00016810 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.3)
0.01 0.5 0.06 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 1.0 0.03 0.02 0.06 0.0 0.23 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0
AMTR_s00044p00073920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.47)
0.0 0.1 0.01 0.1 0.13 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.76 0.62 0.32 0.33 0.47 0.73 0.35 0.17 0.07 0.05 0.16
AMTR_s00044p00093650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.65)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.14 0.0 0.26 0.24 0.32 0.09 0.6 0.11 0.1 0.0 1.0 0.18 0.08 0.28 0.16 0.26
AMTR_s00045p00214720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.299)
0.0 0.0 0.09 0.01 0.46 0.0 0.06 0.08 0.08 0.09 1.0 0.96 0.18 0.12 0.23 0.34 0.51 0.6 0.38 0.09 0.11 0.2
AMTR_s00047p00181740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00047.105)
0.15 0.09 0.11 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.7 0.22 0.2 0.37 0.02 0.15 0.5 0.25 0.11 0.11 0.01
AMTR_s00047p00190220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00047.121)
0.71 0.39 0.41 0.28 0.4 0.17 0.08 0.02 0.05 0.05 0.87 0.48 1.0 0.63 0.61 0.6 0.04 0.11 0.12 0.08 0.07 0.02
AMTR_s00055p00227100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00055.178)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.19 0.0 0.39 0.25 0.92 0.8 1.0 0.42 0.63 0.27 0.84 0.37 0.32 0.25 0.31 0.47
AMTR_s00061p00073800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.49)
0.0 0.2 0.01 0.06 0.02 0.0 0.16 0.04 0.08 0.12 1.0 0.53 0.15 0.04 0.19 0.12 0.34 0.09 0.07 0.01 0.06 0.11
AMTR_s00063p00184870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00063.65)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.1 0.0 0.02 0.0 0.02 0.03 1.0 0.47 0.09 0.01 0.07 0.02 0.18 0.08 0.01 0.07 0.0 0.11
AMTR_s00066p00029900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.7)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.04 0.0 0.11 0.13 0.28 0.62 0.36 0.22 0.17 0.08 1.0 0.22 0.05 0.2 0.39 0.16
AMTR_s00066p00109320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.97)
0.12 0.02 0.1 0.22 0.06 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.74 0.73 0.38 0.19 0.19 0.05 0.02 0.01 0.02 0.0 0.03
AMTR_s00066p00114470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.106)
0.63 0.33 0.64 0.15 0.42 0.29 0.14 0.08 0.14 0.19 0.44 0.41 0.48 0.47 0.23 1.0 0.27 0.25 0.19 0.14 0.1 0.47
AMTR_s00069p00101580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.65)
0.63 0.16 0.26 0.06 0.08 0.01 0.14 0.01 0.21 0.18 1.0 0.67 0.28 0.32 0.22 0.31 0.12 0.18 0.12 0.09 0.08 0.33
AMTR_s00071p00101710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00071.78)
0.28 0.0 0.0 0.04 0.2 0.0 0.16 0.0 0.19 0.17 1.0 0.95 0.32 0.2 0.14 0.17 0.45 0.37 0.3 0.09 0.15 0.21
AMTR_s00071p00157070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00071.145)
0.0 0.24 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.53 1.0 0.63 0.24 0.06 0.01 0.05 0.16 0.07 0.0 0.04
AMTR_s00071p00187920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00071.197)
0.48 0.12 0.45 0.38 0.52 0.03 0.12 0.05 0.18 0.17 1.0 0.84 0.64 0.44 0.45 0.53 0.67 0.53 0.54 0.21 0.26 0.64
AMTR_s00072p00092230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00072.41)
0.73 0.38 0.73 0.22 0.57 0.01 0.14 0.01 0.18 0.19 1.0 0.92 0.7 0.31 0.32 0.63 0.77 0.74 0.82 0.44 0.41 0.55
AMTR_s00077p00022100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.8)
0.67 0.0 0.84 0.03 0.46 0.43 0.03 0.0 0.05 0.05 0.96 1.0 0.45 0.68 0.45 0.7 0.51 0.26 0.16 0.14 0.2 0.32
AMTR_s00080p00043600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00080.10)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 1.0 0.12 0.0 0.1 0.0 0.14 0.3 0.09 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00087p00102660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00087.34)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.33 0.66 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.14 0.02 0.0 0.02
AMTR_s00088p00034420 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00088.16)
0.06 0.33 0.07 0.02 0.24 0.03 0.03 0.04 0.02 0.02 0.95 1.0 0.25 0.17 0.15 0.09 0.15 0.14 0.18 0.05 0.15 0.06
AMTR_s00088p00084700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00088.51)
0.0 0.0 0.13 0.02 0.27 0.0 0.02 0.0 0.02 0.03 1.0 0.8 0.19 0.1 0.12 0.6 0.61 0.98 0.45 0.12 0.33 0.18
AMTR_s00090p00174380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00090.107)
0.05 0.14 0.04 0.03 0.19 0.0 0.19 0.02 0.45 0.39 0.65 0.65 0.65 0.3 0.45 0.17 1.0 0.14 0.16 0.14 0.19 0.39
AMTR_s00092p00117150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.78)
0.11 0.51 0.2 0.04 0.16 0.0 0.04 0.02 0.1 0.08 0.93 1.0 0.89 0.58 0.4 0.16 0.65 0.25 0.3 0.16 0.1 0.16
AMTR_s00092p00146700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.114)
0.19 0.09 0.36 0.07 0.17 0.02 0.08 0.0 0.11 0.08 1.0 0.86 0.18 0.04 0.41 0.29 0.24 0.14 0.12 0.06 0.14 0.17
AMTR_s00095p00123770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00095.79)
0.0 0.0 0.03 0.25 0.23 0.0 0.15 0.0 0.12 0.14 1.0 0.81 0.74 0.4 0.32 0.38 0.32 0.29 0.56 0.6 0.16 0.39
AMTR_s00096p00091060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00096.43)
0.04 0.09 0.02 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.75 0.62 0.02 0.02 0.08 0.44 0.03 0.02 0.02 0.01 0.12
AMTR_s00103p00114590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00103.68)
0.08 0.14 0.22 0.15 0.26 0.02 0.13 0.01 0.17 0.16 1.0 0.72 0.31 0.23 0.39 0.2 0.61 0.42 0.46 0.34 0.3 0.2
AMTR_s00106p00150110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00106.124)
0.02 0.4 0.0 0.02 0.07 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 1.0 0.79 0.33 0.03 0.15 0.03 0.6 0.24 0.11 0.27 0.04 0.13
AMTR_s00109p00105850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00109.99)
0.14 0.16 0.13 0.06 0.67 0.12 0.01 0.02 0.0 0.01 0.19 0.13 1.0 0.94 0.71 0.55 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06
AMTR_s00116p00142750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00116.47)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.03 0.0 0.02 0.04 0.3 0.53 0.29 0.1 0.03 0.0 1.0 0.0 0.1 0.28 0.0 0.14
AMTR_s00119p00112700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00119.86)
0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.21 0.14 1.0 0.09 0.03 0.75 0.11 0.09 0.12 0.24 0.41 0.15
AMTR_s00122p00129500 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00122.66)
0.0 0.62 0.53 0.15 0.12 0.0 0.01 0.01 0.03 0.02 0.97 0.63 1.0 0.35 0.35 0.28 0.65 0.73 0.68 0.53 0.74 0.39
AMTR_s00127p00033470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00127.8)
0.13 0.36 0.43 0.21 0.5 0.32 0.52 0.12 0.56 0.51 0.6 0.62 0.73 0.4 0.4 0.27 1.0 0.4 0.45 0.61 0.12 0.52
AMTR_s00129p00089860 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00129.64)
0.07 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.98 0.18 0.23 0.18 0.13 0.03 0.06 0.05 0.06 0.09 0.45
AMTR_s00147p00015370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00147.3)
0.0 0.21 0.17 0.2 0.16 0.27 0.19 0.0 0.16 0.12 1.0 0.66 0.41 0.45 0.33 0.11 0.5 0.27 0.3 0.11 0.16 0.11
AMTR_s00158p00088530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00158.20)
0.98 0.08 0.55 0.38 0.16 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 1.0 0.75 0.28 0.77 0.34 0.7 0.48 0.06 0.04 0.01 0.04 0.13
AMTR_s00182p00046570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00182.25)
0.0 0.0 0.0 0.2 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.44 1.0 0.2 0.24 0.21 0.44 0.5 0.18 0.56 0.31 0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)