Heatmap: Cluster_154 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Egg apparatus cell (small)	Egg apparatus cell (medium)	Egg apparatus cell (large)	Ovary	Uninuclear microspore	Generative cell	Pollen	Sperm	Pollen tube (bicellular)	Pollen tube (tricellular)	Flower (bud, female)	Flower (bud, male)	Flower (female)	Flower (male)	Flower (tepals)	Fruit (female)	Apical meristem	Shoot (female)	Shoot (male)	Leaf (male)	Leaves	Root (male)
AMTR_s00001p00252140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.323)	0.34	1.0	0.95	0.04	0.32	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.22	0.16	0.17	0.11	0.18	0.12	0.09	0.17	0.15	0.11	0.08	0.12
AMTR_s00002p00262700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.464)	0.15	1.0	0.37	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.12	0.14	0.17	0.11	0.03	0.11	0.09	0.15	0.13	0.06	0.12	0.18
AMTR_s00003p00107900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.73)	0.3	1.0	0.53	0.05	0.04	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.08	0.14	0.05	0.08	0.11	0.22	0.27	0.08	0.07	0.06	0.03
AMTR_s00003p00124840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.92)	0.25	0.52	1.0	0.01	0.17	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.57	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00003p00125220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.93)	0.39	0.42	1.0	0.0	0.18	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00006p00246720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.133)	0.48	1.0	0.79	0.26	0.09	0.02	0.03	0.02	0.04	0.05	0.36	0.33	0.18	0.05	0.08	0.06	0.37	0.16	0.12	0.06	0.04	0.18
AMTR_s00006p00265840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.282)	0.57	1.0	0.94	0.13	0.31	0.08	0.1	0.06	0.06	0.08	0.24	0.26	0.26	0.16	0.15	0.16	0.27	0.21	0.15	0.13	0.05	0.27
AMTR_s00007p00035530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.14)	0.23	0.44	1.0	0.21	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.28	0.02	0.05	0.03	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00010p00232210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.269)	0.76	0.76	1.0	0.02	0.18	0.22	0.14	0.04	0.12	0.11	0.23	0.23	0.17	0.07	0.07	0.11	0.22	0.11	0.11	0.03	0.07	0.19
AMTR_s00013p00199160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.133)	0.5	1.0	0.98	0.07	0.2	0.05	0.09	0.0	0.07	0.07	0.19	0.23	0.17	0.05	0.07	0.07	0.41	0.13	0.16	0.02	0.02	0.07
AMTR_s00016p00140810 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.98)	0.46	1.0	0.49	0.12	0.11	0.02	0.02	0.0	0.02	0.02	0.17	0.16	0.12	0.07	0.09	0.1	0.22	0.12	0.11	0.15	0.1	0.12
AMTR_s00021p00230990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.227)	0.3	0.58	1.0	0.01	0.2	0.23	0.12	0.05	0.12	0.12	0.14	0.16	0.15	0.12	0.14	0.13	0.16	0.1	0.1	0.09	0.07	0.12
AMTR_s00023p00223110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.167)	0.32	1.0	0.53	0.38	0.16	0.01	0.04	0.09	0.04	0.05	0.32	0.38	0.17	0.08	0.05	0.12	0.2	0.12	0.08	0.04	0.03	0.2
AMTR_s00023p00249610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.235)	0.64	0.85	1.0	0.03	0.29	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03	0.05	0.04	0.01	0.02	0.03	0.0	0.01	0.04	0.08	0.04
AMTR_s00032p00108340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.69)	0.67	1.0	0.92	0.0	0.19	0.0	0.01	0.0	0.02	0.01	0.02	0.0	0.03	0.03	0.19	0.0	0.0	0.06	0.0	0.09	0.06	0.02
AMTR_s00032p00239030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.273)	0.0	0.76	1.0	0.0	0.19	0.0	0.02	0.0	0.04	0.04	0.0	0.0	0.01	0.01	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.15	0.01
AMTR_s00033p00148790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.94)	0.51	0.63	1.0	0.04	0.27	0.04	0.02	0.0	0.03	0.03	0.19	0.22	0.15	0.09	0.08	0.1	0.12	0.14	0.13	0.09	0.06	0.12
AMTR_s00033p00243580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.266)	0.32	1.0	0.89	0.02	0.05	0.02	0.09	0.0	0.11	0.12	0.32	0.21	0.08	0.03	0.03	0.04	0.18	0.08	0.07	0.03	0.01	0.12
AMTR_s00037p00236480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00037.157)	0.17	1.0	0.45	0.02	0.04	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.15	0.15	0.11	0.06	0.02	0.13	0.19	0.26	0.17	0.1	0.22	0.06
AMTR_s00040p00145090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.114)	0.51	0.75	1.0	0.15	0.32	0.28	0.04	0.06	0.04	0.04	0.22	0.24	0.26	0.13	0.23	0.09	0.25	0.12	0.11	0.13	0.03	0.18
AMTR_s00040p00224750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.263)	0.0	0.68	0.89	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	1.0	0.03	0.04	0.19	0.11	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00044p00216680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.232)	0.19	1.0	0.62	0.04	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.12	0.13	0.09	0.04	0.1	0.13	0.06	0.05	0.05	0.0	0.16
AMTR_s00045p00206320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.273)	0.5	0.64	1.0	0.12	0.34	0.02	0.03	0.11	0.03	0.04	0.28	0.24	0.26	0.17	0.13	0.25	0.2	0.16	0.2	0.17	0.11	0.18
AMTR_s00051p00109970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00051.43)	0.35	1.0	0.52	0.1	0.09	0.01	0.04	0.0	0.03	0.03	0.18	0.16	0.16	0.15	0.07	0.13	0.2	0.11	0.11	0.12	0.1	0.1
AMTR_s00055p00090070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00055.33)	0.82	0.89	1.0	0.04	0.16	0.18	0.24	0.08	0.17	0.2	0.29	0.23	0.21	0.18	0.16	0.21	0.28	0.28	0.24	0.19	0.19	0.18
AMTR_s00059p00127380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.102)	0.59	0.64	1.0	0.36	0.31	0.22	0.09	0.27	0.11	0.11	0.24	0.38	0.47	0.27	0.3	0.31	0.44	0.3	0.37	0.23	0.1	0.34
AMTR_s00061p00027740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.2)	0.43	0.94	1.0	0.06	0.16	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.13	0.15	0.13	0.07	0.07	0.08	0.24	0.06	0.08	0.13	0.04	0.12
AMTR_s00061p00048280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.24)	0.42	1.0	0.88	0.06	0.27	0.01	0.01	0.0	0.03	0.03	0.23	0.31	0.22	0.16	0.14	0.2	0.23	0.21	0.23	0.2	0.11	0.18
AMTR_s00063p00196210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00063.76)	0.59	1.0	0.86	0.0	0.16	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.14	0.08	0.08	0.06	0.16	0.19	0.17	0.1	0.08	0.08	0.07
AMTR_s00066p00108790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.96)	0.21	0.61	1.0	0.01	0.26	0.02	0.16	0.0	0.15	0.14	0.2	0.11	0.13	0.13	0.07	0.06	0.19	0.13	0.17	0.07	0.1	0.16
AMTR_s00069p00073180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.45)	0.43	0.56	1.0	0.05	0.3	0.01	0.21	0.18	0.16	0.16	0.28	0.3	0.22	0.16	0.14	0.14	0.16	0.21	0.2	0.16	0.14	0.2
AMTR_s00072p00166270 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00072.113)	0.39	0.33	1.0	0.17	0.16	0.06	0.06	0.03	0.11	0.08	0.07	0.23	0.07	0.08	0.05	0.02	0.06	0.08	0.07	0.06	0.1	0.11
AMTR_s00079p00130410 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00079.52)	0.31	0.5	1.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.43	0.04	0.09	0.03	0.28	0.0	0.02	0.03	0.0	0.01	0.04
AMTR_s00089p00104350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00089.58)	0.78	0.96	1.0	0.68	0.39	0.14	0.21	0.18	0.14	0.14	0.38	0.45	0.39	0.3	0.15	0.23	0.11	0.5	0.42	0.2	0.14	0.42
AMTR_s00103p00024060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00103.6)	0.2	1.0	0.73	0.0	0.03	0.03	0.07	0.01	0.09	0.09	0.18	0.24	0.1	0.19	0.16	0.14	0.11	0.27	0.18	0.18	0.13	0.1
AMTR_s00103p00053060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00103.23)	0.0	1.0	0.62	0.0	0.01	0.02	0.01	0.0	0.01	0.01	0.14	0.2	0.11	0.07	0.06	0.01	0.02	0.0	0.09	0.03	0.02	0.02
AMTR_s00110p00118610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00110.84)	0.2	1.0	0.87	0.0	0.1	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.03	0.02	0.28	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01
AMTR_s00110p00118680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00110.85)	0.22	1.0	0.75	0.0	0.11	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.04	0.02	0.23	0.01	0.0	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01
AMTR_s00112p00083400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00112.19)	0.58	1.0	0.95	0.0	0.05	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.8	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00112p00083750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00112.20)	0.95	1.0	0.89	0.0	0.13	0.02	0.13	0.0	0.1	0.11	0.0	0.88	0.0	0.02	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
AMTR_s00117p00106310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00117.42)	0.0	1.0	0.61	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.19	0.43	0.05	0.0	0.0	0.08	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00119p00087830 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00119.66)	0.32	0.83	1.0	0.03	0.26	0.01	0.05	0.13	0.06	0.06	0.31	0.2	0.18	0.11	0.07	0.09	0.27	0.15	0.13	0.07	0.05	0.13
AMTR_s00155p00068710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00155.44)	0.45	0.78	1.0	0.33	0.31	0.19	0.04	0.06	0.03	0.02	0.2	0.31	0.21	0.1	0.06	0.16	0.13	0.14	0.15	0.09	0.08	0.24
AMTR_s00166p00070030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00166.41)	0.27	0.99	0.66	0.3	0.17	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.04	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
AMTR_s00169p00054520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00169.33)	0.56	0.88	1.0	0.0	0.17	0.15	0.05	0.04	0.04	0.04	0.2	0.11	0.14	0.05	0.07	0.11	0.36	0.1	0.09	0.09	0.07	0.14
AMTR_s00170p00032930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00170.12)	0.64	1.0	0.99	0.06	0.35	0.27	0.2	0.12	0.14	0.14	0.22	0.27	0.22	0.21	0.2	0.22	0.29	0.17	0.13	0.17	0.11	0.16
AMTR_s00287p00014320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00287.3)	0.38	0.96	1.0	0.34	0.13	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.17	0.21	0.04	0.04	0.16	0.41	0.33	0.12	0.04	0.03	0.18
AMTR_s01248p00001900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold01248.1)	0.62	0.88	1.0	0.44	0.01	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.22	0.53	0.04	0.03	0.09	0.0	0.01	0.02	0.02	0.01	0.0	0.01
AMTR_s01596p00002130 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold01596.1)	0.65	0.88	1.0	0.12	0.22	0.03	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.03	0.31	0.11	0.27	0.02	0.01	0.0	0.01	0.16	0.0	0.32
AMTR_s04501p00006630 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold04501.1)	0.18	0.62	1.0	0.0	0.24	0.01	0.04	0.0	0.03	0.03	0.01	0.0	0.01	0.01	0.36	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)