1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_120 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00001p00270680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.468)
 0.82 1.0 0.63 0.5 0.85 0.67 0.22 0.15 0.21 0.23 0.42 0.47 0.4 0.34 0.38 0.37 0.32 0.26 0.34 0.36 0.17 0.36
AMTR_s00003p00267670 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.392)
 0.66 0.61 0.45 0.23 1.0 0.58 0.14 0.12 0.08 0.09 0.23 0.26 0.28 0.21 0.3 0.27 0.13 0.13 0.21 0.21 0.08 0.22
AMTR_s00004p00063720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.46)
 0.54 0.79 0.18 0.03 0.15 1.0 0.29 0.05 0.35 0.22 0.29 0.29 0.37 0.24 0.44 0.19 0.19 0.08 0.06 0.17 0.04 0.34
AMTR_s00010p00028600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.12)
 0.76 1.0 0.61 0.27 0.59 0.3 0.14 0.31 0.11 0.13 0.41 0.58 0.31 0.2 0.21 0.24 0.24 0.5 0.34 0.21 0.09 0.32
AMTR_s00012p00067980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.26)
 0.75 0.62 0.83 0.33 1.0 0.38 0.07 0.21 0.09 0.12 0.28 0.39 0.23 0.12 0.26 0.06 0.27 0.1 0.08 0.13 0.03 0.24
AMTR_s00013p00227820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.176)
 0.27 0.88 1.0 0.17 0.63 0.11 0.12 0.24 0.09 0.11 0.24 0.29 0.39 0.32 0.38 0.31 0.17 0.11 0.11 0.15 0.06 0.41
AMTR_s00013p00239330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.197)
 0.89 0.19 0.35 0.17 1.0 0.37 0.21 0.28 0.17 0.19 0.38 0.34 0.28 0.38 0.4 0.3 0.18 0.33 0.24 0.12 0.12 0.31
AMTR_s00015p00196620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00015.50)
 0.57 0.33 0.03 0.17 1.0 0.26 0.09 0.13 0.1 0.1 0.16 0.18 0.29 0.37 0.34 0.41 0.03 0.06 0.13 0.11 0.07 0.22
AMTR_s00015p00197590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00015.51)
 0.68 0.72 0.0 0.01 1.0 0.33 0.08 0.03 0.11 0.1 0.18 0.25 0.24 0.38 0.31 0.57 0.04 0.13 0.2 0.09 0.12 0.22
AMTR_s00015p00200140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00015.54)
 0.31 0.03 0.34 0.33 0.78 1.0 0.01 0.31 0.01 0.0 0.2 0.0 0.25 0.28 0.15 0.49 0.07 0.0 0.53 0.05 0.0 0.09
AMTR_s00016p00253840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.318)
 0.68 0.7 0.7 0.14 1.0 0.45 0.18 0.14 0.12 0.12 0.19 0.29 0.37 0.31 0.53 0.19 0.12 0.13 0.17 0.26 0.05 0.39
AMTR_s00017p00258370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.293)
 1.0 0.82 0.98 0.5 0.92 0.43 0.31 0.25 0.38 0.32 0.54 0.52 0.59 0.32 0.43 0.29 0.72 0.32 0.34 0.36 0.19 0.56
AMTR_s00019p00075770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.52)
 0.75 0.75 1.0 0.18 0.8 0.69 0.1 0.2 0.07 0.08 0.24 0.22 0.15 0.15 0.16 0.28 0.2 0.2 0.21 0.16 0.13 0.17
AMTR_s00021p00050080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.20)
 0.43 0.3 0.39 0.42 1.0 0.15 0.11 0.27 0.18 0.13 0.27 0.31 0.37 0.22 0.52 0.1 0.07 0.16 0.12 0.24 0.1 0.21
AMTR_s00021p00135390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.89)
 0.54 0.55 0.35 0.62 1.0 0.42 0.05 0.28 0.12 0.12 0.22 0.25 0.19 0.34 0.34 0.14 0.03 0.12 0.17 0.13 0.06 0.18
AMTR_s00024p00226010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.226)
 0.23 0.74 1.0 0.49 0.68 0.95 0.11 0.48 0.1 0.1 0.11 0.13 0.29 0.18 0.1 0.08 0.03 0.06 0.2 0.25 0.12 0.19
AMTR_s00024p00250430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.332)
 0.36 0.46 0.12 0.0 1.0 0.41 0.04 0.13 0.06 0.08 0.33 0.39 0.32 0.26 0.39 0.17 0.18 0.3 0.24 0.06 0.15 0.22
AMTR_s00033p00237780 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.245)
 0.87 0.66 1.0 0.32 0.77 0.75 0.26 0.16 0.11 0.15 0.27 0.26 0.22 0.23 0.17 0.18 0.17 0.21 0.21 0.13 0.16 0.17
AMTR_s00034p00044200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00034.5)
 1.0 0.8 0.92 0.05 0.59 0.35 0.08 0.0 0.05 0.06 0.29 0.33 0.41 0.27 0.36 0.36 0.32 0.54 0.35 0.43 0.32 0.38
AMTR_s00034p00079510 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00034.19)
 0.21 0.37 0.39 0.05 1.0 0.87 0.19 0.17 0.14 0.17 0.29 0.33 0.45 0.29 0.57 0.37 0.37 0.2 0.24 0.36 0.12 0.32
AMTR_s00036p00121900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00036.51)
 0.16 1.0 0.33 0.01 0.69 0.9 0.17 0.51 0.43 0.35 0.26 0.26 0.28 0.17 0.15 0.22 0.2 0.35 0.32 0.14 0.1 0.44
AMTR_s00036p00194520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00036.107)
 0.59 0.72 0.57 0.46 1.0 0.54 0.3 0.12 0.11 0.14 0.23 0.37 0.34 0.32 0.37 0.19 0.09 0.17 0.22 0.23 0.05 0.41
AMTR_s00036p00223480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00036.162)
 1.0 0.6 0.88 0.31 0.66 0.52 0.36 0.15 0.23 0.23 0.37 0.49 0.35 0.32 0.2 0.44 0.32 0.35 0.37 0.37 0.2 0.34
AMTR_s00038p00170920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00038.110)
 1.0 0.86 0.28 0.05 0.59 0.47 0.12 0.11 0.31 0.25 0.38 0.39 0.36 0.35 0.37 0.28 0.34 0.4 0.35 0.29 0.28 0.32
AMTR_s00041p00174530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.130)
 0.82 0.83 0.44 0.46 1.0 0.66 0.1 0.33 0.19 0.11 0.52 0.3 0.18 0.26 0.6 0.3 0.81 0.27 0.21 0.48 0.24 0.33
AMTR_s00045p00091120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.83)
 0.39 0.79 0.56 0.47 1.0 0.33 0.24 0.55 0.14 0.16 0.19 0.19 0.22 0.21 0.3 0.16 0.22 0.13 0.19 0.12 0.04 0.23
AMTR_s00045p00188290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.237)
 0.53 0.51 0.39 0.36 1.0 0.52 0.17 0.17 0.08 0.09 0.02 0.04 0.17 0.26 0.43 0.03 0.01 0.0 0.01 0.14 0.0 0.14
AMTR_s00048p00133650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.80)
 0.52 0.74 0.32 0.29 0.77 1.0 0.2 0.34 0.18 0.2 0.36 0.27 0.3 0.22 0.25 0.1 0.36 0.15 0.11 0.18 0.11 0.38
AMTR_s00051p00167860 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00051.63)
 0.84 0.83 0.77 0.11 1.0 0.63 0.22 0.31 0.13 0.15 0.46 0.45 0.42 0.24 0.24 0.28 0.52 0.24 0.39 0.36 0.12 0.36
AMTR_s00056p00153520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.129)
 0.41 0.37 0.0 0.13 1.0 0.3 0.15 0.35 0.08 0.06 0.31 0.3 0.42 0.24 0.26 0.47 0.39 0.31 0.29 0.19 0.09 0.25
AMTR_s00057p00110760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.88)
 0.27 0.55 0.43 0.16 1.0 0.37 0.28 0.08 0.22 0.23 0.4 0.46 0.46 0.39 0.61 0.34 0.41 0.34 0.37 0.45 0.24 0.43
AMTR_s00058p00117790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.78)
 0.76 1.0 0.25 0.01 0.85 0.88 0.1 0.0 0.31 0.19 0.32 0.56 0.46 0.3 0.5 0.45 0.38 0.32 0.29 0.36 0.16 0.54
AMTR_s00059p00023810 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.8)
 0.55 0.62 1.0 0.2 0.62 0.91 0.12 0.22 0.15 0.08 0.03 0.1 0.09 0.07 0.13 0.0 0.0 0.18 0.08 0.05 0.08 0.03
AMTR_s00061p00048040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.23)
 0.36 1.0 0.32 0.01 0.51 0.38 0.13 0.2 0.32 0.17 0.24 0.33 0.28 0.29 0.44 0.16 0.26 0.26 0.32 0.37 0.15 0.32
AMTR_s00061p00195920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.229)
 1.0 0.71 0.79 0.02 0.42 0.3 0.05 0.02 0.06 0.06 0.4 0.35 0.34 0.19 0.33 0.31 0.26 0.32 0.4 0.25 0.17 0.36
AMTR_s00064p00202170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00064.100)
 0.95 1.0 0.48 0.27 0.88 1.0 0.41 0.24 0.34 0.31 0.43 0.5 0.43 0.5 0.46 0.4 0.66 0.51 0.43 0.42 0.36 0.22
AMTR_s00064p00202250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00064.100)
 0.55 1.0 0.13 0.0 0.39 0.45 0.01 0.4 0.04 0.04 0.11 0.26 0.07 0.07 0.06 0.0 0.09 0.11 0.05 0.04 0.51 0.07
AMTR_s00065p00181400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00065.154)
 0.36 0.43 0.46 0.03 1.0 0.93 0.32 0.3 0.36 0.35 0.46 0.43 0.35 0.35 0.48 0.45 0.26 0.33 0.34 0.36 0.29 0.28
AMTR_s00066p00088440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.68)
 0.35 0.72 0.72 0.39 1.0 0.6 0.37 0.19 0.19 0.25 0.18 0.19 0.32 0.29 0.46 0.26 0.16 0.18 0.22 0.41 0.16 0.36
AMTR_s00071p00195020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00071.204)
 0.71 0.9 1.0 0.34 0.87 0.27 0.2 0.35 0.15 0.16 0.26 0.34 0.36 0.28 0.22 0.26 0.14 0.21 0.21 0.16 0.07 0.4
AMTR_s00077p00171190 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.188)
 0.83 0.49 0.34 0.32 1.0 0.44 0.02 0.15 0.03 0.03 0.49 0.44 0.29 0.18 0.26 0.22 0.65 0.26 0.3 0.16 0.24 0.3
AMTR_s00079p00063830 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00079.20)
 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.74 0.06 0.04 0.07 0.15 0.07 0.05 0.66 0.02 0.3 0.0 0.08 0.12 0.0 0.01 0.0 0.66
AMTR_s00079p00169470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00079.82)
 0.2 0.98 0.62 0.15 1.0 0.36 0.32 0.1 0.29 0.28 0.48 0.43 0.44 0.42 0.65 0.37 0.38 0.26 0.31 0.31 0.19 0.38
AMTR_s00088p00172300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00088.147)
 0.81 0.89 0.01 0.0 0.37 1.0 0.13 0.3 0.17 0.17 0.44 0.44 0.58 0.21 0.25 0.25 0.49 0.36 0.58 0.36 0.89 0.32
AMTR_s00090p00161480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00090.96)
 0.85 1.0 0.92 0.25 0.85 0.61 0.11 0.31 0.12 0.15 0.35 0.27 0.38 0.24 0.19 0.11 0.36 0.25 0.19 0.2 0.12 0.34
AMTR_s00092p00139430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.106)
 0.88 0.68 0.53 0.28 1.0 0.72 0.45 0.41 0.28 0.32 0.3 0.33 0.29 0.32 0.57 0.28 0.18 0.14 0.18 0.28 0.08 0.31
AMTR_s00094p00033760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00094.2)
 0.91 1.0 0.79 0.35 1.0 0.77 0.22 0.14 0.05 0.05 0.27 0.36 0.3 0.32 0.28 0.2 0.27 0.42 0.33 0.33 0.14 0.22
AMTR_s00095p00035180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00095.15)
 0.9 0.9 0.8 0.23 1.0 0.28 0.15 0.52 0.12 0.12 0.2 0.27 0.29 0.21 0.23 0.13 0.2 0.14 0.13 0.14 0.07 0.32
AMTR_s00098p00038500 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00098.4)
 0.0 0.0 1.0 0.33 0.22 0.62 0.0 0.26 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00099p00153980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00099.146)
 0.75 0.72 1.0 0.15 0.89 0.21 0.05 0.7 0.25 0.13 0.59 0.64 0.22 0.35 0.72 0.29 0.89 0.49 0.32 0.56 0.15 0.34
AMTR_s00100p00157680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00100.63)
 0.0 1.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.02 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.27 0.26 0.17 0.0 0.0 0.0 0.28 0.57 0.0 0.06
AMTR_s00101p00066400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00101.40)
 0.63 1.0 0.64 0.19 0.82 0.62 0.29 0.29 0.1 0.12 0.21 0.25 0.17 0.09 0.2 0.14 0.15 0.11 0.13 0.1 0.03 0.28
AMTR_s00101p00143980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00101.119)
 0.8 0.73 0.61 0.16 0.88 1.0 0.34 0.28 0.11 0.11 0.49 0.48 0.3 0.18 0.23 0.2 0.42 0.3 0.27 0.19 0.07 0.28
AMTR_s00110p00051980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00110.23)
 0.56 0.6 1.0 0.0 0.81 0.68 0.21 0.3 0.17 0.2 0.45 0.37 0.47 0.4 0.47 0.34 0.35 0.39 0.32 0.3 0.23 0.39
AMTR_s00119p00089160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00119.68)
 0.55 1.0 0.85 0.13 0.87 0.37 0.1 0.06 0.05 0.06 0.15 0.17 0.2 0.17 0.35 0.14 0.53 0.04 0.06 0.21 0.09 0.3
AMTR_s00135p00082620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00135.42)
 0.58 0.83 0.59 0.23 1.0 0.36 0.2 0.14 0.22 0.22 0.42 0.4 0.48 0.38 0.65 0.25 0.46 0.27 0.24 0.42 0.22 0.35
AMTR_s00138p00111880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00138.56)
 0.61 1.0 0.96 0.12 0.8 0.5 0.23 0.26 0.13 0.15 0.23 0.27 0.3 0.19 0.2 0.16 0.25 0.13 0.17 0.23 0.02 0.32
0.0 1.0 0.0 0.13 0.07 0.0 0.0 0.36 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.01
AMTR_s00146p00023310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00146.4)
 0.17 1.0 0.35 0.08 0.55 0.44 0.19 0.0 0.19 0.16 0.2 0.12 0.41 0.46 0.59 0.36 0.24 0.6 0.2 0.61 0.35 0.44
AMTR_s00147p00042930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00147.16)
 0.94 1.0 0.45 0.25 0.41 0.23 0.09 0.07 0.14 0.1 0.23 0.22 0.31 0.22 0.13 0.16 0.16 0.25 0.19 0.1 0.06 0.21
AMTR_s00153p00044690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00153.18)
 0.39 0.86 0.48 0.1 1.0 0.26 0.15 0.08 0.21 0.2 0.17 0.26 0.43 0.29 0.59 0.17 0.15 0.12 0.14 0.29 0.16 0.4
AMTR_s00157p00050570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00157.16)
 0.54 1.0 0.94 0.12 0.85 0.74 0.1 0.05 0.26 0.17 0.06 0.0 0.23 0.09 0.09 0.13 0.12 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04
AMTR_s00157p00076660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00157.40)
 0.98 0.56 1.0 0.08 0.73 0.31 0.11 0.15 0.15 0.13 0.22 0.3 0.2 0.25 0.22 0.23 0.29 0.21 0.2 0.28 0.06 0.2
AMTR_s00159p00078560 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00159.30)
 1.0 0.65 0.52 0.01 0.64 0.34 0.11 0.0 0.07 0.09 0.43 0.47 0.24 0.24 0.27 0.39 0.24 0.26 0.27 0.2 0.14 0.35
AMTR_s00166p00045000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00166.22)
 0.44 0.77 0.58 0.51 1.0 0.45 0.17 0.49 0.65 0.45 0.43 0.45 0.4 0.38 0.48 0.44 0.4 0.33 0.35 0.29 0.12 0.53
AMTR_s02879p00004340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold02879.1)
 0.61 0.59 1.0 0.37 0.78 0.43 0.09 0.22 0.14 0.1 0.45 0.44 0.23 0.37 0.44 0.7 0.69 0.42 0.37 0.7 0.41 0.4
AMTR_s03028p00008020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold03028.1)
 0.17 0.39 0.06 0.03 1.0 0.64 0.31 0.24 0.48 0.36 0.37 0.57 0.29 0.34 0.36 0.38 0.39 0.28 0.22 0.35 0.33 0.41

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)