Heatmap: Cluster_109 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00001p00103780 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.70)
0.1 0.19 0.32 0.03 0.1 0.03 0.05 0.02 0.06 0.05 0.37 0.77 0.23 0.11 0.16 0.27 1.0 0.31 0.21 0.25 0.11 0.33
AMTR_s00001p00272460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.530)
0.76 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.38 0.05 0.0 0.0 0.0 0.19 1.0 0.34 0.0 0.0 0.1
AMTR_s00002p00174180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.146)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.01
AMTR_s00002p00251290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.358)
0.05 0.15 0.0 0.03 0.03 0.01 0.03 0.0 0.1 0.08 0.46 0.46 0.18 0.16 0.15 0.26 1.0 0.33 0.31 0.2 0.23 0.19
AMTR_s00005p00184180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00005.63)
0.72 0.34 0.57 0.0 0.14 0.03 0.18 0.0 0.27 0.26 0.85 0.95 0.44 0.2 0.44 0.49 1.0 0.63 0.48 0.62 0.55 0.47
AMTR_s00006p00179530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.71)
0.0 1.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.02 0.0 0.06 0.06 0.2 0.37 0.09 0.04 0.04 0.05 0.69 0.32 0.22 0.12 0.12 0.11
AMTR_s00007p00245600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.263)
0.03 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.68 0.53 0.12 0.04 0.03 0.2 1.0 0.57 0.86 0.11 0.53 0.07
AMTR_s00010p00151420 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.109)
0.03 0.06 0.02 0.24 0.32 0.01 0.01 0.0 0.02 0.02 0.73 1.0 0.4 0.45 0.36 0.45 0.8 0.69 0.57 0.67 0.2 0.48
AMTR_s00012p00229980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.184)
0.51 0.41 0.21 0.06 0.48 0.0 0.03 0.24 0.03 0.02 0.33 0.11 0.1 0.08 0.14 0.07 1.0 0.0 0.17 0.15 0.3 0.43
AMTR_s00013p00097410 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.46)
0.0 0.0 0.0 0.02 0.13 0.0 0.02 0.15 0.11 0.1 0.31 0.72 0.12 0.02 0.14 0.14 1.0 0.41 0.42 0.14 0.21 0.04
AMTR_s00019p00248210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.397)
0.12 0.12 0.14 0.06 0.17 0.0 0.04 0.06 0.07 0.06 0.34 0.71 0.54 0.49 0.2 0.3 1.0 0.37 0.48 0.55 0.19 0.65
AMTR_s00025p00057190 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.33)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.08 0.0 0.21 0.2 0.87 0.92 0.47 0.56 0.37 0.57 1.0 0.47 0.31 0.27 0.42 0.81
AMTR_s00030p00203660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.145)
0.17 0.33 0.29 0.03 0.14 0.01 0.26 0.03 0.19 0.17 0.51 0.77 0.29 0.34 0.17 0.63 1.0 0.55 0.5 0.23 0.5 0.24
AMTR_s00033p00145790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.88)
0.0 0.0 0.0 0.23 0.32 0.0 0.03 0.0 0.05 0.03 0.15 0.17 0.32 0.21 0.12 0.12 1.0 0.75 0.08 0.04 0.67 0.16
AMTR_s00033p00185760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.139)
0.34 0.73 0.3 0.03 0.1 0.02 0.08 0.15 0.1 0.12 0.81 0.83 0.39 0.3 0.18 0.46 1.0 0.73 0.5 0.5 0.3 0.66
AMTR_s00033p00199690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.163)
0.33 0.0 0.07 0.01 0.14 0.0 0.06 0.0 0.08 0.09 0.42 0.72 0.29 0.26 0.15 0.35 1.0 0.68 0.39 0.4 0.58 0.35
AMTR_s00040p00212480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.225)
0.37 0.26 1.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.05 0.03 0.13 0.18 0.18 0.09 0.06 0.37 0.72 0.32 0.13 0.04 0.47 0.09
AMTR_s00041p00014360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.3)
0.31 0.18 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.58 0.63 0.43 0.28 0.09 1.0 0.15 0.13 0.19 0.04 0.06
AMTR_s00041p00121680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.89)
0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.05 0.02 0.61 0.38 0.26 0.22 0.09 0.43 1.0 0.39 0.26 0.15 0.1 0.22
AMTR_s00042p00143440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00042.38)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.11 0.0 0.02 0.01 0.0 0.29 1.0 0.66 0.26 0.0 0.02
AMTR_s00044p00119700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.101)
0.35 0.38 0.35 0.12 0.38 0.01 0.05 0.17 0.06 0.07 0.32 0.41 0.22 0.19 0.16 1.0 0.84 0.39 0.32 0.2 0.32 0.33
AMTR_s00048p00093900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.45)
0.16 0.12 0.07 0.0 0.46 0.0 0.04 0.05 0.05 0.04 0.3 0.78 0.2 0.14 0.32 0.31 1.0 0.2 0.13 0.18 0.21 0.37
AMTR_s00049p00054350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.29)
0.47 0.68 0.42 0.0 0.25 0.37 0.26 0.1 0.39 0.34 0.9 0.94 0.55 0.28 0.17 0.71 1.0 0.98 0.46 0.17 0.23 0.37
AMTR_s00049p00102670 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.75)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.08 0.28 0.23 0.03 0.1 0.0 1.0 0.25 0.61 0.34 0.22 0.25
AMTR_s00049p00231320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.282)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.17 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00050p00206180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00050.68)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.41 0.0 0.4 0.4 0.6 1.0 0.17 0.22 0.12 0.2 0.68 0.26 0.34 0.18 0.47 0.22
AMTR_s00056p00222060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.222)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.08 1.0 0.05 0.02 0.0 0.01 0.0
AMTR_s00057p00211600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.262)
0.06 0.05 0.04 0.07 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.05 0.06 0.06 0.18 0.15 1.0 0.07 0.05 0.04 0.02 0.07
AMTR_s00058p00042080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.13)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.1 0.2 0.66 0.39 0.08 0.09 0.0 1.0 0.19 0.2 0.31 0.34 0.27
AMTR_s00061p00154840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.140)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.55 0.18 0.07 0.01 0.75 1.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05
AMTR_s00065p00118020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00065.69)
0.32 0.52 1.0 0.0 0.16 0.26 0.1 0.05 0.11 0.1 0.25 0.4 0.47 0.33 0.43 0.35 0.77 0.31 0.27 0.34 0.34 0.49
AMTR_s00071p00073710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00071.43)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.04 0.02 0.2 0.43 0.11 0.08 0.14 0.1 1.0 0.13 0.12 0.23 0.23 0.26
AMTR_s00071p00078420 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00071.52)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.3 0.0 0.01 0.0 0.19
AMTR_s00072p00049060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00072.17)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 1.0 0.0 0.0 0.03 0.16 0.01
AMTR_s00074p00191810 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00074.114)
0.12 0.27 0.12 0.0 0.05 0.02 0.03 0.0 0.03 0.02 0.43 0.59 0.08 0.08 0.1 0.77 0.46 1.0 0.6 0.35 0.68 0.08
AMTR_s00075p00090320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00075.27)
0.0 0.14 0.11 0.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.04 0.02 0.33 0.58 0.37 0.29 0.21 0.39 1.0 0.87 0.66 0.34 0.39 0.19
AMTR_s00078p00065530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.38)
0.06 0.01 0.0 0.01 0.04 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.17 0.26 0.11 0.07 0.1 0.35 1.0 0.61 0.41 0.41 0.27 0.07
AMTR_s00078p00104640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.75)
0.3 0.21 0.37 0.02 0.09 0.18 0.17 0.04 0.12 0.13 0.48 0.78 0.25 0.26 0.17 0.42 1.0 0.51 0.47 0.29 0.31 0.3
AMTR_s00083p00180890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00083.55)
0.95 0.35 1.0 0.0 0.66 0.0 0.07 0.0 0.04 0.07 0.54 0.53 0.2 0.34 0.27 0.36 0.69 0.67 0.98 0.37 0.34 0.15
AMTR_s00090p00035360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00090.6)
0.58 0.0 0.49 0.0 0.33 0.0 0.12 0.0 0.18 0.14 0.59 0.8 0.61 0.33 0.23 0.49 1.0 0.59 0.73 0.5 0.51 0.35
0.06 0.05 0.11 0.0 0.03 0.09 0.03 0.0 0.02 0.01 0.2 0.27 0.02 0.02 0.05 0.09 1.0 0.0 0.11 0.03 0.0 0.02
AMTR_s00092p00064570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.29)
1.0 0.33 0.09 0.11 0.13 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.26 0.15 0.13 0.02 0.17 0.12 0.32 0.78 0.42 0.26 0.07 0.16
AMTR_s00096p00095000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00096.45)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.07 0.05 0.28 0.72 0.28 0.3 0.25 0.08 1.0 0.0 0.41 0.22 0.0 0.29
AMTR_s00100p00145230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00100.55)
0.0 0.0 0.0 0.08 0.06 0.0 0.42 0.0 0.37 0.31 0.52 1.0 0.38 0.34 0.13 0.24 0.73 0.54 0.54 0.39 0.61 0.2
AMTR_s00104p00047810 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00104.14)
0.0 0.1 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.14 0.37 0.06 0.11 0.07 0.17 1.0 0.11 0.1 0.22 0.1 0.14
AMTR_s00105p00140220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00105.69)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00108p00153640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00108.51)
0.01 0.0 0.0 0.02 0.12 0.0 0.07 0.0 0.06 0.06 0.92 0.78 0.31 0.28 0.13 0.33 0.68 0.89 1.0 0.25 1.0 0.17
AMTR_s00137p00078850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00137.37)
0.07 0.0 0.15 0.0 0.18 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.15 0.18 0.13 0.12 0.08 0.12 1.0 0.31 0.16 0.11 0.0 0.08
AMTR_s00142p00088080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00142.55)
0.21 0.23 0.03 0.08 0.07 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.21 0.31 0.2 0.03 0.02 0.16 1.0 0.2 0.27 0.09 0.07 0.21
AMTR_s00162p00073000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00162.32)
0.07 0.12 0.02 0.18 0.16 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.22 0.37 0.08 0.07 0.12 0.39 1.0 0.31 0.2 0.07 0.41 0.08
AMTR_s00166p00027770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00166.8)
0.0 0.0 0.16 0.14 0.11 0.0 0.02 0.0 0.07 0.06 0.29 0.38 0.14 0.09 0.1 0.0 1.0 0.39 0.35 0.08 0.25 0.26
AMTR_s00183p00033680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00183.12)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00202p00029630 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00202.8)
0.47 0.94 1.0 0.11 0.75 0.0 0.05 0.04 0.08 0.05 0.36 0.42 0.43 0.26 0.43 0.24 0.88 0.5 0.44 0.4 0.39 0.42
AMTR_s00210p00029400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00210.9)
0.0 1.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.86 0.82 0.37 0.33 0.28 1.0 0.99 0.72 0.22 0.17 0.77 0.8
AMTR_s00247p00018380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00247.3)
0.26 0.55 0.32 0.01 0.08 0.0 0.04 0.01 0.02 0.03 0.66 0.77 0.24 0.2 0.18 0.27 1.0 0.58 0.62 0.51 0.5 0.29
AMTR_s00315p00013590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00315.2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00342p00015160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00342.3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00610p00009670 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00610.1)
0.74 0.65 0.22 0.0 0.27 0.0 0.01 0.0 0.05 0.03 0.5 0.61 0.39 0.35 0.27 0.26 1.0 0.48 0.46 0.54 0.29 0.45
AMTR_s00779p00006650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00779.1)
0.01 0.02 0.03 0.08 0.05 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.69 1.0 0.28 0.17 0.06 0.26 0.72 0.85 0.74 0.26 0.68 0.19
AMTR_s00934p00009020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00934.2)
0.0 0.0 0.0 0.12 0.01 0.17 0.01 0.0 0.01 0.0 0.31 0.0 0.05 0.02 0.02 0.0 1.0 0.0 0.18 0.12 0.11 0.07
AMTR_s01087p00000170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold01087.1)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.28 1.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.51 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0
AMTR_s02051p00001850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold02051.1)
0.2 0.0 0.0 0.13 0.11 0.0 0.1 0.0 0.09 0.08 0.33 0.64 0.33 0.26 0.16 0.4 0.43 1.0 0.95 0.33 0.53 0.16
AMTR_s02556p00000250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold02556.1)
0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.18 0.0 0.0 0.33 1.0 0.83 0.0 0.0 0.0 0.25
AMTR_s03561p00008170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold03561.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.45 0.08 0.0 0.12 0.0 1.0 0.15 0.05 0.01 0.0 0.0
AMTR_s03745p00005370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold03745.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.1 0.0 0.08 0.08 0.26 0.47 0.24 0.18 0.11 0.15 1.0 0.38 0.37 0.21 0.1 0.17
AMTR_s04000p00007400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold04000.1)
0.01 0.01 0.0 0.57 0.23 0.0 0.11 0.0 0.12 0.12 0.85 0.98 0.54 0.39 0.31 0.46 1.0 0.97 0.64 0.45 0.63 0.37
AMTR_s04315p00004910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold04315.1)
0.0 0.0 0.09 0.01 0.16 0.0 0.12 0.0 0.13 0.09 0.54 0.69 0.34 0.23 0.06 0.13 0.32 1.0 0.7 0.27 0.78 0.23
AMTR_s04988p00004540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold04988.1)
0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.45 0.03 0.0 0.0 0.45 0.79 1.0 0.8 0.0 0.21 0.03
AMTR_s05197p00005730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold05197.1)
0.0 0.16 0.74 0.01 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.29 0.0 1.0 0.2 0.0 0.07 0.79 0.02
AMTR_s05743p00005480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold05743.1)
0.44 0.0 0.5 0.07 0.41 0.0 0.04 0.0 0.08 0.07 0.64 0.47 0.16 0.2 0.25 0.51 1.0 0.46 0.27 0.34 0.69 0.32

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)