Heatmap: Cluster_271 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00002p00130350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.90)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.67 0.0 0.55 0.58 0.07 0.0 0.18 0.03 0.08 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97
AMTR_s00002p00199340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.187)
0.4 0.84 0.26 0.04 0.06 0.01 0.99 0.18 0.92 1.0 0.41 0.32 0.63 0.37 0.07 0.31 0.62 0.3 0.25 0.15 0.16 0.39
AMTR_s00002p00263250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.476)
0.4 0.14 0.34 0.03 0.36 0.53 0.81 0.26 0.78 0.69 0.82 0.78 0.36 0.22 0.22 0.22 1.0 0.5 0.47 0.21 0.19 0.74
AMTR_s00003p00158370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.131)
0.11 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.94 0.14 0.65 1.0 0.75 0.83 0.11 0.13 0.03 0.1 0.62 0.25 0.07 0.01 0.0 0.35
AMTR_s00004p00142010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.138)
0.0 0.0 0.0 0.28 0.66 0.0 0.42 0.34 0.48 0.53 0.59 0.8 0.28 0.25 0.23 0.08 1.0 0.06 0.01 0.04 0.02 0.56
AMTR_s00006p00073100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.26)
0.0 0.0 1.0 0.0 0.35 0.27 0.16 0.34 0.25 0.23 0.15 0.32 0.39 0.16 0.21 0.03 0.75 0.2 0.1 0.2 0.4 0.33
AMTR_s00006p00256960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.195)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.0 0.13 0.16 0.1 0.1 0.83 0.72 0.75 0.21 0.06 1.0 0.45 0.22 0.27 0.07 0.06 0.73
AMTR_s00006p00268510 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.315)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.33 0.0 0.38 0.0 1.0 0.66 0.96 0.89 0.53 0.56 0.4 0.49 1.0 0.68 0.54 0.46 0.59 0.79
AMTR_s00009p00092310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.36)
0.14 0.34 0.27 0.18 0.61 0.43 0.77 0.28 1.0 0.76 0.79 0.7 0.58 0.81 0.64 0.27 0.64 0.49 0.38 0.19 0.2 0.58
AMTR_s00009p00244800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.232)
0.41 0.27 0.0 0.26 0.38 0.09 0.95 0.06 0.86 0.76 0.82 0.35 0.98 0.93 0.5 0.17 1.0 0.3 0.24 0.6 0.28 0.49
AMTR_s00010p00237080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.288)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.9 0.0 0.89 0.74 1.0 0.48 0.48 0.5 0.56 0.12 0.79 0.97 0.6 0.35 0.4 0.58
AMTR_s00010p00241610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.309)
0.0 0.06 0.09 0.01 0.04 0.64 1.0 0.22 0.23 0.2 0.01 0.05 0.02 0.03 0.02 0.0 0.02 0.01 0.06 0.01 0.0 0.97
AMTR_s00011p00267070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00011.235)
0.0 0.14 0.0 0.06 0.68 0.02 0.18 0.32 0.45 0.4 0.43 0.46 0.34 0.13 0.16 0.26 1.0 0.32 0.35 0.15 0.29 0.17
AMTR_s00013p00090250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.41)
0.12 0.33 0.1 0.01 0.45 0.08 1.0 0.15 0.8 0.74 0.47 0.42 0.39 0.58 0.45 0.2 0.43 0.69 0.59 0.56 0.42 0.18
AMTR_s00013p00200170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.135)
0.11 0.59 0.26 0.28 0.3 0.0 0.24 0.34 0.31 0.27 1.0 0.98 0.8 0.54 0.25 0.37 0.81 0.38 0.33 0.37 0.41 0.67
AMTR_s00013p00217890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.153)
0.0 0.0 0.0 0.09 0.19 0.04 0.32 0.05 0.38 0.35 0.61 0.28 0.64 0.11 0.06 0.04 1.0 0.06 0.05 0.08 0.08 0.41
AMTR_s00017p00071350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.26)
0.48 0.12 0.0 0.23 0.23 0.0 1.0 0.26 0.52 0.5 0.52 0.52 0.41 0.35 0.18 0.26 0.63 0.26 0.28 0.26 0.27 0.26
AMTR_s00019p00192810 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.215)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.01 0.68 0.01 0.0 0.2 0.91 0.09 0.02 0.07 0.0 0.74 0.0 0.22 0.8 0.05 1.0
AMTR_s00023p00245540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.219)
0.68 0.44 0.01 0.34 0.5 0.42 1.0 0.04 0.82 0.58 0.85 0.71 0.56 0.67 0.51 0.48 0.77 0.63 0.57 0.45 0.38 0.38
AMTR_s00024p00226830 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.228)
0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 0.12 0.59 0.1 0.54 0.53 0.13 0.23 0.05 0.09 0.18 0.06 0.5 0.72 1.0 0.26 0.82 0.28
AMTR_s00024p00239120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.275)
0.97 0.0 0.0 0.18 0.41 0.0 0.83 0.14 0.83 0.82 1.0 0.93 0.77 0.86 0.62 0.53 0.97 0.69 0.62 0.48 0.91 0.64
AMTR_s00025p00172530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.207)
0.6 0.43 0.85 0.11 0.26 0.0 0.94 0.5 0.94 1.0 0.7 0.69 0.53 0.49 0.18 0.19 0.74 0.44 0.36 0.19 0.16 0.55
AMTR_s00025p00174890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.210)
0.46 0.47 0.32 0.09 0.33 0.81 1.0 0.19 0.74 0.77 0.72 0.46 0.29 0.46 0.35 0.4 0.49 0.54 0.42 0.23 0.26 0.25
AMTR_s00032p00131610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.91)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.25 0.55 0.31 0.93 0.74 0.79 0.89 0.17 0.18 0.17 0.19 1.0 0.12 0.09 0.08 0.07 0.26
AMTR_s00032p00220610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.227)
0.99 0.0 0.0 0.03 0.42 0.3 0.98 0.42 0.88 0.92 0.62 0.72 0.52 0.35 0.4 0.35 1.0 0.41 0.52 0.53 0.25 0.38
AMTR_s00033p00232550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.231)
0.6 0.22 0.01 0.01 0.22 0.0 0.64 0.0 0.4 0.45 0.78 0.38 0.75 0.55 0.29 0.31 1.0 0.61 0.64 0.49 0.3 0.4
AMTR_s00036p00146430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00036.69)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.62 0.0 0.55 1.0 0.16 0.27 0.03 0.15 0.07 0.0 0.45 0.95 0.68 0.4 0.43 0.1
AMTR_s00036p00179350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00036.89)
0.76 0.78 0.32 0.12 0.49 0.22 1.0 0.37 0.95 0.98 0.52 0.64 0.39 0.6 0.39 0.7 0.44 0.27 0.26 0.31 0.22 0.4
AMTR_s00037p00072620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00037.20)
0.0 0.0 0.0 0.49 0.24 0.0 0.15 0.61 0.24 0.18 0.35 0.64 0.85 0.11 0.19 0.1 1.0 0.37 0.93 0.38 0.11 0.68
AMTR_s00038p00172140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00038.112)
0.0 0.03 0.0 0.05 0.31 0.65 1.0 0.07 0.52 0.58 0.42 0.35 0.22 0.36 0.24 0.25 0.23 0.64 0.5 0.26 0.46 0.16
AMTR_s00039p00236170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00039.226)
0.0 0.18 0.0 0.0 0.61 0.0 0.61 0.0 0.43 0.57 1.0 0.62 0.92 0.93 0.32 0.54 0.62 0.48 0.64 0.47 0.46 0.46
AMTR_s00040p00212580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.226)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.63 0.0 0.68 0.0 0.44 0.33 1.0 0.96 0.74 0.19 0.77 0.24 0.63 0.15 0.15 0.08 0.36 0.17
AMTR_s00044p00046900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.21)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 1.0 0.01 0.48 0.41 0.34 0.24 0.11 0.19 0.06 0.03 0.7 0.27 0.14 0.03 0.04 0.55
AMTR_s00045p00140260 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.144)
0.8 0.0 0.0 0.01 0.15 0.0 0.51 0.16 0.97 0.98 0.1 0.36 0.2 0.03 0.18 0.12 1.0 0.31 0.0 0.19 0.0 0.28
AMTR_s00045p00210220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.286)
0.31 0.0 0.0 0.01 0.56 0.0 0.7 0.0 0.52 0.41 1.0 0.53 0.37 0.3 0.41 0.21 0.3 0.33 0.47 0.27 0.0 0.35
AMTR_s00047p00139160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00047.61)
0.39 0.34 0.48 0.0 0.29 0.0 0.58 0.19 0.36 0.22 1.0 0.28 0.67 0.31 0.14 0.12 0.39 0.44 0.63 0.32 0.33 0.38
AMTR_s00048p00108400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.53)
0.45 0.86 0.27 0.02 0.54 0.29 1.0 0.06 0.47 0.34 0.49 0.66 0.55 0.58 0.63 0.3 0.45 0.39 0.47 0.57 0.41 0.46
AMTR_s00048p00211630 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.191)
0.18 0.94 0.28 0.03 0.47 0.01 0.48 0.01 1.0 0.8 0.97 0.92 0.81 0.79 0.59 0.65 0.97 0.68 0.51 0.46 0.48 0.92
AMTR_s00049p00217900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.252)
0.5 0.28 0.0 0.0 0.28 0.0 0.12 0.41 0.14 0.12 1.0 0.74 0.61 0.17 0.17 0.16 0.54 0.18 0.26 0.28 0.13 0.73
AMTR_s00050p00186430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00050.49)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.0 1.0 0.0 0.35 0.38 0.06 0.4 0.17 0.15 0.08 0.14 0.34 0.18 0.09 0.03 0.16 0.71
AMTR_s00052p00156010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00052.63)
0.67 0.23 0.24 0.02 0.6 0.21 0.53 0.28 0.46 0.49 0.83 0.68 0.75 0.71 0.43 0.7 1.0 0.46 0.49 0.4 0.36 0.57
AMTR_s00052p00198680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00052.95)
0.27 1.0 0.26 0.09 0.13 0.01 0.88 0.25 0.3 0.36 0.25 0.27 0.29 0.45 0.37 0.2 0.2 0.18 0.19 0.22 0.13 0.27
AMTR_s00054p00123570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00054.39)
0.57 0.34 0.28 0.22 0.85 0.11 0.76 0.59 0.53 0.54 0.82 0.62 0.75 0.61 0.79 1.0 0.69 0.65 0.69 0.43 0.53 0.61
AMTR_s00056p00214650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.206)
0.26 0.17 0.0 0.1 0.36 0.0 1.0 0.13 0.47 0.51 0.64 0.39 0.47 0.55 0.6 0.19 0.39 0.39 0.41 0.39 0.3 0.4
AMTR_s00057p00079210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.50)
0.29 0.0 0.53 0.0 0.14 0.0 0.24 0.68 0.42 0.23 0.55 0.64 0.42 0.07 0.09 0.14 1.0 0.15 0.17 0.21 0.16 0.42
AMTR_s00057p00207420 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.250)
0.6 1.0 0.37 0.06 0.48 0.45 0.44 0.46 0.62 0.55 0.96 0.58 0.48 0.55 0.43 0.38 0.7 0.41 0.61 0.42 0.26 0.38
AMTR_s00058p00166220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.150)
0.06 0.27 0.62 0.21 0.14 0.06 0.74 0.64 1.0 0.92 0.71 0.51 0.39 0.4 0.22 0.39 0.78 0.52 0.41 0.43 0.25 0.36
AMTR_s00059p00217300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.259)
0.36 0.18 0.77 0.0 0.33 0.0 0.91 0.24 1.0 0.71 0.43 0.55 0.29 0.39 0.31 0.14 0.58 0.48 0.35 0.22 0.32 0.38
AMTR_s00059p00217330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.260)
0.0 0.29 1.0 0.01 0.48 0.0 0.88 0.22 0.96 0.74 0.74 0.72 0.37 0.43 0.3 0.37 0.61 0.49 0.55 0.17 0.26 0.33
AMTR_s00061p00095500 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.71)
0.36 0.38 0.68 0.01 0.2 0.02 0.66 0.43 1.0 0.91 0.52 0.47 0.22 0.13 0.11 0.21 0.67 0.56 0.47 0.21 0.33 0.12
AMTR_s00063p00107170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00063.21)
0.11 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.98 0.0 1.0 0.47 0.07 0.39 0.16 0.19 0.11 0.21 0.76 0.27 0.16 0.14 0.06 0.06
AMTR_s00064p00062340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00064.18)
0.25 0.0 0.0 0.01 0.34 0.0 0.4 0.14 0.63 0.51 1.0 0.83 0.78 0.79 0.69 0.14 0.47 0.45 0.26 0.25 0.41 0.55
AMTR_s00065p00166970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00065.132)
0.83 0.1 0.02 0.13 0.41 0.1 0.99 0.14 0.69 0.71 1.0 0.73 0.51 0.53 0.63 0.33 0.83 0.39 0.48 0.57 0.32 0.38
AMTR_s00065p00210290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00065.207)
0.04 0.0 0.0 0.07 0.13 0.01 1.0 0.46 0.8 0.81 0.41 0.38 0.17 0.23 0.08 0.11 0.45 0.83 0.64 0.26 0.66 0.07
AMTR_s00068p00185430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00068.145)
0.62 0.0 0.0 0.08 0.45 0.0 1.0 0.16 0.85 0.85 0.94 0.85 0.19 0.21 0.17 0.25 0.66 0.65 0.48 0.05 0.13 0.06
AMTR_s00069p00030230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.14)
0.25 0.1 0.0 0.09 0.34 0.34 1.0 0.1 0.7 0.63 0.46 0.47 0.49 0.59 0.39 0.48 0.31 0.32 0.57 0.49 0.22 0.4
AMTR_s00074p00193640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00074.120)
0.09 0.08 0.05 0.02 0.22 0.0 0.63 0.0 0.68 0.59 1.0 0.22 0.25 0.44 0.17 0.06 0.41 0.16 0.2 0.39 0.05 0.29
AMTR_s00077p00058980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.37)
0.55 0.42 0.58 0.01 0.82 0.19 1.0 0.16 0.84 0.73 0.66 0.42 0.33 0.47 0.25 0.24 0.62 0.36 0.31 0.37 0.18 0.37
AMTR_s00077p00163180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.172)
0.38 0.24 0.32 0.01 0.58 0.03 0.83 0.1 0.87 0.81 0.88 0.87 0.73 0.8 0.7 0.78 1.0 0.66 0.68 0.51 0.49 0.61
AMTR_s00083p00036180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00083.9)
0.0 0.0 0.0 0.02 0.14 0.0 0.52 0.0 0.52 0.45 0.59 0.74 0.16 0.08 0.05 0.09 1.0 0.08 0.04 0.02 0.07 0.42
AMTR_s00088p00108420 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00088.74)
0.0 0.28 0.19 0.0 0.46 0.31 1.0 0.45 0.67 0.67 0.26 0.34 0.56 0.31 0.24 0.18 0.71 0.15 0.2 0.43 0.08 0.68
AMTR_s00090p00027440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00090.4)
0.06 0.38 0.0 0.09 0.44 0.02 0.39 0.0 0.31 0.29 1.0 0.93 0.48 0.39 0.48 0.45 0.41 0.32 0.57 0.28 0.41 0.23
AMTR_s00091p00105580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00091.39)
0.78 0.0 0.0 0.08 0.1 0.0 0.48 0.11 0.37 0.43 0.37 1.0 0.22 0.27 0.08 0.07 0.02 0.06 0.34 0.02 0.04 0.21
AMTR_s00092p00122190 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.86)
0.32 0.42 0.0 0.01 0.14 0.0 0.65 0.39 0.67 0.63 0.28 0.26 0.79 0.45 0.35 0.21 0.97 0.34 0.34 0.81 0.45 1.0
AMTR_s00109p00049700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00109.35)
0.01 0.01 0.29 0.07 0.28 0.02 1.0 0.12 0.73 0.74 0.55 0.6 0.55 0.43 0.48 0.33 0.5 0.43 0.46 0.38 0.26 0.55
AMTR_s00126p00116180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00126.55)
0.0 0.0 0.39 0.06 0.3 0.03 0.42 0.0 0.42 0.43 0.54 0.51 0.48 0.32 0.25 0.18 1.0 0.09 0.05 0.24 0.04 0.37
AMTR_s00128p00024350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00128.6)
0.62 0.07 0.03 0.11 0.22 0.3 1.0 0.0 0.76 0.63 0.57 0.51 0.54 0.62 0.26 0.35 0.52 0.39 0.43 0.36 0.32 0.38
AMTR_s00137p00033100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00137.9)
0.64 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.61 0.19 0.42 0.54 0.57 1.0 0.06 0.05 0.02 0.0 0.21 0.07 0.0 0.01 0.0 0.13
AMTR_s00166p00027970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00166.10)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.57 0.0 0.27 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 1.0 0.72 0.37 0.0 0.0 0.48
AMTR_s00176p00061280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00176.31)
0.22 0.08 0.29 0.04 0.43 0.0 0.31 0.0 0.65 0.49 0.79 1.0 0.41 0.39 0.4 0.48 0.76 0.92 0.83 0.24 0.61 0.55
AMTR_s00194p00023080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00194.9)
0.0 0.0 0.14 0.0 0.45 0.0 0.37 0.0 0.37 0.44 1.0 0.19 0.96 0.16 0.04 0.13 0.61 0.12 0.43 0.19 0.04 0.28
AMTR_s00199p00036120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00199.13)
0.05 0.25 0.0 0.12 0.36 0.0 0.37 0.49 0.32 0.3 0.63 0.66 0.39 0.19 0.13 0.22 1.0 0.38 0.36 0.14 0.08 0.43
AMTR_s00280p00015410 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00280.1)
0.0 0.0 0.0 0.1 0.25 0.0 0.1 0.4 0.5 0.64 0.56 1.0 0.26 0.26 0.28 0.07 0.82 0.24 0.4 0.18 0.08 0.28
AMTR_s00285p00017900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00285.4)
0.0 0.0 0.14 0.0 0.4 0.0 0.71 0.0 0.76 0.45 1.0 0.19 0.96 0.16 0.14 0.13 0.61 0.12 0.43 0.19 0.04 0.28
AMTR_s01905p00009050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold01905.1)
0.29 0.08 0.29 0.01 0.07 0.0 0.85 0.01 0.68 0.65 0.1 0.29 0.22 0.38 0.24 0.69 1.0 0.0 0.22 0.07 0.82 0.18
AMTR_s03551p00001840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold03551.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.25 0.0 0.47 0.6 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 1.0 0.56 0.43 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)