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Heatmap: Cluster_266 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00004p00263150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.263)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00005p00115220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00005.30)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00006p00243540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.122)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00007p00266160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.369)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00008p00131060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00008.59)
 - - - - 4.36 - - - - 0.53 - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00014p00255080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00014.140)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00021p00122230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.71)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00023p00252110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.246)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00028p00104290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00028.30)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00028p00157780 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00028.62)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00030p00209850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.154)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00031p00150150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00031.66)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - -11.49 - -
AMTR_s00033p00196950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.158)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00038p00227140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00038.217)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00041p00185100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.156)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00041p00236010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.292)
 - - - - 4.38 - -0.54 - - - - - - - -0.95 - - - - - - -
AMTR_s00044p00188030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.203)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00044p00210930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.221)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00049p00021970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.9)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00049p00120200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.96)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00052p00195700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00052.90)
 - - - - 4.28 - - - - - - - - - - - 1.38 - - - - -
AMTR_s00057p00024910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.7)
 - - - - 4.4 - - - - -1.01 - - - - -1.49 - - - - - - -
AMTR_s00059p00205030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.232)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00062p00209180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.226)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00065p00195400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00065.170)
 - - - - 4.31 - - - - - - - 1.11 - - - - - - - - -
AMTR_s00067p00032950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00067.16)
 - - - - 4.12 - 0.12 - -0.63 1.05 - - - -0.41 - - - - - - - -
AMTR_s00072p00098400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00072.45)
 - - - - 4.44 - - - - - - - - - -1.73 - - - - - - -
AMTR_s00076p00192270 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00076.83)
 - - - - 4.35 - - - - - - - 0.62 - - - - - - - - -
AMTR_s00080p00130330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00080.54)
 - - - - 4.27 - - - -0.82 -0.05 - - - - 0.29 - - - - - - -
AMTR_s00080p00182800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00080.94)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00081p00107370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00081.37)
 - - - - 4.24 - - - - - - - 0.8 0.41 - - - - - - - -
AMTR_s00086p00136610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00086.77)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00094p00130940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00094.16)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00100p00072190 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00100.16)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00112p00030960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00112.8)
 - - - - 4.32 - - - - - - - - -1.62 -0.76 - - - - - - 0.12
AMTR_s00114p00093910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00114.36)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00118p00140870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00118.37)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00162p00035640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00162.14)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00183p00032220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00183.10)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00241p00020730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00241.3)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00262p00009720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00262.1)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00300p00013710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00300.1)
 - - - -0.3 4.19 - - - -3.33 - - - 1.03 - -0.25 - - - - - - -
AMTR_s00302p00018610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00302.4)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00516p00014900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00516.1)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s00573p00014840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00573.1)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s01015p00001200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold01015.1)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s03203p00006820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold03203.1)
 - - - - 4.42 - - -0.74 - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s03712p00007390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold03712.1)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -
AMTR_s03970p00007900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold03970.1)
 - - - - 4.46 - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.