Heatmap: Cluster_233 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00001p00220200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.228)
0.34 0.22 0.74 0.21 0.37 0.03 0.16 0.04 0.31 0.31 0.67 0.84 0.8 0.7 0.81 0.91 1.0 0.56 0.6 0.81 0.59 0.86
AMTR_s00001p00246890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.300)
0.22 0.54 0.47 0.01 0.22 0.0 0.1 0.02 0.23 0.2 0.66 0.87 0.78 0.43 0.39 0.44 1.0 0.63 0.53 0.52 0.41 0.54
AMTR_s00001p00273100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.594)
0.29 0.22 0.35 0.05 0.43 0.03 0.07 0.0 0.08 0.09 0.54 0.49 0.6 0.23 0.42 0.34 1.0 0.36 0.49 0.55 0.17 0.44
AMTR_s00002p00140630 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.103)
0.18 0.08 0.33 0.08 0.33 0.01 0.12 0.02 0.27 0.24 0.83 0.96 0.65 0.68 0.88 0.65 1.0 0.62 0.53 0.79 1.0 0.62
AMTR_s00003p00268400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.398)
0.62 0.46 0.25 0.03 0.34 0.0 0.35 0.07 0.2 0.24 0.53 0.59 0.54 0.4 0.32 0.62 1.0 0.45 0.54 0.7 0.26 0.55
AMTR_s00004p00092300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.75)
0.05 0.0 0.0 0.14 0.32 0.05 0.09 0.0 0.13 0.1 0.71 0.72 0.48 0.44 0.44 0.5 1.0 0.6 0.62 0.44 0.5 0.35
AMTR_s00004p00166400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.183)
0.11 0.23 0.46 0.03 0.38 0.01 0.11 0.01 0.18 0.16 0.59 0.63 0.52 0.34 0.44 0.35 1.0 0.37 0.38 0.32 0.36 0.42
AMTR_s00005p00261230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00005.199)
0.74 0.45 0.8 0.24 0.26 0.02 0.23 0.05 0.33 0.37 1.0 0.9 0.6 0.53 0.41 0.61 0.88 0.68 0.51 0.33 0.53 0.6
0.2 0.44 0.38 0.3 0.24 0.03 0.35 0.06 0.36 0.37 0.89 1.0 0.66 0.74 0.71 0.7 0.95 0.68 0.57 0.76 0.71 0.79
AMTR_s00007p00259060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.316)
0.58 0.37 0.68 0.06 0.35 0.0 0.12 0.05 0.13 0.15 0.87 0.8 0.79 0.48 0.55 0.51 1.0 0.6 0.51 0.76 0.19 0.65
AMTR_s00009p00262150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.345)
0.29 0.25 0.31 0.03 0.32 0.0 0.11 0.0 0.3 0.14 0.89 1.0 0.66 0.39 0.34 0.5 1.0 0.55 0.58 0.55 0.43 0.61
AMTR_s00013p00091760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.42)
0.05 0.02 0.02 0.07 0.54 0.14 0.09 0.03 0.13 0.13 0.57 0.44 0.63 0.37 0.62 0.34 1.0 0.35 0.3 0.44 0.3 0.45
AMTR_s00014p00250090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00014.130)
0.58 0.54 0.41 0.02 0.23 0.01 0.12 0.0 0.15 0.13 0.68 0.57 0.6 0.51 0.37 0.46 1.0 0.53 0.4 0.25 0.31 0.58
AMTR_s00016p00160930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.117)
0.32 0.02 0.34 0.17 0.28 0.0 0.09 0.16 0.21 0.15 0.82 0.78 0.91 0.53 0.64 0.54 1.0 0.6 0.63 0.6 0.35 0.74
AMTR_s00016p00246090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.281)
0.72 0.33 0.95 0.15 0.44 0.01 0.14 0.09 0.21 0.17 0.49 0.49 0.59 0.57 0.68 0.57 1.0 0.5 0.42 0.45 0.43 0.65
AMTR_s00019p00134390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.116)
0.5 0.35 0.16 0.05 0.65 0.0 0.23 0.02 0.14 0.16 0.71 0.84 0.83 0.36 0.61 0.35 1.0 0.55 0.7 0.85 0.4 0.36
AMTR_s00019p00255470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.442)
0.33 0.41 0.36 0.08 0.37 0.01 0.05 0.05 0.08 0.1 0.56 0.6 0.57 0.39 0.51 0.78 1.0 0.52 0.5 0.56 0.47 0.62
AMTR_s00020p00070810 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00020.28)
0.4 0.02 0.0 0.02 0.33 0.0 0.17 0.01 0.12 0.15 0.52 0.45 0.37 0.36 0.23 0.37 1.0 0.23 0.24 0.64 0.28 0.35
AMTR_s00022p00213770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.253)
0.38 0.42 0.66 0.16 0.35 0.01 0.21 0.06 0.26 0.3 0.68 0.66 0.68 0.47 0.43 0.41 1.0 0.47 0.44 0.32 0.34 0.59
AMTR_s00022p00238440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.334)
0.24 0.32 0.84 0.05 0.23 0.01 0.14 0.03 0.26 0.25 0.68 0.58 0.61 0.57 0.66 0.39 1.0 0.5 0.41 0.53 0.3 0.73
AMTR_s00024p00040890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.14)
0.43 0.42 0.59 0.1 0.51 0.01 0.01 0.0 0.03 0.04 0.33 0.35 0.42 0.32 0.72 0.21 1.0 0.29 0.23 0.23 0.1 0.54
AMTR_s00024p00115620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.65)
0.31 0.36 0.33 0.15 0.3 0.0 0.09 0.07 0.16 0.16 0.98 0.9 0.91 0.57 0.63 0.97 1.0 0.74 0.64 0.44 0.54 0.88
AMTR_s00025p00100140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.84)
0.14 0.1 0.2 0.06 0.36 0.02 0.04 0.0 0.1 0.08 0.46 0.39 0.44 0.3 0.39 0.2 1.0 0.29 0.29 0.36 0.31 0.3
AMTR_s00025p00194920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.245)
0.26 0.81 0.92 0.07 0.24 0.16 0.16 0.07 0.27 0.28 0.85 1.0 0.67 0.57 0.42 0.53 0.92 0.81 0.66 0.49 0.43 0.82
AMTR_s00029p00103360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.100)
0.03 0.76 0.15 0.1 0.44 0.0 0.1 0.13 0.12 0.15 0.92 0.9 1.0 0.52 0.52 0.35 0.92 0.63 0.65 0.72 0.35 0.65
AMTR_s00036p00239020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00036.188)
0.51 0.59 0.43 0.0 0.4 0.0 0.06 0.01 0.13 0.11 0.69 0.64 0.84 0.44 0.48 0.3 1.0 0.42 0.47 0.44 0.34 0.6
AMTR_s00039p00165240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00039.122)
0.02 0.0 0.02 0.04 0.12 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.38 0.38 0.24 0.19 0.23 0.11 1.0 0.23 0.17 0.15 0.15 0.15
AMTR_s00039p00218660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00039.189)
0.45 0.25 0.52 0.12 0.28 0.1 0.14 0.06 0.21 0.21 0.75 1.0 0.57 0.6 0.46 0.43 0.97 0.6 0.57 0.49 0.4 0.75
AMTR_s00040p00215000 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.230)
0.08 0.04 0.04 0.02 0.19 0.0 0.02 0.01 0.08 0.07 0.6 0.6 0.29 0.24 0.38 0.15 1.0 0.32 0.26 0.2 0.31 0.19
AMTR_s00045p00223730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.315)
0.14 0.32 0.31 0.18 0.24 0.02 0.15 0.06 0.19 0.15 0.55 0.51 0.43 0.3 0.43 0.28 1.0 0.3 0.27 0.35 0.22 0.42
AMTR_s00049p00071550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.44)
0.2 0.25 0.0 0.12 0.21 0.0 0.12 0.04 0.23 0.19 0.54 0.51 0.32 0.35 0.39 0.2 1.0 0.37 0.38 0.4 0.31 0.32
AMTR_s00050p00189240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00050.52)
0.0 0.02 0.32 0.03 0.15 0.0 0.12 0.0 0.08 0.1 0.85 0.82 0.88 0.51 0.48 0.5 1.0 0.74 0.63 0.59 0.21 0.74
AMTR_s00051p00079490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00051.29)
0.25 0.37 0.26 0.1 0.26 0.04 0.11 0.0 0.22 0.2 0.68 0.68 0.71 0.65 0.91 1.0 0.72 0.49 0.56 0.74 0.8 0.64
AMTR_s00051p00090280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00051.36)
0.18 0.57 0.71 0.01 0.26 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.66 0.64 0.82 0.6 0.6 0.5 1.0 0.45 0.34 0.58 0.33 0.66
AMTR_s00051p00091260 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00051.37)
0.19 0.19 0.51 0.01 0.18 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.34 0.45 0.49 0.37 0.39 0.6 1.0 0.3 0.19 0.4 0.15 0.39
AMTR_s00051p00218610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00051.97)
0.45 0.68 0.37 0.01 0.28 0.02 0.28 0.06 0.31 0.32 0.63 0.55 0.7 0.49 0.46 0.59 1.0 0.43 0.46 0.56 0.34 0.65
AMTR_s00056p00180950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.160)
0.3 0.23 0.59 0.14 0.44 0.01 0.08 0.02 0.15 0.17 0.59 0.65 0.61 0.42 0.43 0.57 1.0 0.48 0.36 0.3 0.29 0.52
AMTR_s00056p00220040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.219)
0.38 0.29 0.31 0.1 0.06 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.9 0.92 0.85 0.28 0.26 0.44 1.0 0.63 0.75 0.66 0.14 0.45
AMTR_s00057p00039750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.19)
0.18 0.11 0.26 0.02 0.33 0.01 0.06 0.0 0.12 0.11 0.56 0.55 0.61 0.38 0.42 0.38 1.0 0.47 0.42 0.42 0.39 0.59
AMTR_s00057p00183920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.196)
0.02 0.56 0.1 0.16 0.14 0.0 0.01 0.0 0.04 0.03 0.61 0.71 0.84 0.66 0.42 0.8 1.0 0.7 0.7 0.66 0.66 0.74
AMTR_s00057p00205760 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.246)
0.15 0.18 0.14 0.08 0.35 0.03 0.2 0.06 0.23 0.21 0.66 0.72 0.66 0.39 0.48 0.43 1.0 0.43 0.4 0.37 0.28 0.62
AMTR_s00058p00175640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.165)
0.4 0.6 0.51 0.12 0.32 0.01 0.01 0.0 0.02 0.02 0.72 0.73 0.92 0.34 0.37 0.56 1.0 0.48 0.45 0.4 0.28 0.93
AMTR_s00059p00069290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.44)
0.25 0.46 0.53 0.16 0.15 0.06 0.08 0.08 0.14 0.15 0.6 0.72 0.61 0.42 0.42 0.67 1.0 0.52 0.4 0.4 0.34 0.69
AMTR_s00059p00183080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.197)
0.14 0.34 0.03 0.03 0.28 0.01 0.03 0.0 0.06 0.05 0.52 0.58 0.47 0.14 0.4 0.18 1.0 0.25 0.17 0.3 0.07 0.49
AMTR_s00059p00212210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.248)
0.28 0.0 0.41 0.04 0.33 0.0 0.05 0.02 0.12 0.11 0.72 0.68 0.66 0.48 0.32 0.44 1.0 0.47 0.4 0.46 0.2 0.6
AMTR_s00061p00051290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.29)
0.31 0.0 0.0 0.01 0.28 0.0 0.11 0.0 0.2 0.2 0.84 0.68 0.43 0.42 0.17 1.0 0.84 0.71 0.43 0.63 0.19 0.52
AMTR_s00061p00087560 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.63)
0.06 0.0 0.0 0.02 0.18 0.0 0.1 0.0 0.04 0.07 0.37 0.36 0.4 0.19 0.14 1.0 0.85 0.36 0.36 0.41 0.23 0.33
AMTR_s00064p00050700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00064.11)
0.39 0.5 0.56 0.24 0.27 0.0 0.03 0.11 0.05 0.06 0.72 0.74 0.62 0.43 0.48 0.77 1.0 0.56 0.55 0.69 0.33 0.69
AMTR_s00065p00185540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00065.158)
0.52 0.23 0.61 0.32 0.31 0.04 0.14 0.03 0.22 0.23 0.85 0.98 0.66 0.63 0.6 0.53 1.0 0.87 0.57 0.54 0.5 0.68
AMTR_s00066p00182330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.227)
0.52 0.28 0.55 0.05 0.36 0.01 0.22 0.07 0.44 0.38 1.0 0.9 0.52 0.49 0.5 0.55 0.96 0.73 0.55 0.47 0.46 0.59
AMTR_s00071p00045940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00071.24)
0.33 0.72 0.69 0.06 0.5 0.0 0.15 0.04 0.27 0.25 0.74 0.78 0.79 0.59 0.73 0.73 1.0 0.6 0.54 0.63 0.48 0.6
AMTR_s00071p00179250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00071.182)
0.77 0.59 0.04 0.0 0.34 0.0 0.18 0.09 0.13 0.14 0.51 0.23 0.44 0.36 0.3 0.4 1.0 0.23 0.24 0.56 0.22 0.77
AMTR_s00078p00181940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.179)
0.12 0.08 0.14 0.17 0.15 0.14 0.23 0.03 0.2 0.19 0.66 0.57 0.73 0.49 0.44 0.57 1.0 0.49 0.4 0.62 0.58 0.55
AMTR_s00086p00102400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00086.53)
0.33 0.33 0.15 0.14 0.45 0.13 0.35 0.09 0.23 0.24 0.63 0.52 0.63 0.38 0.25 0.67 1.0 0.49 0.53 0.63 0.52 0.36
AMTR_s00089p00034850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00089.9)
0.14 0.35 0.42 0.03 0.35 0.01 0.12 0.04 0.18 0.18 0.64 0.72 0.59 0.46 0.7 0.75 1.0 0.48 0.4 0.58 0.41 0.68
AMTR_s00099p00018620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00099.5)
0.38 0.25 0.61 0.02 0.31 0.01 0.06 0.05 0.11 0.1 0.72 0.69 0.61 0.35 0.54 0.4 1.0 0.49 0.41 0.43 0.27 0.49
AMTR_s00101p00087960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00101.64)
0.24 0.24 0.16 0.03 0.16 0.0 0.06 0.0 0.09 0.09 0.47 0.34 0.52 0.38 0.43 0.42 1.0 0.45 0.32 0.43 0.26 0.42
AMTR_s00101p00091430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00101.68)
0.0 0.04 0.07 0.0 0.25 0.0 0.08 0.0 0.13 0.1 0.75 0.81 0.73 0.28 0.3 0.91 1.0 0.47 0.38 0.44 0.26 0.54
AMTR_s00109p00054710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00109.40)
0.67 0.4 0.64 0.04 0.39 0.02 0.17 0.12 0.23 0.27 0.96 0.98 0.87 0.74 0.72 0.7 1.0 0.7 0.68 0.66 0.35 0.79
AMTR_s00109p00121860 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00109.121)
0.24 0.31 0.36 0.08 0.34 0.08 0.11 0.04 0.22 0.21 0.6 0.63 0.67 0.43 0.42 0.36 1.0 0.53 0.48 0.53 0.38 0.56
AMTR_s00110p00131200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00110.105)
0.27 0.79 0.58 0.11 0.29 0.0 0.19 0.0 0.24 0.27 0.76 0.83 1.0 0.7 0.5 0.52 0.87 0.67 0.7 0.76 0.69 0.73
AMTR_s00111p00045560 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00111.23)
0.62 0.03 0.0 0.01 0.15 0.0 0.11 0.0 0.16 0.13 0.56 0.53 0.24 0.12 0.33 0.4 1.0 0.28 0.16 0.4 0.22 0.33
AMTR_s00111p00056660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00111.28)
0.33 0.64 0.5 0.18 0.27 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.65 0.56 0.59 0.31 0.5 0.54 1.0 0.48 0.48 0.54 0.35 0.76
AMTR_s00119p00124540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00119.97)
0.15 0.22 0.18 0.0 0.31 0.0 0.02 0.0 0.02 0.03 0.48 0.48 0.51 0.26 0.5 0.34 1.0 0.29 0.31 0.49 0.22 0.58
AMTR_s00131p00046730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00131.27)
0.44 0.38 0.35 0.32 0.26 0.0 0.04 0.07 0.06 0.06 0.68 0.57 0.81 0.44 0.51 0.6 1.0 0.57 0.6 0.59 0.07 0.63
AMTR_s00136p00104320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00136.58)
0.24 0.82 1.0 0.24 0.34 0.02 0.04 0.01 0.1 0.12 0.63 0.86 0.65 0.5 0.64 0.45 0.82 0.58 0.52 0.33 0.19 0.52
AMTR_s00142p00013680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00142.4)
0.3 0.32 0.55 0.09 0.32 0.01 0.16 0.04 0.28 0.28 0.87 0.82 0.58 0.6 0.58 0.88 1.0 0.63 0.56 0.55 0.4 0.73
AMTR_s00146p00044900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00146.23)
0.17 0.38 0.42 0.08 0.05 0.0 0.14 0.02 0.21 0.19 0.68 0.79 0.78 0.45 0.47 0.99 1.0 0.51 0.51 0.61 0.37 0.71
AMTR_s00175p00061780 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00175.34)
0.46 0.47 0.36 0.32 0.61 0.02 0.15 0.03 0.21 0.23 0.82 0.81 0.89 0.49 0.57 0.38 1.0 0.58 0.57 0.66 0.25 0.59
AMTR_s00303p00010520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00303.1)
0.19 0.19 0.34 0.02 0.34 0.01 0.01 0.0 0.04 0.03 0.68 0.68 0.62 0.46 0.69 0.35 1.0 0.78 0.44 0.67 0.53 0.84

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)