Heatmap: Cluster_198 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Egg apparatus cell (small)	Egg apparatus cell (medium)	Egg apparatus cell (large)	Ovary	Uninuclear microspore	Generative cell	Pollen	Sperm	Pollen tube (bicellular)	Pollen tube (tricellular)	Flower (bud, female)	Flower (bud, male)	Flower (female)	Flower (male)	Flower (tepals)	Fruit (female)	Apical meristem	Shoot (female)	Shoot (male)	Leaf (male)	Leaves	Root (male)
AMTR_s00001p00097800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.67)	0.76	1.0	0.92	0.0	0.11	0.38	0.65	0.1	0.65	0.61	0.06	0.15	0.15	0.41	0.29	0.06	0.05	0.1	0.11	0.05	0.01	0.46
AMTR_s00002p00153430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.122)	0.73	0.86	1.0	0.55	0.4	0.56	0.85	0.21	0.83	0.72	0.66	0.61	0.59	0.61	0.77	0.52	0.71	0.44	0.48	0.72	0.37	0.61
AMTR_s00003p00132120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.99)	0.63	0.89	1.0	0.2	0.18	0.33	0.58	0.01	0.5	0.38	0.24	0.22	0.25	0.3	0.18	0.52	0.26	0.14	0.2	0.22	0.11	0.22
AMTR_s00003p00152430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.125)	0.53	0.0	1.0	0.0	0.02	0.08	0.0	0.21	0.09	0.05	0.0	0.12	0.01	0.0	0.03	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04
AMTR_s00010p00179240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.150)	1.0	0.46	0.76	0.0	0.06	0.71	0.14	0.01	0.13	0.14	0.17	0.25	0.23	0.2	0.15	0.1	0.01	0.13	0.28	0.05	0.2	0.04
AMTR_s00011p00206350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00011.75)	0.21	0.11	0.97	0.05	0.09	0.44	1.0	0.54	0.7	0.75	0.01	0.04	0.01	0.2	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00012p00258620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.308)	0.45	0.69	1.0	0.02	0.0	0.5	0.8	0.19	0.64	0.54	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
AMTR_s00013p00253430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.238)	0.12	0.36	0.82	0.0	0.16	0.39	0.94	0.27	1.0	0.83	0.03	0.05	0.0	0.13	0.05	0.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01
AMTR_s00015p00191620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00015.41)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.47	0.0	0.39	0.0	0.27	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00016p00209280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.181)	1.0	0.7	0.53	0.0	0.03	0.39	0.03	0.14	0.04	0.05	0.04	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00016p00259280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.364)	0.53	0.06	0.27	0.05	0.08	0.72	1.0	0.04	0.37	0.57	0.18	0.22	0.15	0.3	0.05	0.05	0.14	0.03	0.01	0.04	0.04	0.1
AMTR_s00023p00240990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.205)	1.0	0.0	0.0	0.04	0.11	0.97	0.04	0.02	0.16	0.07	0.36	0.15	0.15	0.21	0.18	0.22	0.52	0.27	0.15	0.11	0.31	0.16
AMTR_s00025p00102970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.85)	0.35	0.35	1.0	0.0	0.01	0.13	0.26	0.11	0.45	0.36	0.03	0.05	0.01	0.05	0.01	0.0	0.07	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02
AMTR_s00025p00208890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.273)	1.0	0.79	0.77	0.1	0.19	0.72	0.22	0.19	0.23	0.23	0.24	0.23	0.22	0.19	0.15	0.32	0.12	0.25	0.21	0.16	0.05	0.25
AMTR_s00026p00031590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00026.9)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.25	0.01	0.36	0.02	0.48	0.38	0.0	0.14	0.0	0.05	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00026p00031910	0.02	0.05	1.0	0.0	0.12	0.08	0.14	0.0	0.26	0.19	0.0	0.1	0.0	0.03	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00029p00123030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.138)	0.26	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.08	0.0	0.6	0.34	0.12	0.13	0.02	0.06	0.01	0.02	0.07	0.3	0.2	0.15	0.06	0.03
AMTR_s00029p00123080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.139)	0.16	0.06	1.0	0.0	0.01	0.0	0.1	0.05	0.59	0.36	0.11	0.07	0.04	0.05	0.01	0.03	0.06	0.24	0.13	0.12	0.02	0.02
AMTR_s00029p00186480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.247)	0.74	0.23	1.0	0.0	0.0	0.31	0.13	0.1	0.12	0.17	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0
AMTR_s00029p00235080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.379)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.03	0.01	0.24	0.0	0.54	0.27	0.04	0.07	0.03	0.04	0.02	0.0	0.05	0.06	0.05	0.05	0.08	0.04
AMTR_s00033p00210300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.184)	0.0	0.66	1.0	0.03	0.08	0.01	0.06	0.37	0.4	0.23	0.2	0.18	0.19	0.08	0.1	0.23	0.2	0.15	0.19	0.25	0.33	0.14
AMTR_s00055p00155200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00055.71)	0.0	0.0	1.0	0.13	0.32	0.23	0.87	0.0	0.61	0.61	0.44	0.46	0.22	0.29	0.32	0.04	0.3	0.25	0.43	0.38	0.18	0.18
AMTR_s00055p00218640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00055.166)	0.0	0.64	1.0	0.0	0.14	0.02	0.32	0.28	0.54	0.5	0.29	0.24	0.15	0.14	0.11	0.05	0.32	0.05	0.06	0.08	0.1	0.14
AMTR_s00057p00182580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.194)	0.54	0.22	0.01	0.19	0.34	1.0	0.29	0.02	0.28	0.24	0.31	0.18	0.25	0.23	0.23	0.37	0.19	0.23	0.32	0.26	0.21	0.23
AMTR_s00059p00152210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.138)	1.0	0.32	0.36	0.18	0.2	0.49	0.34	0.04	0.73	0.58	0.23	0.2	0.16	0.24	0.4	0.21	0.24	0.06	0.05	0.25	0.13	0.19
AMTR_s00060p00156120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00060.90)	0.1	0.33	0.98	0.0	0.04	0.01	0.99	0.22	0.88	1.0	0.04	0.26	0.01	0.16	0.02	0.03	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01
AMTR_s00061p00034560 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.10)	0.28	1.0	0.8	0.26	0.12	0.89	0.94	0.38	0.76	0.73	0.29	0.4	0.12	0.26	0.05	0.21	0.24	0.33	0.52	0.28	0.52	0.18
AMTR_s00061p00143360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.125)	1.0	0.47	0.29	0.1	0.24	0.6	0.18	0.1	0.06	0.08	0.45	0.49	0.2	0.09	0.15	0.45	0.3	0.27	0.3	0.1	0.1	0.33
AMTR_s00061p00194090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.225)	0.3	0.43	1.0	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.08	0.36	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
AMTR_s00064p00180230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00064.81)	1.0	0.0	0.86	0.0	0.67	0.0	0.03	0.0	0.51	0.36	0.0	0.27	0.1	0.0	0.18	0.0	0.03	0.0	0.0	0.02	0.0	0.18
AMTR_s00069p00178740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.167)	0.18	0.0	0.88	0.09	0.0	0.01	1.0	0.5	0.38	0.44	0.0	0.01	0.05	0.07	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
AMTR_s00073p00168640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00073.48)	0.45	0.0	1.0	0.03	0.34	0.0	0.42	0.0	0.57	0.66	0.15	0.13	0.16	0.18	0.08	0.18	0.16	0.09	0.25	0.09	0.13	0.26
AMTR_s00073p00173240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00073.51)	1.0	0.7	0.48	0.46	0.38	0.69	0.72	0.17	0.41	0.47	0.43	0.46	0.45	0.43	0.35	0.39	0.57	0.36	0.34	0.39	0.31	0.38
AMTR_s00077p00166590 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.176)	0.81	0.31	0.48	0.22	0.38	1.0	0.28	0.14	0.24	0.21	0.29	0.3	0.3	0.28	0.24	0.48	0.19	0.33	0.34	0.22	0.14	0.25
AMTR_s00085p00122470	1.0	0.19	0.35	0.0	0.07	0.37	0.01	0.0	0.04	0.02	0.17	0.18	0.09	0.08	0.1	0.61	0.08	0.18	0.28	0.1	0.1	0.11
AMTR_s00099p00078200 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00099.58)	0.21	0.0	1.0	0.03	0.07	0.02	0.21	0.31	0.45	0.45	0.16	0.15	0.2	0.14	0.05	0.2	0.03	0.07	0.04	0.02	0.06	0.23
AMTR_s00106p00095310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00106.64)	0.27	0.59	1.0	0.14	0.15	0.31	0.72	0.1	0.77	0.78	0.14	0.19	0.33	0.74	0.44	0.16	0.2	0.19	0.19	0.32	0.16	0.36
AMTR_s00110p00123600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00110.98)	1.0	0.5	0.45	0.2	0.28	0.57	0.24	0.21	0.13	0.12	0.27	0.38	0.31	0.21	0.12	0.17	0.32	0.24	0.27	0.24	0.1	0.29
AMTR_s00111p00127270 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00111.102)	1.0	0.29	0.0	0.0	0.06	0.55	0.13	0.05	0.16	0.16	0.01	0.0	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02
AMTR_s00114p00149480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00114.69)	0.0	1.0	0.84	0.0	0.12	0.0	0.02	0.17	0.06	0.05	0.09	0.07	0.06	0.1	0.02	0.11	0.04	0.31	0.27	0.24	0.5	0.19
AMTR_s00130p00111680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00130.55)	1.0	0.24	0.19	0.01	0.13	0.32	0.03	0.01	0.04	0.03	0.29	0.29	0.25	0.15	0.12	0.19	0.17	0.22	0.25	0.15	0.19	0.2
AMTR_s00140p00053130 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00140.22)	0.02	0.0	1.0	0.22	0.26	0.0	0.29	0.0	0.38	0.39	0.0	0.06	0.02	0.11	0.08	0.08	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01
AMTR_s00141p00067710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00141.19)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.33	0.0	0.16	0.0	0.56	0.29	0.0	0.0	0.0	0.04	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0
AMTR_s00144p00039870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00144.14)	0.51	0.61	1.0	0.28	0.11	0.31	0.65	0.03	0.4	0.44	0.32	0.23	0.26	0.33	0.34	0.14	0.16	0.16	0.15	0.21	0.17	0.18
AMTR_s00161p00036360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00161.8)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.35	0.0	0.32	0.0	0.54	0.52	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04
AMTR_s00173p00069210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00173.17)	0.69	0.4	0.78	0.02	0.18	0.66	1.0	0.18	0.48	0.49	0.13	0.19	0.13	0.25	0.19	0.07	0.09	0.06	0.08	0.14	0.05	0.13
AMTR_s00351p00009890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00351.1)	1.0	0.0	0.81	0.0	0.31	0.0	0.01	0.03	0.59	0.39	0.01	0.11	0.01	0.08	0.17	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.01
AMTR_s00389p00012170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00389.2)	0.07	0.72	1.0	0.06	0.07	0.48	0.27	0.03	0.38	0.32	0.07	0.06	0.07	0.09	0.06	0.07	0.05	0.03	0.07	0.05	0.04	0.23
AMTR_s04264p00002410 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold04264.1)	0.5	0.09	1.0	0.0	0.02	0.95	0.01	0.08	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)