Heatmap: Cluster_184 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00001p00112910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.79)
0.91 0.57 0.27 0.01 0.25 0.0 0.43 0.17 0.49 0.4 1.0 0.84 0.54 0.49 0.3 0.68 0.85 0.83 0.7 0.28 0.48 0.47
AMTR_s00001p00273050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.589)
1.0 0.32 0.6 0.29 0.27 0.02 0.12 0.18 0.19 0.16 0.81 0.95 0.67 0.4 0.37 0.8 0.83 0.62 0.58 0.45 0.48 0.57
AMTR_s00002p00135040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.97)
0.86 0.27 0.26 0.03 0.15 0.0 0.02 0.0 0.04 0.04 0.9 0.96 0.31 0.32 0.23 0.25 1.0 0.59 0.41 0.23 0.35 0.39
AMTR_s00002p00135270 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.98)
0.93 0.35 0.22 0.02 0.26 0.01 0.02 0.0 0.03 0.05 1.0 0.79 0.5 0.34 0.24 0.29 0.85 0.58 0.5 0.23 0.31 0.4
1.0 0.0 0.43 0.01 0.17 0.0 0.12 0.01 0.15 0.11 0.83 0.88 0.58 0.42 0.42 0.26 0.57 0.53 0.35 0.26 0.18 0.38
AMTR_s00003p00110110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.76)
0.78 0.01 0.27 0.2 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.93 0.37 0.18 0.09 0.59 0.56 0.71 0.86 0.21 0.32 0.25
AMTR_s00003p00268830 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.401)
0.75 0.0 0.0 0.01 0.35 0.0 0.07 0.0 0.08 0.07 0.67 0.52 0.41 0.17 0.14 0.27 1.0 0.34 0.43 0.26 0.26 0.35
AMTR_s00003p00269770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.417)
1.0 0.2 0.0 0.09 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.66 0.69 0.43 0.22 0.18 0.67 0.68 0.55 0.5 0.27 0.31 0.37
AMTR_s00006p00073450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.28)
0.89 0.5 0.1 0.11 0.28 0.0 0.17 0.03 0.34 0.27 1.0 0.96 0.33 0.27 0.3 0.51 0.58 0.83 0.55 0.31 0.62 0.32
AMTR_s00007p00245790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.266)
0.62 0.19 0.28 0.03 0.09 0.0 0.04 0.0 0.02 0.03 0.87 1.0 0.52 0.21 0.1 0.39 0.41 0.35 0.28 0.11 0.11 0.45
AMTR_s00009p00260370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.320)
1.0 0.0 0.3 0.0 0.11 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.89 0.64 0.37 0.2 0.14 0.15 1.0 0.69 0.49 0.3 0.48 0.5
AMTR_s00009p00262080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.344)
0.84 0.39 0.32 0.11 0.22 0.01 0.05 0.0 0.02 0.03 0.85 1.0 0.38 0.22 0.19 0.52 0.73 0.69 0.63 0.31 0.4 0.64
AMTR_s00011p00175100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00011.50)
0.98 0.05 0.38 0.07 0.25 0.0 0.08 0.0 0.13 0.14 1.0 0.98 0.52 0.29 0.25 0.65 0.59 0.86 0.57 0.41 0.36 0.53
AMTR_s00012p00127030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.66)
1.0 0.0 0.56 0.16 0.18 0.01 0.06 0.0 0.1 0.08 0.73 0.63 0.42 0.36 0.29 0.41 0.89 0.63 0.57 0.36 0.71 0.38
AMTR_s00012p00190030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.121)
0.61 0.1 0.01 0.15 0.08 0.0 0.01 0.01 0.02 0.03 0.58 0.48 0.52 0.29 0.24 0.47 0.69 1.0 0.46 0.22 0.21 0.46
0.72 0.15 0.2 0.06 0.17 0.02 0.02 0.0 0.01 0.02 1.0 0.75 0.6 0.25 0.2 0.54 0.66 0.57 0.54 0.34 0.57 0.41
AMTR_s00012p00261420 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.323)
0.75 0.02 0.25 0.07 0.34 0.01 0.11 0.13 0.1 0.11 1.0 0.62 0.59 0.5 0.29 0.56 0.54 0.5 0.43 0.41 0.26 0.43
AMTR_s00013p00103080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.53)
0.19 0.45 0.0 0.01 0.18 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 1.0 0.55 0.78 0.3 0.23 0.24 0.77 0.36 0.32 0.28 0.08 0.39
AMTR_s00019p00249410 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.401)
0.39 0.79 0.21 0.02 0.18 0.01 0.05 0.0 0.09 0.06 1.0 0.97 0.55 0.27 0.4 0.66 0.81 0.67 0.62 0.21 0.54 0.44
AMTR_s00021p00042680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.16)
0.97 0.22 0.9 0.1 0.26 0.01 0.1 0.04 0.13 0.15 0.8 0.76 0.5 0.35 0.23 0.4 1.0 0.58 0.41 0.33 0.41 0.52
AMTR_s00021p00087240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.39)
1.0 0.0 0.36 0.0 0.16 0.0 0.09 0.01 0.12 0.14 0.62 0.67 0.57 0.36 0.33 0.2 0.88 0.48 0.28 0.18 0.22 0.4
AMTR_s00021p00180100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.138)
1.0 0.33 0.0 0.05 0.49 0.0 0.08 0.0 0.09 0.09 0.88 0.9 0.57 0.33 0.22 0.42 0.74 0.5 0.4 0.36 0.53 0.43
AMTR_s00022p00189290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.206)
1.0 0.41 0.04 0.14 0.45 0.04 0.07 0.18 0.09 0.12 0.96 0.81 0.71 0.4 0.21 0.46 0.59 0.35 0.42 0.24 0.21 0.6
AMTR_s00022p00227870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.300)
0.71 0.0 0.07 0.07 0.35 0.0 0.02 0.0 0.04 0.05 1.0 0.62 0.49 0.2 0.23 0.32 0.57 0.56 0.51 0.33 0.35 0.32
AMTR_s00025p00108960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.94)
0.82 0.53 0.0 0.02 0.18 0.0 0.05 0.0 0.07 0.05 0.97 1.0 0.42 0.26 0.16 0.44 0.53 0.48 0.36 0.12 0.18 0.42
AMTR_s00025p00126210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.116)
0.73 0.5 0.0 0.06 0.08 0.0 0.07 0.0 0.11 0.08 1.0 0.94 0.43 0.29 0.12 0.28 0.46 0.48 0.57 0.23 0.19 0.29
AMTR_s00029p00145660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.170)
0.64 0.07 0.26 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.55 1.0 0.47 0.14 0.04 0.44 0.42 0.26 0.12 0.1 0.05 0.26
AMTR_s00029p00233630 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.375)
0.89 0.6 0.0 0.1 0.1 0.0 0.02 0.0 0.03 0.04 1.0 0.67 0.3 0.16 0.1 0.21 0.55 0.4 0.36 0.26 0.23 0.25
AMTR_s00029p00235180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.380)
0.59 0.28 0.03 0.01 0.15 0.01 0.01 0.0 0.04 0.03 1.0 0.8 0.47 0.2 0.13 0.28 0.55 0.33 0.46 0.13 0.2 0.27
AMTR_s00029p00241780 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.416)
1.0 0.0 0.01 0.03 0.07 0.0 0.03 0.0 0.07 0.08 0.87 0.71 0.45 0.39 0.15 0.5 0.76 0.58 0.46 0.37 0.45 0.32
AMTR_s00029p00247640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.447)
0.54 0.02 0.2 0.07 0.15 0.26 0.19 0.0 0.1 0.18 1.0 0.79 0.48 0.36 0.2 0.41 0.63 0.59 0.63 0.43 0.32 0.29
AMTR_s00032p00194040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.176)
0.28 0.3 0.15 0.03 0.21 0.07 0.13 0.01 0.37 0.28 0.8 0.87 0.51 0.65 0.38 0.49 1.0 0.58 0.41 0.41 0.38 0.26
AMTR_s00033p00199740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.164)
1.0 0.31 0.82 0.05 0.15 0.01 0.04 0.0 0.05 0.06 0.69 0.69 0.49 0.22 0.13 0.45 0.81 0.59 0.5 0.3 0.24 0.43
AMTR_s00038p00204530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00038.155)
0.98 0.0 0.47 0.18 0.28 0.01 0.23 0.0 0.24 0.21 1.0 0.96 0.44 0.43 0.53 0.58 0.7 0.52 0.49 0.48 0.36 0.44
1.0 0.07 0.52 0.24 0.28 0.0 0.12 0.0 0.14 0.14 0.88 0.99 0.56 0.35 0.46 0.38 0.6 0.6 0.53 0.4 0.3 0.43
AMTR_s00039p00189340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00039.152)
0.7 0.4 0.0 0.13 0.25 0.0 0.04 0.0 0.28 0.18 1.0 0.66 0.41 0.32 0.29 0.25 0.69 0.72 0.53 0.2 0.15 0.45
AMTR_s00040p00191090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.189)
0.62 0.44 0.02 0.17 0.25 0.15 0.17 0.08 0.12 0.12 1.0 0.68 0.64 0.36 0.22 0.57 0.69 0.59 0.52 0.37 0.34 0.49
AMTR_s00040p00194390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.192)
1.0 0.4 0.07 0.01 0.21 0.1 0.06 0.01 0.11 0.12 0.79 0.65 0.47 0.37 0.18 0.45 0.75 0.51 0.37 0.3 0.25 0.42
AMTR_s00041p00200730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.180)
1.0 0.2 0.69 0.01 0.07 0.0 0.03 0.0 0.04 0.03 0.89 0.66 0.43 0.39 0.21 0.79 0.47 0.51 0.41 0.34 0.19 0.76
AMTR_s00045p00208290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.281)
1.0 0.29 0.49 0.07 0.06 0.0 0.06 0.0 0.15 0.13 0.73 0.77 0.26 0.21 0.21 0.34 0.53 0.65 0.53 0.38 0.37 0.26
AMTR_s00045p00222230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.312)
0.94 0.0 0.02 0.32 0.34 0.0 0.07 0.02 0.15 0.11 1.0 0.9 0.41 0.44 0.4 0.38 0.5 0.85 0.77 0.35 0.66 0.31
AMTR_s00049p00120540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.97)
1.0 0.91 0.0 0.03 0.58 0.0 0.15 0.0 0.24 0.19 0.96 0.97 0.54 0.37 0.29 0.43 0.85 0.88 0.75 0.33 0.47 0.48
AMTR_s00049p00191150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.201)
0.87 1.0 0.0 0.04 0.49 0.0 0.16 0.09 0.21 0.18 0.71 0.64 0.4 0.24 0.15 0.34 0.74 0.52 0.52 0.23 0.33 0.21
AMTR_s00055p00202230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00055.142)
0.83 0.0 0.0 0.03 0.5 0.0 0.27 0.0 0.19 0.16 0.9 0.6 0.42 0.25 0.23 0.34 1.0 0.66 0.62 0.23 0.6 0.79
AMTR_s00056p00066830 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.42)
1.0 0.0 0.35 0.08 0.41 0.03 0.07 0.0 0.13 0.13 0.76 0.71 0.54 0.24 0.13 0.3 0.92 0.54 0.45 0.22 0.25 0.46
AMTR_s00057p00168150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.175)
1.0 0.48 0.46 0.08 0.11 0.01 0.02 0.0 0.09 0.07 0.95 0.85 0.6 0.25 0.19 0.32 0.97 0.55 0.37 0.31 0.34 0.52
AMTR_s00057p00169950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.177)
1.0 0.61 0.0 0.02 0.21 0.0 0.05 0.0 0.05 0.05 0.84 0.75 0.27 0.21 0.19 0.4 0.52 0.3 0.26 0.19 0.25 0.25
AMTR_s00058p00135170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.97)
0.84 0.01 0.28 0.16 0.25 0.01 0.14 0.0 0.14 0.14 0.86 1.0 0.65 0.34 0.19 0.29 0.68 0.42 0.66 0.24 0.23 0.33
0.78 0.02 0.01 0.14 0.07 0.0 0.04 0.1 0.1 0.07 1.0 0.6 0.48 0.23 0.1 0.33 0.83 0.48 0.46 0.32 0.38 0.45
AMTR_s00061p00186110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.211)
0.73 0.17 0.75 0.44 0.2 0.0 0.05 0.0 0.13 0.13 0.76 0.8 0.65 0.46 0.35 0.38 1.0 0.62 0.5 0.41 0.61 0.56
AMTR_s00063p00149680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00063.40)
0.7 0.0 0.32 0.06 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.72 0.41 0.14 0.08 0.79 0.68 0.96 0.82 0.31 0.28 0.34
AMTR_s00066p00121670 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.116)
0.83 0.0 0.49 0.1 0.29 0.0 0.08 0.23 0.12 0.14 0.94 1.0 0.7 0.3 0.25 0.48 0.93 0.53 0.48 0.54 0.22 0.58
AMTR_s00066p00181890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.226)
0.7 0.46 0.0 0.16 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.85 0.47 0.38 0.25 0.58 0.83 0.86 1.0 0.37 0.59 0.63
AMTR_s00067p00167320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00067.172)
1.0 0.29 0.4 0.16 0.33 0.03 0.05 0.02 0.12 0.11 0.81 0.67 0.42 0.3 0.51 0.36 0.41 0.65 0.42 0.16 0.4 0.3
AMTR_s00069p00036320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.19)
0.74 0.02 0.07 0.13 0.17 0.06 0.22 0.07 0.31 0.29 0.79 1.0 0.4 0.27 0.25 0.71 0.47 0.82 0.75 0.28 0.43 0.31
AMTR_s00069p00069960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.42)
1.0 0.44 0.2 0.08 0.18 0.01 0.06 0.02 0.14 0.15 0.66 0.62 0.44 0.32 0.31 0.78 0.77 0.61 0.42 0.2 0.19 0.42
0.75 0.17 0.42 0.06 0.43 0.01 0.31 0.09 0.44 0.42 0.97 0.93 0.65 0.68 0.45 0.45 1.0 0.9 0.77 0.44 0.46 0.46
AMTR_s00092p00158340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.134)
0.85 0.09 0.24 0.09 0.28 0.01 0.21 0.03 0.25 0.23 1.0 0.83 0.6 0.63 0.31 0.74 0.65 0.68 0.6 0.39 0.32 0.54
AMTR_s00095p00110450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00095.67)
0.95 0.35 0.37 0.19 0.35 0.0 0.02 0.0 0.03 0.03 1.0 0.82 0.73 0.53 0.22 0.55 0.79 0.76 0.62 0.47 0.42 0.51
AMTR_s00095p00122580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00095.76)
0.11 0.0 0.0 0.14 0.22 0.06 0.27 0.0 0.23 0.45 0.78 0.85 0.35 0.26 0.29 0.46 0.27 1.0 0.73 0.24 0.46 0.25
AMTR_s00097p00122940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00097.30)
1.0 0.14 0.61 0.23 0.19 0.0 0.27 0.06 0.29 0.28 0.81 0.59 0.45 0.44 0.33 0.44 0.75 0.66 0.59 0.33 0.37 0.43
AMTR_s00098p00019020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00098.1)
0.92 0.29 0.6 0.15 0.35 0.2 0.5 0.0 0.32 0.43 0.99 1.0 0.59 0.59 0.28 0.6 0.44 0.72 0.65 0.35 0.39 0.62
AMTR_s00098p00020560 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00098.2)
0.87 0.32 0.56 0.03 0.22 0.04 0.37 0.0 0.28 0.29 0.75 1.0 0.33 0.44 0.2 0.46 0.6 0.68 0.38 0.21 0.49 0.52
AMTR_s00114p00051110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00114.16)
1.0 0.01 0.14 0.23 0.26 0.19 0.17 0.18 0.24 0.23 0.91 0.83 0.65 0.41 0.27 0.41 0.86 0.53 0.42 0.19 0.21 0.62
AMTR_s00116p00130860 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00116.35)
1.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.05 0.0 0.15 0.11 0.71 0.79 0.29 0.34 0.11 0.3 0.42 0.56 0.33 0.19 0.26 0.29
AMTR_s00125p00070010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00125.16)
0.99 0.37 0.42 0.09 0.12 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.88 0.47 0.08 0.22 0.54 0.94 0.43 0.46 0.45 0.28 0.57
AMTR_s00143p00058740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00143.13)
0.87 0.41 0.8 0.11 0.3 0.01 0.27 0.07 0.33 0.33 0.81 0.8 0.54 0.42 0.36 0.57 1.0 0.76 0.72 0.52 0.54 0.48
AMTR_s00144p00069890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00144.35)
0.81 0.2 0.0 0.01 0.29 0.0 0.09 0.0 0.12 0.12 1.0 0.82 0.44 0.33 0.31 0.6 0.63 0.69 0.45 0.15 0.38 0.41
AMTR_s00146p00018170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00146.2)
1.0 0.49 0.56 0.26 0.29 0.21 0.12 0.04 0.12 0.12 0.85 0.8 0.63 0.46 0.23 0.59 0.94 0.46 0.55 0.53 0.44 0.45
AMTR_s00149p00082270 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00149.66)
1.0 0.21 0.39 0.05 0.26 0.01 0.02 0.0 0.02 0.03 0.55 0.51 0.53 0.2 0.23 0.37 0.72 0.39 0.28 0.33 0.13 0.4
AMTR_s00171p00060310 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00171.44)
0.96 0.23 0.91 0.1 0.24 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.99 0.57 0.33 0.27 0.55 0.63 1.0 0.53 0.22 0.59 0.87
AMTR_s00175p00021990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00175.2)
0.86 0.41 0.0 0.06 0.26 0.29 0.23 0.06 0.19 0.18 1.0 0.82 0.73 0.48 0.26 0.5 0.84 0.68 0.67 0.49 0.3 0.56

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)