Heatmap: Cluster_204 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00001p00018090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.5)
0.0 0.03 0.04 0.02 0.05 0.0 0.04 0.0 0.03 0.03 0.74 0.47 0.39 0.23 0.07 0.32 0.3 0.52 1.0 0.24 0.18 0.21
AMTR_s00001p00272880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.572)
0.0 0.01 0.15 0.18 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 1.0 0.78 0.27 0.12 0.08 0.47 0.39 0.94 0.81 0.22 0.29 0.19
AMTR_s00002p00160160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.133)
0.01 0.07 0.0 0.3 0.06 0.0 0.02 0.0 0.03 0.03 1.0 0.83 0.32 0.21 0.07 0.17 0.39 0.55 0.49 0.25 0.23 0.18
AMTR_s00002p00270390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.582)
0.0 0.33 0.11 0.15 0.11 0.0 0.04 0.0 0.04 0.05 1.0 0.64 0.36 0.11 0.06 0.56 0.41 0.63 0.72 0.15 0.15 0.31
AMTR_s00003p00162530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.135)
0.0 0.0 0.68 0.24 0.58 0.02 0.09 0.0 0.11 0.11 0.73 0.89 0.55 0.52 0.31 0.66 0.69 0.99 0.91 0.52 1.0 0.37
AMTR_s00006p00259530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.218)
0.08 0.55 0.74 0.24 0.09 0.01 0.02 0.0 0.03 0.03 0.85 0.76 0.32 0.33 0.15 1.0 0.61 0.78 0.54 0.47 0.64 0.26
AMTR_s00006p00260160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.220)
0.02 0.0 0.46 0.11 0.13 0.13 0.54 0.25 0.4 0.39 0.97 1.0 0.53 0.47 0.13 0.54 0.71 0.92 0.97 0.29 0.32 0.37
AMTR_s00007p00239300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.251)
0.0 0.0 0.65 0.08 0.06 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.76 0.53 0.29 0.2 0.07 0.2 0.43 1.0 0.7 0.31 0.4 0.2
AMTR_s00007p00249450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.278)
0.14 0.22 0.61 0.04 0.29 0.07 0.11 0.08 0.2 0.2 0.82 0.67 0.39 0.39 0.27 1.0 0.67 0.72 0.44 0.33 0.46 0.27
AMTR_s00007p00258060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.309)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.1 0.0 0.14 0.14 0.63 0.76 0.26 0.31 0.05 0.4 0.56 1.0 0.56 0.19 0.52 0.26
AMTR_s00007p00266080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.368)
0.0 0.05 0.0 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.72 0.18 0.28 0.09 0.6 0.55 1.0 0.43 0.21 0.74 0.24
AMTR_s00008p00040610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00008.13)
0.05 0.0 0.64 0.01 0.22 0.02 0.02 0.0 0.02 0.02 1.0 0.76 0.32 0.19 0.11 0.13 0.56 0.46 0.62 0.43 0.39 0.27
AMTR_s00009p00261490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.333)
0.2 0.02 0.34 0.03 0.05 0.0 0.2 0.0 0.14 0.11 0.82 0.73 0.26 0.22 0.05 0.24 0.45 1.0 0.68 0.15 0.44 0.13
AMTR_s00010p00258070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.409)
0.18 0.26 0.44 0.03 0.07 0.0 0.23 0.14 0.22 0.18 0.93 1.0 0.48 0.29 0.23 0.79 0.7 0.91 0.65 0.38 0.34 0.24
AMTR_s00012p00228300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.179)
0.11 0.51 0.0 0.0 0.2 0.0 0.12 0.01 0.17 0.15 0.95 0.62 0.32 0.2 0.15 0.46 0.84 0.75 1.0 0.29 0.37 0.25
AMTR_s00012p00232280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.188)
0.13 0.04 0.7 0.05 0.13 0.0 0.43 0.0 0.36 0.38 1.0 0.88 0.29 0.26 0.16 0.46 0.74 1.0 0.98 0.37 0.97 0.18
AMTR_s00016p00112930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.74)
0.0 0.29 0.02 0.09 0.17 0.0 0.05 0.0 0.16 0.1 0.97 0.62 0.22 0.19 0.19 0.48 0.46 1.0 0.69 0.37 0.67 0.09
AMTR_s00016p00231800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.228)
0.0 0.02 0.26 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.04 0.04 1.0 0.53 0.28 0.04 0.08 0.37 0.59 0.65 0.65 0.04 0.67 0.13
AMTR_s00017p00186340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.105)
0.0 0.35 0.6 0.15 0.18 0.02 0.04 0.0 0.04 0.04 0.98 0.77 0.35 0.23 0.16 1.0 0.71 0.94 0.62 0.32 0.61 0.21
AMTR_s00017p00186830 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.106)
0.0 0.0 0.54 0.13 0.19 0.0 0.03 0.0 0.04 0.03 0.58 0.95 0.21 0.18 0.16 0.92 0.46 1.0 0.45 0.38 0.71 0.23
AMTR_s00018p00255490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00018.168)
0.0 0.0 0.0 0.36 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.68 0.37 0.25 0.06 0.12 0.61 0.44 0.43 0.16 0.25 0.11
AMTR_s00019p00039340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.18)
0.0 0.0 0.0 0.05 0.24 0.0 0.02 0.0 0.04 0.03 0.95 1.0 0.18 0.05 0.15 0.41 0.22 0.67 0.79 0.51 0.71 0.19
AMTR_s00019p00231050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.315)
0.0 0.0 0.0 0.09 0.22 0.0 0.08 0.0 0.15 0.15 1.0 0.77 0.24 0.23 0.19 0.37 0.54 0.92 0.8 0.13 0.31 0.16
AMTR_s00021p00115920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.64)
0.0 0.06 0.22 0.03 0.17 0.0 0.33 0.0 0.47 0.53 0.79 0.81 0.44 0.22 0.09 0.66 0.78 1.0 0.75 0.25 0.53 0.22
AMTR_s00022p00017150 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.5)
0.07 0.34 0.29 0.32 0.06 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.59 0.74 0.15 0.17 0.14 0.72 0.49 0.73 0.56 0.33 1.0 0.26
AMTR_s00022p00098890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.82)
0.12 0.14 0.0 0.26 0.07 0.01 0.03 0.0 0.02 0.02 1.0 0.89 0.29 0.1 0.08 0.3 0.47 0.94 0.83 0.31 0.32 0.15
AMTR_s00022p00127120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.118)
0.01 0.02 0.0 0.12 0.16 0.0 0.02 0.01 0.07 0.04 0.66 0.52 0.28 0.19 0.14 0.33 0.57 0.67 1.0 0.29 0.39 0.18
AMTR_s00022p00251260 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.388)
0.26 0.03 0.08 0.02 0.07 0.0 0.01 0.07 0.02 0.02 1.0 0.9 0.36 0.1 0.04 0.43 0.62 0.96 0.96 0.25 0.57 0.22
AMTR_s00023p00241180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.207)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.14 0.06 0.04 0.05 0.05 1.0 0.67 0.38 0.14 0.17 0.51 0.48 0.84 0.83 0.41 0.2 0.16
AMTR_s00025p00136470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.139)
0.06 0.06 0.23 0.03 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.8 0.21 0.22 0.1 0.34 0.36 1.0 0.56 0.34 0.35 0.27
AMTR_s00025p00136600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.140)
0.04 0.07 0.2 0.09 0.17 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.59 0.32 0.21 0.1 0.24 0.35 0.84 0.5 0.34 0.16 0.27
AMTR_s00025p00217750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.298)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.64 0.1 0.09 0.01 0.21 0.45 0.98 0.69 0.08 0.27 0.03
AMTR_s00029p00237180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.396)
0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 0.03 0.04 0.0 0.07 0.08 0.84 0.78 0.18 0.24 0.12 0.3 0.42 1.0 0.58 0.22 0.57 0.17
AMTR_s00029p00242750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.424)
0.01 0.01 0.09 0.17 0.05 0.0 0.03 0.0 0.02 0.05 1.0 0.59 0.24 0.11 0.02 0.34 0.49 0.79 0.94 0.24 0.52 0.08
AMTR_s00030p00041970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.14)
0.0 0.06 0.58 0.06 0.17 0.01 0.11 0.0 0.16 0.13 0.8 0.9 0.44 0.28 0.15 0.54 0.63 1.0 0.72 0.37 0.79 0.28
AMTR_s00030p00222710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.171)
0.11 0.11 0.16 0.1 0.04 0.02 0.08 0.01 0.04 0.04 0.84 0.61 0.26 0.15 0.03 0.13 0.52 1.0 0.65 0.12 0.4 0.14
AMTR_s00032p00018130 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.3)
0.33 0.0 0.37 0.08 0.13 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 1.0 0.84 0.3 0.17 0.07 0.64 0.93 0.98 0.98 0.33 0.61 0.2
AMTR_s00032p00034370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.15)
0.01 0.03 0.11 0.24 0.11 0.0 0.06 0.0 0.07 0.06 1.0 0.82 0.25 0.17 0.14 0.39 0.56 0.83 0.61 0.25 0.57 0.15
AMTR_s00032p00122530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.85)
0.0 0.07 0.44 0.02 0.25 0.0 0.32 0.0 0.3 0.29 1.0 1.0 0.63 0.37 0.37 0.47 0.75 0.88 0.93 0.42 0.99 0.43
AMTR_s00032p00130220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.89)
0.17 0.15 0.13 0.25 0.08 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 1.0 0.58 0.5 0.12 0.04 0.66 0.48 0.73 0.68 0.23 0.36 0.13
AMTR_s00037p00179540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00037.86)
0.04 0.08 0.49 0.17 0.11 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.69 0.91 0.37 0.18 0.1 0.7 0.66 0.79 0.8 0.4 1.0 0.34
AMTR_s00038p00138170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00038.83)
0.02 0.0 0.0 0.07 0.06 0.0 0.07 0.0 0.08 0.06 0.85 0.75 0.64 0.18 0.09 0.12 0.45 1.0 0.69 0.13 0.41 0.2
AMTR_s00044p00062160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.33)
0.0 0.0 0.07 0.08 0.15 0.0 0.01 0.0 0.04 0.03 0.7 1.0 0.21 0.03 0.06 0.49 0.72 0.81 0.57 0.08 0.36 0.24
AMTR_s00048p00224860 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.214)
0.31 0.42 0.4 0.11 0.3 0.03 0.08 0.05 0.05 0.07 1.0 0.73 0.52 0.3 0.22 0.33 0.59 0.7 0.84 0.45 0.33 0.4
AMTR_s00049p00169350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.158)
0.0 0.06 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.54 0.15 0.08 0.08 0.24 0.61 1.0 0.88 0.14 0.47 0.09
AMTR_s00053p00090140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00053.45)
0.0 0.0 0.0 0.18 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 1.0 0.8 0.16 0.08 0.1 0.05 0.23 0.49 0.67 0.22 0.57 0.11
AMTR_s00056p00069820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.47)
0.0 0.0 0.39 0.18 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.74 0.18 0.03 0.02 0.18 0.49 0.77 0.45 0.06 0.18 0.29
AMTR_s00056p00141500 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.115)
0.11 0.13 0.45 0.07 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.64 0.39 0.15 0.17 0.37 0.58 0.98 0.89 0.44 0.45 0.2
0.08 0.02 0.22 0.07 0.03 0.01 0.02 0.01 0.04 0.03 0.6 0.53 0.17 0.09 0.06 0.23 0.53 1.0 0.52 0.19 0.41 0.18
AMTR_s00057p00161970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.150)
0.0 0.02 0.0 0.08 0.07 0.06 0.39 0.0 0.26 0.22 0.93 0.61 0.13 0.18 0.02 0.67 0.58 1.0 0.69 0.27 1.0 0.04
AMTR_s00057p00162170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.151)
0.17 0.0 0.02 0.17 0.09 0.01 0.25 0.01 0.14 0.13 0.95 0.58 0.32 0.19 0.05 0.33 0.84 0.95 1.0 0.28 0.55 0.16
AMTR_s00061p00166800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.170)
0.45 0.0 0.49 0.01 0.14 0.0 0.17 0.0 0.13 0.12 0.88 0.57 0.35 0.25 0.1 0.77 0.63 1.0 0.78 0.34 0.23 0.18
AMTR_s00062p00145630 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.132)
0.0 0.0 0.0 0.07 0.19 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.86 0.66 0.39 0.11 0.06 0.27 0.49 1.0 0.87 0.22 0.31 0.19
AMTR_s00066p00040550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.17)
0.07 0.16 0.07 0.36 0.07 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.97 0.74 0.23 0.17 0.12 0.29 0.49 1.0 0.6 0.17 0.73 0.3
AMTR_s00069p00130920 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.91)
0.08 0.17 0.04 0.05 0.12 0.07 0.12 0.02 0.04 0.05 0.82 0.6 0.09 0.04 0.2 0.25 0.22 1.0 0.61 0.22 0.24 0.05
AMTR_s00072p00102490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00072.49)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.9 0.68 0.43 0.1 0.11 0.37 0.42 0.98 1.0 0.31 0.49 0.33
AMTR_s00076p00181180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00076.69)
0.0 0.0 0.33 0.01 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.74 0.29 0.21 0.11 0.56 0.59 1.0 0.63 0.34 0.85 0.2
AMTR_s00078p00125670 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.101)
0.31 0.46 0.79 0.18 0.23 0.0 0.02 0.0 0.07 0.07 0.97 1.0 0.33 0.34 0.26 0.79 0.74 0.78 0.46 0.46 0.37 0.35
AMTR_s00082p00122660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00082.26)
0.27 0.08 0.54 0.04 0.19 0.0 0.06 0.0 0.06 0.07 1.0 0.88 0.29 0.12 0.08 0.34 0.47 0.64 0.86 0.15 0.33 0.14
AMTR_s00088p00128580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00088.93)
0.06 0.11 0.07 0.27 0.09 0.0 0.04 0.01 0.06 0.05 1.0 0.81 0.16 0.24 0.12 0.15 0.41 0.75 0.58 0.13 0.28 0.09
AMTR_s00089p00029710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00089.8)
0.0 0.25 0.35 0.03 0.12 0.02 0.01 0.0 0.02 0.04 0.92 0.77 0.21 0.11 0.05 0.27 0.6 1.0 0.93 0.12 0.38 0.17
AMTR_s00089p00072370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00089.30)
0.23 0.0 0.67 0.0 0.08 0.0 0.11 0.0 0.24 0.31 0.72 0.82 0.25 0.09 0.04 0.35 0.77 1.0 0.74 0.32 0.32 0.11
AMTR_s00089p00168750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00089.99)
0.1 0.07 0.02 0.17 0.11 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.68 0.36 0.28 0.16 0.47 0.7 0.55 0.38 0.12 0.27 0.03
AMTR_s00092p00091040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.51)
0.0 0.0 0.16 0.24 0.29 0.11 0.19 0.0 0.2 0.19 1.0 0.98 0.45 0.33 0.41 0.53 0.69 0.98 0.94 0.3 0.49 0.28
AMTR_s00099p00124940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00099.108)
0.0 0.07 0.32 0.05 0.35 0.0 0.31 0.02 0.23 0.21 0.94 0.89 0.63 0.54 0.27 0.58 0.43 0.95 1.0 0.54 1.0 0.27
AMTR_s00111p00138070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00111.118)
0.01 0.0 0.01 0.29 0.09 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 1.0 0.86 0.34 0.23 0.07 0.65 0.76 0.93 0.81 0.43 0.75 0.17
AMTR_s00114p00089730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00114.33)
0.36 0.62 0.47 0.01 0.23 0.0 0.32 0.14 0.29 0.25 0.99 1.0 0.63 0.6 0.2 0.52 0.59 0.85 0.74 0.46 0.37 0.5
AMTR_s00154p00031530 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00154.12)
0.2 0.16 0.06 0.25 0.19 0.0 0.03 0.0 0.03 0.03 1.0 0.63 0.71 0.23 0.33 0.66 0.47 0.69 0.76 0.46 0.3 0.12
AMTR_s05169p00002110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold05169.1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.86 0.98 0.18 0.17 0.06 0.28 0.43 1.0 0.59 0.17 0.51 0.22

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)