1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_254 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00001p00156050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.142)
 0.41 0.53 0.34 0.57 1.0 0.35 0.3 0.29 0.37 0.44 0.38 0.55 0.67 0.67 0.58 0.39 0.1 0.34 0.44 0.19 0.09 0.56
AMTR_s00001p00244480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.289)
 0.58 0.1 0.15 0.28 0.84 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.14 0.14 0.64 0.9 1.0 0.26 0.13 0.11 0.13 0.76 0.13 0.58
AMTR_s00002p00134180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.95)
 0.83 0.36 1.0 0.42 0.67 0.15 0.09 0.06 0.25 0.2 0.5 0.48 0.66 0.66 0.77 0.55 0.5 0.4 0.41 0.43 0.21 0.67
AMTR_s00002p00240250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.297)
 0.07 0.0 0.0 0.86 1.0 0.0 0.1 0.0 0.05 0.1 0.48 0.25 0.34 0.12 0.76 0.4 0.82 0.26 0.51 0.44 0.63 0.92
AMTR_s00006p00267360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.301)
 0.0 0.0 0.0 0.39 0.39 0.0 0.03 0.0 0.18 0.09 0.09 0.31 0.26 0.14 0.14 0.0 0.15 0.0 0.31 0.8 0.12 1.0
AMTR_s00007p00250120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.280)
 0.86 1.0 0.53 0.45 0.38 0.0 0.02 0.22 0.21 0.12 0.46 0.52 0.26 0.48 0.2 0.36 0.12 0.16 0.22 0.07 0.1 0.21
AMTR_s00012p00233600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.190)
 0.78 0.83 0.7 1.0 1.0 0.54 0.43 0.55 0.72 0.86 0.87 0.73 0.86 0.87 0.68 0.49 0.4 0.69 0.59 0.5 0.58 0.65
AMTR_s00016p00104160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.65)
 0.0 0.47 0.22 0.36 0.46 0.53 0.17 0.0 0.08 0.1 0.15 0.17 0.28 0.57 0.74 1.0 0.15 0.11 0.15 0.32 0.05 0.48
AMTR_s00016p00242400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.259)
 0.15 1.0 0.34 0.4 0.69 0.01 0.08 0.0 0.08 0.09 0.58 0.5 0.64 0.49 0.89 0.6 0.45 0.18 0.38 0.36 0.2 0.91
AMTR_s00017p00256710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.283)
 0.79 0.42 0.55 0.33 0.71 0.01 0.02 0.01 0.06 0.05 0.27 0.63 0.48 0.99 1.0 0.75 0.49 0.23 0.16 0.18 0.19 0.25
AMTR_s00019p00222550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.283)
 0.19 0.12 0.18 0.25 0.29 0.19 0.44 0.04 0.35 0.37 0.38 0.28 0.4 0.93 1.0 0.39 0.26 0.2 0.2 0.38 0.21 0.51
AMTR_s00021p00200510 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.167)
 0.08 0.08 0.04 0.09 0.09 0.1 0.26 0.12 0.35 0.41 0.12 0.08 0.2 0.57 1.0 0.12 0.08 0.07 0.19 0.5 0.13 0.13
AMTR_s00022p00240740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.343)
 0.09 0.01 0.15 0.22 1.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.04 0.44 0.53 0.28 0.06 0.78 0.1 0.64 0.3 0.23 0.17 0.65 0.98
AMTR_s00024p00232670 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.252)
 0.0 0.68 0.0 0.02 0.56 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.19 0.45 0.41 0.35 0.33 0.41 0.09 0.17 0.8 0.34 0.41 1.0
AMTR_s00024p00240490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.280)
 0.81 0.58 0.81 0.24 1.0 0.34 0.25 0.16 0.26 0.2 0.33 0.33 0.78 0.72 0.89 0.31 0.32 0.18 0.18 0.68 0.14 0.67
AMTR_s00030p00237270 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00030.203)
 0.53 1.0 0.54 0.56 0.63 0.2 0.17 0.25 0.17 0.2 0.44 0.49 0.56 0.77 0.62 0.55 0.29 0.41 0.39 0.37 0.24 0.76
AMTR_s00031p00041130 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00031.9)
 0.19 0.28 0.0 0.58 0.63 0.0 0.01 0.0 0.32 0.38 0.45 0.29 0.29 0.19 0.34 0.12 0.27 1.0 0.23 0.44 0.49 0.29
AMTR_s00032p00204040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.194)
 0.51 0.38 0.53 0.37 0.76 0.5 0.45 0.25 0.26 0.28 0.63 0.92 0.46 0.5 1.0 0.32 0.28 0.18 0.13 0.08 0.02 0.85
AMTR_s00032p00228290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.247)
 0.64 0.75 0.49 0.57 0.84 0.36 0.4 0.35 0.32 0.31 0.42 0.64 0.66 0.63 0.62 1.0 0.31 0.42 0.42 0.37 0.14 0.72
AMTR_s00035p00016570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00035.3)
 0.0 0.0 0.43 0.0 1.0 0.01 0.0 0.09 0.04 0.07 0.06 1.0 0.48 0.73 0.28 0.39 0.05 0.05 0.08 0.31 0.05 0.95
AMTR_s00041p00170940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.125)
 0.15 0.22 0.16 0.61 0.04 0.08 0.23 0.04 0.38 0.32 0.45 0.34 0.48 0.41 0.48 0.35 0.16 0.51 0.68 1.0 0.49 0.48
AMTR_s00044p00222680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.242)
 0.0 0.03 0.34 0.39 0.83 0.0 0.05 0.21 0.06 0.06 0.44 0.51 0.63 0.32 0.42 0.47 0.65 0.36 0.43 0.17 0.19 1.0
AMTR_s00045p00202280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.263)
 0.33 0.42 0.17 0.69 0.89 0.16 0.06 0.03 0.04 0.05 0.17 0.25 0.63 1.0 0.83 0.38 0.25 0.16 0.16 0.27 0.03 0.8
AMTR_s00048p00042950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.12)
 0.2 0.27 0.29 1.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.15 0.21 0.05 0.18 0.28 0.12 0.2 0.24 0.5 0.16 0.96
AMTR_s00048p00127800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.70)
 0.67 0.75 0.61 0.26 0.61 0.19 0.16 0.16 0.18 0.19 0.48 0.45 0.8 0.5 0.97 0.43 0.58 0.25 0.27 0.49 0.07 1.0
AMTR_s00048p00169570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.124)
 0.0 0.0 0.0 0.3 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.1 0.05 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.02 0.0 0.0 1.0
AMTR_s00048p00170020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.125)
 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.06 0.0 0.0 0.0 0.17 0.02 0.03 0.0 0.0 1.0
AMTR_s00055p00220460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00055.169)
 0.39 0.41 0.34 0.32 1.0 0.18 0.09 0.1 0.08 0.07 0.26 0.35 0.6 0.86 0.49 0.33 0.23 0.21 0.28 0.26 0.1 0.52
AMTR_s00056p00022510 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.7)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
AMTR_s00058p00113540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.68)
 0.47 0.8 0.65 0.81 0.22 0.02 0.0 0.0 0.04 0.01 0.68 0.31 0.33 0.21 0.13 0.16 0.13 0.27 0.13 0.19 0.16 1.0
AMTR_s00058p00162730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.143)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.05 0.0 0.39 0.32 0.46 0.23 0.31 0.18 0.2 0.1 0.51 0.0 0.0 0.05 0.36 1.0
AMTR_s00060p00085140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00060.33)
 0.95 0.84 0.81 0.47 1.0 0.07 0.12 0.13 0.07 0.08 0.37 0.32 1.0 0.51 0.78 0.47 0.24 0.19 0.35 0.8 0.22 0.84
AMTR_s00061p00110540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00061.85)
 0.0 0.0 0.0 0.06 1.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.09 0.07 0.9 0.54 0.3 0.91 0.11 0.32 0.12 0.09 0.24 0.1 0.79
AMTR_s00064p00123160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00064.46)
 0.55 0.55 0.44 0.27 0.56 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.21 0.65 0.45 0.94 0.19 0.43 0.21 0.32 1.0 0.16 0.54
AMTR_s00067p00080250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00067.56)
 1.0 0.55 0.65 0.23 0.49 0.33 0.13 0.29 0.26 0.23 0.27 0.35 0.49 0.39 0.65 0.26 0.32 0.21 0.22 0.26 0.18 0.65
AMTR_s00069p00200860 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.218)
 0.0 0.99 0.0 0.26 0.61 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.49 0.74 0.57 0.35 0.57 1.0 0.26 0.34 0.65 0.3 0.33 0.85
AMTR_s00073p00050630 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00073.10)
 0.69 1.0 0.81 0.49 0.69 0.08 0.1 0.41 0.31 0.26 0.47 0.53 0.77 0.55 0.41 0.4 0.15 0.34 0.46 0.35 0.1 0.58
AMTR_s00077p00134130 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.128)
 0.49 0.12 0.09 0.28 1.0 0.12 0.31 0.05 0.35 0.22 0.56 0.55 0.67 0.84 0.64 0.22 0.64 0.24 0.21 0.15 0.08 0.39
AMTR_s00077p00184480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.212)
 0.15 0.11 0.0 0.02 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.14 0.7 0.8 1.0 0.48 0.15 0.12 0.1 0.93 0.12 0.66
0.47 0.05 0.0 0.43 1.0 0.01 0.09 0.0 0.08 0.07 0.47 0.38 0.66 0.85 0.9 0.39 0.25 0.23 0.22 0.35 0.13 0.25
AMTR_s00088p00121090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00088.87)
 0.32 0.28 0.27 0.79 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.29 0.68 0.27 0.9 0.44 0.28 0.22 0.28 0.59 0.16 1.0
AMTR_s00089p00096280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00089.51)
 0.64 0.28 0.51 0.05 0.8 0.33 0.06 0.17 0.08 0.09 0.25 0.31 0.54 0.44 0.74 0.36 0.19 0.32 0.36 1.0 0.45 0.53
AMTR_s00091p00025820 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00091.4)
 0.0 0.48 0.0 0.96 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.76 0.3 0.12 1.0 0.1 0.32 0.39 0.4 0.52 0.27 0.77
AMTR_s00099p00115860 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00099.99)
 0.01 0.0 0.09 0.06 0.4 0.01 0.02 0.0 0.06 0.03 0.32 0.37 0.61 1.0 0.94 0.3 0.28 0.19 0.3 0.41 0.16 0.66
AMTR_s00106p00008250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00106.1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.31 0.55 0.07 0.0 0.0 0.0 0.26 0.48 0.24 0.0 0.0 0.63
AMTR_s00106p00147010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00106.119)
 0.4 0.7 0.0 0.27 1.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.17 0.26 0.38 0.09 0.35 0.0 0.65 0.3 0.15 0.06 0.0 0.86
AMTR_s00117p00057980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00117.14)
 0.63 0.31 0.29 0.32 1.0 0.13 0.05 0.0 0.04 0.05 0.23 0.32 0.87 0.61 0.85 0.28 0.13 0.22 0.35 0.35 0.17 0.51
AMTR_s00133p00048740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00133.14)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.12 0.0 0.17 0.12 0.3 0.36 0.44 0.14 0.22 0.28 0.4 0.18 0.23 0.35 0.93 1.0
AMTR_s00133p00049080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00133.16)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.04 0.0 0.06 0.08 0.3 0.33 0.38 0.16 0.23 0.23 0.57 0.11 0.05 0.12 0.29 1.0
AMTR_s00136p00093430 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00136.48)
 0.0 0.0 0.11 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.48 0.2 0.32 0.12 0.22 0.22 0.2 0.28 0.05 0.07 0.91
AMTR_s00148p00084540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00148.56)
 0.82 0.12 0.6 0.16 0.53 0.01 0.05 0.1 0.03 0.03 0.23 0.21 1.0 0.7 0.65 0.12 0.11 0.08 0.1 0.52 0.2 0.48
AMTR_s00155p00039520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00155.20)
 0.76 0.54 0.68 0.56 0.9 0.01 0.08 0.04 0.19 0.13 0.56 0.56 0.71 1.0 0.75 0.52 0.64 0.35 0.3 0.38 0.28 0.58
AMTR_s00158p00089990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00158.22)
 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.51 0.59 0.76 0.91 0.74 0.0 0.22 0.0 0.0 0.01 0.19 0.26
AMTR_s00181p00060490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00181.36)
 0.0 0.0 0.0 0.24 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.29 0.76 0.93 0.69 0.12 0.51 0.2 0.17 0.11 0.12 0.35
AMTR_s00182p00033480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00182.13)
 0.56 0.79 0.97 0.63 1.0 0.2 0.19 0.24 0.14 0.16 0.37 0.52 0.47 0.52 0.5 0.4 0.07 0.33 0.52 0.47 0.04 0.4
AMTR_s00264p00014380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00264.3)
 0.29 0.16 0.11 0.28 0.54 0.07 0.28 0.04 0.3 0.31 0.39 0.45 0.74 0.74 1.0 0.82 0.59 0.21 0.23 0.57 0.26 0.64
AMTR_s01203p00002490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold01203.1)
 0.5 0.51 0.26 0.16 0.8 0.0 0.09 0.04 0.09 0.11 0.18 0.38 0.71 0.59 0.72 0.3 0.19 0.26 0.32 1.0 0.19 0.68
AMTR_s01428p00008710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold01428.1)
 0.36 0.27 0.17 0.37 0.8 0.24 0.24 0.1 0.11 0.17 0.32 0.32 0.75 0.76 1.0 0.38 0.35 0.28 0.22 0.76 0.18 0.69
AMTR_s04578p00001390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold04578.1)
 0.0 0.0 0.0 0.51 0.12 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.25 0.24 0.29 0.23 0.15 0.55 0.34 1.0 0.6 0.35

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)