Heatmap: Cluster_187 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Egg apparatus cell (small)	Egg apparatus cell (medium)	Egg apparatus cell (large)	Ovary	Uninuclear microspore	Generative cell	Pollen	Sperm	Pollen tube (bicellular)	Pollen tube (tricellular)	Flower (bud, female)	Flower (bud, male)	Flower (female)	Flower (male)	Flower (tepals)	Fruit (female)	Apical meristem	Shoot (female)	Shoot (male)	Leaf (male)	Leaves	Root (male)
AMTR_s00001p00109570 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.77)	0.34	0.42	0.71	0.01	1.0	0.58	0.21	0.15	0.14	0.16	0.64	0.42	0.5	0.22	0.43	0.32	0.59	0.25	0.28	0.33	0.16	0.45
AMTR_s00001p00269490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.441)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.03	0.11	0.11	0.06	0.36	0.02	0.33	0.34	0.24	0.07	0.02	0.0	0.03	0.42	0.06	0.42
AMTR_s00002p00017020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.6)	0.38	0.31	0.53	0.01	1.0	0.27	0.15	0.16	0.19	0.15	0.39	0.34	0.55	0.4	0.43	0.23	0.67	0.32	0.27	0.45	0.19	0.36
AMTR_s00002p00099610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.56)	1.0	0.69	0.54	0.12	0.35	0.82	0.21	0.2	0.29	0.26	0.63	0.49	0.36	0.29	0.32	0.31	0.68	0.29	0.42	0.41	0.23	0.41
AMTR_s00004p00062410 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00004.45)	0.19	0.56	0.78	1.0	0.71	0.26	0.08	0.07	0.07	0.05	0.74	0.49	0.35	0.47	0.38	0.21	0.93	0.33	0.22	0.27	0.8	0.84
AMTR_s00006p00077230 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.29)	0.44	0.49	0.74	0.01	1.0	0.52	0.28	0.18	0.24	0.3	0.32	0.33	0.35	0.23	0.48	0.28	0.4	0.19	0.16	0.22	0.14	0.47
AMTR_s00007p00231250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.233)	0.83	0.84	0.32	0.2	1.0	0.25	0.22	0.19	0.25	0.22	0.61	0.57	0.51	0.44	0.78	0.63	0.46	0.46	0.5	0.71	0.23	0.48
AMTR_s00008p00055030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00008.17)	0.0	0.0	0.0	0.11	1.0	0.0	0.02	0.14	0.12	0.01	0.53	0.63	0.09	0.04	0.04	0.14	0.11	0.18	0.26	0.05	0.16	0.09
AMTR_s00009p00240510 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.212)	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.0	0.07	0.36	0.08	0.1	0.39	0.2	0.11	0.41	0.27	0.14	0.37	0.0	0.04	0.35	0.24	0.19
AMTR_s00011p00260020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00011.188)	0.65	1.0	0.57	0.18	0.79	0.42	0.45	0.28	0.42	0.41	0.46	0.4	0.58	0.43	0.6	0.39	0.56	0.26	0.35	0.52	0.3	0.35
AMTR_s00014p00228980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00014.88)	0.0	0.0	0.32	0.05	1.0	0.0	0.09	0.0	0.07	0.09	0.37	0.05	0.23	0.17	0.25	0.14	0.4	0.14	0.34	0.24	0.04	0.1
AMTR_s00016p00171940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.131)	0.58	0.76	0.46	0.24	1.0	0.42	0.23	0.02	0.17	0.21	0.42	0.52	0.51	0.58	0.57	0.4	0.45	0.32	0.36	0.28	0.26	0.46
AMTR_s00017p00209370 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.134)	0.64	0.84	0.6	0.23	0.55	1.0	0.74	0.24	0.57	0.58	0.37	0.36	0.54	0.39	0.33	0.97	0.13	0.45	0.52	0.71	0.33	0.67
AMTR_s00019p00052090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.29)	0.54	0.15	0.61	0.3	0.29	1.0	0.6	0.37	0.71	0.72	0.5	0.55	0.42	0.57	0.57	0.71	0.39	0.4	0.46	0.7	0.37	0.51
AMTR_s00019p00173770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.175)	0.14	0.19	0.04	0.45	1.0	0.2	0.42	0.04	0.33	0.31	0.89	0.71	0.66	0.67	0.58	0.46	0.66	0.44	0.53	0.41	0.41	0.41
AMTR_s00019p00188800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.208)	1.0	0.93	0.49	0.04	0.66	0.36	0.27	0.1	0.22	0.22	0.86	0.93	0.6	0.48	0.82	0.62	0.85	0.52	0.66	0.79	0.5	0.54
AMTR_s00021p00192170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.153)	0.85	1.0	0.81	0.44	0.91	0.71	0.28	0.24	0.12	0.13	0.97	0.56	0.67	0.5	0.5	0.67	0.69	0.44	0.77	0.73	0.41	0.63
AMTR_s00022p00185610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.199)	0.86	0.78	0.76	0.31	0.53	0.71	0.62	0.24	0.48	0.5	0.48	0.53	0.59	0.81	0.4	1.0	0.31	0.5	0.56	0.85	0.56	0.46
AMTR_s00024p00072290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.30)	0.03	0.26	1.0	0.01	0.18	0.4	0.18	0.0	0.25	0.18	0.57	0.58	0.31	0.26	0.22	0.38	0.33	0.36	0.33	0.2	0.35	0.3
AMTR_s00024p00237330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00024.266)	0.66	0.64	0.87	0.01	1.0	0.44	0.12	0.17	0.12	0.11	0.81	0.78	0.58	0.42	0.29	0.59	0.54	0.55	0.75	0.24	0.35	0.36
AMTR_s00025p00186730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.226)	0.33	0.46	0.5	0.02	1.0	0.01	0.03	0.08	0.03	0.03	0.27	0.29	0.54	0.37	0.32	0.5	0.12	0.28	0.24	0.23	0.13	0.29
AMTR_s00028p00221880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00028.109)	0.78	0.79	0.0	0.03	0.37	0.0	0.37	0.16	0.47	0.48	1.0	0.7	0.55	0.62	0.98	0.64	0.98	0.56	0.53	0.73	0.58	0.68
AMTR_s00028p00229280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00028.111)	0.0	0.0	0.0	0.46	1.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.32	0.0	0.11	0.07	0.03	0.0	0.53	0.0	0.0	0.06	0.0	0.22
AMTR_s00029p00219630 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.332)	0.16	0.45	0.45	0.02	1.0	0.1	0.05	0.06	0.04	0.05	0.22	0.36	0.31	0.2	0.23	0.23	0.07	0.22	0.22	0.14	0.1	0.25
AMTR_s00029p00219780 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.335)	0.24	0.72	0.76	0.01	1.0	0.13	0.07	0.03	0.07	0.07	0.3	0.45	0.35	0.28	0.34	0.35	0.15	0.23	0.22	0.2	0.14	0.37
AMTR_s00031p00043410 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00031.10)	0.56	0.77	0.12	0.03	0.6	0.01	0.57	0.12	0.52	0.53	1.0	0.66	0.58	0.73	0.68	0.49	1.0	0.72	0.46	0.47	0.55	0.45
AMTR_s00031p00183990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00031.89)	0.23	0.61	1.0	0.11	0.81	0.39	0.12	0.02	0.09	0.09	0.58	0.53	0.36	0.23	0.31	0.29	0.32	0.33	0.4	0.23	0.18	0.27
AMTR_s00032p00222950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.233)	0.42	0.11	1.0	0.0	0.53	0.33	0.07	0.04	0.14	0.09	0.54	0.54	0.27	0.17	0.19	0.14	0.37	0.45	0.42	0.16	0.07	0.29
AMTR_s00033p00237860 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.246)	0.41	0.52	0.65	0.0	1.0	0.22	0.05	0.01	0.09	0.09	0.28	0.33	0.3	0.22	0.3	0.19	0.19	0.22	0.15	0.15	0.15	0.26
AMTR_s00037p00238300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00037.161)	0.85	0.62	0.41	0.02	0.55	0.0	0.03	0.0	0.09	0.08	0.44	0.81	0.33	0.24	0.56	0.5	0.49	0.47	0.39	0.58	1.0	0.39
AMTR_s00038p00132010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00038.76)	0.79	1.0	0.65	0.06	0.86	0.66	0.41	0.28	0.28	0.34	0.37	0.34	0.43	0.4	0.64	0.54	0.62	0.27	0.34	0.63	0.19	0.53
AMTR_s00040p00149720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.122)	0.6	0.65	0.24	0.28	1.0	0.49	0.03	0.0	0.06	0.05	0.6	0.48	0.51	0.23	0.38	0.27	0.72	0.3	0.3	0.36	0.17	0.37
AMTR_s00041p00099130 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.65)	0.38	1.0	0.51	0.03	0.7	0.37	0.1	0.02	0.12	0.12	0.62	0.51	0.46	0.43	0.82	0.47	0.47	0.32	0.36	0.5	0.19	0.36
AMTR_s00044p00064160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.35)	0.46	0.48	1.0	0.4	0.54	0.48	0.04	0.0	0.06	0.06	0.65	0.43	0.47	0.37	0.33	0.45	0.45	0.4	0.42	0.36	0.39	0.43
AMTR_s00047p00145320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00047.66)	0.4	0.33	1.0	0.06	0.58	0.45	0.14	0.07	0.22	0.21	0.87	0.52	0.54	0.4	0.54	0.33	0.83	0.5	0.47	0.54	0.38	0.37
AMTR_s00047p00153190 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00047.75)	0.44	0.57	0.88	0.04	0.57	0.58	0.53	0.14	0.35	0.4	0.22	0.24	0.45	0.38	1.0	0.15	0.33	0.19	0.17	0.19	0.27	0.25
AMTR_s00048p00149070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.100)	0.4	0.42	0.14	0.67	1.0	0.15	0.15	0.33	0.18	0.19	0.95	0.35	0.74	0.61	0.47	0.3	0.78	0.31	0.27	0.5	0.21	0.7
AMTR_s00049p00099070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.70)	0.44	0.35	0.54	0.28	0.8	0.91	0.33	0.17	0.92	0.5	0.2	0.42	0.24	0.74	1.0	0.39	0.16	0.19	0.21	0.57	0.36	0.23
AMTR_s00051p00210110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00051.92)	0.67	1.0	0.73	0.65	0.98	0.94	0.61	0.37	0.8	0.8	0.26	0.25	0.63	0.81	0.82	0.54	0.16	0.23	0.39	0.58	0.44	0.46
AMTR_s00055p00049520 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00055.16)	0.0	0.71	0.86	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.71	0.43	0.39	0.24	0.4	0.12	0.43	0.83	0.59	0.15	0.13	0.34
AMTR_s00055p00182870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00055.100)	0.64	0.63	0.91	0.06	1.0	0.68	0.33	0.14	0.26	0.25	0.44	0.41	0.52	0.47	0.6	0.46	0.53	0.32	0.25	0.39	0.2	0.53
AMTR_s00055p00194180 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00055.130)	0.81	0.4	0.6	0.09	1.0	0.65	0.22	0.01	0.18	0.18	0.97	0.7	0.53	0.47	0.84	0.72	0.89	0.5	0.55	0.71	0.42	0.46
AMTR_s00056p00067330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.43)	0.18	1.0	0.66	0.26	0.55	0.07	0.28	0.27	0.2	0.17	0.61	0.53	0.59	0.59	0.3	0.32	0.49	0.55	0.44	0.28	0.35	0.42
AMTR_s00056p00191540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.179)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.95	0.0	0.03	0.0	0.02	0.06	0.72	0.64	0.29	0.42	0.26	0.0	0.0	0.0	0.25	0.16	1.0	0.05
AMTR_s00058p00040770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.11)	0.42	0.9	0.61	0.43	0.97	0.0	0.05	0.32	0.05	0.04	0.84	0.53	0.24	0.15	0.13	0.38	1.0	0.16	0.41	0.29	0.24	0.23
AMTR_s00058p00132170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.95)	0.43	0.12	1.0	0.13	0.58	0.18	0.13	0.0	0.12	0.11	0.7	0.69	0.25	0.36	0.32	0.44	0.74	0.22	0.27	0.12	0.18	0.44
AMTR_s00062p00096480 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.70)	0.0	0.37	0.66	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03	0.3	0.24	0.5	0.29	0.49	0.25	0.35	0.21	0.58	0.12	0.19	0.46
AMTR_s00079p00186170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00079.108)	0.95	0.96	0.91	0.08	1.0	0.44	0.23	0.07	0.17	0.18	0.66	0.58	0.4	0.33	0.3	0.32	0.36	0.48	0.43	0.17	0.11	0.31
AMTR_s00080p00170250 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00080.86)	0.47	0.5	0.61	0.08	1.0	0.49	0.34	0.2	0.16	0.18	0.3	0.4	0.3	0.22	0.25	0.26	0.69	0.22	0.24	0.17	0.08	0.29
AMTR_s00086p00162440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00086.100)	0.66	1.0	0.4	0.16	0.77	0.22	0.12	0.13	0.14	0.11	0.42	0.45	0.51	0.42	0.6	0.47	0.61	0.42	0.36	0.5	0.34	0.35
AMTR_s00090p00126740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00090.63)	0.74	0.62	0.58	0.02	1.0	0.4	0.42	0.12	0.46	0.47	0.93	0.76	0.9	0.79	0.78	0.87	0.93	0.46	0.59	0.36	0.19	0.77
AMTR_s00091p00122780 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00091.45)	0.59	0.79	0.96	0.01	1.0	0.48	0.25	0.13	0.22	0.22	0.31	0.33	0.28	0.31	0.22	0.25	0.26	0.23	0.18	0.14	0.05	0.23
AMTR_s00092p00055650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.25)	0.0	0.0	0.6	0.0	0.61	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	1.0	0.11	0.48	0.38	0.48	0.69	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.21
AMTR_s00095p00028050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00095.9)	0.42	0.43	0.86	0.0	1.0	0.53	0.2	0.36	0.21	0.24	0.91	0.76	0.57	0.6	0.55	0.49	0.9	0.54	0.48	0.39	0.27	0.58
AMTR_s00106p00106040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00106.76)	0.37	1.0	0.26	0.32	0.85	0.49	0.14	0.0	0.12	0.12	0.81	0.59	0.56	0.4	0.46	0.4	0.73	0.37	0.51	0.4	0.17	0.42
AMTR_s00109p00068640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00109.53)	0.35	0.34	0.47	0.01	1.0	0.06	0.13	0.1	0.19	0.2	0.23	0.39	0.26	0.34	0.25	0.7	0.16	0.19	0.22	0.16	0.07	0.23
AMTR_s00109p00069190 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00109.54)	0.37	0.88	1.0	0.13	0.84	0.09	0.05	0.33	0.12	0.08	0.75	0.59	0.49	0.37	0.27	0.38	0.36	0.65	0.5	0.17	0.43	0.23
AMTR_s00109p00141140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00109.151)	0.36	0.59	0.78	0.24	1.0	0.02	0.01	0.13	0.08	0.07	0.81	0.61	0.38	0.4	0.46	0.27	0.83	0.36	0.48	0.44	0.46	0.38
AMTR_s00118p00071600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00118.12)	0.0	0.53	0.0	0.02	1.0	0.0	0.07	0.01	0.07	0.09	0.65	0.54	0.3	0.37	0.31	0.25	0.18	0.47	0.58	0.13	0.3	0.09
AMTR_s00119p00049510 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00119.31)	1.0	0.89	0.76	0.05	0.73	0.53	0.67	0.03	0.3	0.42	0.37	0.37	0.66	0.53	0.76	0.41	0.36	0.23	0.25	0.42	0.12	0.51
AMTR_s00133p00076510 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00133.32)	0.2	0.37	1.0	0.09	0.32	0.31	0.3	0.07	0.32	0.29	0.85	0.6	0.5	0.5	0.47	0.4	0.8	0.51	0.41	0.42	0.26	0.47
AMTR_s00143p00072740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00143.17)	0.67	1.0	0.59	0.1	0.78	0.83	0.36	0.44	0.44	0.42	0.71	0.56	0.38	0.46	0.43	0.59	0.58	0.5	0.54	0.5	0.43	0.28
AMTR_s00143p00105790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00143.27)	0.89	1.0	0.98	0.15	0.66	0.23	0.16	0.46	0.29	0.25	0.71	0.72	0.7	0.51	0.36	0.41	0.34	0.45	0.42	0.29	0.25	0.41
AMTR_s00146p00077020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00146.44)	0.45	0.52	0.58	0.57	1.0	0.32	0.16	0.3	0.17	0.17	0.67	0.52	0.49	0.28	0.6	0.4	0.97	0.25	0.27	0.49	0.15	0.54
AMTR_s00150p00086460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00150.31)	0.3	0.71	0.38	0.15	0.74	0.36	0.61	0.22	0.46	0.5	0.75	0.62	0.63	0.73	0.66	0.83	1.0	0.57	0.46	0.45	0.44	0.49
AMTR_s00156p00062990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00156.33)	1.0	0.72	0.2	0.07	0.78	0.01	0.07	0.0	0.06	0.07	0.49	0.5	0.37	0.24	0.46	0.7	0.3	0.3	0.41	0.51	0.5	0.34
AMTR_s00164p00043960 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00164.16)	0.0	0.0	0.07	0.0	1.0	0.0	0.02	0.0	0.02	0.0	0.53	0.0	0.14	0.09	0.37	0.44	0.0	0.0	0.0	0.07	0.51	0.13
AMTR_s00166p00067930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00166.39)	0.54	0.55	1.0	0.16	0.49	0.39	0.08	0.01	0.05	0.04	0.52	0.39	0.37	0.2	0.22	0.1	0.33	0.23	0.26	0.14	0.08	0.23
AMTR_s00168p00026690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00168.6)	0.83	0.86	0.69	0.19	1.0	0.8	0.31	0.28	0.19	0.26	0.78	0.41	0.41	0.32	0.47	0.39	0.91	0.3	0.33	0.4	0.13	0.38
AMTR_s00171p00056020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00171.39)	0.21	0.0	0.33	0.02	1.0	0.02	0.11	0.27	0.09	0.09	0.36	0.32	0.37	0.19	0.44	0.31	0.72	0.34	0.26	0.24	0.3	0.26
AMTR_s00173p00058300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00173.14)	0.15	0.59	0.81	0.0	0.96	0.01	0.05	0.24	0.07	0.09	1.0	0.96	0.55	0.48	0.44	0.21	0.38	0.34	0.44	0.15	0.06	0.38
AMTR_s00183p00050040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00183.26)	0.5	0.76	0.54	0.14	1.0	0.46	0.15	0.11	0.16	0.14	0.35	0.39	0.47	0.4	0.48	0.46	0.27	0.28	0.32	0.2	0.11	0.37
AMTR_s00213p00017610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00213.4)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.05	0.17	0.06	0.16	0.45	0.11	0.71	0.0	0.04	0.19	0.0	0.17
AMTR_s00638p00003060 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00638.1)	0.0	0.0	0.17	0.14	1.0	0.0	0.01	0.0	0.03	0.02	0.46	0.11	0.2	0.06	0.06	0.22	0.74	0.28	0.22	0.13	0.09	0.11
AMTR_s02269p00004750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold02269.1)	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.0	0.04	0.28	0.07	0.06	0.17	0.23	0.14	0.21	0.19	0.0	0.54	0.0	0.04	0.26	0.0	0.11

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)