Heatmap: Cluster_224 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00001p00049640 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.29)
1.0 0.43 0.96 0.0 0.54 0.01 0.36 0.0 0.31 0.32 0.4 0.57 0.26 0.22 0.29 0.44 0.36 0.28 0.2 0.13 0.17 0.18
AMTR_s00001p00247600 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00001.302)
0.27 0.67 0.28 0.0 0.27 0.0 0.04 0.44 0.06 0.08 0.65 0.48 1.0 0.48 0.36 0.3 0.61 0.45 0.51 0.83 0.4 0.64
AMTR_s00007p00251400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.285)
1.0 0.0 0.75 0.01 0.31 0.01 0.39 0.0 0.38 0.27 0.49 0.67 0.51 0.41 0.14 0.53 0.97 0.44 0.45 0.48 0.33 0.47
AMTR_s00007p00265360 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00007.358)
0.16 0.0 0.37 0.01 0.5 0.0 0.63 0.53 0.51 0.46 0.97 0.63 0.96 0.51 0.38 1.0 0.7 0.92 0.54 0.84 0.58 0.7
AMTR_s00009p00082170 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.29)
0.51 0.37 0.66 0.12 1.0 0.54 0.6 0.45 0.7 0.65 0.81 0.67 0.69 0.69 0.58 0.21 0.49 0.43 0.39 0.3 0.2 0.29
AMTR_s00009p00175930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.106)
0.0 0.0 1.0 0.24 0.29 0.01 0.23 0.0 0.22 0.19 0.39 0.47 0.28 0.18 0.2 0.29 0.34 0.35 0.25 0.07 0.21 0.21
AMTR_s00011p00261970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00011.197)
0.66 0.3 1.0 0.08 0.51 0.24 0.48 0.17 0.56 0.54 0.63 0.73 0.63 0.63 0.54 0.37 0.8 0.66 0.57 0.67 0.83 0.38
AMTR_s00013p00143500 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00013.69)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.21 0.0 0.01 0.52 0.01 0.01 1.0 0.94 0.44 0.06 0.07 0.06 0.36 0.43 0.76 0.83 0.43 0.25
AMTR_s00017p00249300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.250)
0.8 0.14 1.0 0.06 0.32 0.0 0.2 0.17 0.22 0.23 0.35 0.54 0.31 0.2 0.13 0.31 0.32 0.13 0.34 0.3 0.03 0.26
AMTR_s00019p00247160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.392)
0.0 0.01 1.0 0.02 0.04 0.0 0.02 0.0 0.06 0.06 0.28 0.26 0.05 0.09 0.16 0.18 0.0 0.23 0.29 0.09 0.21 0.05
AMTR_s00020p00210440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00020.89)
0.35 0.11 0.63 0.66 0.3 0.02 0.53 0.0 0.54 0.54 0.83 1.0 0.57 0.35 0.14 0.51 0.92 0.73 0.64 0.49 0.26 0.29
AMTR_s00021p00197950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.162)
0.15 0.05 0.42 0.04 0.57 0.12 0.45 0.66 0.43 0.5 0.85 1.0 0.77 0.8 0.71 0.65 0.58 0.68 0.85 0.73 0.17 0.69
AMTR_s00021p00234080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.232)
0.21 0.2 1.0 0.03 0.62 0.01 0.58 0.12 0.5 0.49 0.45 0.45 0.57 0.47 0.35 0.25 0.33 0.26 0.26 0.32 0.05 0.41
AMTR_s00022p00198910 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.230)
0.0 1.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.17 0.01 0.37 0.26 0.29 0.62 0.01 0.04 0.03 0.01 0.32 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02
AMTR_s00023p00246550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00023.222)
0.45 0.63 0.93 0.14 1.0 0.11 0.45 0.37 0.54 0.59 0.4 0.47 0.51 0.71 0.73 0.41 0.4 0.36 0.34 0.51 0.1 0.64
AMTR_s00025p00160940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.183)
0.34 0.23 0.28 0.33 0.82 0.66 0.52 0.31 0.39 0.36 0.33 0.38 0.56 0.72 1.0 0.38 0.17 0.26 0.35 0.57 0.09 0.65
AMTR_s00026p00018050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00026.1)
1.0 0.0 0.98 0.02 0.94 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.55 0.81 0.12 0.04 0.09 0.14 0.28 0.09 0.09 0.03 0.11 0.32
AMTR_s00028p00139860 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00028.50)
0.52 0.54 0.41 0.35 0.63 0.01 0.5 0.64 0.45 0.46 0.66 0.72 0.97 0.81 0.48 0.68 0.64 0.76 0.59 0.87 0.27 1.0
AMTR_s00029p00245680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.438)
0.63 1.0 0.98 0.08 0.63 0.52 0.78 0.4 0.68 0.73 0.49 0.56 0.59 0.54 0.67 0.38 0.49 0.32 0.33 0.28 0.12 0.57
AMTR_s00040p00233220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00040.293)
0.52 1.0 0.62 0.0 0.29 0.0 0.4 0.09 0.37 0.39 0.4 0.54 0.43 0.32 0.17 0.15 0.33 0.47 0.37 0.31 0.35 0.26
AMTR_s00044p00038930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.13)
0.0 0.0 1.0 0.03 0.2 0.01 0.26 0.0 0.19 0.16 0.45 0.38 0.14 0.11 0.15 0.13 0.31 0.12 0.21 0.03 0.15 0.06
0.01 0.0 1.0 0.0 0.18 0.06 0.13 0.0 0.15 0.18 0.27 0.13 0.11 0.12 0.16 0.72 0.11 0.66 0.45 0.02 0.45 0.21
AMTR_s00047p00209120 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00047.149)
0.51 0.62 1.0 0.13 0.77 0.28 0.72 0.24 0.66 0.68 0.46 0.64 0.62 0.69 0.69 0.53 0.64 0.33 0.23 0.51 0.25 0.93
AMTR_s00048p00177400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.132)
0.26 1.0 0.07 0.05 0.57 0.01 0.14 0.42 0.07 0.06 0.41 0.56 0.5 0.43 0.58 0.46 0.3 0.37 0.51 0.54 0.32 0.39
AMTR_s00053p00213400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00053.165)
0.27 0.27 1.0 0.09 0.36 0.05 0.22 0.04 0.59 0.41 0.51 0.38 0.44 0.52 0.82 0.35 0.69 0.58 0.5 0.4 0.36 0.27
AMTR_s00053p00229450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00053.186)
0.3 1.0 0.55 0.0 0.26 0.03 0.52 0.27 0.36 0.39 0.24 0.38 0.34 0.2 0.16 0.09 0.46 0.18 0.14 0.14 0.05 0.22
AMTR_s00054p00176730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00054.64)
0.0 0.07 0.08 0.0 1.0 0.0 0.09 0.0 0.04 0.02 0.65 0.78 0.27 0.05 0.1 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09
AMTR_s00056p00186500 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00056.167)
0.87 0.16 1.0 0.14 0.85 0.27 0.58 0.24 0.33 0.38 0.51 0.48 0.44 0.56 0.39 0.2 0.41 0.35 0.22 0.34 0.11 0.44
AMTR_s00058p00077380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.36)
0.0 0.0 1.0 0.01 0.29 0.0 0.3 0.0 0.44 0.34 0.33 0.36 0.45 0.38 0.44 0.22 0.4 0.39 0.31 0.26 0.35 0.39
AMTR_s00058p00219700 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00058.239)
0.52 0.32 1.0 0.23 0.81 0.02 0.67 0.05 0.59 0.57 0.7 0.59 0.57 0.56 0.68 0.41 0.6 0.44 0.27 0.33 0.17 0.56
AMTR_s00059p00124020 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.98)
0.56 0.24 0.09 0.0 0.29 0.01 0.14 0.33 0.17 0.15 0.67 1.0 0.74 0.38 0.61 0.44 0.26 0.67 0.6 0.38 0.31 0.52
AMTR_s00062p00025650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.9)
0.65 0.3 1.0 0.06 0.5 0.02 0.55 0.0 0.41 0.42 0.39 0.6 0.28 0.32 0.18 0.58 0.41 0.2 0.21 0.09 0.13 0.19
AMTR_s00062p00026440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.10)
0.34 0.29 1.0 0.2 0.2 0.01 0.49 0.0 0.33 0.39 0.6 0.85 0.25 0.26 0.19 0.74 0.59 0.52 0.48 0.11 0.11 0.18
AMTR_s00062p00189850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.193)
0.33 0.5 1.0 0.23 0.38 0.06 0.67 0.45 0.68 0.67 0.43 0.48 0.43 0.52 0.38 0.2 0.31 0.33 0.31 0.24 0.42 0.25
AMTR_s00066p00200650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.269)
0.6 0.0 0.44 0.1 1.0 0.01 0.21 0.23 0.26 0.22 0.91 0.72 0.38 0.63 0.42 0.1 0.45 0.07 0.11 0.05 0.07 0.07
AMTR_s00068p00200270 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00068.170)
0.79 0.52 0.95 0.07 1.0 0.01 0.35 0.0 0.41 0.45 0.43 0.47 0.53 0.51 0.23 0.37 0.3 0.35 0.33 0.24 0.15 0.46
AMTR_s00069p00197560 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00069.212)
0.22 1.0 0.21 0.09 0.17 0.18 0.36 0.01 0.36 0.37 0.24 0.2 0.38 0.31 0.21 0.08 0.45 0.17 0.18 0.15 0.12 0.22
AMTR_s00071p00122330 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00071.98)
0.0 0.0 1.0 0.0 0.18 0.0 0.17 0.0 0.28 0.19 0.24 0.24 0.34 0.07 0.06 0.0 0.38 0.0 0.02 0.01 0.0 0.12
AMTR_s00081p00076550 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00081.27)
1.0 0.33 0.81 0.04 0.43 0.04 0.44 0.04 0.34 0.37 0.5 0.54 0.42 0.58 0.35 0.51 0.68 0.52 0.5 0.7 0.59 0.33
AMTR_s00089p00079320 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00089.35)
0.41 0.67 1.0 0.07 0.29 0.16 0.6 0.15 0.41 0.32 0.21 0.21 0.39 0.28 0.22 0.32 0.5 0.12 0.09 0.11 0.08 0.22
AMTR_s00092p00106290 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.61)
0.9 0.57 0.89 0.09 0.89 0.01 0.31 0.11 0.45 0.42 0.81 1.0 0.39 0.44 0.26 0.22 0.61 0.4 0.27 0.16 0.16 0.31
AMTR_s00095p00122860 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00095.77)
0.0 0.0 1.0 0.0 0.1 0.0 0.2 0.0 0.24 0.34 0.55 0.47 0.15 0.2 0.23 0.34 0.26 0.57 0.35 0.13 0.57 0.21
AMTR_s00095p00176620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00095.155)
0.94 0.12 1.0 0.26 0.42 0.49 0.44 0.35 0.4 0.4 0.4 0.46 0.54 0.5 0.21 0.33 0.27 0.32 0.35 0.33 0.25 0.38
AMTR_s00096p00083240 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00096.40)
0.99 1.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.44 0.0 0.25 0.17 0.0 0.0 0.07 0.11 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1
AMTR_s00101p00062740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00101.35)
0.0 0.0 1.0 0.0 0.38 0.0 0.1 0.0 0.23 0.1 0.2 0.5 0.11 0.09 0.08 0.04 0.42 0.06 0.02 0.07 0.05 0.1
AMTR_s00101p00073580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00101.49)
1.0 0.0 0.85 0.06 0.83 0.02 0.21 0.0 0.22 0.17 0.71 0.68 0.36 0.34 0.29 0.72 0.47 0.51 0.44 0.2 0.48 0.22
AMTR_s00118p00068490 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00118.11)
0.66 0.51 0.59 0.13 1.0 0.35 0.48 0.27 0.43 0.41 0.2 0.29 0.46 0.56 0.69 0.25 0.1 0.15 0.18 0.31 0.15 0.43
AMTR_s00118p00072930 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00118.13)
0.8 0.75 1.0 0.28 0.68 0.0 0.58 0.12 0.46 0.48 0.16 0.5 0.48 0.59 0.86 0.52 0.21 0.32 0.3 0.4 0.26 0.61
AMTR_s00122p00014830 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00122.3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 1.0 0.0 0.07 0.33 0.0 0.0 0.42 0.54 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AMTR_s00127p00103770 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00127.26)
0.65 1.0 0.14 0.0 0.31 0.18 0.43 0.02 0.33 0.3 0.26 0.42 0.23 0.15 0.11 0.14 0.36 0.24 0.15 0.1 0.1 0.3
AMTR_s00135p00048880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00135.16)
0.49 0.32 0.76 0.22 1.0 0.51 0.68 0.23 0.32 0.32 0.26 0.33 0.34 0.54 0.69 0.27 0.25 0.16 0.16 0.16 0.08 0.33
AMTR_s00140p00055140 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00140.23)
0.26 0.01 1.0 0.06 0.51 0.0 0.32 0.26 0.35 0.37 0.52 0.45 0.39 0.31 0.16 0.33 0.4 0.38 0.34 0.18 0.29 0.34
AMTR_s00145p00033710 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00145.9)
0.38 0.04 1.0 0.03 0.74 0.34 0.39 0.02 0.26 0.32 0.73 0.99 0.48 0.43 0.18 0.24 0.43 0.54 0.36 0.15 0.39 0.28
AMTR_s00153p00074100 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00153.38)
0.5 0.0 1.0 0.06 0.51 0.0 0.21 0.25 0.12 0.15 0.37 0.55 0.46 0.3 0.18 0.76 0.4 0.4 0.48 0.41 0.39 0.35
AMTR_s00155p00073880 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00155.48)
0.26 0.34 0.95 0.08 0.22 0.11 0.24 0.08 0.64 0.4 0.75 1.0 0.46 0.45 0.57 0.47 0.62 0.56 0.44 0.46 0.37 0.47
AMTR_s00171p00043900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00171.22)
0.0 0.29 0.69 0.01 0.58 0.0 0.13 0.39 0.14 0.13 0.42 0.54 1.0 0.4 0.48 0.5 0.64 0.43 0.76 0.43 0.27 0.57
AMTR_s00175p00058810 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00175.31)
0.51 0.59 0.2 0.42 0.83 0.93 0.35 0.29 0.27 0.29 0.48 0.64 0.76 1.0 0.95 0.6 0.19 0.51 0.58 0.53 0.15 0.77
AMTR_s00176p00051090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00176.25)
0.0 1.0 0.0 0.02 0.13 0.0 0.37 0.0 0.35 0.37 0.21 0.21 0.17 0.12 0.27 0.03 0.37 0.0 0.02 0.01 0.0 0.17
AMTR_s00182p00020350 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00182.7)
0.57 0.71 0.72 0.37 1.0 0.49 0.55 0.25 0.48 0.53 0.24 0.27 0.66 0.8 0.96 0.38 0.11 0.27 0.35 0.56 0.16 0.68
AMTR_s00183p00019870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00183.4)
0.91 0.86 0.99 0.21 0.95 0.42 0.84 0.25 0.55 0.63 0.42 0.58 0.63 0.7 1.0 0.41 0.61 0.34 0.24 0.31 0.14 0.73
AMTR_s00183p00047540 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00183.24)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.23 0.41 0.35 0.25 0.42 0.81 0.41 0.24 0.2 0.29 0.76 0.53 1.0 0.66 0.7 0.26
AMTR_s00340p00014790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00340.3)
0.06 0.34 0.0 0.09 0.03 0.0 0.06 0.38 0.34 0.42 0.5 1.0 0.36 0.23 0.24 0.24 0.39 0.36 0.92 0.53 0.04 0.17

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)