Heatmap: Cluster_253 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Egg apparatus cell (small)
Egg apparatus cell (medium)
Egg apparatus cell (large)
Ovary
Uninuclear microspore
Generative cell
Pollen
Sperm
Pollen tube (bicellular)
Pollen tube (tricellular)
Flower (bud, female)
Flower (bud, male)
Flower (female)
Flower (male)
Flower (tepals)
Fruit (female)
Apical meristem
Shoot (female)
Shoot (male)
Leaf (male)
Leaves
Root (male)
AMTR_s00002p00059110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00002.23)
0.33 0.0 0.35 0.09 0.16 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.63 0.69 0.5 0.24 0.35 0.39 1.0 0.53 0.47 0.42 0.46 0.47
AMTR_s00003p00101050 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00003.65)
0.47 0.25 0.46 0.07 0.27 0.0 0.07 0.03 0.05 0.06 0.97 0.84 0.54 0.5 0.55 0.51 1.0 0.8 0.62 0.59 0.64 0.53
AMTR_s00006p00256440 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00006.192)
0.66 0.36 0.44 0.13 0.47 0.1 0.14 0.01 0.16 0.16 0.91 0.96 0.81 0.58 0.57 0.46 1.0 0.72 0.7 0.63 0.35 0.69
AMTR_s00009p00247750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00009.244)
0.42 0.35 0.47 0.16 0.18 0.0 0.03 0.0 0.07 0.07 0.88 0.79 0.47 0.33 0.2 0.4 1.0 0.65 0.48 0.45 0.47 0.45
AMTR_s00010p00247870 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00010.340)
0.23 0.42 0.06 0.09 0.25 0.35 0.21 0.1 0.18 0.18 0.86 0.78 0.48 0.38 0.34 0.52 1.0 0.77 0.68 0.7 0.68 0.41
AMTR_s00012p00234420 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00012.192)
0.26 0.17 0.15 0.08 0.21 0.0 0.03 0.0 0.05 0.05 0.67 0.62 0.47 0.27 0.34 0.44 1.0 0.51 0.58 0.65 0.37 0.46
AMTR_s00016p00109400 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00016.71)
0.16 0.14 0.41 0.05 0.16 0.0 0.07 0.0 0.08 0.08 0.51 0.51 0.42 0.34 0.2 0.42 1.0 0.44 0.45 0.32 0.42 0.32
AMTR_s00017p00244380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00017.225)
0.16 0.09 0.06 0.23 0.24 0.09 0.15 0.06 0.43 0.33 0.89 0.62 0.55 0.49 0.57 0.35 1.0 0.59 0.37 0.41 0.73 0.38
AMTR_s00019p00154210 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00019.143)
0.46 0.32 0.26 0.04 0.21 0.04 0.04 0.01 0.04 0.04 0.76 0.77 0.53 0.3 0.42 0.44 1.0 0.45 0.53 0.55 0.14 0.44
AMTR_s00021p00207790 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00021.180)
0.09 0.3 0.42 0.3 0.3 0.12 0.11 0.05 0.13 0.11 0.83 0.76 0.6 0.39 0.63 0.53 1.0 0.47 0.53 0.78 0.54 0.64
AMTR_s00022p00244130 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.358)
0.38 0.31 0.0 0.02 0.13 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.68 0.69 0.49 0.33 0.27 0.56 1.0 0.71 0.63 0.49 0.53 0.36
AMTR_s00022p00245030 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00022.362)
0.38 0.13 0.18 0.23 0.25 0.01 0.11 0.0 0.09 0.09 0.77 0.71 0.4 0.27 0.34 0.67 1.0 0.67 0.56 0.61 0.55 0.43
AMTR_s00025p00024460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.5)
0.14 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.03 0.0 0.03 0.02 0.83 0.93 0.18 0.23 0.42 0.98 1.0 0.68 0.54 0.64 0.73 0.37
AMTR_s00025p00038580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.17)
0.42 0.39 0.01 0.18 0.2 0.02 0.18 0.03 0.18 0.19 0.98 0.97 0.6 0.45 0.23 0.44 1.0 0.71 0.69 0.71 0.46 0.44
AMTR_s00025p00209980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00025.278)
0.0 0.06 0.08 0.01 0.06 0.0 0.08 0.03 0.49 0.24 1.0 0.78 0.38 0.34 0.16 0.59 0.66 0.55 0.74 0.41 0.52 0.31
AMTR_s00027p00053690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00027.8)
0.27 0.45 0.0 0.19 0.12 0.0 0.06 0.0 0.07 0.06 0.82 0.79 0.61 0.4 0.28 0.42 1.0 0.64 0.72 0.64 0.5 0.61
AMTR_s00028p00237040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00028.124)
0.45 0.08 0.0 0.04 0.12 0.0 0.04 0.0 0.05 0.06 0.64 0.53 0.55 0.3 0.14 0.44 1.0 0.57 0.49 0.38 0.42 0.29
AMTR_s00028p00239280 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00028.127)
0.47 0.11 0.0 0.03 0.23 0.0 0.13 0.0 0.32 0.23 0.99 0.75 0.54 0.44 0.47 0.58 1.0 0.64 0.49 0.5 0.78 0.52
AMTR_s00029p00248990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00029.453)
0.07 0.28 0.02 0.01 0.09 0.0 0.02 0.0 0.03 0.02 0.97 0.59 0.34 0.27 0.27 0.19 1.0 0.61 0.71 0.68 0.33 0.28
AMTR_s00032p00047690 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00032.26)
0.34 0.25 0.0 0.0 0.21 0.0 0.03 0.01 0.05 0.04 0.84 0.81 0.63 0.47 0.31 0.35 1.0 0.64 0.62 0.44 0.37 0.69
AMTR_s00033p00140070 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00033.76)
0.04 0.08 0.15 0.0 0.29 0.01 0.06 0.01 0.15 0.12 1.0 0.78 0.2 0.24 0.47 0.5 0.81 1.0 0.62 0.54 0.97 0.35
AMTR_s00037p00154410 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00037.71)
0.02 0.2 0.06 0.16 0.14 0.0 0.17 0.01 0.36 0.3 0.9 0.62 0.5 0.43 0.37 0.21 1.0 0.78 0.53 0.34 0.15 0.53
AMTR_s00041p00123630 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00041.92)
0.08 0.14 0.45 0.1 0.19 0.03 0.09 0.07 0.16 0.14 0.89 0.78 0.44 0.4 0.41 0.62 1.0 0.6 0.5 0.63 0.52 0.52
AMTR_s00044p00033620 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.10)
0.58 0.24 0.18 0.11 0.1 0.0 0.02 0.0 0.09 0.07 0.75 0.71 0.5 0.37 0.42 0.56 1.0 0.54 0.45 0.48 0.65 0.4
AMTR_s00044p00164390 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00044.179)
0.37 0.05 0.4 0.1 0.19 0.01 0.03 0.01 0.04 0.05 0.7 0.59 0.53 0.3 0.39 0.55 1.0 0.58 0.58 0.53 0.38 0.45
AMTR_s00045p00026940 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.4)
0.0 0.11 0.0 0.53 0.14 0.0 0.02 0.02 0.12 0.08 0.68 0.58 0.27 0.24 0.24 0.39 0.73 0.64 0.39 0.49 1.0 0.17
AMTR_s00045p00052450 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00045.34)
0.72 0.15 0.08 0.12 0.23 0.05 0.29 0.2 0.64 0.4 1.0 0.83 0.56 0.41 0.41 0.52 0.89 0.54 0.66 0.67 0.6 0.49
AMTR_s00047p00175730 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00047.99)
0.43 0.03 0.31 0.03 0.23 0.0 0.07 0.0 0.07 0.07 0.7 0.62 0.38 0.23 0.27 0.55 1.0 0.6 0.54 0.41 0.5 0.35
AMTR_s00047p00208850 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00047.148)
0.18 0.04 0.08 0.12 0.22 0.03 0.08 0.03 0.11 0.1 1.0 0.94 0.78 0.38 0.41 0.34 0.96 0.6 0.69 0.64 0.45 0.44
AMTR_s00048p00207080 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00048.181)
0.55 0.01 0.45 0.06 0.1 0.0 0.04 0.0 0.04 0.04 0.98 0.81 0.38 0.19 0.21 0.45 1.0 0.5 0.39 0.36 0.32 0.56
AMTR_s00049p00201740 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00049.216)
0.25 0.24 0.21 0.35 0.35 0.13 0.02 0.01 0.09 0.09 1.0 0.68 0.33 0.36 0.42 0.58 0.72 1.0 0.48 0.57 0.72 0.31
AMTR_s00057p00203610 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00057.240)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.12 0.0 0.38 0.28 0.82 0.65 0.5 0.41 0.43 0.26 1.0 0.58 0.41 0.28 0.36 0.42
AMTR_s00059p00150840 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00059.137)
0.77 0.12 0.26 0.02 0.14 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.81 0.58 0.39 0.36 0.26 0.38 1.0 0.65 0.41 0.49 0.47 0.5
AMTR_s00060p00130340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00060.71)
0.03 0.01 0.05 0.11 0.11 0.0 0.02 0.04 0.03 0.03 0.8 0.79 0.52 0.35 0.2 0.47 1.0 0.47 0.41 0.66 0.64 0.36
AMTR_s00062p00113470 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00062.93)
0.13 0.38 0.4 0.05 0.34 0.0 0.09 0.0 0.16 0.14 0.8 0.85 0.54 0.41 0.61 0.45 1.0 0.67 0.51 0.66 0.47 0.56
AMTR_s00065p00174980 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00065.145)
0.22 0.17 0.33 0.19 0.16 0.0 0.08 0.02 0.15 0.13 0.95 0.85 0.57 0.33 0.52 0.36 1.0 0.56 0.49 0.58 0.7 0.47
AMTR_s00066p00084950 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00066.66)
0.52 0.32 0.28 0.04 0.25 0.01 0.04 0.0 0.08 0.09 0.57 0.66 0.4 0.29 0.26 0.4 1.0 0.47 0.39 0.45 0.5 0.32
AMTR_s00067p00104300 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00067.84)
0.11 0.16 0.08 0.29 0.17 0.0 0.06 0.01 0.09 0.07 0.82 0.85 0.39 0.4 0.39 0.67 0.73 1.0 0.73 0.88 0.98 0.35
AMTR_s00072p00168660 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00072.118)
0.5 0.02 0.6 0.03 0.15 0.01 0.1 0.05 0.14 0.13 0.66 0.64 0.58 0.42 0.26 0.38 1.0 0.47 0.44 0.41 0.5 0.44
AMTR_s00076p00078090 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00076.20)
0.18 0.42 0.6 0.11 0.23 0.26 0.06 0.0 0.11 0.13 1.0 0.88 0.76 0.42 0.28 0.46 0.99 0.64 0.56 0.52 0.36 0.62
AMTR_s00077p00041680 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00077.23)
0.0 0.0 0.0 0.11 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.63 0.08 0.2 0.15 0.86 0.64 0.49 0.46 0.74 0.77 0.25
AMTR_s00078p00015380 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.1)
0.52 0.04 0.04 0.14 0.12 0.04 0.58 0.04 0.47 0.53 0.99 0.88 0.57 0.32 0.24 0.63 1.0 0.77 0.72 0.71 0.47 0.53
AMTR_s00078p00132750 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00078.111)
0.48 0.21 0.25 0.35 0.56 0.29 0.23 0.09 0.33 0.27 0.94 0.94 0.46 0.6 0.58 0.67 0.86 0.89 0.77 0.76 1.0 0.45
AMTR_s00088p00115810 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00088.82)
0.52 0.29 0.46 0.07 0.2 0.03 0.04 0.0 0.05 0.05 0.75 0.85 0.55 0.4 0.28 0.47 1.0 0.7 0.66 0.48 0.4 0.46
AMTR_s00090p00148990 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00090.83)
0.04 0.23 0.14 0.37 0.26 0.04 0.12 0.06 0.21 0.18 0.91 0.89 0.48 0.52 0.7 0.58 0.81 0.76 0.5 0.72 1.0 0.48
AMTR_s00092p00098010 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00092.55)
0.19 0.19 0.44 0.41 0.24 0.01 0.11 0.01 0.16 0.15 0.96 1.0 0.56 0.46 0.39 0.61 0.88 0.71 0.7 0.72 0.54 0.53
AMTR_s00100p00119160 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00100.38)
0.31 0.15 0.15 0.12 0.38 0.01 0.22 0.06 0.56 0.51 0.77 0.98 0.54 0.46 0.72 0.6 0.87 0.61 0.46 0.66 1.0 0.51
AMTR_s00102p00095780 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00102.50)
0.55 0.54 0.49 0.03 0.42 0.09 0.21 0.03 0.16 0.18 0.87 0.79 0.73 0.56 0.61 0.62 1.0 0.58 0.6 0.69 0.58 0.69
AMTR_s00104p00047720 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00104.13)
0.0 0.41 0.0 0.11 0.14 0.03 0.01 0.0 0.05 0.03 0.88 1.0 0.26 0.32 0.22 0.4 0.78 0.6 0.61 0.59 0.5 0.35
AMTR_s00104p00054580 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00104.16)
0.29 0.34 0.12 0.05 0.13 0.01 0.07 0.01 0.09 0.11 0.82 0.77 0.54 0.37 0.2 0.55 1.0 0.56 0.47 0.43 0.4 0.5
AMTR_s00105p00039650 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00105.16)
0.74 0.37 0.27 0.01 0.29 0.0 0.05 0.04 0.09 0.08 0.78 0.74 0.49 0.36 0.3 0.55 1.0 0.68 0.46 0.46 0.43 0.44
AMTR_s00108p00115900 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00108.28)
0.01 0.36 0.57 0.09 0.13 0.0 0.11 0.0 0.35 0.22 0.81 0.91 0.23 0.41 0.68 0.62 0.7 0.52 0.41 0.69 1.0 0.51
AMTR_s00111p00041460 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00111.21)
0.24 0.3 0.2 0.04 0.23 0.02 0.02 0.02 0.05 0.05 0.82 0.77 0.45 0.39 0.56 0.48 1.0 0.58 0.72 0.73 0.29 0.49
AMTR_s00117p00120670 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00117.50)
0.17 0.16 0.21 0.14 0.22 0.13 0.32 0.01 0.39 0.36 0.9 0.65 0.64 0.56 0.64 0.77 1.0 0.58 0.55 0.74 0.51 0.63
AMTR_s00121p00121190 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00121.30)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.36 0.04 0.31 0.21 0.7 0.67 0.25 0.2 0.07 0.3 1.0 0.76 0.8 0.46 0.33 0.17
AMTR_s00131p00018630 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00131.4)
0.34 0.33 0.14 0.13 0.28 0.0 0.06 0.05 0.1 0.11 0.82 0.7 0.56 0.33 0.29 0.38 1.0 0.68 0.83 0.75 0.39 0.51
AMTR_s00138p00044110 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00138.19)
0.15 0.07 0.15 0.2 0.21 0.07 0.03 0.01 0.08 0.07 0.79 0.78 0.4 0.27 0.33 0.47 1.0 0.67 0.62 0.52 0.79 0.41
AMTR_s00138p00108220 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00138.52)
0.04 0.18 0.02 0.03 0.14 0.0 0.04 0.04 0.08 0.08 0.65 0.65 0.52 0.39 0.23 0.42 1.0 0.5 0.5 0.43 0.45 0.43
AMTR_s00140p00073890 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00140.30)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.21 0.07 0.16 0.14 0.49 0.6 0.29 0.31 0.24 0.26 1.0 0.55 0.4 0.36 0.43 0.23
AMTR_s00140p00073970 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00140.31)
0.0 0.0 0.0 0.05 0.15 0.0 0.22 0.0 0.19 0.13 0.45 0.6 0.27 0.35 0.23 0.2 1.0 0.42 0.36 0.48 0.49 0.27
AMTR_s00147p00036340 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00147.15)
0.42 0.3 0.39 0.16 0.14 0.01 0.05 0.0 0.05 0.05 0.73 0.79 0.54 0.31 0.34 0.54 1.0 0.46 0.43 0.59 0.55 0.39
AMTR_s00152p00077800 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00152.24)
0.0 0.0 0.0 0.42 0.11 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.58 0.24 0.26 0.19 0.11 0.23 0.7 0.43 0.22 0.26 1.0 0.32
AMTR_s00154p00087040 (evm_27.TU.AmTr_v1.0_scaffold00154.57)
0.0 0.33 0.0 0.03 0.04 0.0 0.03 0.01 0.2 0.16 0.85 0.87 0.25 0.25 0.42 0.6 0.71 0.55 0.34 0.64 1.0 0.4

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)