1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_277 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Egg cell
Ovule
Uninucleate microspore (Col-0)
Uninucleate microspore (Ler-0)
Pollen (bicellular, Col-0)
Pollen (late bicellular, Col-0)
Pollen (bicellular, Ler-0)
Pollen (tricellular, Col-0)
Pollen (tricellular, Ler-0)
Pollen (mature, Col-0)
Pollen (mature, Ler-0)
Sperm
Pollen tube (Col-0)
Flower (receptacles)
Flower (floral buds)
Flower (sepals)
Flower (petals)
Flower (stamen filaments)
Flower (anthers)
Flower (carpels)
Flower (stigmatic tissue)
Pedicel
Axis of the inflorescence
Silique
Silique (senescent)
Pods of siliques
Pods of siliques (senescent)
Embryo
Endosperm
Seed
Seed (young)
Seed (germinating)
Seedling
Seedling (etiolated)
Meristem
Stem (internode)
Stem (internode, senescent)
Stems
Leaf (rosette)
Epidermis cells
Mature guard cells
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (apex)
Root (stele)
Root (QC cells)
Root (tip)
0.24 0.46 0.11 0.07 0.15 0.15 0.07 0.07 0.03 0.06 0.02 0.17 0.13 0.44 0.37 0.29 0.42 0.24 0.26 0.39 0.58 0.26 0.31 0.31 0.73 0.31 0.38 0.65 0.94 0.66 0.34 0.52 0.29 0.5 0.26 0.35 0.4 0.37 0.56 0.54 1.0 0.76 0.35 0.26 0.34 0.0 0.0 0.16
0.42 0.33 0.99 0.92 0.82 0.47 1.0 0.11 0.12 0.22 0.15 0.01 0.06 0.33 0.25 0.17 0.18 0.13 0.25 0.31 0.24 0.24 0.4 0.11 0.25 0.13 0.33 0.61 0.18 0.23 0.18 0.38 0.21 0.23 0.39 0.2 0.24 0.22 0.21 0.34 0.42 0.23 0.29 0.69 0.4 0.43 0.33 0.37
1.0 0.37 0.17 0.21 0.15 0.05 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.35 0.22 0.3 0.2 0.09 0.37 0.25 0.22 0.28 0.2 0.12 0.19 0.13 0.22 0.45 0.09 0.33 0.24 0.16 0.22 0.23 0.27 0.29 0.23 0.27 0.13 0.12 0.3 0.39 0.36 0.34 0.31 0.26 0.2
0.84 0.68 0.17 0.17 0.15 0.05 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.68 0.43 0.51 0.32 0.11 0.63 0.31 0.48 0.53 0.36 0.14 0.38 0.3 0.52 0.39 0.11 0.47 0.57 0.36 0.51 0.44 0.44 0.67 0.42 0.76 0.14 0.22 1.0 0.69 0.68 0.57 0.5 0.34 0.37
0.81 0.87 0.15 0.11 0.16 0.15 0.13 0.05 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.47 0.42 0.4 0.25 0.2 0.12 0.66 0.28 0.43 0.46 0.22 0.12 0.31 0.37 0.37 0.46 0.07 0.35 0.24 0.34 0.3 0.28 0.41 0.41 0.41 1.0 0.28 0.3 0.38 0.28 0.45 0.17 0.11 0.26 0.18
AT1G77410 (BGAL16)
 0.02 0.01 0.03 0.03 0.01 0.01 0.02 0.05 0.03 0.04 0.02 1.0 0.1 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.13 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01
0.06 0.07 0.04 0.03 0.04 0.11 0.04 0.58 0.43 1.0 0.41 0.08 0.03 0.07 0.16 0.05 0.08 0.07 0.75 0.07 0.08 0.04 0.04 0.07 0.03 0.06 0.13 0.03 0.2 0.01 0.08 0.04 0.03 0.07 0.05 0.06 0.08 0.05 0.07 0.08 0.14 0.09 0.08 0.04 0.05 0.2 0.0 0.03
0.58 1.0 0.05 0.0 0.07 0.09 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.52 0.32 0.25 0.28 0.19 0.08 0.47 0.26 0.27 0.27 0.19 0.1 0.25 0.23 0.14 0.16 0.06 0.26 0.14 0.22 0.39 0.15 0.42 0.32 0.35 0.58 0.11 0.31 0.56 0.55 0.36 0.15 0.08 0.36 0.23
0.37 0.01 0.01 0.07 0.07 0.18 0.18 0.34 0.12 0.14 0.16 0.0 1.0 0.01 0.16 0.01 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.03 0.08 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.2 0.05 0.02 0.03 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.11 0.01
AT2G30440 (TPP)
 0.19 0.15 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.27 0.15 0.31 0.2 0.18 0.06 0.21 0.23 0.17 0.14 0.22 0.04 0.26 0.33 0.12 0.17 0.02 0.12 0.2 0.19 0.47 0.09 0.34 0.71 0.26 1.0 0.43 0.64 0.71 0.29 0.09 0.26 0.17 0.88 0.1
0.13 0.04 0.05 0.03 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.24 0.19 0.12 0.12 0.06 0.05 0.03 0.05 0.06 0.06 0.02 0.09 0.24 0.03 0.15 0.0 0.04 0.15 0.08 0.29 0.05 0.14 0.25 0.11 0.22 1.0 0.62 0.46 0.21 0.04 0.28 0.09 0.01 0.06
0.02 0.42 0.31 0.18 0.1 0.01 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.21 0.24 0.14 0.03 0.02 0.04 0.48 0.03 0.54 1.0 0.21 0.0 0.12 0.03 0.57 0.36 0.0 0.28 0.1 0.17 0.07 0.49 0.32 0.17 0.28 0.01 0.07 0.07 0.01 0.04 0.34 0.13 0.0 0.0 0.15
AT2G38020 (MAN)
 0.74 0.53 0.38 0.51 0.43 0.36 0.45 0.27 0.16 0.04 0.04 0.0 0.08 0.65 0.6 0.52 0.71 0.51 0.34 0.6 0.62 0.44 0.47 0.5 0.32 0.53 0.77 0.41 0.68 0.22 0.52 0.56 0.39 0.68 0.43 0.71 0.92 0.56 0.98 0.15 0.13 1.0 0.71 0.46 0.78 0.88 0.47 0.37
AT2G40180 (PP2C5)
 0.06 0.0 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.33 0.42 0.26 0.33 0.0 0.13 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 1.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
AT2G42880 (MPK20)
 0.01 0.48 0.26 0.21 0.29 0.2 0.25 0.09 0.08 0.07 0.08 0.01 0.13 0.42 0.34 0.24 0.49 0.35 0.14 0.34 0.33 0.33 0.39 0.38 0.08 0.47 0.23 0.28 0.47 0.06 0.23 0.38 0.34 0.55 0.3 0.45 0.16 0.43 0.3 0.4 0.59 0.65 0.98 0.31 0.47 1.0 0.16 0.34
0.39 0.37 0.68 0.58 0.4 0.1 0.53 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.33 0.34 0.2 0.16 0.18 0.1 0.42 0.35 0.37 0.51 0.15 0.12 0.12 0.06 0.41 0.19 0.09 0.4 0.45 0.17 0.22 0.38 0.14 0.34 0.3 0.2 0.07 0.06 0.13 0.26 1.0 0.53 0.05 0.14 0.62
AT2G47620 (CHB1)
 1.0 0.51 0.75 0.54 0.59 0.25 0.49 0.03 0.02 0.02 0.01 0.2 0.03 0.24 0.38 0.18 0.15 0.12 0.14 0.54 0.2 0.27 0.39 0.19 0.11 0.14 0.1 0.52 0.31 0.11 0.38 0.32 0.21 0.24 0.56 0.19 0.34 0.26 0.25 0.1 0.32 0.18 0.21 0.51 0.23 0.2 0.55 0.24
0.51 0.35 0.74 0.94 0.57 0.28 0.77 0.03 0.06 0.02 0.05 0.36 0.02 0.28 0.09 0.28 0.37 0.36 0.2 0.52 0.34 0.25 0.34 0.28 0.27 0.23 0.24 0.37 0.16 0.2 0.59 0.56 0.17 0.3 0.49 0.32 0.35 0.31 0.24 0.05 0.08 0.42 0.71 0.41 0.65 1.0 0.32 0.48
AT3G07610 (IBM1)
 1.0 0.53 0.65 0.55 0.41 0.16 0.44 0.02 0.01 0.01 0.02 0.03 0.02 0.35 0.4 0.26 0.23 0.14 0.21 0.58 0.32 0.33 0.43 0.23 0.21 0.19 0.16 0.44 0.47 0.16 0.64 0.39 0.19 0.15 0.54 0.2 0.3 0.22 0.44 0.21 0.36 0.28 0.13 0.32 0.3 0.01 0.09 0.17
AT3G10800 (BZIP28)
 0.65 0.19 0.21 0.22 0.18 0.15 0.24 0.14 0.13 0.07 0.08 0.41 0.05 0.17 0.2 0.19 0.26 0.2 0.25 0.22 0.23 0.11 0.13 0.22 0.17 0.22 0.27 0.18 1.0 0.14 0.25 0.16 0.11 0.17 0.16 0.28 0.41 0.15 0.36 0.36 0.98 0.28 0.22 0.11 0.2 0.54 0.93 0.11
0.64 0.39 0.32 0.46 0.27 0.13 0.43 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.25 0.36 0.16 0.22 0.21 0.11 0.51 0.25 0.21 0.35 0.22 0.2 0.17 0.14 0.48 1.0 0.21 0.45 0.23 0.16 0.16 0.53 0.21 0.33 0.26 0.21 0.03 0.07 0.1 0.19 0.39 0.27 0.0 0.17 0.27
0.09 0.08 0.07 0.04 0.06 0.01 0.04 0.02 0.03 0.02 0.02 0.78 0.06 0.16 0.06 0.12 0.1 0.06 0.09 0.12 0.21 0.07 0.06 0.11 0.06 0.13 0.32 0.08 0.18 0.06 0.09 0.08 0.14 0.27 0.09 0.11 0.37 0.19 0.62 0.49 1.0 0.55 0.14 0.06 0.13 0.05 0.16 0.04
0.64 0.27 0.42 0.68 0.33 0.13 0.57 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.26 0.18 0.17 0.3 0.23 0.12 0.32 0.22 0.21 0.27 0.21 0.08 0.17 0.13 0.36 1.0 0.06 0.29 0.32 0.15 0.22 0.31 0.25 0.24 0.22 0.18 0.16 0.32 0.31 0.35 0.4 0.4 0.22 0.07 0.3
AT3G19180 (CDP1)
 0.56 1.0 0.65 0.5 0.54 0.33 0.49 0.07 0.04 0.01 0.02 0.0 0.01 0.49 0.46 0.4 0.76 0.55 0.18 0.8 0.32 0.7 0.84 0.37 0.05 0.4 0.08 1.0 0.17 0.03 0.57 0.42 0.29 0.24 0.54 0.32 0.12 0.38 0.09 0.15 0.07 0.12 0.54 0.83 0.41 0.14 0.23 0.4
0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.06 0.03 0.05 0.04 0.06 0.03 0.02 0.04 0.03 0.02 0.03 0.02 0.05 0.19 0.02 0.17 0.01 0.02 0.03 0.05 0.11 0.02 0.05 0.18 0.05 0.16 0.36 1.0 0.16 0.05 0.01 0.05 0.06 0.08 0.01
1.0 0.39 0.32 0.44 0.29 0.22 0.36 0.1 0.18 0.04 0.15 0.98 0.1 0.45 0.26 0.36 0.41 0.37 0.18 0.4 0.44 0.35 0.35 0.26 0.14 0.3 0.42 0.42 0.28 0.12 0.33 0.38 0.26 0.36 0.32 0.27 0.41 0.32 0.49 0.24 0.23 0.38 0.41 0.33 0.51 0.65 0.1 0.27
0.26 0.33 0.23 0.27 0.26 0.29 0.28 0.27 0.16 0.04 0.05 0.31 0.06 0.61 0.31 0.3 0.61 0.33 0.35 0.24 0.27 0.1 0.09 0.27 0.14 0.3 0.79 0.17 0.79 0.1 0.3 0.2 0.15 0.32 0.13 0.24 0.32 0.26 0.44 0.41 1.0 0.77 0.5 0.19 0.26 0.74 0.48 0.17
AT3G56110 (PRA1.B1)
 0.15 0.23 0.32 0.24 0.28 0.17 0.24 0.07 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.16 0.07 0.12 0.16 0.2 0.09 0.22 0.15 0.17 0.26 0.13 0.04 0.11 0.23 0.26 0.05 0.03 0.27 0.17 0.11 0.17 0.3 0.15 0.16 0.18 0.17 0.15 0.24 0.13 0.35 0.28 0.28 1.0 0.14 0.32
0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.09 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.06 0.01 0.01 0.0 0.12 0.03 0.01 0.01 1.0 0.03 0.01 0.13 0.09 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0
0.14 0.49 0.17 0.1 0.11 0.05 0.12 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.06 0.66 0.42 0.55 0.45 0.38 0.14 0.39 0.44 0.4 0.43 0.39 0.37 0.45 1.0 0.35 0.6 0.27 0.35 0.45 0.37 0.46 0.3 0.33 0.79 0.49 0.69 0.32 0.76 0.58 0.39 0.33 0.3 0.52 0.41 0.26
AT4G11830 (PLDGAMMA2)
 0.19 0.58 0.12 0.05 0.16 0.15 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.52 0.23 0.22 0.18 0.06 0.46 0.25 0.25 0.27 0.17 0.03 0.22 0.19 0.22 0.33 0.03 0.26 0.14 0.23 0.3 0.19 0.44 0.3 0.34 1.0 0.19 0.3 0.51 0.51 0.46 0.17 0.25 0.32 0.21
0.19 0.19 0.04 0.02 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.22 0.11 0.12 0.12 0.11 0.07 0.34 0.21 0.14 0.15 0.14 0.09 0.12 0.09 0.04 0.03 0.05 0.31 0.09 0.04 0.08 0.18 0.26 1.0 0.19 0.04 0.01 0.02 0.03 0.09 0.05 0.05 0.07 0.06 0.03
0.14 0.26 0.14 0.06 0.06 0.05 0.04 0.37 0.35 0.17 0.24 0.0 0.15 0.29 0.45 0.15 0.32 0.2 0.21 0.31 0.54 0.19 0.37 0.22 0.02 0.18 0.21 0.46 0.26 0.01 0.22 0.22 0.16 0.15 0.56 0.27 0.43 0.3 0.34 0.1 0.33 0.15 0.33 0.79 0.39 0.12 1.0 0.55
AT4G18710 (SK21)
 0.03 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.08 0.1 0.15 0.13 0.03 0.11 0.1 0.08 0.08 0.09 0.04 0.12 0.08 0.08 0.05 0.03 0.06 0.11 0.11 0.24 0.08 0.13 0.12 0.12 0.21 0.28 1.0 0.19 0.21 0.05 0.13 0.19 0.16 0.07
AT4G21710 (RPB2)
 0.44 0.74 0.65 0.5 0.44 0.2 0.43 0.07 0.03 0.03 0.02 0.0 0.06 0.58 0.41 0.3 0.34 0.25 0.24 0.83 0.34 0.43 0.67 0.32 0.36 0.31 0.41 0.87 0.62 0.44 0.54 0.46 0.33 0.4 0.54 0.34 0.75 0.47 0.7 0.11 0.2 0.34 0.39 1.0 0.56 0.39 0.65 0.42
0.01 0.01 0.1 0.03 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.07 0.0 0.0 0.1 0.01 0.04 0.02 0.01 0.03 0.0 0.04 0.05 0.0 0.06 0.0 0.01 0.05 0.05 0.12 0.0 0.01 0.03 0.05 0.12 0.05 1.0 0.2 0.08 0.01 0.04 0.01 0.02 0.0
AT4G29160 (SNF7.1)
 0.43 0.29 0.21 0.23 0.3 0.36 0.27 0.16 0.08 0.02 0.02 0.06 0.08 0.38 0.93 0.42 0.49 0.34 0.21 0.29 0.36 0.19 0.19 0.44 0.18 0.46 0.72 0.15 0.72 0.22 0.28 0.26 0.36 0.37 0.21 0.44 0.83 0.39 0.8 0.22 0.3 0.66 0.51 0.17 0.3 0.91 1.0 0.17
0.11 0.16 0.03 0.07 0.04 0.07 0.1 0.2 0.3 0.17 0.2 0.0 0.07 0.39 0.25 0.16 0.15 0.13 0.25 0.23 0.15 0.12 0.11 0.14 0.13 0.18 0.53 0.08 0.15 0.07 0.1 0.1 0.19 0.44 0.1 0.2 0.39 0.23 0.96 1.0 0.79 0.94 0.53 0.08 0.23 0.02 0.67 0.1
AT4G30200 (VEL1)
 0.26 0.64 0.35 0.31 0.34 0.34 0.33 0.44 0.25 0.37 0.14 0.45 0.08 0.65 0.68 0.31 0.3 0.25 0.58 0.58 0.18 0.35 0.43 0.39 0.04 0.39 0.49 0.58 0.59 0.01 0.39 0.57 0.31 0.7 0.44 0.38 0.8 0.41 0.49 0.76 0.88 0.82 0.57 0.76 0.51 0.98 1.0 0.33
0.62 0.81 0.64 0.71 0.56 0.37 0.73 0.12 0.07 0.04 0.06 0.04 0.08 0.53 0.53 0.26 0.28 0.33 0.29 0.61 0.45 0.29 0.4 0.3 0.15 0.25 0.43 1.0 0.78 0.14 0.67 0.25 0.28 0.24 0.53 0.23 0.32 0.26 0.32 0.31 0.27 0.19 0.22 0.39 0.36 0.71 0.27 0.24
AT4G34710 (ADC2)
 0.02 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.01 0.03 0.01 0.04 0.01 0.06 0.04 0.03 0.06 0.06 0.02 0.03 0.04 0.03 0.02 0.03 0.05 0.04 0.01 0.01 0.02 0.03 0.05 0.09 0.03 0.03 0.11 0.07 0.05 0.11 1.0 0.1 0.04 0.01 0.02 0.0 0.03 0.02
0.69 0.48 1.0 0.87 0.8 0.42 0.86 0.03 0.02 0.02 0.01 0.34 0.07 0.27 0.25 0.19 0.23 0.21 0.12 0.54 0.24 0.2 0.3 0.24 0.3 0.2 0.09 0.51 0.09 0.37 0.47 0.31 0.18 0.2 0.39 0.22 0.25 0.28 0.27 0.06 0.15 0.16 0.21 0.42 0.23 0.17 0.93 0.26
1.0 0.12 0.13 0.09 0.14 0.23 0.11 0.32 0.15 0.16 0.11 0.1 0.06 0.13 0.11 0.16 0.17 0.17 0.17 0.11 0.21 0.14 0.12 0.16 0.19 0.2 0.18 0.06 0.45 0.18 0.13 0.22 0.18 0.21 0.06 0.23 0.29 0.17 0.33 0.11 0.65 0.13 0.15 0.2 0.21 0.45 0.02 0.14
AT5G24470 (PRR5)
 0.13 0.14 0.14 0.1 0.12 0.04 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 1.0 0.19 0.1 0.14 0.21 0.24 0.12 0.42 0.42 0.08 0.06 0.12 0.86 0.19 0.05 0.01 0.1 0.21 0.13 0.03 0.23 0.17 0.6 0.27 0.28 0.71 0.79 0.14 0.1 0.06 0.05 0.08 0.25 0.04
AT5G26980 (SYP41)
 0.38 0.76 0.62 0.44 0.59 0.51 0.39 0.09 0.02 0.03 0.03 0.0 0.06 0.5 0.47 0.23 0.23 0.14 0.1 0.62 0.22 0.32 0.35 0.23 0.14 0.26 0.22 0.17 0.42 0.12 0.31 0.24 0.2 0.28 0.29 0.38 0.49 0.44 0.47 0.05 0.29 0.27 0.36 0.4 0.2 1.0 0.19 0.22
0.13 0.07 0.04 0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.02 0.03 0.02 0.01 0.06 0.03 0.02 0.04 0.03 0.01 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.04 0.04 0.03 0.02 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.69 1.0 0.06 0.04 0.08 0.03 0.0 0.0 0.02
0.83 0.33 0.35 0.26 0.14 0.06 0.21 0.01 0.05 0.15 0.05 0.01 0.03 0.14 0.08 0.05 0.04 0.04 0.17 0.34 0.02 0.24 0.63 0.09 0.02 0.05 0.03 0.52 1.0 0.03 0.35 0.1 0.08 0.05 0.52 0.16 0.01 0.17 0.01 0.81 0.48 0.03 0.07 0.4 0.27 0.0 0.0 0.25

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)