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Heatmap: Cluster_12 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.34 1.39 1.24 0.47 -1.34 -2.3 -1.22 -0.33 0.04 0.69 0.93 1.23 0.81 -1.7 -1.02 -1.65 -0.17 -0.26 -0.36 0.41 -4.5 -1.14 -1.78 -1.03 -0.04 -0.5
1.47 0.88 0.69 1.75 0.89 -0.33 -0.04 0.4 -1.24 -0.24 0.11 0.17 1.86 -3.11 -2.84 -2.87 0.74 -2.02 -1.85 -2.46 -4.85 -2.23 -1.18 -1.91 -1.47 -1.84
0.49 0.57 0.65 0.77 0.8 0.52 -0.32 -0.56 -0.44 -0.19 0.3 0.6 0.57 -2.39 -1.67 -1.97 -0.75 -0.38 -0.69 -0.1 -0.58 0.21 0.29 0.43 -1.11 -0.32
0.36 1.05 1.26 1.65 1.12 0.43 0.45 0.96 0.55 -0.11 -0.1 -0.18 0.43 -2.23 -1.49 -2.59 -1.59 -1.18 -1.05 -0.09 -6.23 -1.74 -4.25 -4.15 -0.46 -0.63
0.66 1.29 1.08 0.82 0.53 -0.29 -0.82 -0.63 -0.64 0.08 0.45 0.63 0.5 -2.02 -1.0 -1.67 -0.11 0.1 -0.34 0.36 -6.04 0.27 -1.57 -0.18 -1.05 -0.93
0.71 0.64 0.44 0.36 0.28 -0.49 -0.43 -0.34 -0.46 0.12 0.52 0.74 0.51 -0.5 -0.95 -0.8 -0.49 -0.42 -0.79 -0.23 -0.49 0.57 -0.21 0.08 -0.35 -0.34
0.76 0.45 0.11 0.54 0.01 -0.71 -0.12 -0.27 -0.45 0.25 0.56 0.66 0.33 -0.96 -1.34 -1.05 -0.8 -0.0 -1.02 -0.71 0.07 0.71 0.39 -0.17 -0.13 -0.07
0.69 0.69 0.55 0.69 0.55 -0.36 -0.24 -0.18 -0.27 0.3 0.68 0.86 0.5 -0.78 -0.99 -1.07 -0.74 -0.68 -0.95 -0.31 -2.21 0.74 -1.47 -0.39 -0.18 -0.28
1.45 1.33 0.94 0.28 -0.73 -1.41 -0.76 -0.13 -0.08 0.19 0.51 0.92 1.54 -3.02 -1.38 -2.64 -0.45 0.26 -0.2 0.42 -2.86 -3.25 -1.36 -0.89 -1.32 -1.19
0.74 1.25 1.35 1.3 0.54 -1.62 -2.2 -1.74 -2.35 -1.36 -0.37 0.37 0.91 -1.07 -1.31 -0.97 -0.02 -0.32 -0.67 -0.11 -2.57 1.61 -3.28 -0.72 -0.29 -0.67
1.17 0.38 -0.11 1.03 0.66 -0.14 -0.27 0.21 0.01 -0.26 0.8 0.8 1.76 -1.72 -2.09 -1.18 -0.25 -1.77 -1.65 -1.88 -6.16 -2.24 -0.19 -0.91 0.5 -0.92
0.94 0.52 0.54 0.97 0.03 -1.29 -0.83 -0.45 -0.6 0.43 0.99 1.24 1.92 -4.26 -1.84 -4.28 1.03 -2.76 -3.37 -3.9 -2.55 1.04 -1.86 -1.18 -1.52 -1.53
1.05 1.39 1.22 0.92 0.41 -0.82 -0.89 -0.43 -0.21 0.22 0.51 0.79 1.16 -2.76 -2.29 -2.29 -0.35 -0.09 -0.64 0.6 -5.17 -0.61 -3.87 -1.57 -1.04 -1.01
2.04 1.31 1.07 1.59 -0.65 -1.02 0.05 0.74 -1.53 -1.3 -0.98 -0.26 2.32 -3.56 -3.06 -3.4 -3.47 -2.59 -2.07 -1.01 -3.99 -2.34 -2.56 -2.38 -0.47 -0.49
0.75 1.06 1.11 1.2 0.85 0.25 0.48 0.75 0.53 0.88 1.1 1.14 1.26 -6.84 -7.03 -7.08 0.32 -6.16 -6.34 -5.18 -14.83 -3.44 -9.77 -8.31 -3.75 -2.42
1.13 0.93 0.93 0.8 0.71 0.55 0.4 0.52 -0.07 0.31 0.78 1.05 1.85 -3.62 -3.66 -4.01 -0.19 -3.04 -3.03 -3.86 -2.42 -1.94 -2.58 -3.05 -2.14 -1.16
0.18 0.54 0.76 1.01 1.0 0.78 0.09 -0.55 -0.75 -0.56 -0.08 0.31 0.16 -2.98 -1.6 -2.75 -0.7 -0.3 -0.54 0.26 -2.87 0.85 -0.39 0.54 -0.56 -0.11
0.26 0.29 0.26 0.67 0.44 -0.73 -1.45 -0.94 -0.8 -0.35 0.26 0.55 -0.19 -0.99 -1.26 -0.98 -0.53 -0.13 -0.47 -0.17 -1.91 1.39 -0.25 1.07 0.18 0.52
1.13 1.16 1.01 0.75 0.29 -0.23 -0.48 -0.26 -0.23 -0.01 0.35 0.74 1.0 -1.26 -0.93 -0.75 -0.77 -0.04 -0.14 0.59 -4.29 -1.67 -3.86 -1.47 -0.9 -0.69
0.77 0.54 0.62 0.79 0.2 -0.43 -0.34 -0.13 -0.82 -0.69 -0.13 0.49 0.72 -1.37 -1.45 -1.4 -0.59 -0.36 -1.5 -1.12 -1.47 1.43 -1.29 0.65 0.37 0.16
1.34 1.04 0.98 1.9 1.46 0.1 -0.39 -0.37 -2.44 -1.13 -0.94 -0.73 2.22 -3.3 -4.52 -0.78 1.44 -4.32 -4.55 -5.5 -6.22 -4.19 -4.23 -5.49 -3.16 -3.18
1.3 0.83 0.8 1.63 0.81 -0.63 -0.11 0.06 -0.55 -0.29 0.18 0.17 2.07 -2.19 -2.38 -1.97 0.48 -1.27 -1.97 -2.73 -3.89 -1.84 -1.56 -2.02 -1.28 -1.43
-0.86 0.03 0.01 0.83 0.79 -0.02 0.32 -0.07 0.16 0.47 0.89 0.57 -0.98 0.09 -0.39 -0.22 -0.83 -0.38 -0.08 -0.48 -4.19 0.39 -0.74 0.22 -0.49 -0.2
1.46 1.05 0.59 -0.18 -1.29 -2.28 -0.7 -0.11 -0.21 0.43 0.52 0.88 1.57 -1.39 -1.23 -1.36 -0.3 0.42 -0.56 0.22 -3.82 -1.16 -1.83 -0.58 -0.35 -0.42
0.43 0.62 0.82 0.9 0.74 0.21 -0.3 -0.59 -0.58 -0.25 0.13 0.47 0.36 -1.78 -1.2 -1.44 -0.33 -0.2 -0.59 0.32 -1.42 0.65 -0.52 0.32 -0.99 -0.24
0.43 0.66 0.94 1.05 1.05 0.49 -0.31 -0.44 -0.96 -0.48 0.1 0.45 0.44 -1.8 -1.12 -0.88 -0.12 -0.19 -0.4 0.45 -2.02 -0.45 -2.0 -0.23 -0.63 0.17
0.46 0.66 0.86 0.84 0.74 0.51 -0.23 -0.52 -0.35 -0.12 0.23 0.63 0.56 -2.5 -1.31 -1.97 -0.3 -0.33 -0.42 0.56 -0.94 -0.22 -1.09 0.31 -1.23 -0.51
1.16 1.22 0.81 0.15 -0.73 -1.19 -0.89 -0.26 0.11 0.42 0.81 1.15 1.19 -1.84 -1.63 -1.48 -0.39 -0.34 -0.51 0.08 -4.6 -0.79 -1.47 0.02 -0.56 -0.86
0.04 0.59 0.7 0.68 -0.09 -0.55 -0.1 0.34 -0.67 -0.6 -0.66 -0.54 -0.65 0.27 -0.41 -0.06 0.09 0.17 0.1 -0.24 -0.66 1.25 -1.92 -2.21 0.61 0.16
0.06 0.58 0.61 0.73 0.01 -0.68 0.09 0.51 -0.64 -0.53 -0.3 -0.53 -0.77 0.4 -0.5 0.02 0.29 0.01 -0.03 -0.23 -0.75 1.21 -1.53 -2.87 0.45 -0.21
0.69 0.71 0.67 0.49 0.34 -0.09 -0.74 -0.78 -0.56 -0.24 0.24 0.67 0.65 -0.8 -0.73 -1.27 -0.06 -0.43 -0.41 -0.04 -2.5 0.68 -0.67 0.54 -0.36 -0.26
0.25 0.77 0.75 0.63 0.72 0.39 -0.32 -0.47 -0.46 -0.3 -0.04 0.18 0.46 -1.44 -0.58 -1.16 -0.07 -0.54 -0.32 0.4 -1.65 0.85 -1.27 0.05 -0.18 -0.59
0.88 0.95 0.63 0.5 0.11 -0.43 -0.57 -0.18 0.17 0.28 0.67 0.89 1.06 -2.49 -1.86 -1.87 -0.43 -0.19 -0.46 0.18 -1.72 -0.46 -1.07 -0.53 -0.3 -0.31
0.92 1.14 0.95 0.65 0.11 -0.56 -0.41 0.08 0.26 0.43 0.67 0.86 1.14 -1.9 -1.92 -1.94 -0.77 -0.17 -0.94 -0.17 -4.78 -0.72 -2.01 -0.88 -0.08 -0.66
0.93 1.28 1.09 0.61 -0.02 -0.64 -0.66 -0.09 0.27 0.41 0.61 0.77 1.09 -3.7 -2.08 -3.24 -0.38 0.11 -0.45 0.47 -5.57 -1.06 -2.88 -0.78 -0.6 -0.57
1.15 1.4 1.17 1.01 0.44 -0.73 -0.13 0.45 -0.11 0.26 0.66 0.85 1.52 -2.53 -1.78 -1.23 -2.18 -1.74 -1.59 -0.82 -3.6 -1.4 -3.16 -2.15 -0.51 -1.11
1.77 0.24 1.16 1.39 0.18 1.48 0.41 1.26 0.68 0.06 0.3 0.32 1.5 -2.15 -4.82 -4.76 -2.18 - -3.77 -5.11 -3.38 - - -4.84 -3.56 -2.84
0.29 0.75 1.04 1.12 0.9 0.59 0.48 0.35 -0.61 -0.15 -0.06 0.22 0.82 -1.54 -1.69 -1.59 1.06 -0.63 -1.13 -1.35 -4.02 -1.22 -1.11 -1.75 -0.08 -0.73
0.72 0.79 0.51 0.61 0.5 0.45 -0.31 -0.47 -0.16 0.06 0.45 0.86 0.68 -2.78 -1.79 -2.21 -0.91 -0.7 -0.63 0.17 -2.06 0.35 -0.53 0.41 -0.53 -0.26
0.59 0.98 0.45 0.64 -0.1 -0.92 -0.87 -0.22 0.02 -0.08 0.24 0.4 0.64 -1.7 -1.36 -1.55 -0.85 -0.3 -0.5 0.07 -1.53 0.58 0.24 0.18 0.41 0.1
0.57 0.61 0.73 0.81 0.58 0.06 0.11 0.21 0.2 0.51 0.61 0.56 0.57 -0.69 -1.67 -1.06 -0.31 -0.85 -0.97 -0.35 -3.52 -0.79 -1.29 -0.04 -0.41 -0.16
0.8 0.64 0.55 0.67 0.61 0.37 -0.22 -0.31 -0.36 -0.06 0.46 0.89 0.9 -3.08 -2.29 -2.32 -1.01 -0.57 -1.13 -0.31 -1.43 0.1 0.16 0.72 -1.14 -0.5
0.42 0.58 0.56 0.61 0.54 0.17 -0.51 -0.66 -0.5 -0.32 0.09 0.5 0.52 -2.94 -1.27 -2.33 -0.46 -0.24 -0.46 0.27 -0.6 0.96 -0.62 0.84 -0.57 -0.2
0.56 0.71 0.59 0.56 0.42 -0.03 -0.67 -0.66 -0.45 -0.12 0.34 0.71 0.6 -3.16 -2.03 -2.74 -0.8 -0.29 -1.04 -0.05 -0.91 0.7 0.8 0.69 -0.68 -0.35
0.45 0.76 0.65 0.78 0.61 0.37 -0.17 -0.24 -0.33 -0.32 0.05 0.31 0.41 -2.24 -1.09 -1.73 -0.53 -0.11 -0.36 0.02 -2.25 0.61 -0.16 0.28 -0.27 -0.25
1.31 1.26 0.8 0.41 -0.5 -1.57 -0.81 -0.15 -0.08 0.26 0.5 0.66 1.3 -1.93 -1.51 -1.76 -0.41 0.36 -0.31 0.28 -2.77 -1.1 -2.04 -1.0 -0.21 -0.43
0.78 0.9 0.76 0.56 0.26 -0.06 -0.36 -0.12 0.01 -0.1 0.21 0.55 0.83 -1.23 -1.54 -0.74 -0.39 -0.79 -0.98 -0.3 -0.64 0.33 -0.92 -0.09 -0.07 -0.49
1.07 1.33 0.99 0.55 -0.07 -0.62 -0.48 -0.05 -0.08 -0.12 0.19 0.48 1.21 -1.76 -1.81 -1.6 -0.58 -0.12 -0.7 -0.15 -2.09 0.18 -2.13 -0.48 -0.19 -0.51
0.72 1.13 1.16 0.91 0.54 0.36 0.09 0.3 0.45 0.13 0.39 0.71 1.03 -1.48 -1.57 -1.64 -0.8 -0.54 -0.46 -0.28 -6.03 -1.6 -3.27 -1.74 -1.01 -1.03
0.64 1.19 1.04 0.86 0.47 -0.16 -0.04 0.19 0.2 0.27 0.44 0.57 0.88 -1.15 -1.48 -1.16 -0.18 0.13 -0.47 0.23 -8.72 -1.03 -6.19 -3.12 -0.56 -1.25
0.51 0.62 0.65 0.62 0.49 0.12 0.18 0.39 0.08 0.05 0.12 0.21 0.59 -0.53 -0.09 -0.29 0.45 -0.24 -0.2 -0.05 -5.26 -0.73 -1.57 -1.21 -0.52 -0.82
1.48 1.32 0.95 1.07 -0.07 -2.14 -1.45 -0.49 -0.48 0.0 0.67 1.02 1.75 -3.33 -3.6 -3.13 -1.2 -0.72 -1.52 -0.45 -4.0 -0.53 -3.48 -1.26 0.12 -0.06
0.63 0.89 0.9 0.71 0.28 -0.31 -0.45 -0.11 0.11 0.06 0.27 0.47 0.66 -1.26 -1.24 -0.65 -0.33 -0.34 -0.67 0.19 -1.56 0.17 -1.79 -0.27 -0.28 -0.17
0.99 1.17 0.99 0.82 -0.1 -1.61 -1.7 -0.36 -0.39 -0.57 0.03 0.63 1.06 -1.76 -1.68 -1.69 -1.4 -0.94 -1.24 -0.47 -0.77 0.33 0.29 0.03 0.57 0.05
0.99 1.37 1.04 0.57 -0.24 -1.31 -0.97 -0.31 0.04 0.14 0.33 0.51 0.98 -2.02 -1.16 -1.6 0.01 0.38 -0.17 0.56 -3.78 -0.78 -2.25 -1.06 -0.43 -0.39
0.59 0.69 0.82 0.74 0.79 0.45 -0.35 -0.59 -0.36 -0.14 0.34 0.7 0.67 -2.47 -1.12 -2.06 -0.5 -0.47 -0.52 0.23 -2.88 0.41 -0.61 0.44 -1.02 -0.82
0.39 1.08 1.48 2.33 0.64 0.05 0.28 -1.13 -0.01 -0.98 0.59 0.84 1.73 -2.83 -4.3 -2.48 -0.25 - -3.28 - -0.64 -3.53 -4.59 -3.61 -3.86 -2.73
1.23 1.11 1.1 1.12 0.73 -0.3 -0.43 -0.24 -1.4 -0.81 -0.36 0.02 1.3 -1.44 -1.36 -1.55 0.69 -0.98 -1.32 -0.85 -2.05 -0.58 -0.89 -1.23 0.01 -0.2
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1.7 1.42 0.34 0.02 -1.67 -3.3 -1.91 -0.58 -0.3 0.55 1.15 1.41 1.79 -3.0 -2.48 -3.1 -1.09 -0.35 -1.09 -0.47 -4.03 -0.55 -2.12 -0.75 -0.33 -0.77
-0.45 0.65 0.75 1.02 0.83 0.53 0.3 0.29 -0.35 0.41 0.49 0.61 -0.07 -2.19 -1.73 -1.93 -0.19 0.15 -0.45 0.47 -3.97 -0.11 -2.37 -0.46 -0.41 -0.38
0.64 0.78 0.72 1.1 0.59 0.52 0.24 0.55 0.49 -0.02 0.01 0.37 0.78 -0.7 -0.18 -0.56 -0.53 0.18 -0.24 0.06 -4.93 -4.24 -3.77 -2.36 -3.44 -0.75

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.