Heatmap: Cluster_195 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.78 0.65 0.72 0.72 0.63 0.55 0.73 0.81 0.61 0.64 0.58 0.5 0.7 0.75 1.0 0.7 0.61 0.64 0.52 0.61 0.09 0.5 0.25 0.26 0.48 0.5
0.76 0.63 0.69 0.62 0.58 0.67 0.75 0.75 0.63 0.56 0.47 0.37 0.61 1.0 1.0 0.79 0.62 0.64 0.66 0.69 0.01 0.15 0.18 0.17 0.51 0.41
0.29 0.31 0.31 0.35 0.44 0.48 0.44 0.37 0.38 0.42 0.36 0.29 0.32 0.77 0.82 0.64 0.49 0.61 0.75 0.43 0.13 0.33 0.53 0.53 1.0 0.68
0.3 0.36 0.41 0.48 0.59 0.62 0.65 0.61 0.72 0.62 0.58 0.62 0.33 0.83 0.77 1.0 0.77 0.89 0.64 0.74 0.45 0.27 0.51 0.58 0.61 0.64
0.64 0.7 0.68 0.7 0.68 0.82 0.74 0.67 0.63 0.58 0.56 0.48 0.65 0.58 0.61 0.72 1.0 0.85 0.85 0.62 0.15 0.44 0.37 0.41 0.66 0.6
0.75 0.74 0.7 0.75 0.74 0.59 0.65 0.54 0.59 0.6 0.52 0.48 0.65 0.92 0.69 1.0 0.5 0.73 0.7 0.46 0.15 0.98 0.5 0.51 0.85 0.73
0.32 0.3 0.25 0.36 0.52 0.59 0.6 0.51 0.49 0.53 0.49 0.45 0.34 1.0 0.57 1.0 0.55 0.74 0.72 0.64 0.32 0.48 0.45 0.59 0.65 0.77
0.52 0.51 0.51 0.62 0.85 1.0 0.9 0.76 0.81 0.92 0.76 0.69 0.54 0.89 0.82 0.72 0.74 0.98 0.79 0.67 0.15 0.22 0.64 0.39 0.59 0.7
0.67 0.63 0.72 0.8 0.85 0.89 0.84 0.82 0.79 0.85 0.86 0.85 0.68 1.0 0.87 0.98 0.74 0.95 0.8 0.77 0.08 0.5 0.44 0.55 0.6 0.78
0.72 0.74 0.81 0.77 0.7 0.66 0.81 0.84 0.73 0.75 0.65 0.56 0.66 1.0 0.82 0.78 0.63 0.84 0.63 0.82 0.09 0.37 0.22 0.31 0.74 0.77
0.52 0.82 0.88 0.78 0.42 0.26 0.38 0.48 0.37 0.35 0.38 0.37 0.49 1.0 0.56 0.82 0.46 0.63 0.47 0.47 0.02 0.29 0.25 0.23 0.91 0.81
0.52 0.46 0.51 0.47 0.49 0.45 0.69 0.67 0.69 0.65 0.53 0.51 0.57 0.78 1.0 0.76 0.57 0.88 0.58 0.57 0.16 0.55 0.5 0.31 0.77 0.56
0.94 0.66 0.57 0.64 1.0 0.82 0.9 0.74 0.74 0.57 0.5 0.51 0.68 0.92 0.71 0.97 0.52 0.93 0.81 0.6 0.04 0.23 0.71 0.58 0.63 0.51
0.19 0.15 0.18 0.27 0.25 0.17 0.25 0.25 0.29 0.27 0.34 0.28 0.23 0.63 0.78 0.56 0.51 0.58 0.8 0.37 0.19 0.38 0.45 0.79 1.0 0.78
0.55 0.74 0.75 0.74 0.83 0.75 0.64 0.59 0.4 0.41 0.41 0.43 0.75 0.73 0.88 0.99 0.69 0.56 0.6 0.49 0.05 0.42 0.18 0.23 1.0 0.48
0.63 0.56 0.55 0.57 0.63 0.77 0.85 0.71 0.64 0.58 0.49 0.5 0.68 0.82 0.84 0.91 0.68 0.96 1.0 0.77 0.2 0.36 0.66 0.47 0.79 0.7
0.36 0.59 0.34 0.37 0.42 0.18 0.39 0.33 0.2 0.37 0.28 0.36 0.38 0.97 0.81 0.72 0.63 0.71 1.0 0.57 0.12 0.92 0.28 0.4 0.39 0.87
0.66 0.74 0.75 0.77 0.9 0.83 0.83 0.73 0.7 0.61 0.6 0.63 0.73 0.95 0.92 1.0 0.6 0.68 0.86 0.61 0.06 0.51 0.42 0.38 0.44 0.6
0.58 0.58 0.53 0.51 0.53 0.61 0.51 0.41 0.45 0.5 0.36 0.47 0.5 0.83 0.84 0.81 0.57 0.73 0.72 0.46 0.2 0.48 0.58 0.62 1.0 0.96
0.67 0.62 0.57 0.65 0.77 0.82 0.74 0.7 0.58 0.51 0.58 0.48 0.63 1.0 0.72 0.83 0.66 0.9 0.82 0.68 0.04 0.53 0.39 0.48 0.64 0.64
0.67 0.58 0.69 0.61 0.64 0.79 0.77 0.71 0.63 0.65 0.51 0.5 0.68 0.77 0.8 0.76 0.95 0.99 1.0 0.92 0.07 0.44 0.54 0.53 0.81 0.97
0.64 0.51 0.55 0.69 0.81 1.0 0.91 0.92 0.85 0.71 0.63 0.49 0.51 0.65 0.72 0.71 0.54 0.79 0.7 0.62 0.13 0.54 0.54 0.36 0.5 0.66
0.37 0.4 0.46 0.51 0.61 0.58 0.55 0.52 0.58 0.56 0.52 0.52 0.39 1.0 0.55 0.93 0.53 0.65 0.5 0.51 0.16 0.54 0.39 0.47 0.81 0.75
0.82 0.87 0.9 0.77 0.74 0.75 0.63 0.68 0.47 0.47 0.39 0.43 0.65 0.62 0.53 0.47 0.59 0.89 1.0 0.78 0.06 0.36 0.27 0.41 0.6 0.97
1.0 0.9 0.83 0.64 0.54 0.57 0.69 0.71 0.62 0.55 0.48 0.46 0.74 0.77 0.67 0.59 0.55 0.77 0.7 0.76 0.03 0.17 0.23 0.31 0.72 0.7
0.28 0.37 0.56 0.61 0.63 0.76 0.75 0.66 0.89 0.73 0.6 0.5 0.23 0.9 0.88 1.0 0.7 0.96 0.63 0.59 0.09 0.56 0.66 0.43 0.65 0.71
0.27 0.31 0.25 0.24 0.25 0.32 0.5 0.44 0.45 0.33 0.27 0.22 0.21 0.28 1.0 0.38 0.41 0.63 0.55 0.38 0.14 0.16 0.5 0.36 0.47 0.36
0.61 0.44 0.46 0.62 0.7 0.58 0.7 0.71 0.57 0.66 0.6 0.5 0.46 0.89 1.0 0.96 0.51 0.51 0.56 0.69 0.03 0.65 0.27 0.26 0.4 0.67
0.35 0.32 0.37 0.46 0.46 0.48 0.52 0.59 0.78 0.62 0.57 0.43 0.33 0.93 0.5 1.0 0.47 0.77 0.66 0.54 0.08 0.86 0.54 0.41 0.67 0.74
0.67 0.54 0.61 0.63 0.51 0.4 0.51 0.57 0.42 0.44 0.4 0.37 0.63 0.72 1.0 0.94 0.57 0.75 0.71 0.59 0.17 0.69 0.32 0.35 0.5 0.68
0.4 0.85 0.9 0.78 0.76 0.62 0.63 0.68 0.78 0.74 0.75 0.7 0.36 1.0 0.92 0.91 0.76 1.0 0.77 0.71 0.08 0.26 0.47 0.47 0.98 0.88
0.67 0.85 0.58 0.46 0.62 1.0 0.74 0.66 0.59 0.46 0.46 0.33 0.56 0.84 0.57 0.82 0.66 0.8 0.87 0.66 0.06 0.56 0.44 0.28 0.58 0.65
0.59 0.57 0.6 0.61 0.69 0.66 0.69 0.56 0.48 0.49 0.33 0.36 0.6 1.0 0.85 0.9 0.65 0.84 0.77 0.62 0.09 0.28 0.49 0.52 0.73 0.86
0.49 0.35 0.32 0.29 0.48 0.7 0.78 0.62 0.51 0.39 0.28 0.19 0.5 0.66 0.74 0.63 0.67 1.0 0.87 0.77 0.03 0.21 0.76 0.18 0.49 0.43
0.42 0.77 0.75 0.75 0.71 0.58 0.66 0.63 0.57 0.62 0.57 0.59 0.39 0.57 0.77 1.0 0.75 0.9 0.89 0.69 0.16 0.58 0.62 0.74 0.89 0.69
0.55 0.75 0.56 0.53 0.55 0.72 0.69 0.63 0.57 0.38 0.28 0.29 0.44 0.76 0.8 0.78 0.72 0.91 1.0 0.74 0.08 0.28 0.55 0.46 0.64 0.66
0.88 0.66 0.65 0.7 0.83 0.68 0.68 0.58 0.45 0.35 0.3 0.39 0.86 0.81 0.77 1.0 0.76 0.88 0.75 0.57 0.02 0.53 0.26 0.45 0.76 0.75
0.8 0.75 0.64 0.54 0.56 0.53 0.57 0.52 0.46 0.46 0.42 0.44 0.62 0.85 0.75 0.87 0.61 0.75 0.66 0.58 0.17 1.0 0.41 0.5 0.76 0.79
0.58 0.51 0.62 0.63 0.65 0.69 0.75 0.79 0.9 0.85 0.7 0.73 0.76 0.74 0.74 1.0 0.67 0.9 0.85 0.75 0.03 0.16 0.56 0.35 0.58 0.49
0.34 0.48 0.49 0.55 0.64 0.46 0.59 0.48 0.61 0.52 0.36 0.35 0.28 0.9 0.74 1.0 0.63 0.76 0.71 0.52 0.34 0.85 0.7 0.45 0.81 0.79
0.36 0.32 0.35 0.34 0.35 0.46 0.65 0.6 0.64 0.48 0.4 0.33 0.3 0.76 0.86 0.68 0.52 1.0 0.74 0.51 0.03 0.3 0.46 0.39 0.56 0.48
0.61 0.64 0.62 0.59 0.53 0.45 0.59 0.72 0.67 0.63 0.6 0.49 0.52 0.65 1.0 0.67 0.53 0.7 0.56 0.61 0.16 0.35 0.56 0.29 0.58 0.44
0.74 0.67 0.92 0.85 0.83 0.71 0.86 0.8 0.64 0.6 0.52 0.48 0.61 0.68 0.83 0.84 0.76 1.0 0.82 0.78 0.03 0.49 0.36 0.39 0.89 0.67
0.6 0.59 0.57 0.5 0.43 0.4 0.53 0.56 0.53 0.52 0.49 0.45 0.62 0.77 0.9 1.0 0.75 0.93 0.74 0.6 0.19 0.62 0.5 0.41 0.51 0.5
0.34 0.22 0.18 0.14 0.1 0.12 0.16 0.15 0.1 0.1 0.11 0.15 0.39 0.46 1.0 0.49 0.33 0.38 0.36 0.2 0.08 0.18 0.05 0.11 0.15 0.16
0.97 0.92 1.0 0.89 0.76 0.71 0.86 0.97 0.71 0.69 0.59 0.5 0.79 0.8 0.95 0.88 0.66 0.86 0.76 0.81 0.01 0.41 0.18 0.24 0.69 0.64
0.83 0.69 0.72 0.77 0.72 0.69 0.6 0.54 0.43 0.49 0.43 0.42 0.65 0.98 0.81 0.97 0.65 1.0 0.8 0.65 0.35 0.39 0.36 0.53 0.65 0.91
0.58 0.47 0.5 0.47 0.6 0.47 0.74 0.67 0.7 0.64 0.55 0.6 0.64 1.0 0.71 0.98 0.74 0.79 0.64 0.66 0.05 0.22 0.41 0.28 0.49 0.47
0.5 0.52 0.47 0.43 0.34 0.28 0.45 0.43 0.23 0.27 0.24 0.27 0.47 0.62 0.57 0.51 0.47 0.54 0.63 0.52 0.06 1.0 0.26 0.44 0.51 0.87
0.62 0.41 0.35 0.3 0.32 0.36 0.46 0.43 0.32 0.34 0.31 0.3 0.71 1.0 0.76 0.92 0.58 0.55 0.66 0.42 0.02 0.09 0.45 0.35 0.78 0.59
0.37 0.6 0.63 0.52 0.39 0.39 0.48 0.53 0.51 0.43 0.41 0.35 0.3 0.57 0.71 0.52 0.61 0.76 0.72 0.71 0.03 0.07 0.39 0.49 0.98 1.0
0.43 0.49 0.55 0.45 0.42 0.39 0.46 0.5 0.45 0.45 0.37 0.36 0.39 0.75 1.0 0.75 0.55 0.57 0.55 0.72 0.02 0.26 0.25 0.19 0.38 0.46
0.8 1.0 0.94 0.66 0.54 0.54 0.37 0.52 0.32 0.22 0.2 0.23 0.63 0.54 0.84 0.66 0.75 0.22 0.4 0.52 0.03 0.34 0.1 0.17 0.99 0.53
0.73 0.83 0.71 0.72 0.7 0.53 0.6 0.57 0.48 0.38 0.38 0.35 0.44 0.87 0.67 1.0 0.78 0.89 0.72 0.68 0.04 0.28 0.61 0.31 0.61 0.53
0.8 0.65 0.48 0.53 0.71 0.64 0.77 0.7 0.63 0.52 0.5 0.37 0.62 1.0 0.76 0.91 0.5 0.78 0.67 0.49 0.07 0.37 0.43 0.42 0.58 0.59
0.56 0.45 0.41 0.46 0.56 0.63 0.6 0.53 0.52 0.42 0.36 0.36 0.6 0.9 1.0 0.85 0.67 0.94 0.85 0.46 0.12 0.7 0.47 0.56 0.83 0.64
0.29 0.27 0.34 0.33 0.32 0.25 0.31 0.32 0.28 0.32 0.33 0.33 0.29 0.55 1.0 0.61 0.27 0.52 0.43 0.24 0.04 0.4 0.25 0.24 0.32 0.33
0.93 0.82 0.75 0.68 0.67 0.74 0.75 0.78 0.69 0.56 0.53 0.55 0.82 0.88 0.52 1.0 0.71 0.87 0.91 0.84 0.22 0.38 0.53 0.52 0.66 0.85
0.33 0.22 0.33 0.39 0.43 0.35 0.64 0.59 0.59 0.69 0.51 0.43 0.34 0.43 0.29 1.0 0.6 0.62 0.53 0.68 0.02 0.23 0.19 0.18 0.31 0.32
0.51 0.51 0.58 0.57 0.57 0.49 0.63 0.62 0.56 0.51 0.45 0.39 0.48 0.79 0.95 1.0 0.65 0.85 0.72 0.61 0.18 0.55 0.5 0.46 0.67 0.6
0.38 0.33 0.31 0.35 0.38 0.34 0.39 0.38 0.26 0.3 0.27 0.26 0.32 0.78 1.0 0.99 0.77 0.69 0.69 0.34 0.05 0.22 0.35 0.31 0.46 0.3
0.44 0.58 0.56 0.73 0.61 0.65 0.64 0.56 0.63 0.65 0.57 0.53 0.28 0.99 0.99 0.91 0.74 0.8 0.83 0.61 0.49 0.78 1.0 0.7 0.78 0.97
0.58 0.75 0.75 0.8 0.9 0.76 0.99 0.91 0.8 0.73 0.63 0.56 0.53 1.0 0.78 0.8 0.69 0.91 0.72 0.68 0.07 0.44 0.38 0.55 0.58 0.83
0.63 0.68 0.67 0.54 0.47 0.5 0.45 0.37 0.28 0.2 0.17 0.18 0.51 0.83 0.65 0.78 0.74 0.45 0.58 0.45 0.02 0.32 0.17 0.2 1.0 0.56
0.43 0.56 0.61 0.6 0.65 0.47 0.43 0.43 0.44 0.47 0.42 0.48 0.41 0.86 0.97 1.0 0.65 0.9 0.67 0.49 0.09 0.21 0.54 0.51 0.76 0.59
1.0 0.69 0.76 0.73 0.62 0.52 0.71 0.93 0.75 0.73 0.45 0.38 0.85 0.65 0.86 0.89 0.55 0.9 0.65 0.66 0.02 0.43 0.28 0.18 0.88 0.82
0.28 0.32 0.32 0.46 0.44 0.37 0.41 0.42 0.49 0.61 0.47 0.55 0.31 1.0 0.33 0.99 0.25 0.44 0.44 0.36 0.16 0.47 0.37 0.62 0.56 0.78
0.35 0.38 0.37 0.37 0.32 0.23 0.24 0.24 0.21 0.29 0.3 0.32 0.37 0.68 1.0 0.55 0.32 0.35 0.23 0.28 0.02 0.16 0.17 0.19 0.39 0.3
0.1 0.22 0.31 0.45 0.58 0.51 0.64 0.51 0.49 0.44 0.38 0.26 0.11 0.8 0.91 0.55 0.44 1.0 0.75 0.57 0.1 0.21 0.57 0.27 0.43 0.64
0.74 0.62 0.65 0.74 0.68 0.65 0.72 0.75 0.63 0.58 0.55 0.53 0.7 0.76 0.7 0.91 0.55 0.82 0.72 0.58 0.37 1.0 0.95 0.61 0.94 0.96
0.37 0.48 0.49 0.52 0.56 0.53 0.61 0.55 0.63 0.52 0.5 0.43 0.41 1.0 0.78 0.93 0.6 0.97 0.72 0.54 0.18 0.76 0.66 0.5 0.72 0.75
0.86 0.77 0.87 0.66 0.62 0.69 0.78 0.86 0.66 0.66 0.63 0.7 0.65 1.0 0.73 0.81 0.87 0.66 0.79 0.77 0.05 0.14 0.41 0.43 0.62 0.73
0.45 0.51 0.53 0.46 0.57 0.72 0.65 0.57 0.61 0.61 0.51 0.49 0.43 1.0 0.85 0.85 0.67 0.83 0.67 0.61 0.36 0.31 0.61 0.62 0.76 0.85

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)