1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_6 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
0.02 0.19 0.27 0.32 0.34 0.23 0.29 0.37 0.3 0.37 0.31 0.28 0.02 1.0 0.86 0.98 0.67 0.84 0.73 0.54 0.02 0.1 0.05 0.12 0.27 0.22
0.38 0.42 0.46 0.51 0.52 0.41 0.47 0.46 0.38 0.41 0.36 0.32 0.37 0.71 0.65 1.0 0.53 0.76 0.64 0.4 0.24 0.65 0.37 0.34 0.39 0.41
0.03 0.03 0.03 0.04 0.05 0.06 0.08 0.08 0.07 0.11 0.12 0.1 0.07 0.83 0.71 0.96 0.48 1.0 0.53 0.45 0.0 0.03 0.01 0.03 0.06 0.03
0.09 0.2 0.24 0.3 0.45 0.6 0.52 0.43 0.3 0.24 0.18 0.17 0.11 0.61 0.82 1.0 0.56 0.77 0.86 0.55 0.38 0.48 0.68 0.34 0.32 0.38
0.69 0.68 0.61 0.65 0.54 0.54 0.97 0.93 0.77 0.8 0.74 0.74 0.65 0.67 0.53 0.66 0.9 0.68 1.0 0.63 0.67 0.8 0.8 0.55 0.84 0.58
0.12 0.19 0.25 0.41 0.34 0.32 0.32 0.3 0.36 0.32 0.38 0.29 0.06 0.6 0.42 1.0 0.32 0.57 0.53 0.37 0.04 0.5 0.39 0.3 0.5 0.62
0.11 0.1 0.06 0.07 0.08 0.08 0.1 0.1 0.1 0.12 0.17 0.17 0.17 0.7 0.52 0.82 0.44 1.0 0.45 0.32 0.01 0.01 0.03 0.02 0.05 0.03
0.21 0.28 0.33 0.34 0.35 0.32 0.37 0.34 0.36 0.3 0.29 0.24 0.15 0.27 0.26 1.0 0.39 0.8 0.51 0.51 0.05 0.2 0.31 0.3 0.37 0.42
0.14 0.17 0.15 0.21 0.18 0.14 0.18 0.23 0.24 0.21 0.2 0.14 0.12 0.56 0.71 0.87 0.32 1.0 0.58 0.21 0.24 0.33 0.57 0.27 0.27 0.28
0.16 0.47 0.61 0.73 0.87 0.76 0.46 0.35 0.29 0.3 0.29 0.32 0.15 0.93 1.0 0.81 0.5 0.55 0.47 0.39 0.17 0.99 0.5 0.45 0.77 0.72
0.45 0.35 0.37 0.41 0.55 0.6 0.37 0.38 0.46 0.55 0.51 0.55 0.47 0.7 0.79 1.0 0.52 0.49 0.85 0.59 0.38 0.68 0.17 0.31 0.28 0.31
0.31 0.37 0.42 0.48 0.43 0.29 0.43 0.47 0.33 0.37 0.34 0.31 0.32 0.53 0.7 1.0 0.65 0.91 0.7 0.47 0.39 0.79 0.62 0.43 0.43 0.41
0.48 0.51 0.51 0.68 0.64 0.45 0.6 0.64 0.52 0.49 0.5 0.41 0.47 0.53 0.77 0.92 0.56 0.77 0.76 0.44 0.46 1.0 0.78 0.52 0.61 0.5
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 1.0 0.63 0.18 0.11 0.25 0.27 0.24 0.0 0.2 0.15 0.0 0.11
0.32 0.36 0.45 0.42 0.43 0.35 0.28 0.29 0.37 0.42 0.39 0.42 0.34 1.0 0.58 0.86 0.46 0.47 0.36 0.4 0.03 0.51 0.21 0.32 0.37 0.45
0.13 0.13 0.24 0.25 0.29 0.27 0.31 0.3 0.31 0.25 0.18 0.14 0.19 0.61 0.68 1.0 0.51 0.75 0.72 0.49 0.06 0.08 0.14 0.21 0.29 0.38
0.41 0.42 0.49 0.51 0.51 0.45 0.68 0.52 0.38 0.54 0.43 0.42 0.27 1.0 0.74 0.86 0.71 0.6 0.64 0.66 0.59 0.74 0.74 0.47 0.54 0.39
0.36 0.36 0.51 0.43 0.52 0.38 0.59 0.48 0.34 0.59 0.44 0.34 0.27 1.0 0.74 0.92 0.78 0.59 0.65 0.7 0.61 0.64 0.75 0.31 0.39 0.38
0.57 0.61 0.66 0.74 0.81 0.77 1.0 0.75 0.71 0.8 0.68 0.65 0.49 0.79 0.68 0.79 0.63 0.69 0.8 0.69 0.75 0.68 0.99 0.44 0.64 0.58
0.55 0.63 0.53 0.57 0.59 0.56 0.55 0.58 0.55 0.57 0.56 0.53 0.56 0.78 0.94 1.0 0.56 0.77 0.8 0.58 0.5 0.74 0.75 0.58 0.67 0.62
0.49 0.4 0.5 0.43 0.42 0.49 0.46 0.39 0.38 0.4 0.36 0.37 0.49 0.85 1.0 0.84 0.63 0.5 0.63 0.57 0.23 0.32 0.55 0.3 0.31 0.45
0.43 0.68 0.74 0.64 0.58 0.44 0.4 0.37 0.51 0.57 0.52 0.54 0.43 0.91 0.93 0.8 0.39 0.55 1.0 0.9 0.33 0.49 0.47 0.31 0.28 0.31
0.42 0.58 0.52 0.55 0.56 0.58 0.45 0.48 0.46 0.45 0.48 0.53 0.61 0.77 0.74 1.0 0.6 0.65 0.67 0.31 0.2 0.79 0.38 0.36 0.37 0.42
0.08 0.14 0.09 0.09 0.18 0.33 0.32 0.14 0.11 0.05 0.05 0.03 0.05 0.47 0.86 1.0 0.22 0.2 0.24 0.09 0.02 0.07 0.06 0.02 0.05 0.05
0.3 0.51 0.63 0.72 0.8 0.69 0.62 0.57 0.6 0.62 0.61 0.63 0.37 0.93 1.0 1.0 0.71 0.9 0.8 0.51 0.36 0.72 0.5 0.51 0.56 0.53
0.12 0.23 0.25 0.27 0.27 0.27 0.3 0.3 0.27 0.34 0.25 0.28 0.09 0.3 0.28 1.0 0.21 0.44 0.48 0.23 0.21 0.21 0.31 0.37 0.55 0.64
0.12 0.24 0.3 0.33 0.36 0.29 0.28 0.25 0.23 0.23 0.2 0.19 0.11 0.51 0.51 1.0 0.35 0.4 0.38 0.28 0.1 0.45 0.31 0.27 0.31 0.34
0.12 0.33 0.43 0.51 0.56 0.51 0.42 0.46 0.52 0.45 0.38 0.31 0.15 0.63 1.0 0.85 0.5 0.84 0.8 0.46 0.48 0.84 0.67 0.47 0.54 0.5
0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.19 0.19 0.16 0.12 0.16 0.16 0.09 0.01 0.38 0.76 1.0 0.1 0.03 0.02 0.04 0.0 0.07 0.01 0.02 0.27 0.1
0.32 0.44 0.58 0.49 0.54 0.45 0.67 0.46 0.43 0.44 0.44 0.25 0.29 0.87 0.99 0.98 1.0 0.38 0.73 1.0 0.15 0.2 0.11 0.28 0.15 0.28
0.61 0.8 1.0 0.67 0.31 0.21 0.38 0.38 0.53 0.59 0.6 0.46 0.48 0.98 0.96 0.97 0.67 0.59 0.77 0.96 0.03 0.01 0.0 0.13 0.01 0.13
0.67 0.6 0.62 0.61 0.74 0.79 0.83 0.75 0.63 0.63 0.54 0.52 0.66 0.81 1.0 0.97 0.74 0.84 0.75 0.67 0.3 0.61 0.62 0.48 0.5 0.49
0.13 0.21 0.33 0.35 0.43 0.4 0.45 0.38 0.49 0.68 0.62 0.5 0.11 0.95 1.0 0.92 0.84 0.41 0.56 0.57 0.01 0.02 0.15 0.19 0.06 0.15
0.42 0.43 0.42 0.41 0.43 0.49 0.54 0.46 0.43 0.44 0.41 0.36 0.36 0.44 0.51 1.0 0.47 0.78 0.64 0.57 0.04 0.37 0.48 0.49 0.62 0.48
0.39 0.38 0.42 0.39 0.36 0.36 0.36 0.39 0.3 0.3 0.27 0.26 0.38 0.53 0.87 1.0 0.41 0.5 0.54 0.42 0.25 0.42 0.21 0.25 0.28 0.4
0.67 0.73 0.77 0.74 0.74 0.73 0.74 0.68 0.59 0.55 0.46 0.45 0.66 0.72 0.93 1.0 0.93 0.92 0.77 0.59 0.67 0.57 0.84 0.49 0.78 0.53
0.33 0.32 0.51 0.43 0.55 0.49 0.84 0.64 0.56 0.53 0.32 0.29 0.25 0.65 0.69 0.87 1.0 0.57 0.75 0.99 0.04 0.13 0.16 0.2 0.16 0.23
0.32 0.49 0.62 0.66 0.65 0.64 0.57 0.61 0.59 0.54 0.5 0.51 0.35 0.85 1.0 0.97 0.5 0.89 0.78 0.43 0.17 0.71 0.31 0.31 0.45 0.52
0.12 0.06 0.06 0.06 0.06 0.04 0.06 0.08 0.12 0.18 0.2 0.21 0.11 0.72 0.49 0.86 0.28 1.0 0.59 0.34 0.03 0.05 0.01 0.04 0.06 0.08
0.38 0.26 0.18 0.22 0.45 0.45 0.35 0.32 0.3 0.22 0.15 0.12 0.39 0.17 0.49 1.0 0.12 0.28 0.22 0.13 0.12 0.04 0.36 0.15 0.17 0.16
0.17 0.25 0.34 0.42 0.46 0.38 0.55 0.54 0.6 0.48 0.39 0.29 0.15 0.73 0.7 1.0 0.56 0.86 0.78 0.4 0.35 0.7 0.81 0.43 0.43 0.31
0.17 0.28 0.27 0.28 0.26 0.24 0.26 0.27 0.24 0.25 0.22 0.21 0.22 0.61 0.64 1.0 0.36 0.79 0.66 0.28 0.47 0.17 0.46 0.21 0.22 0.27
0.52 0.65 0.74 0.76 0.65 0.47 0.62 0.67 0.55 0.54 0.46 0.42 0.45 0.75 0.9 1.0 0.66 0.98 0.74 0.51 0.46 0.76 0.6 0.49 0.67 0.52
0.14 0.23 0.23 0.28 0.39 0.42 0.32 0.25 0.27 0.28 0.24 0.18 0.13 0.33 0.65 1.0 0.29 0.59 0.46 0.21 0.14 0.24 0.31 0.25 0.18 0.18
0.13 0.29 0.38 0.36 0.43 0.44 0.36 0.32 0.34 0.37 0.3 0.28 0.13 0.56 0.54 1.0 0.46 0.56 0.45 0.39 0.08 0.43 0.32 0.39 0.48 0.56
0.08 0.07 0.07 0.09 0.08 0.06 0.09 0.09 0.11 0.16 0.22 0.19 0.14 0.79 0.48 1.0 0.28 0.74 0.45 0.25 0.0 0.04 0.01 0.02 0.05 0.02
1.0 0.98 0.82 0.77 0.68 0.57 0.97 0.9 0.85 0.95 0.83 0.9 0.78 0.67 0.64 0.76 0.89 0.67 0.95 0.72 0.78 0.54 0.76 0.41 0.65 0.56
0.52 0.49 0.36 0.41 0.32 0.31 0.51 0.47 0.38 0.39 0.35 0.34 0.58 1.0 0.36 0.76 0.47 0.91 0.48 0.48 0.13 0.88 0.43 0.49 0.58 0.55
0.53 0.5 0.41 0.39 0.38 0.39 0.45 0.43 0.35 0.4 0.35 0.32 0.54 1.0 0.45 0.82 0.51 0.76 0.61 0.55 0.1 0.6 0.34 0.35 0.51 0.43
0.09 0.28 0.28 0.27 0.46 0.54 0.49 0.28 0.32 0.15 0.12 0.11 0.06 0.34 0.93 1.0 0.55 0.53 0.59 0.54 0.18 0.3 0.28 0.18 0.29 0.25
0.24 0.36 0.38 0.53 0.47 0.35 0.81 0.68 0.64 0.56 0.45 0.42 0.3 0.85 0.6 1.0 0.64 0.91 0.64 0.49 0.15 0.7 0.35 0.22 0.56 0.47
0.35 0.38 0.43 0.52 0.59 0.54 0.74 0.69 0.58 0.59 0.52 0.47 0.47 0.79 0.61 1.0 0.56 0.84 0.55 0.44 0.38 0.66 0.44 0.42 0.46 0.44
0.08 0.12 0.12 0.12 0.15 0.16 0.16 0.14 0.14 0.14 0.11 0.09 0.09 0.63 0.71 1.0 0.35 0.8 0.72 0.23 0.32 0.18 0.37 0.28 0.21 0.27
0.85 0.82 0.72 0.65 0.87 0.66 1.0 0.75 0.73 1.0 0.77 0.79 0.57 0.97 0.78 0.97 0.71 0.61 0.69 0.67 0.56 0.58 0.55 0.61 0.46 0.84
0.12 0.16 0.14 0.15 0.18 0.18 0.18 0.16 0.18 0.18 0.15 0.14 0.13 0.63 0.77 1.0 0.36 0.77 0.62 0.25 0.19 0.25 0.25 0.25 0.17 0.25
0.14 0.25 0.43 0.57 0.63 0.47 0.59 0.58 0.54 0.56 0.57 0.61 0.13 0.63 0.79 0.77 0.56 0.9 0.89 0.43 0.47 1.0 0.54 0.39 0.52 0.43
0.42 0.5 0.57 0.49 0.56 0.65 0.56 0.51 0.53 0.56 0.52 0.53 0.42 0.52 1.0 0.87 0.69 0.67 0.8 0.68 0.42 0.29 0.39 0.46 0.23 0.27
0.44 0.4 0.35 0.37 0.41 0.41 0.43 0.43 0.42 0.39 0.38 0.35 0.49 0.79 0.93 1.0 0.49 0.68 0.73 0.38 0.56 0.36 0.68 0.41 0.37 0.5
0.11 0.3 0.4 0.4 0.48 0.45 0.5 0.46 0.49 0.41 0.33 0.3 0.12 0.47 0.74 0.55 0.45 0.79 1.0 0.34 0.14 0.71 0.33 0.28 0.27 0.23
0.3 0.37 0.42 0.36 0.43 0.44 0.42 0.43 0.44 0.45 0.43 0.38 0.29 0.56 0.78 1.0 0.51 0.51 0.62 0.51 0.26 0.21 0.35 0.38 0.21 0.31
0.27 0.29 0.32 0.38 0.45 0.41 0.4 0.4 0.49 0.54 0.58 0.53 0.35 0.46 0.55 1.0 0.53 0.72 0.73 0.54 0.27 0.4 0.45 0.35 0.35 0.27
0.04 0.04 0.03 0.04 0.03 0.03 0.03 0.04 0.08 0.05 0.06 0.05 0.03 0.65 0.69 0.67 0.36 1.0 0.47 0.2 0.02 0.06 0.1 0.06 0.1 0.08
0.2 0.17 0.27 0.37 0.37 0.26 0.46 0.45 0.33 0.44 0.37 0.3 0.17 0.88 0.68 1.0 0.73 0.62 0.72 0.48 0.32 0.61 0.61 0.32 0.55 0.39
0.3 0.27 0.4 0.62 0.62 0.48 0.74 0.69 0.62 0.65 0.6 0.51 0.29 0.96 0.77 1.0 0.78 0.63 0.82 0.55 0.35 0.68 0.7 0.46 0.65 0.52
0.43 0.4 0.43 0.42 0.47 0.46 0.43 0.4 0.44 0.41 0.44 0.47 0.49 0.65 0.7 1.0 0.46 0.82 0.7 0.39 0.36 0.29 0.54 0.34 0.39 0.31
0.08 0.15 0.22 0.31 0.41 0.45 0.58 0.47 0.27 0.28 0.21 0.16 0.07 0.58 0.64 1.0 0.71 0.86 0.87 0.62 0.21 0.33 0.65 0.38 0.36 0.31
0.32 0.38 0.32 0.36 0.52 0.56 0.43 0.41 0.42 0.46 0.41 0.38 0.25 0.53 0.5 1.0 0.42 0.64 0.61 0.49 0.02 0.2 0.37 0.47 0.32 0.41
0.09 0.34 0.44 0.63 0.62 0.44 0.49 0.55 0.52 0.49 0.52 0.47 0.11 0.55 0.8 0.96 0.4 1.0 0.72 0.33 0.46 0.88 0.85 0.48 0.59 0.52
0.26 0.4 0.45 0.48 0.51 0.44 0.37 0.39 0.4 0.36 0.32 0.32 0.34 0.89 0.66 1.0 0.74 0.6 0.55 0.48 0.14 0.54 0.25 0.24 0.52 0.41
0.24 0.28 0.19 0.2 0.31 0.48 0.6 0.47 0.59 0.31 0.21 0.17 0.19 0.46 0.65 1.0 0.39 0.38 0.33 0.3 0.07 0.17 0.37 0.19 0.28 0.22
0.3 0.41 0.29 0.32 0.38 0.38 0.44 0.44 0.51 0.44 0.41 0.31 0.35 0.62 0.8 1.0 0.48 0.86 0.71 0.5 0.31 0.37 0.38 0.29 0.23 0.23
0.2 0.22 0.27 0.31 0.37 0.4 0.45 0.44 0.58 0.61 0.63 0.62 0.31 0.49 0.43 1.0 0.59 0.86 0.67 0.43 0.35 0.37 0.5 0.57 0.43 0.29
0.17 0.22 0.21 0.26 0.3 0.38 0.44 0.39 0.34 0.37 0.35 0.31 0.17 0.78 0.52 1.0 0.42 0.72 0.5 0.29 0.22 0.54 0.51 0.22 0.61 0.26
0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.03 0.03 0.03 0.01 1.0 0.53 0.8 0.23 0.68 0.4 0.43 0.01 0.03 0.03 0.02 0.04 0.06
0.25 0.3 0.31 0.37 0.42 0.39 0.43 0.39 0.42 0.42 0.4 0.37 0.23 0.58 0.62 1.0 0.46 0.77 0.67 0.41 0.27 0.58 0.63 0.38 0.42 0.45
0.28 0.36 0.35 0.37 0.4 0.39 0.29 0.29 0.32 0.31 0.26 0.25 0.3 0.65 1.0 0.87 0.39 0.91 0.92 0.36 0.32 0.59 0.79 0.36 0.35 0.55
0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.1 0.23 0.13 0.42 0.08 0.05 0.03 0.02 0.44 0.86 1.0 0.16 0.25 0.35 0.07 0.11 0.01 0.18 0.1 0.04 0.01
0.44 0.37 0.29 0.43 0.45 0.4 0.39 0.49 0.37 0.34 0.31 0.34 0.44 0.26 0.3 1.0 0.14 0.51 0.35 0.18 0.22 0.41 0.54 0.43 0.75 0.8
0.16 0.17 0.1 0.13 0.18 0.18 0.23 0.21 0.24 0.25 0.23 0.19 0.16 0.64 0.66 1.0 0.3 0.63 0.56 0.19 0.62 0.24 0.43 0.28 0.16 0.23
0.39 0.41 0.53 0.51 0.52 0.44 0.44 0.42 0.3 0.33 0.3 0.31 0.43 0.92 0.87 1.0 0.57 0.65 0.53 0.47 0.3 0.86 0.57 0.37 0.63 0.57
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.49 1.0 0.17 0.36 0.3 0.12 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
0.59 0.63 0.6 0.69 0.88 1.0 1.0 0.87 0.95 0.87 0.79 0.64 0.61 0.81 0.89 0.77 0.71 0.75 0.8 0.68 0.86 0.74 0.9 0.53 0.66 0.68
0.45 0.56 0.55 0.56 0.61 0.49 0.61 0.55 0.7 0.67 0.62 0.59 0.5 1.0 0.83 0.99 0.71 0.72 0.95 0.46 0.44 0.71 0.71 0.47 0.48 0.55
0.03 0.21 0.38 0.26 0.25 0.03 0.13 0.03 0.03 0.29 0.17 0.0 0.0 0.81 0.89 0.75 1.0 0.21 0.43 0.68 0.02 0.05 0.0 0.12 0.0 0.08
0.29 0.34 0.41 0.46 0.36 0.21 0.41 0.44 0.28 0.34 0.31 0.27 0.27 0.43 0.63 1.0 0.43 0.74 0.43 0.37 0.35 0.62 0.4 0.31 0.59 0.58
0.35 0.39 0.49 0.51 0.46 0.37 0.47 0.48 0.35 0.39 0.34 0.33 0.35 0.46 0.75 1.0 0.46 0.77 0.58 0.41 0.3 0.52 0.31 0.3 0.58 0.62
0.13 0.3 0.33 0.37 0.44 0.45 0.42 0.36 0.44 0.4 0.37 0.32 0.13 0.58 0.49 1.0 0.37 0.74 0.6 0.43 0.01 0.19 0.12 0.15 0.18 0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)